FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4212.ptfa, 600 aa vs ./tmplib.26680 library 1768417 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9833+/-0.00857; mu= -10.0477+/- 0.565 mean_var=469.5645+/-115.010, 0's: 0 Z-trim: 26 B-trim: 24 in 1/35 Lambda= 0.0592 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1537 ( 628 res) mbg18407 ( 628) 2479 226 5.7e-60 mKIAA0871 ( 471 res) mbh00987 ( 471) 1255 122 1.4e-28 mFLJ00238 ( 1452 res) mfj01101 (1452) 359 46 2.9e-05 mFLJ00279 ( 1335 res) mpg01084 (1335) 274 39 0.0043 mKIAA1643 ( 950 res) mbh04344 ( 950) 263 37 0.0067 >>mKIAA1537 ( 628 res) mbg18407 (628 aa) initn: 2479 init1: 2479 opt: 2479 Z-score: 1169.0 bits: 226.4 E(): 5.7e-60 Smith-Waterman score: 2479; 62.121% identity (62.121% ungapped) in 594 aa overlap (4-597:32-625) 10 20 30 mKIAA4 MMEERANLMHMMKLSIKVLLQSALSLGRSLDAD :::::..: ::::: :..::::.::.::.: mKIAA1 PRACGELLTRSASPCPARTAAMATKDPTAVERANLLNMAKLSIKGLIESALSFGRTLDSD 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 mKIAA4 YAPLQQFFVVMEHCLKHGLKVKKSFIGQNKSFFGPLELVEKLCPEASDIATSVRNLPELK : :::::::::::::::::: .:::.. ::...::::::::: ::: .:..:::.:: :: mKIAA1 YPPLQQFFVVMEHCLKHGLKGRKSFLSYNKTIWGPLELVEKLYPEAEEIGASVRDLPGLK 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 mKIAA4 TAVGRGRAWLYLALMQKKLADYLKVLIDNKQLLSEFYEPEALMMEEEGMVIVGLLVGLNV : .::.:::: :::::::.::::. :: ...::::::: .:::::::: ::::::::::: mKIAA1 TPLGRARAWLRLALMQKKMADYLRCLIIQRELLSEFYEYHALMMEEEGAVIVGLLVGLNV 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 mKIAA4 LDANLCLKGEDLDSQVGVIDFSLCLKDAQDLDSGREHERITDVLDQKNYVEELNRHLSCT .:::::.:::::::::::::::. ::. ... . ... .:. .::::::::::::.:. : mKIAA1 IDANLCVKGEDLDSQVGVIDFSMYLKNEEEIGNKERNVQIAAILDQKNYVEELNRQLNST 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 mKIAA4 VGDLQTKIDGLEKTNSKLQEELSAATDRICSLQKEQQQLREQNEVIRERSEKSVEITKQD :..:....:.:::.:.:: :::. : . : .::.:..::: .::.: :... .:.:: : mKIAA1 VSSLHSRVDSLEKSNTKLIEELAIAKNNIIKLQEENHQLRSENELILMRTRQHLEVTKVD 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 mKIAA4 TKVELETYKQTRQGLDEMYSDVWKQLKEEKKVRLELEKELELQIGMKTEMEIAMKLLEKD ...::.:::..::::::::.:. .::..:...: ..:.:: .:.::: :::.:::::::: mKIAA1 VETELQTYKHSRQGLDEMYNDARRQLRDESQLRQDVENELSVQVGMKHEMELAMKLLEKD 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 mKIAA4 THEKQDTLVALRQQLEEVKAINLQMFHKVQSAESSLQQKNEAIASFEGKTTQVMSSMKQM :::::::..::::::::::::..:....:..:..:..::: :: .: ::... ..:.:. mKIAA1 IHEKQDTLIGLRQQLEEVKAINIEMYQRLQGSEDGLKEKNEIIARLEEKTNKITTAMRQL 370 380 390 400 410 420 400 410 420 430 440 450 mKIAA4 EERLQQAERARQAAEERSHKLQQELSGRGSALQLQLSQLRDQCSGLEKELKSEKEQRQAL :.::::::.:.. :: ...: :: .....:: :.:: ..: :: .:: ::: ::.: mKIAA1 EQRLQQAEKAQKEAEAEDEKYAQECLSQSDSLQRQISQKEQQLVQLETDLKIEKEWRQTL 430 440 450 460 470 480 460 470 480 490 500 510 mKIAA4 QRELQREKDTSCLLQTELQQVEGLKKELRELQDEKAELRKVCEEQEQALQEMGLHLSQSK :..::.:::. :. : :.: .::::. .::::. .:... .::::::::.: .: .:: mKIAA1 QEDLQKEKDVLSHLRHETQKVISLKKEFLNLQDENQQLKRIYQEQEQALQELGSKLCESK 490 500 510 520 530 540 520 530 540 550 560 570 mKIAA4 LKMEDIKEVNKALKGHTWLKDDEATHCKQCEKDFSISRRKHHCRNCGHIFCNTCSSNELA ::..::::.::::.: .:::: .::::: :::.::.:.:::::::::.::::.::.::: mKIAA1 LKIDDIKEANKALQGLVWLKDKDATHCKLCEKEFSLSKRKHHCRNCGEIFCNACSDNELP 550 560 570 580 590 600 580 590 600 mKIAA4 LPSYPKPVRVCDSCHTLLLQRCSSTAS ::: :::::::::::..:.:::::. mKIAA1 LPSSPKPVRVCDSCHAMLIQRCSSNMP 610 620 >>mKIAA0871 ( 471 res) mbh00987 (471 aa) initn: 1517 init1: 1174 opt: 1255 Z-score: 605.4 bits: 121.7 E(): 1.4e-28 Smith-Waterman score: 1496; 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