FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0540.ptfa, 1539 aa vs ./tmplib.26680 library 1767478 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7438+/-0.00491; mu= 10.7010+/- 0.327 mean_var=170.3840+/-40.878, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0983 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1544 ( 1356 res) mbg00554 (1356) 1364 207 2.6e-53 mKIAA0993 ( 646 res) mbg00079 ( 646) 483 82 6.2e-16 >>mKIAA1544 ( 1356 res) mbg00554 (1356 aa) initn: 1441 init1: 505 opt: 1364 Z-score: 1049.5 bits: 206.8 E(): 2.6e-53 Smith-Waterman score: 1651; 33.855% identity (37.005% ungapped) in 1022 aa overlap (451-1443:320-1283) 430 440 450 460 470 480 mKIAA0 LSRALTTSSSETEHASTAVAASERCSWLVPLVRTLLDRAYGPLGLQWGLPSLPPTNGSPT : :::: : : . . .: ..: . mKIAA1 ENMSITAKLERALEKVAPLLREIFVDFAPFLSRTLL----GSHGQELLIEGLVCMKSSTS 290 300 310 320 330 340 490 500 510 520 530 540 mKIAA0 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