FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1108.ptfa, 1266 aa vs ./tmplib.26680 library 1767751 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6360+/-0.00649; mu= 7.1766+/- 0.431 mean_var=202.7254+/-48.421, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 40 in 1/35 Lambda= 0.0901 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0603 ( 956 res) mfj60230 ( 956) 2053 280 1.3e-75 mKIAA4104 ( 1065 res) mbg15134 (1065) 706 105 6.8e-23 mKIAA0019 ( 841 res) mpm12253 ( 841) 437 70 1.9e-12 mKIAA1055 ( 979 res) mpf00228 ( 979) 392 64 1.2e-10 mFLJ00006 ( 766 res) mbj00080 ( 766) 385 63 1.9e-10 mKIAA0882 ( 1229 res) mfj03243 (1229) 374 62 7.2e-10 mKIAA0676 ( 1268 res) mfj02220 (1268) 331 56 3.6e-08 mFLJ00288 ( 329 res) mic33003 ( 329) 309 53 1e-07 mKIAA0608 ( 738 res) mfj39041 ( 738) 312 54 1.4e-07 mKIAA1322 ( 645 res) mbh00387 ( 645) 288 51 1.1e-06 mFLJ00332 ( 439 res) msk03045 ( 439) 221 42 0.00035 >>mKIAA0603 ( 956 res) mfj60230 (956 aa) initn: 2984 init1: 1676 opt: 2053 Z-score: 1450.1 bits: 280.1 E(): 1.3e-75 Smith-Waterman score: 3007; 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