Miyakogusa Predicted Gene
- Lj3g3v2812190.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj3g3v2812190.1 CUFF.44742.1
(1365 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC61687 similar to UniRef100_Q93VK1 Cluster: AT4g28450/... 2633 0.0
>gnl|LJGI|TC61687 similar to UniRef100_Q93VK1 Cluster: AT4g28450/F20O9_130; n=1;
Arabidopsis thaliana|Rep: AT4g28450/F20O9_130 -
Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress), complete
Length = 1839
Score = 2633 bits (1328), Expect = 0.0
Identities = 1355/1365 (99%), Gaps = 1/1365 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgaaggtcaaagtcatatcacgctctgtagatgagttcacccgagaacgaagccaagac 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 126 atgaaggtcaaagtcatatcacgctctgtagatgagttcacccgagaacgaagccaagac 185
Query: 61 cttcagagggtattccacaattttgatcccatccttcgtcctcaagagaaggcggtggag 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 186 cttcagagggtattccacaattttgatcccatccttcgtcctcaagagaaggcggtggag 245
Query: 121 tatgtacgtgctttaaatgcagtcaaattggacaagattttcgcaagaccgtttataggg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 246 tatgtacgtgctttaaatgcagtcaaattggacaagattttcgcaagaccgtttataggg 305
Query: 181 gcaatggatgggcatatagacgcggtttcatgtatggctaaggaccctagtcagttgaaa 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 306 gcaatggatgggcatatagacgcggtttcatgtatggcgaaggaccctagtcagttgaaa 365
Query: 241 catatattctcaggttcaatggatggagatattcgactctgggatatagcttcaagacgg 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 366 catatattctcaggttcaatggatggagatattcgactctgggatatagcttcaagacgg 425
Query: 301 actgtttatcaatttcccggtcaccaaggtgctgtgcgaggcctgactgtatctacagat 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 426 actgtttatcaatttcccggtcaccaaggtgctgtgcgaggcctgactgtatctacagat 485
Query: 361 ggacgtattctcgtgtcatgtggaactgattgcactgtcagactatggaatgttcctgtt 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 486 ggacgtattctcgtgtcatgtggaactgattgcactgtcagactatggaatgttcctgtt 545
Query: 421 gatactcttatggactcagatgactcaactaagaatactgttgagccggcaagtgtttat 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 546 gatactcttatggactcagatgactcaactaagaatactgttgagccggcaagtgtttat 605
Query: 481 gttttgaagaatgccttttgggctgctgatcaccagtgggagggtgagctttttgccaca 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 606 gttttgaagaatgccttttgggctgctgatcaccagtgggagg-tgagctttttgccaca 664
Query: 541 gctggtgctcaaatagatatatggaatcacaacaggtctcagccaataaatagttttaca 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 665 gctggtgctcaaatagatatatggaatcacaacaggtctcagccaataaatagttttaca 724
Query: 601 tggggatcagatactacaatttctgttcggtttaatccgggagaaccaaatctcttggca 660
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 725 tggggatcagatactacaatttctgttcggtttagtccgggagaaccaaatctcttggca 784
Query: 661 gcctcaactagtggcgggagcaggagcataattctgtatgatatacgtatggcttctcca 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 785 gcctcaactagtggcgggagcaggagcataattctgtatgatatacgtatggcttctcca 844
Query: 721 gtgaggaaaatgatgatggagacaaaaaccaattctatatcttggaacccaatggaaccc 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 845 gtgaggaaaatgatgatggagacaaaaaccaattctatatcttggaacccaatggaaccc 904
Query: 781 ttaaattttacggctgcaaatgaagatggaaactgctatagctatgatgctaggaagttg 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 905 ttaaattttacggctgcaaatgaagatggaaactgctatagctatgatgctaggaagttg 964
Query: 841 gatgaagccaaatgtgttcacaaagatcacgtttttccagtgttggacattgactactca 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 965 gatgaagccaaatgtgttcacaaagatcacgtttttccagtgttggacattgactactca 1024
Query: 901 ccaactggccgagagtttgtcactggatcttatgatagaacattgagactgttcccgtat 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1025 ccaactggccgagagtttgtcactggatcttatgatagaacattgagactgttcccgtat 1084
Query: 961 aatggtggtcatagcaaggagatttatcatactaagagaatgcaaagggtattctgtgtc 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1085 aatggtggtcatagcaaggagatttatcatactaagagaatgcaaagggtattctgtgtc 1144
Query: 1021 aagttcagcggtgatggaagttacgtgatttctggcagtgatgacactaacctcaggctt 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1145 aagttcagcggtgatggaagttacgtgatttctggcagtgatgacactaacctcaggctt 1204
Query: 1081 tggaaggcaaaagcatcagaacaacttggagtgattctcccaagggaacagaagaaacat 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1205 tggaaggcaaaagcatcagaacaacttggagtgattctcccaagggaacagaagaaacat 1264
Query: 1141 gattattacgaggccataaagaaacgctacaagcacctccctgatattaaaagaattgat 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1265 gattattacgaggccataaagaaacgctacaagcacctccctgatattaaaagaattgat 1324
Query: 1201 aggcataggcacttgccaaaaccagtatacaaagctgctgctgaggcacgtattagggcg 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1325 aggcataggcacttgccaaaaccagtatacaaagctgctgctgaggcacgtattagggcg 1384
Query: 1261 gattctaagagaagaaaagaacaaaggaggaaagctcacagtgccccaggaagtgttaca 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1385 gattctaagagaagaaaagaacaaaggaggaaagctcacagtgccccaggaagtgttaca 1444
Query: 1321 acacagccattacggnnnnnnngaattatctctgaagttgagtaa 1365
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1445 acacagccattacggaaaaaaagaattatctctgaagttgagtaa 1489