Miyakogusa Predicted Gene
- Lj2g3v3339150.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj2g3v3339150.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1JJS2|I1JJS2_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=Gma.5229 PE=,72.47,0,WD
REPEAT PROTEIN,NULL; WD_REPEATS_1,WD40 repeat, conserved site; WD40
repeats,WD40 repeat; WD40 rep,CUFF.40085.1
(1476 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC66761 similar to UniRef100_A7QE81 Cluster: Chromosome... 2926 0.0
>gnl|LJGI|TC66761 similar to UniRef100_A7QE81 Cluster: Chromosome chr4 scaffold_83,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr4 scaffold_83, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (94%)
Length = 1869
Score = 2926 bits (1476), Expect = 0.0
Identities = 1476/1476 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgattgcggcaatttcatggataccgaaaggtgcatcgaaggcggaacccgttctcgct 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 82 atgattgcggcaatttcatggataccgaaaggtgcatcgaaggcggaacccgttctcgct 141
Query: 61 gcacctccttccaaggaagaagttgaagaactcatcaccctccacgctcagagtgtgatg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 142 gcacctccttccaaggaagaagttgaagaactcatcaccctccacgctcagagtgtgatg 201
Query: 121 gaggaagagagtgataatgaagatgagatggtggatgaaggtgataccagcaacaacaaa 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 202 gaggaagagagtgataatgaagatgagatggtggatgaaggtgataccagcaacaacaaa 261
Query: 181 cacagtgaagaagttgcgcaggcattagccgtcgcgaatgctattggcaaaacctccacg 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 262 cacagtgaagaagttgcgcaggcattagccgtcgcgaatgctattggcaaaacctccacg 321
Query: 241 gatcaatatgacgatattgcccttgccctcaaggccctcaacatggataattatgatgat 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 322 gatcaatatgacgatattgcccttgccctcaaggccctcaacatggataattatgatgat 381
Query: 301 gaggaagatggagtggagctatttagttctggggttggtgatctttactatggaagcaac 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 382 gaggaagatggagtggagctatttagttctggggttggtgatctttactatggaagcaac 441
Query: 361 gaagaggacccatatatcaaagataaaaatgatgatgatgaggaagagcttgaagatttg 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 442 gaagaggacccatatatcaaagataaaaatgatgatgatgaggaagagcttgaagatttg 501
Query: 421 atcattcatccgactgattcggtcattgtttgtgcgcgttatgaggatgacctcaatctt 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 502 atcattcatccgactgattcggtcattgtttgtgcgcgttatgaggatgacctcaatctt 561
Query: 481 cttgaggtttggatactagaggatgccggtacacctgaaatgaacacgtatactcatcat 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 562 cttgaggtttggatactagaggatgccggtacacctgaaatgaacacgtatactcatcat 621
Query: 541 gatatcataattccagcatttcccctctgcactgcttggcttgactgcccccttaaagga 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 622 gatatcataattccagcatttcccctctgcactgcttggcttgactgcccccttaaagga 681
Query: 601 ggagaaaaagggaacttcttagctgttggatcaatggaaccttccatagaaatttgggac 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 682 ggagaaaaagggaacttcttagctgttggatcaatggaaccttccatagaaatttgggac 741
Query: 661 cttgatgttcttgatgaggttcagccatgcgtggtgttgggtggcattgagaaaaagaaa 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 742 cttgatgttcttgatgaggttcagccatgcgtggtgttgggtggcattgagaaaaagaaa 801
Query: 721 aaggggaaagcagggacaaagaaatcaatcaaatacaaagatggcagtcacactgactca 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 802 aaggggaaagcagggacaaagaaatcaatcaaatacaaagatggcagtcacactgactca 861
Query: 781 gtacttggtcttgcatggaacaaggagtacaggaatatacttgcaagtgccagtgctgac 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 862 gtacttggtcttgcatggaacaaggagtacaggaatatacttgcaagtgccagtgctgac 921
Query: 841 aagcgagtaaagatttgggatgttgttgctgagaagtgtgatattacgatggagcaccac 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 922 aagcgagtaaagatttgggatgttgttgctgagaagtgtgatattacgatggagcaccac 981
Query: 901 actgacaaggttcaagcagttgcttggaatcattttcaaccccaggttcttcttactggt 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 982 actgacaaggttcaagcagttgcttggaatcattttcaaccccaggttcttcttactggt 1041
Query: 961 tcgtttgatcatactgttgccttgaaggatggaaggatgccatcacattctggctatagg 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1042 tcgtttgatcatactgttgccttgaaggatggaaggatgccatcacattctggctatagg 1101
Query: 1021 tggtcagtcaattctgatgtagaaagcttggcatgggatcctcacacagaacactctttt 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1102 tggtcagtcaattctgatgtagaaagcttggcatgggatcctcacacagaacactctttt 1161
Query: 1081 gtggtgagtcttgatgatggcactgtcaagtgttttgatattcgaactgcccagtctaat 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1162 gtggtgagtcttgatgatggcactgtcaagtgttttgatattcgaactgcccagtctaat 1221
Query: 1141 cccacatctgagctgagttctgcagcttctacttttaccctccatgcacatgacaaagct 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1222 cccacatctgagctgagttctgcagcttctacttttaccctccatgcacatgacaaagct 1281
Query: 1201 gttacctcagtatcctataatccgtcagcacccaatcttcttgccactggatccatggac 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1282 gttacctcagtatcctataatccgtcagcacccaatcttcttgccactggatccatggac 1341
Query: 1261 aaaacggtaaagctttgggatttgtcgaacaaccaaccatcttgtgtagcatcaaaaaat 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1342 aaaacggtaaagctttgggatttgtcgaacaaccaaccatcttgtgtagcatcaaaaaat 1401
Query: 1321 ccgaaagtaggggctgtgttttctgttgttttctcacaggataaccccttcttgttggct 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1402 ccgaaagtaggggctgtgttttctgttgttttctcacaggataaccccttcttgttggct 1461
Query: 1381 attggaggctcgaagggagacttggatgtatggaacaccttatctgaatccggggtctct 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1462 attggaggctcgaagggagacttggatgtatggaacaccttatctgaatccggggtctct 1521
Query: 1441 caaagatttaagaatagaactcaatctgcgtcttga 1476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1522 caaagatttaagaatagaactcaatctgcgtcttga 1557