FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1728.ptfa, 1313 aa vs ./tmplib.26680 library 1767704 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9640+/-0.00742; mu= -5.6819+/- 0.491 mean_var=333.1796+/-82.016, 0's: 0 Z-trim: 24 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0703 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1148 ( 1589 res) mfj27189 (1589) 3494 369 3.4e-102 mKIAA0379 ( 377 res) mtj01105 ( 377) 370 52 2.7e-07 mKIAA1223 ( 600 res) mfj51380 ( 600) 371 52 3.4e-07 mFLJ00246 ( 1454 res) mpm02140 (1454) 359 51 1.5e-06 mKIAA1250 ( 1693 res) mbg07525 (1693) 350 50 3.1e-06 mKIAA1334 ( 992 res) mpm09174 ( 992) 322 47 1.5e-05 mKIAA1306 ( 1347 res) mbg04314 (1347) 321 47 2e-05 mKIAA1977 ( 649 res) mph01546 ( 649) 305 45 3.7e-05 mKIAA1785 ( 617 res) mph01357 ( 617) 303 45 4.2e-05 mFLJ00040 ( 638 res) mpm09196 ( 638) 295 44 7.5e-05 mKIAA0229 ( 1198 res) mpf00455 (1198) 289 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RSHLTSAKPKRSFIESNV ..:. ..: mKIAA1 CDELSPVSPTQGGYPSEPTRSRTTPFMGIIDKTARTQQYPHLHQQNRTWAVSSVDTVLSP 1420 1430 1440 1450 1460 1470 >>mKIAA0379 ( 377 res) mtj01105 (377 aa) initn: 184 init1: 144 opt: 370 Z-score: 223.4 bits: 51.8 E(): 2.7e-07 Smith-Waterman score: 370; 31.894% identity (33.684% ungapped) in 301 aa overlap (413-708:1-290) 390 400 410 420 430 440 mKIAA1 RTEVLNNAPILCVQSHLGHEEVVTLLLEFGACLDGMSENGMNALCYAAAAGHMKLVCLLI : .:. .. : .:: .:..:: . : :. mKIAA0 ANVDAKDKWGRTALHRGAVTGHEECVDALL 10 20 30 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 KKGARVDHLDKKGQCALVHSALRGHSDILQYLLNCEWSAGPPQPGTLRKSQALQQALTAA ..::. :..:. . :: :: .: ::. :. .:... . :: : mKIAA0 QHGAKCLLRDSRGRTPIHLSAACGHIGVLGALLQSATSVDA-NPAVVDNHG--YTALHWA 40 50 60 70 80 510 520 530 540 550 560 mKIAA1 ASMGHSSVVQSLLGMAEEHEIEVNGTDTLWGETALTAAAGRGKVEICELLLERGAAVSRA :: . :. :: . ..:. :. . : . :. ..: .:. :. ::.. : mKIAA0 CYNGHETCVELLLEQDVFQKIDGNAFSPL--HCAVIND-NEGAAEM--LIDSLGASIVNA 90 100 110 120 130 140 570 580 590 600 610 620 mKIAA1 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...:..:. .::... ..: .:: : .:: ::: :.:.::. ...:. ::: . . mKIAA1 VKVVQLLIEHGAVVDHTCNQGATALCIAAQEGHVDVVQVLLEHGADPNHADQFGRTAMRV 200 210 220 230 240 250 680 690 700 710 720 730 mKIAA1 AAFYGDAETVLYLVEKGAVIEHVDHSGMRPLDRAIGCRNTAVVVTLLRKGAKLGNAAWAM :: : .. . : . :: mKIAA1 AAKNGHSQIIKLLEKYGASSLNGCSPSPVHTMEQKPPQSAPSKMQSLTIRSNSSGGTGGG 260 270 280 290 300 310 >>mFLJ00246 ( 1454 res) mpm02140 (1454 aa) initn: 435 init1: 248 opt: 359 Z-score: 210.0 bits: 51.3 E(): 1.5e-06 Smith-Waterman score: 547; 25.829% identity (31.345% ungapped) in 875 aa overlap (369-1118:289-1134) 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 HLQALWIGYSTEGLSAALASLRNLYTPNVKVSRLLILGGANVNYRTEVLNNAPILCVQSH . .::.: :.:: .. . :.: : mFLJ00 LLAMHANVEDRGNKGDITPLMAASSGGYLDIVKLLLLHDADVNSQSATGNTA--LTYACA 260 270 280 290 300 310 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 LGHEEVVTLLLEFGACLDGMSENGMNALCYAAAAGHMKLVCLLIKKGARVD-HLDKKGQC : ..: .::. :: .. .::: . : ::.:::.... .:. .:: .. : .. . mFLJ00 GGFIDIVKVLLNEGANIEDHNENGHTPLMEAASAGHVEVARVLLDHGAGINTHSNEFKES 320 330 340 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