Miyakogusa Predicted Gene

Lj3g3v3336160.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj3g3v3336160.1 Non Chatacterized Hit- tr|I3SA35|I3SA35_LOTJA
Uncharacterized protein OS=Lotus japonicus PE=2
SV=1,99.14,0,Glyco_hydro_19,Glycoside hydrolase, family 19, catalytic;
CHITINASE_19_1,Glycoside hydrolase, family,CUFF.45620.1
         (696 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC60492 similar to UniRef100_Q6RV28 Cluster: Class IV c...  1306   0.0  
gnl|LJGI|TC81316 similar to UniRef100_Q6RV28 Cluster: Class IV c...  1120   0.0  

>gnl|LJGI|TC60492 similar to UniRef100_Q6RV28 Cluster: Class IV chitinase precursor;
           n=1; Medicago truncatula|Rep: Class IV chitinase
           precursor - Medicago truncatula (Barrel medic), partial
           (72%)
          Length = 792

 Score = 1306 bits (659), Expect = 0.0
 Identities = 665/667 (99%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 30  tcatgctccacgatttgcggtagcctttgtcatgatgatgatgatggttcccaaatttgt 89
           |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2   tcatgctccacgatttgcggtagcgtttgtcatgatgatgatgatggttcccaaatttgt 61

                                                                       
Query: 90  gagagcccaaagttcagtagctgacatagtcacaccagagttcttcaatggcataattga 149
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62  gagagcccaaagttcagtagctgacatagtcacaccagagttcttcaatggcataattga 121

                                                                       
Query: 150 tcaggctgatgctagttgtgcagggaagaatttctactcacgagatgctttcctcaatgc 209
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 tcaggctgatgctagttgtgcagggaagaatttctactcacgagatgctttcctcaatgc 181

                                                                       
Query: 210 tctcaattcctacaaccaattcggtagccttgactctttggatgattctaagcgtgagat 269
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 tctcaattcctacaaccaattcggtagccttgactctttggatgattctaagcgtgagat 241

                                                                       
Query: 270 tgcagctgcttttgcccacttcacccatgaaacaggacatttttgctacatagaagagat 329
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 tgcagctgcttttgcccacttcacccatgaaacaggacatttttgctacatagaagagat 301

                                                                       
Query: 330 tgatggcgcatcaaaggactattgtgacgaaaccaacactgaatacccttgtgcacctaa 389
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 tgatggcgcatcaaaggactattgtgacgaaaccaacactgaatacccttgtgcacctaa 361

                                                                       
Query: 390 caaaggctattatgggcgtggaccaatccaactatcatggaacttcaattatggaccagc 449
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 caaaggctattatgggcgtggaccaatccaactatcatggaacttcaattatggaccagc 421

                                                                       
Query: 450 agggaagagcaacgatttcgatggattgaatgctccagagacagtggccaatgaccctgt 509
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 agggaagagcaacgatttcgatggattgaatgctccagagacagtggccaatgaccctgt 481

                                                                       
Query: 510 tgtgtccttcaagacagcactgtggtactggatgcaatttgtgcgccctgtcttgagcca 569
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 tgtgtccttcaagacagcactgtggtactggatgcaatttgtgcgccctgtcttgagcca 541

                                                                       
Query: 570 agggtttggtgcaaccattagagctatcaatggccaacttgaatgtgatggtgcgaactc 629
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 542 agggtttggtgcaaccattagagctatcaatggccaacttgaatgtgatggtgcgaactc 601

                                                                       
Query: 630 caacacagttcaagctcgagttaattactatacccaatattgttcacaactcggtgttgc 689
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 602 caacacagttcaagctcgagttaattactatacccaatattgttcacgactcggtgttgc 661

                  
Query: 690 tcctggg 696
           |||||||
Sbjct: 662 tcctggg 668


>gnl|LJGI|TC81316 similar to UniRef100_Q6RV28 Cluster: Class IV chitinase precursor;
           n=1; Medicago truncatula|Rep: Class IV chitinase
           precursor - Medicago truncatula (Barrel medic), partial
           (52%)
          Length = 672

 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0
 Identities = 565/565 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 1   atgagcatggggaataagttactgaacattcatgctccacgatttgcggtagcctttgtc 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 108 atgagcatggggaataagttactgaacattcatgctccacgatttgcggtagcctttgtc 167

                                                                       
Query: 61  atgatgatgatgatggttcccaaatttgtgagagcccaaagttcagtagctgacatagtc 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 168 atgatgatgatgatggttcccaaatttgtgagagcccaaagttcagtagctgacatagtc 227

                                                                       
Query: 121 acaccagagttcttcaatggcataattgatcaggctgatgctagttgtgcagggaagaat 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 228 acaccagagttcttcaatggcataattgatcaggctgatgctagttgtgcagggaagaat 287

                                                                       
Query: 181 ttctactcacgagatgctttcctcaatgctctcaattcctacaaccaattcggtagcctt 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 288 ttctactcacgagatgctttcctcaatgctctcaattcctacaaccaattcggtagcctt 347

                                                                       
Query: 241 gactctttggatgattctaagcgtgagattgcagctgcttttgcccacttcacccatgaa 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 348 gactctttggatgattctaagcgtgagattgcagctgcttttgcccacttcacccatgaa 407

                                                                       
Query: 301 acaggacatttttgctacatagaagagattgatggcgcatcaaaggactattgtgacgaa 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 408 acaggacatttttgctacatagaagagattgatggcgcatcaaaggactattgtgacgaa 467

                                                                       
Query: 361 accaacactgaatacccttgtgcacctaacaaaggctattatgggcgtggaccaatccaa 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 468 accaacactgaatacccttgtgcacctaacaaaggctattatgggcgtggaccaatccaa 527

                                                                       
Query: 421 ctatcatggaacttcaattatggaccagcagggaagagcaacgatttcgatggattgaat 480
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 528 ctatcatggaacttcaattatggaccagcagggaagagcaacgatttcgatggattgaat 587

                                                                       
Query: 481 gctccagagacagtggccaatgaccctgttgtgtccttcaagacagcactgtggtactgg 540
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 588 gctccagagacagtggccaatgaccctgttgtgtccttcaagacagcactgtggtactgg 647

                                    
Query: 541 atgcaatttgtgcgccctgtcttga 565
           |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 648 atgcaatttgtgcgccctgtcttga 672