# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg08215.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0305.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0305, 1536 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7918838 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5703+/-0.000188; mu= 13.6598+/- 0.011 mean_var=84.9663+/-16.295, 0's: 40 Z-trim: 57 B-trim: 7 in 1/66 Lambda= 0.139140 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|50401754|sp|Q80U44.2|ZFY16_MOUSE RecName: Full= (1528) 10155 2049.5 0 gi|109464212|ref|XP_574833.2| PREDICTED: similar t (1547) 7768 1570.4 0 gi|57999444|emb|CAI45932.1| hypothetical protein [ (1539) 6298 1275.3 0 gi|157426864|ref|NP_055548.3| zinc finger, FYVE do (1539) 6297 1275.1 0 gi|50401753|sp|Q7Z3T8.2|ZFY16_HUMAN RecName: Full= (1539) 6296 1274.9 0 gi|114599409|ref|XP_001135982.1| PREDICTED: endoso (1539) 6278 1271.3 0 gi|31873350|emb|CAD97666.1| hypothetical protein [ 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