FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0318.ptfa, 884 aa vs ./tmplib.26680 library 1768133 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2826+/-0.00698; mu= 1.2333+/- 0.464 mean_var=256.3521+/-61.527, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0801 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0612 ( 353 res) mbj00855 ( 353) 503 71 2.1e-13 mKIAA1666 ( 1139 res) mbp08305 (1139) 301 49 4.8e-06 >>mKIAA0612 ( 353 res) mbj00855 (353 aa) initn: 772 init1: 445 opt: 503 Z-score: 333.0 bits: 71.5 E(): 2.1e-13 Smith-Waterman score: 654; 42.361% identity (49.796% ungapped) in 288 aa overlap (592-843:55-335) 570 580 590 600 610 620 mKIAA0 QPHCCHGDEYHTESSRGSDLSDIMEEDEEELYSEMQLEDGGRRRPSGTSHNALKILGNST :. .. . : : .:...... : . . mKIAA0 GASARPSTVGVSGTSARLGQAPGEEFCAPVLMCCLRCRRGQSRGVWATTEDSVSPLPSVA 30 40 50 60 70 80 630 640 650 660 670 680 mKIAA0 LMGRADRMEHVSRRYSHSGGGSHRHRPAMAPSIDEYTGRDHLSPDFYDESETDPGAEELP : .: . . :: ..:: . ..: : .: .: .:.: . .:. : ..:: mKIAA0 LSLQATETGE-SRGQDNSGRRGPQRRGARVPR----SGTTELAPP-RSPQEAPPH-QDLP 90 100 110 120 130 690 700 710 720 730 740 mKIAA0 ARIFVALFDYDPLTMSPNPDAAEEELPFKEGQIIKVYGDKDADGFYRGETCARLGLIPCN .:.:::::::::..:::::::.::::::::::..::.::::::::::::. .: : :::: mKIAA0 VRVFVALFDYDPVSMSPNPDAGEEELPFKEGQLLKVFGDKDADGFYRGESGGRTGYIPCN 140 150 160 170 180 190 750 760 770 mKIAA0 MVSEIHADDEEMMDQLLRQGFLPLNT-------------------PVEKIERSRR---SG ::.:. .:. .:::..:::: :. : : .::.. : mKIAA0 MVAEVAVDSPAGRQQLLQRGFLPPNVLTEASGNGPSVYSSAHTPGPPPKPRRSKKVELEG 200 210 220 230 240 250 780 790 800 810 820 mKIAA0 RGHSVP-------------TRRMVALYDYDPRESSPNVDVEAELPFCTGDIITVFGEIDE . : .: ::: .::.:::.:::.:::::::: .::.:::::..:. mKIAA0 PTQLCPGPPKLIHSAAQKTSRPMVAAFDYNPRENSPNMDVEAELPFRAGDVITVFGNMDD 260 270 280 290 300 310 830 840 850 860 870 880 mKIAA0 DGFYYGELN-GQKGLVPSNFLEEVPDDVEVHLSDAPPHYSHDPPMRSKAKRKKSVHFTP ::::: . . :..:.. :. mKIAA0 DGFYYVRSSWGKEGVLCSGSPAGHAYGQTFLAEGWR 320 330 340 350 >>mKIAA1666 ( 1139 res) mbp08305 (1139 aa) initn: 1007 init1: 296 opt: 301 Z-score: 200.8 bits: 48.7 E(): 4.8e-06 Smith-Waterman score: 1078; 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