FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1322.ptfa, 645 aa vs ./tmplib.26680 library 1768372 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0991+/-0.00566; mu= 10.6447+/- 0.379 mean_var=146.6278+/-33.836, 0's: 0 Z-trim: 14 B-trim: 91 in 1/35 Lambda= 0.1059 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0608 ( 738 res) mfj39041 ( 738) 2135 338 1.7e-93 mKIAA4104 ( 1065 res) mbg15134 (1065) 346 65 4.1e-11 mKIAA0019 ( 841 res) mpm12253 ( 841) 316 60 8.5e-10 mKIAA0603 ( 956 res) mfj60230 ( 956) 294 57 9.5e-09 mKIAA1108 ( 1266 res) mbg02140 (1266) 288 56 2.1e-08 mFLJ00006 ( 766 res) mbj00080 ( 766) 265 52 1.8e-07 mKIAA1055 ( 979 res) mpf00228 ( 979) 265 53 2.1e-07 mFLJ00288 ( 329 res) mic33003 ( 329) 226 46 6.4e-06 mKIAA0882 ( 1229 res) mfj03243 (1229) 191 41 0.00061 mKIAA0676 ( 1268 res) mfj02220 (1268) 187 41 0.00095 mFLJ00332 ( 439 res) msk03045 ( 439) 178 39 0.0012 mKIAA0397 ( 1032 res) mbg06355 (1032) 166 37 0.0077 mKIAA1171 ( 586 res) mph01652 ( 586) 162 37 0.0082 >>mKIAA0608 ( 738 res) mfj39041 (738 aa) initn: 2111 init1: 1289 opt: 2135 Z-score: 1771.1 bits: 338.2 E(): 1.7e-93 Smith-Waterman score: 2135; 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