FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1537.ptfa, 628 aa vs ./tmplib.26680 library 1768389 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6234+/-0.00872; mu= -1.8575+/- 0.576 mean_var=450.9129+/-108.440, 0's: 0 Z-trim: 22 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0604 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4212 ( 600 res) mbg08227 ( 600) 2479 231 2.9e-61 mKIAA0871 ( 471 res) mbh00987 ( 471) 1292 127 3.5e-30 mFLJ00238 ( 1452 res) mfj01101 (1452) 312 43 0.00032 mKIAA0647 ( 1186 res) mbg01911 (1186) 258 38 0.0074 mKIAA1643 ( 950 res) mbh04344 ( 950) 256 37 0.0075 >>mKIAA4212 ( 600 res) mbg08227 (600 aa) initn: 2479 init1: 2479 opt: 2479 Z-score: 1192.3 bits: 230.7 E(): 2.9e-61 Smith-Waterman score: 2479; 62.121% identity (62.121% ungapped) in 594 aa overlap (32-625:4-597) 10 20 30 40 50 60 mKIAA1 PRACGELLTRSASPCPARTAAMATKDPTAVERANLLNMAKLSIKGLIESALSFGRTLDSD :::::..: ::::: :..::::.::.::.: mKIAA4 MMEERANLMHMMKLSIKVLLQSALSLGRSLDAD 10 20 30 70 80 90 100 110 120 mKIAA1 YPPLQQFFVVMEHCLKHGLKGRKSFLSYNKTIWGPLELVEKLYPEAEEIGASVRDLPGLK : :::::::::::::::::: .:::.. ::...::::::::: ::: .:..:::.:: :: mKIAA4 YAPLQQFFVVMEHCLKHGLKVKKSFIGQNKSFFGPLELVEKLCPEASDIATSVRNLPELK 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 mKIAA1 TPLGRARAWLRLALMQKKMADYLRCLIIQRELLSEFYEYHALMMEEEGAVIVGLLVGLNV : .::.:::: :::::::.::::. :: ...::::::: .:::::::: ::::::::::: mKIAA4 TAVGRGRAWLYLALMQKKLADYLKVLIDNKQLLSEFYEPEALMMEEEGMVIVGLLVGLNV 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 mKIAA1 IDANLCVKGEDLDSQVGVIDFSMYLKNEEEIGNKERNVQIAAILDQKNYVEELNRQLNST .:::::.:::::::::::::::. ::. ... . ... .:. .::::::::::::.:. : mKIAA4 LDANLCLKGEDLDSQVGVIDFSLCLKDAQDLDSGREHERITDVLDQKNYVEELNRHLSCT 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 mKIAA1 VSSLHSRVDSLEKSNTKLIEELAIAKNNIIKLQEENHQLRSENELILMRTRQHLEVTKVD :..:....:.:::.:.:: :::. : . : .::.:..::: .::.: :... .:.:: : mKIAA4 VGDLQTKIDGLEKTNSKLQEELSAATDRICSLQKEQQQLREQNEVIRERSEKSVEITKQD 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 mKIAA1 VETELQTYKHSRQGLDEMYNDARRQLRDESQLRQDVENELSVQVGMKHEMELAMKLLEKD ...::.:::..::::::::.:. .::..:...: ..:.:: .:.::: :::.:::::::: mKIAA4 TKVELETYKQTRQGLDEMYSDVWKQLKEEKKVRLELEKELELQIGMKTEMEIAMKLLEKD 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 mKIAA1 IHEKQDTLIGLRQQLEEVKAINIEMYQRLQGSEDGLKEKNEIIARLEEKTNKITTAMRQL :::::::..::::::::::::..:....:..:..:..::: :: .: ::... ..:.:. mKIAA4 THEKQDTLVALRQQLEEVKAINLQMFHKVQSAESSLQQKNEAIASFEGKTTQVMSSMKQM 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 mKIAA1 EQRLQQAEKAQKEAEAEDEKYAQECLSQSDSLQRQISQKEQQLVQLETDLKIEKEWRQTL :.::::::.:.. :: ...: :: .....:: :.:: ..: :: .:: ::: ::.: mKIAA4 EERLQQAERARQAAEERSHKLQQELSGRGSALQLQLSQLRDQCSGLEKELKSEKEQRQAL 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 mKIAA1 QEDLQKEKDVLSHLRHETQKVISLKKEFLNLQDENQQLKRIYQEQEQALQELGSKLCESK :..::.:::. :. : :.: .::::. .::::. .:... .::::::::.: .: .:: mKIAA4 QRELQREKDTSCLLQTELQQVEGLKKELRELQDEKAELRKVCEEQEQALQEMGLHLSQSK 460 470 480 490 500 510 550 560 570 580 590 600 mKIAA1 LKIDDIKEANKALQGLVWLKDKDATHCKLCEKEFSLSKRKHHCRNCGEIFCNACSDNELP ::..::::.::::.: .:::: .::::: :::.::.:.:::::::::.::::.::.::: mKIAA4 LKMEDIKEVNKALKGHTWLKDDEATHCKQCEKDFSISRRKHHCRNCGHIFCNTCSSNELA 520 530 540 550 560 570 610 620 mKIAA1 LPSSPKPVRVCDSCHAMLIQRCSSNMP ::: :::::::::::..:.:::::. mKIAA4 LPSYPKPVRVCDSCHTLLLQRCSSTAS 580 590 600 >>mKIAA0871 ( 471 res) mbh00987 (471 aa) initn: 1355 init1: 1256 opt: 1292 Z-score: 634.3 bits: 127.1 E(): 3.5e-30 Smith-Waterman score: 1597; 59.132% identity (62.110% ungapped) in 438 aa overlap (7-441:46-465) 10 20 30 mKIAA1 PPRACGELLTRSASPCPARTAAMATKDPT---AVER :: : .: : : .::. : :: mKIAA0 TTDKITQAAMETIYLCKFRVSMDGEWLCLRELDDISLTPDPEPTH----EDPNYLMANER 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 ANLLNMAKLSIKGLIESALSFGRTLDSDYPPLQQFFVVMEHCLKHGLKGRKSFLSYNKTI ::.:::::::::::::::..:::::::: ::::::::::::::::::..:.::. ::.. mKIAA0 MNLMNMAKLSIKGLIESALNLGRTLDSDYAPLQQFFVVMEHCLKHGLKAKKTFLGQNKSF 80 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 WGPLELVEKLYPEAEEIGASVRDLPGLKTPLGRARAWLRLALMQKKMADYLRCLIIQREL :::::::::: ::: :: :::.::::::::.::.::::::::::::...:.. :: ..:: mKIAA0 WGPLELVEKLVPEAAEITASVKDLPGLKTPVGRGRAWLRLALMQKKLSEYMKALINKKEL 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 LSEFYEYHALMMEEEGAVIVGLLVGLNVIDANLCVKGEDLDSQVGVIDFSMYLKNEEEIG :::::: .:::::::::.:.::::::::::::.:.:::::::::::::::::::. . mKIAA0 LSEFYEVNALMMEEEGAIIAGLLVGLNVIDANFCMKGEDLDSQVGVIDFSMYLKDGNSSK 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 NKERNVQIAAILDQKNYVEELNRQLNSTVSSLHSRVDSLEKSNTKLIEELAIAKNNIIKL ..: . ::.::::::::::::::.::.::..:...:: :::::::: ::::.:.: :: : mKIAA0 GSEGDGQITAILDQKNYVEELNRHLNATVNNLQTKVDLLEKSNTKLTEELAVANNRIITL 260 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 QEENHQLRSENELILMRTRQHLEVTKVDVETELQTYKHSRQGLDEMYNDARRQLRDESQL ::: .... :. .: :.. . :..: . . ..::..:..:.:: mKIAA0 QEEMERVKEESSYLL--------------ESNRKGPKQDRTAEGQALSEARKHLKEETQL 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 RQDVENELSVQVGMKHEMELAMKLLEKDIHEKQDTLIGLRQQLEEVKAINIEMYQRLQGS : :::.:: .:..:..:::::::.::::. ::::.:..:::::....:.. :. .::.: mKIAA0 RLDVEKELELQISMRQEMELAMKMLEKDVCEKQDALVSLRQQLDDLRALKHELAFKLQSS 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 EDGLKEKNEIIARLEEKTNKITTAMRQLEQRLQQAEKAQKEAEAEDEKYAQECLSQSDSL . :.:.:.:. .:::::::.......:::: .. : : .. .: mKIAA0 DLGVKQKSELNSRLEEKTNQMAATIKQLEQSEKDLVKQAKTLNSAANKLIPKHH 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 QRQISQKEQQLVQLETDLKIEKEWRQTLQEDLQKEKDVLSHLRHETQKVISLKKEFLNLQ >>mFLJ00238 ( 1452 res) mfj01101 (1452 aa) initn: 436 init1: 201 opt: 312 Z-score: 168.2 bits: 42.5 E(): 0.00032 Smith-Waterman score: 331; 23.520% identity (26.534% ungapped) in 625 aa overlap (47-626:613-1211) 20 30 40 50 60 70 mKIAA1 PARTAAMATKDPTAVERANLLNMAKLSIKGLIESALSFGRTLDSDYPPLQQFFVVMEHCL :.:. : ..:..:: ::: .... : mFLJ00 REEQVNNSTVSEAEQEELQKELQNMVDRNQLLEGKL---QALQTDYKALQQREAAIQGSL 590 600 610 620 630 80 90 100 110 120 130 mKIAA1 KHGLKGRKSFLSYNKTIWGPLELVEK----LYPEAEEIGASVRDLPGLKTPLGRARAWLR . :. .. . . : :.: . .. : :.... . : . : mFLJ00 ASLEAEQASIRHLGNQMEASLLAVKKAKETMKAQVAEKEAALQSKESECQRLQEEADQCR 640 650 660 670 680 690 140 150 160 170 180 190 mKIAA1 LALMQKKMADYLRCLIIQRELLSEFYEYHALMMEEEGAVIVGLLVG-LNVIDANLCV-KG : . . .:. :: : : . .. : . ..: . . . : . .:.: . .: mFLJ00 L--QAEAQAQELRALENQCQQQIQLIEVLSAEKGQQGLSLPQVNTDQLALSQAQLEIHQG 700 710 720 730 740 750 200 210 220 230 240 mKIAA1 EDLDSQVGVIDFSMYLKNEEEIGNKER-----NVQIAAILDQKNYVEELNRQLNSTVSSL : : :.:.. :. .:.... .: ... ..:. :..:..: : ... mFLJ00 EAQRLQNEVVDLQAKLQVA--LGDRDKLQSQLGVAETVLREHKTLVQQLKEQ-NEALNRA 760 770 780 790 800 810 250 260 270 280 290 300 mKIAA1 HSRVDSLEKSNTKLIEELAIAKNNIIKLQEENHQLRS-ENELILMRTRQ---HLEVTKVD : :. : . . . : . ...: : :.....::. . :: .: . ::: .... mFLJ00 H--VQELLQCSER---EGILQEESIYKAQKQEQELRALQAELSQVRCSSEGAHLEHAELQ 820 830 840 850 860 310 320 330 340 350 mKIAA1 VETELQTYKHSRQGLDEMYNDARRQLRDES------QLRQDVENELSVQVGMKHE-MELA . . . .. :.. :... .:. .:... : :. . :.. . :.: mFLJ00 DQLHRANTDTAELGIQVCALTAEKDRMEEALASLAQELQDSKEAALQERKGLELQVMQLQ 870 880 890 900 910 920 360 370 380 390 400 mKIAA1 M---KLLEK--DIHEKQDTLIGLRQQLEEVKAINIEMYQRLQGSEDGLKEKNEIIARLEE . :: :: .: ... ::. :: ... . . . . .:.:: . . :.. . mFLJ00 QEKEKLQEKVKAAEEAASSFSGLQAQLAQAEQLAQSLQETAHQEQDALKFQ--LSAEIMD 930 940 950 960 970 980 410 420 430 440 450 mKIAA1 KTNKITTA------MR-QLE---QRLQQAEKAQKEAE----AEDEKYAQECLSQSDS-LQ . :.. :: .: ::: :.::....: .: : : .:: .: :. . : mFLJ00 HQNRLKTANEECGHLRAQLEEQGQQLQMTKEAVQELEITKAAMEEKL--NCTSSHLAECQ 990 1000 1010 1020 1030 1040 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 RQISQKEQQLVQLETDL-KIEKEWRQTLQEDLQKEKDVLSHLRHE-TQKVISLKKEFLNL . .:... ..:.:.: . .:: :.. .: .. ..: .: :.. . .: . .: mFLJ00 ATLLRKDEESTMLQTSLERTQKE----LEKATSKIQEYYNKLCQEVTNRERNDQKMLADL 1050 1060 1070 1080 1090 1100 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 QDENQQLKRIYQEQEQALQELGSKLCESKLKIDDIKEANKALQGLVW-LKDKDATHCKLC .: :. : . .:. .. : .: .. . .: : .. :.. : : ...::. : mFLJ00 DDLNRTKKYL---EERLIELLRDK--DALWQKSDALEFQQKLSAEEKCLGDMEVNHCHDC 1110 1120 1130 1140 1150 580 590 600 610 620 mKIAA1 EKEFSLSKRKHHCRNCGEIFCNACSDNELPLPSSPKPVRVCDSCHAMLIQRCSSNMP ..::: :.:::: ::.::: : .: . : : : : .: . . .:: mFLJ00 KREFSWIVRRHHCRICGRIFCYYCCNNYVVTKPSGKKERCCRACFQKFGEGSGSNDSSGS 1160 1170 1180 1190 1200 1210 mFLJ00 GTSQGEPSPMVSPAEASPQSIGSQGINSVCRPPDDAVFDIITDEELCQIQESGSSLPETP 1220 1230 1240 1250 1260 1270 >>mKIAA0647 ( 1186 res) mbg01911 (1186 aa) initn: 250 init1: 186 opt: 258 Z-score: 143.6 bits: 37.7 E(): 0.0074 Smith-Waterman score: 261; 29.167% identity (31.210% ungapped) in 168 aa overlap (451-616:1003-1161) 430 440 450 460 470 480 mKIAA1 LEQRLQQAEKAQKEAEAEDEKYAQECLSQSDSLQRQISQKEQQLVQLETDLKIEKEWRQT :.: . ...: :.:. . : : . mKIAA0 WFSSHPKQVSSTKPSLLSCPSPVPPLYLDDDGLPFPTDVIQHRLRQIEAGYRQEVEQLRR 980 990 1000 1010 1020 1030 490 500 510 520 530 540 mKIAA1 LQEDLQKEKDVLSHLRHETQKVISLKKEFLNLQDENQQLKRIYQEQEQALQELGSKLCES ..:: . :. :: . .. .:. ::. . . . :. : : mKIAA0 QVRELQMRLDI----RHCCAPPA---EPPMDYEDDFTCLKESDGSDTEDFGSDHSEDCLS 1040 1050 1060 1070 1080 550 560 570 580 590 600 mKIAA1 KLKIDDIKEANKALQGLVWLKDKDATHCKLCEKEFSLSKRKHHCRNCGEIFCNACSDNEL . . . . . : . :. :. :.:: :. :: :.::.:::::::..:: .: .: mKIAA0 EASWEPVDK--KETEVTRWVPDHMASHCFNCDCEFWLAKRRHHCRNCGNVFCAGCCHLKL 1090 1100 1110 1120 1130 1140 610 620 mKIAA1 PLPSSP--KPVRVCDSCHAMLIQRCSSNMP :.:.. :: ::.::. mKIAA0 PIPDQQLYDPVLVCNSCYEHIQVSRARELMSQHLKKPIATASS 1150 1160 1170 1180 >>mKIAA1643 ( 950 res) mbh04344 (950 aa) initn: 253 init1: 174 opt: 256 Z-score: 143.6 bits: 37.3 E(): 0.0075 Smith-Waterman score: 256; 35.455% identity (39.000% ungapped) in 110 aa overlap (514-616:830-936) 490 500 510 520 530 540 mKIAA1 DLQKEKDVLSHLRHETQKVISLKKEFLNLQDENQQLKRIYQEQEQALQELGSKLCESKLK :....::.. : ..: : ::. .. mKIAA1 VADQLQTNYASDLRSILKTLFEVMATKPETDDKEKLKKVTQTLRSAALE-DCALCQETVS 800 810 820 830 840 850 550 560 570 580 590 mKIAA1 IDDIKEANKALQGLV-----WLKDKDATHCKLCEKEFSLSKRKHHCRNCGEIFCNACSDN ... : :. .: :. :. : :. :.. .::::::.::.:::. ::.. mKIAA1 SSEL--AAKTRDGDFEDPPEWVPDEACGFCTSCKAPFTVIRRKHHCRSCGKIFCSRCSSH 860 870 880 890 900 910 600 610 620 mKIAA1 ELPLP--SSPKPVRVCDSCHAMLIQRCSSNMP ::: .. :::::: :. mKIAA1 SAPLPRYGQVKPVRVCTHCYMFHVTPFYSDKTGM 920 930 940 950 628 residues in 1 query sequences 1768389 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:47:34 2006 done: Mon Mar 27 10:47:36 2006 Scan time: 0.800 Display time: 0.160 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]