Miyakogusa Predicted Gene
- Lj4g3v1787030.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj4g3v1787030.1 tr|Q1WK55|Q1WK55_LOTJA CYC5 OS=Lotus japonicus
PE=2 SV=1,98.91,0,TCP,Transcription factor TCP subgroup; R,CYC/TB1, R
domain; TCP,Transcription factor, TCP; seg,NULL,CUFF.49715.1
(1167 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC70101 UniRef100_Q1WK55 Cluster: CYC5; n=1; Lotus japo... 2185 0.0
>gnl|LJGI|TC70101 UniRef100_Q1WK55 Cluster: CYC5; n=1; Lotus japonicus|Rep: CYC5 -
Lotus japonicus, complete
Length = 1322
Score = 2185 bits (1102), Expect = 0.0
Identities = 1130/1137 (99%), Gaps = 3/1137 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgttttcctcaaatagttccctcaatggaaatgacctaatctcctcatcctcctaccct 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 188 atgttttcctcaaatagttccctcaatggaaatgacctaatctcctcatcctcctaccct 247
Query: 61 aacaacaaccaagcatttattttctctaggcatttttcctttgaaagcaacctcacttca 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 248 aacaacaaccaagcatttattttctctaggcatttttcctttgaaagcaacctcacttca 307
Query: 121 aaagatgaaaccaattgtcctttgtccttacttcaattcccctattctccctttgaagac 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 308 aaagatgaaaccaattgtcctttgtccttacttcaattcccctattctccctttgaagac 367
Query: 181 catgaaaatatcttccctgaacaacaccatgatttctcactccaacaacatcaatctcta 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 368 catgaaaatatcttccctgaacaacaccatgatttctcactccaacaacatcaatctcta 427
Query: 241 cctgagcctgttgtgaacaacaatatggatgcttcaatcaacaacaacaagaataatagt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 428 cctgagcctgttgtgaacaacaatatggatgcttcaatcaacaacaacaagaataatagt 487
Query: 301 attcctggaacctgctccgttgtaggaaaaggcactgcaacggagcaggttgcggtgaga 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 488 attcctggaacctgctccgttgtaggaaaaggcactgcaacggagcaggttgcggtgaga 547
Query: 361 agaagatctagcaagagggatcggcacagcaagatcaacacggctcgaggactcagggat 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 548 agaagatctagcaagagggatcggcacagcaagatcaacacggctcgaggactcagggat 607
Query: 421 cggagaatgagactttcacttgaagttgccaagaggttctttggccttcaagacatgctg 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 608 cggagaatgagactttcacttgaagttgccaagaggttctttggccttcaagacatgctg 667
Query: 481 ggctttgataaagcaagcaaaactg-tggactggttgctgaaccaagcaaaagttgaaat 539
||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 668 ggcttcgataaaccaagcaaaactgctggactggttgctgaaccaagcaaaagttgaaat 727
Query: 540 taagcaccttgcaagggagaagaatctccaccacccaagttgtagtggcgccaagagcag 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 728 taagcaccttgcaagggagaagaatctccaccacccaagttgtagtggcgccaagagcag 787
Query: 600 ttcttcaacttctgagggtgaaggggtgtctggcttggatgaggttgtgattagtgaaaa 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 788 ttcttcaacttctgagggtgaaggggtgtctggcttggatgaggttgtgattagtgaaaa 847
Query: 660 tcaagagcaagagaaggagcaacaaccaatagtgaagaggagagctaacaaggtttgtag 719
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 848 tcaagggcaagagaaggagcaacaaccaatagtgaagaggagagctaacaaggtttgtag 907
Query: 720 aaagagtgcattcaatgctattgggagggaaaaggcaagggaaagggcaagagaaagaac 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 908 aaagagtgcattcaatgctattgggagggaaaaggcaagggaaagggcaagagaaagaac 967
Query: 780 aagagaaaagctgaggactaagaagctagctgatgataaagaatcaaagcaatgcaagga 839
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 968 aagagaaaagctgaggactaagaagctagctgatgataaagaatcaaaacaatgcaagga 1027
Query: 840 ggtaacaaaccataacctgaacttgtggaatccctttgaaactgtggaagaatctgcagg 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1028 ggtaacaaaccataacctgaacttgtggaatccctttgaaactgtggaagaatctgcagg 1087
Query: 900 cacccaccagagccaaagtgtgaataatcatccctccttggatcttctggctgaggctga 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1088 cacccaccagagccaaagtgtgaataatcatccctccttggatcttctggctgaggctga 1147
Query: 960 aaaagaaccaagttctcaagcaaaggagaattcaggaactgttgtagatgatgatatgtc 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1148 aaaagaaccaagttctcaagcaaaggagaattcaggaactgttgtagatgatgatatgtc 1207
Query: 1020 tcatgaagattccttcttgattatgagcaaatggagtccaaccatgatgttcaattcttt 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1208 tcatgaagattccttcttgattatgagcaaatggagtccaaccatgatgttcaattcttt 1267
Query: 1080 gagtaattcagaaatccttcaagaacaccaatttgcagaatttcagcccttgggtaa 1136
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1268 gagtaattcagaaatccttcaaga--accaatttgcagaatttcagcccttgggtaa 1322