Miyakogusa Predicted Gene
- Lj2g3v0834810.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj2g3v0834810.1 Non Chatacterized Hit- tr|H9WD81|H9WD81_PINTA
Uncharacterized protein (Fragment) OS=Pinus taeda
GN=0,54.93,2e-17,seg,NULL; SUBFAMILY NOT NAMED,NULL; FAMILY NOT
NAMED,NULL; DUF1675,Protein of unknown function DUF16,CUFF.35534.1
(1464 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC58880 similar to UniRef100_A7PEJ7 Cluster: Chromosome... 1869 0.0
gnl|LJGI|GO037717 1043 0.0
gnl|LJGI|TC61265 886 0.0
>gnl|LJGI|TC58880 similar to UniRef100_A7PEJ7 Cluster: Chromosome chr11 scaffold_13,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr11 scaffold_13, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (27%)
Length = 1151
Score = 1869 bits (943), Expect = 0.0
Identities = 943/943 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggaagatgatggtgggcttgagctcagtttgggtttatcttgtggtagctcatcagtc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 209 atggaagatgatggtgggcttgagctcagtttgggtttatcttgtggtagctcatcagtc 268
Query: 61 aagccgaaaaataagaatggtagctccttggatcttagagcagaagaagttggtaaaggg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 269 aagccgaaaaataagaatggtagctccttggatcttagagcagaagaagttggtaaaggg 328
Query: 121 aacaagatggctgatgactttaagagcatatttgataccgataagccagattcaatcact 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 329 aacaagatggctgatgactttaagagcatatttgataccgataagccagattcaatcact 388
Query: 181 ggcactcgaagaaatgagtcttcaaagcctgaggagaatttctttagtgacctttcaaag 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 389 ggcactcgaagaaatgagtcttcaaagcctgaggagaatttctttagtgacctttcaaag 448
Query: 241 gttaaagaagataatacctctttgaatttaaatgcgagaggatttctgggtgcaaacagt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 449 gttaaagaagataatacctctttgaatttaaatgcgagaggatttctgggtgcaaacagt 508
Query: 301 agtagacctattgaaatcgaggaagataaacggttggaaacagtaagtaagcggaaaata 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 509 agtagacctattgaaatcgaggaagataaacggttggaaacagtaagtaagcggaaaata 568
Query: 361 tctttcgatgagatacgtaatcaaaagaagcatgacagcgatgttcatcatactgattta 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 569 tctttcgatgagatacgtaatcaaaagaagcatgacagcgatgttcatcatactgattta 628
Query: 421 catgacaggacaagaacatctcacatttctgtaacagaagatggctcaactgcagaaaat 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 629 catgacaggacaagaacatctcacatttctgtaacagaagatggctcaactgcagaaaat 688
Query: 481 gaagatgtggctgattctgaagctgagaactccacctccaggcctctctcacaccatagt 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 689 gaagatgtggctgattctgaagctgagaactccacctccaggcctctctcacaccatagt 748
Query: 541 gatggttccaaaggattcatcagagttggtgctactagtgatgctccaaaagaggttcgt 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 749 gatggttccaaaggattcatcagagttggtgctactagtgatgctccaaaagaggttcgt 808
Query: 601 ggagttgctgactccaatgccactgattttaatgggcagaagagatttattgggtcatca 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 809 ggagttgctgactccaatgccactgattttaatgggcagaagagatttattgggtcatca 868
Query: 661 gaaaaagattttaaacatgcaaacatgacttatggtgcttccttctctgttcaacctatt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 869 gaaaaagattttaaacatgcaaacatgacttatggtgcttccttctctgttcaacctatt 928
Query: 721 aatatgaatatgccttacccttctccagttaaagagtccaactctgtcggggcaccaagc 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 929 aatatgaatatgccttacccttctccagttaaagagtccaactctgtcggggcaccaagc 988
Query: 781 cctcaaattcctggaatgatgcatatgatgtctacagctactggtgaccgcacaggagcc 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 989 cctcaaattcctggaatgatgcatatgatgtctacagctactggtgaccgcacaggagcc 1048
Query: 841 caatctgtgaataatgggaacttgccagctatgtttggatatcctcctgttcagcttccc 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1049 caatctgtgaataatgggaacttgccagctatgtttggatatcctcctgttcagcttccc 1108
Query: 901 atgttggataaggatagctcatggggtttgggttctcgccctc 943
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1109 atgttggataaggatagctcatggggtttgggttctcgccctc 1151
>gnl|LJGI|GO037717
Length = 531
Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0
Identities = 526/526 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 932 gttctcgccctcaacagttacacccttcctttgttgggagaggtccaactaacccagctt 991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 531 gttctcgccctcaacagttacacccttcctttgttgggagaggtccaactaacccagctt 472
Query: 992 ctctacacatgatgtcaaacaatatatctgaggctgtgccatatgagggaaggccgctag 1051
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 471 ctctacacatgatgtcaaacaatatatctgaggctgtgccatatgagggaaggccgctag 412
Query: 1052 aacgactcaaaggagatggaaaacagcgcgtcactgaagatggctcctcttcacaacatg 1111
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 411 aacgactcaaaggagatggaaaacagcgcgtcactgaagatggctcctcttcacaacatg 352
Query: 1112 aagacgtaaaaggaagtagcaccaacctcagggccaaagatgtatcagaccagccaaaag 1171
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 351 aagacgtaaaaggaagtagcaccaacctcagggccaaagatgtatcagaccagccaaaag 292
Query: 1172 gagaaggctccgctgttgatttttcaaatattaagccaggtcttgctgcagatgtgaaat 1231
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 291 gagaaggctccgctgttgatttttcaaatattaagccaggtcttgctgcagatgtgaaat 232
Query: 1232 ttggcggaggtggttcctatccaaatctgccttgggtatccacctcaggttcaggcccaa 1291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 231 ttggcggaggtggttcctatccaaatctgccttgggtatccacctcaggttcaggcccaa 172
Query: 1292 atggaaggacaatatctggtgttacttacagatacagctctaaccaaatcaggatagtct 1351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 171 atggaaggacaatatctggtgttacttacagatacagctctaaccaaatcaggatagtct 112
Query: 1352 gtgcatgccatgggacccacctgacccctgaggagtttgttcgccatgcaagtgatgaca 1411
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 111 gtgcatgccatgggacccacctgacccctgaggagtttgttcgccatgcaagtgatgaca 52
Query: 1412 aagccaatcaagagggaaatgcagttttggggtcggtacctaatgg 1457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 51 aagccaatcaagagggaaatgcagttttggggtcggtacctaatgg 6
>gnl|LJGI|TC61265
Length = 729
Score = 886 bits (447), Expect = 0.0
Identities = 447/447 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1011 caatatatctgaggctgtgccatatgagggaaggccgctagaacgactcaaaggagatgg 1070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 caatatatctgaggctgtgccatatgagggaaggccgctagaacgactcaaaggagatgg 61
Query: 1071 aaaacagcgcgtcactgaagatggctcctcttcacaacatgaagacgtaaaaggaagtag 1130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 aaaacagcgcgtcactgaagatggctcctcttcacaacatgaagacgtaaaaggaagtag 121
Query: 1131 caccaacctcagggccaaagatgtatcagaccagccaaaaggagaaggctccgctgttga 1190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 caccaacctcagggccaaagatgtatcagaccagccaaaaggagaaggctccgctgttga 181
Query: 1191 tttttcaaatattaagccaggtcttgctgcagatgtgaaatttggcggaggtggttccta 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 tttttcaaatattaagccaggtcttgctgcagatgtgaaatttggcggaggtggttccta 241
Query: 1251 tccaaatctgccttgggtatccacctcaggttcaggcccaaatggaaggacaatatctgg 1310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 tccaaatctgccttgggtatccacctcaggttcaggcccaaatggaaggacaatatctgg 301
Query: 1311 tgttacttacagatacagctctaaccaaatcaggatagtctgtgcatgccatgggaccca 1370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 tgttacttacagatacagctctaaccaaatcaggatagtctgtgcatgccatgggaccca 361
Query: 1371 cctgacccctgaggagtttgttcgccatgcaagtgatgacaaagccaatcaagagggaaa 1430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 cctgacccctgaggagtttgttcgccatgcaagtgatgacaaagccaatcaagagggaaa 421
Query: 1431 tgcagttttggggtcggtacctaatgg 1457
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 tgcagttttggggtcggtacctaatgg 448