Result of FASTA (ccds) for pF1KA0672
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0672, 818 aa
  1>>>pF1KA0672 818 - 818 aa - 818 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.0004+/-0.00123; mu= -21.2166+/- 0.074
 mean_var=644.2867+/-131.839, 0's: 0 Z-trim(115.5): 121  B-trim: 0 in 0/54
 Lambda= 0.050528
 statistics sampled from 15971 (16078) to 15971 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.767), E-opt: 0.2 (0.494), width:  16
 Scan time:  5.060

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS45616.1 ARHGAP44 gene_id:9912|Hs108|chr17      ( 818) 5428 411.1 3.8e-114
CCDS82077.1 ARHGAP44 gene_id:9912|Hs108|chr17      ( 812) 5371 406.9 6.8e-113
CCDS82076.1 ARHGAP44 gene_id:9912|Hs108|chr17      ( 774) 5133 389.6 1.1e-107
CCDS32408.1 ARHGAP17 gene_id:55114|Hs108|chr16     ( 803) 2325 184.9 4.7e-46
CCDS32409.1 ARHGAP17 gene_id:55114|Hs108|chr16     ( 881) 2193 175.3   4e-43
CCDS13952.2 SH3BP1 gene_id:23616|Hs108|chr22       ( 701)  872 78.9 3.2e-14


>>CCDS45616.1 ARHGAP44 gene_id:9912|Hs108|chr17           (818 aa)
 initn: 5428 init1: 5428 opt: 5428  Z-score: 2162.7  bits: 411.1 E(32554): 3.8e-114
Smith-Waterman score: 5428; 99.9% identity (99.9% similar) in 818 aa overlap (1-818:1-818)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MKKQFNRMRQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQVEKRLELVKQVSHSTHKKLTACLQGQQGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MKKQFNRMRQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQVEKRLELVKQVSHSTHKKLTACLQGQQGA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 EADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVERDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVERDV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 IEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSLQPAGAKADALR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSLQPAGAKADALR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 EEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHRKSLTLLQAVLPQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHRKSLTLLQAVLPQI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 KAQQEAWVEKPSFGKPLEEHLTISGREIAFPIEACVTMLLECGMQEEGLFRVAPSASKLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KAQQEAWVEKPSFGKPLEEHLTISGREIAFPIEACVTMLLECGMQEEGLFRVAPSASKLK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 KLKAALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALKSYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KLKAALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALKSYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 QALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKLSEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKLSEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNIT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 EMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGEIEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGEIEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 DRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDGLRKIQSMGVRVMDTNWVARRGSSAGRKVSCAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDGLRKIQSMGVRVMDTNWVARRGSSAGRKVSCAP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 PSMQPPAPPAELAAPLPSPLPEQPLDSPAAPALSPSGLGLQPGPERTSTTKSKELSPGSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PSMQPPAPPAELAAPLPSPLPEQPLDSPAAPALSPSGLGLQPGPERTSTTKSKELSPGSA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 QKGSPGSSQGTACAGTQPGAQPGAQPGASPSPSQPPADQSPHTLRKVSKKLAPIPPKVPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QKGSPGSSQGTACAGTQPGAQPGAQPGASPSPSQPPADQSPHTLRKVSKKLAPIPPKVPF
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 GQPGAMADQSAGQLSPVSLSPTPPSTPSPYGLSYPQGYSLASGQLSPAAAPPLASPSVFT
       ::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GQPGAMADQSAGQPSPVSLSPTPPSTPSPYGLSYPQGYSLASGQLSPAAAPPLASPSVFT
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 STLSKSRPTPKPRQRPTLPPPQPPTVNLSASSPQSTEAPMLDGMSPGESMSTDLVHFDIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 STLSKSRPTPKPRQRPTLPPPQPPTVNLSASSPQSTEAPMLDGMSPGESMSTDLVHFDIP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810        
pF1KA0 SIHIELGSTLRLSPLEHMRRHSVTDKRDSEEESESTAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SIHIELGSTLRLSPLEHMRRHSVTDKRDSEEESESTAL
              790       800       810        

>>CCDS82077.1 ARHGAP44 gene_id:9912|Hs108|chr17           (812 aa)
 initn: 3416 init1: 3335 opt: 5371  Z-score: 2140.3  bits: 406.9 E(32554): 6.8e-113
Smith-Waterman score: 5371; 99.1% identity (99.1% similar) in 818 aa overlap (1-818:1-812)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MKKQFNRMRQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQVEKRLELVKQVSHSTHKKLTACLQGQQGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MKKQFNRMRQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQVEKRLELVKQVSHSTHKKLTACLQGQQGA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 EADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVERDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVERDV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 IEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSLQPAGAKADALR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSLQPAGAKADALR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 EEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHRKSLTLLQAVLPQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHRKSLTLLQAVLPQI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 KAQQEAWVEKPSFGKPLEEHLTISGREIAFPIEACVTMLLECGMQEEGLFRVAPSASKLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KAQQEAWVEKPSFGKPLEEHLTISGREIAFPIEACVTMLLECGMQEEGLFRVAPSASKLK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 KLKAALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALKSYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KLKAALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALKSYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 QALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKLSEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKLSEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNIT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 EMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGEIEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGEIEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 DRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDGLRKIQSMGVRVMDTNWVARRGSSAGRKVSCAP
       ::::::::::::::::::::::::::::      ::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 DRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDG------MGVRVMDTNWVARRGSSAGRKVSCAP
              490       500             510       520       530    

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 PSMQPPAPPAELAAPLPSPLPEQPLDSPAAPALSPSGLGLQPGPERTSTTKSKELSPGSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PSMQPPAPPAELAAPLPSPLPEQPLDSPAAPALSPSGLGLQPGPERTSTTKSKELSPGSA
          540       550       560       570       580       590    

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 QKGSPGSSQGTACAGTQPGAQPGAQPGASPSPSQPPADQSPHTLRKVSKKLAPIPPKVPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QKGSPGSSQGTACAGTQPGAQPGAQPGASPSPSQPPADQSPHTLRKVSKKLAPIPPKVPF
          600       610       620       630       640       650    

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 GQPGAMADQSAGQLSPVSLSPTPPSTPSPYGLSYPQGYSLASGQLSPAAAPPLASPSVFT
       ::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GQPGAMADQSAGQPSPVSLSPTPPSTPSPYGLSYPQGYSLASGQLSPAAAPPLASPSVFT
          660       670       680       690       700       710    

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 STLSKSRPTPKPRQRPTLPPPQPPTVNLSASSPQSTEAPMLDGMSPGESMSTDLVHFDIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 STLSKSRPTPKPRQRPTLPPPQPPTVNLSASSPQSTEAPMLDGMSPGESMSTDLVHFDIP
          720       730       740       750       760       770    

              790       800       810        
pF1KA0 SIHIELGSTLRLSPLEHMRRHSVTDKRDSEEESESTAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SIHIELGSTLRLSPLEHMRRHSVTDKRDSEEESESTAL
          780       790       800       810  

>>CCDS82076.1 ARHGAP44 gene_id:9912|Hs108|chr17           (774 aa)
 initn: 5133 init1: 5133 opt: 5133  Z-score: 2046.8  bits: 389.6 E(32554): 1.1e-107
Smith-Waterman score: 5133; 99.9% identity (99.9% similar) in 772 aa overlap (1-772:1-772)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MKKQFNRMRQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQVEKRLELVKQVSHSTHKKLTACLQGQQGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MKKQFNRMRQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQVEKRLELVKQVSHSTHKKLTACLQGQQGA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 EADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVERDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVERDV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 IEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSLQPAGAKADALR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSLQPAGAKADALR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 EEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHRKSLTLLQAVLPQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHRKSLTLLQAVLPQI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 KAQQEAWVEKPSFGKPLEEHLTISGREIAFPIEACVTMLLECGMQEEGLFRVAPSASKLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KAQQEAWVEKPSFGKPLEEHLTISGREIAFPIEACVTMLLECGMQEEGLFRVAPSASKLK
              250       260       270       280       290       300

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pF1KA0 KLKAALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALKSYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KLKAALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALKSYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 QALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKLSEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKLSEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNIT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 EMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGEIEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGEIEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 DRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDGLRKIQSMGVRVMDTNWVARRGSSAGRKVSCAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 DRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDGLRKIQSMGVRVMDTNWVARRGSSAGRKVSCAP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 PSMQPPAPPAELAAPLPSPLPEQPLDSPAAPALSPSGLGLQPGPERTSTTKSKELSPGSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PSMQPPAPPAELAAPLPSPLPEQPLDSPAAPALSPSGLGLQPGPERTSTTKSKELSPGSA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 QKGSPGSSQGTACAGTQPGAQPGAQPGASPSPSQPPADQSPHTLRKVSKKLAPIPPKVPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QKGSPGSSQGTACAGTQPGAQPGAQPGASPSPSQPPADQSPHTLRKVSKKLAPIPPKVPF
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 GQPGAMADQSAGQLSPVSLSPTPPSTPSPYGLSYPQGYSLASGQLSPAAAPPLASPSVFT
       ::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GQPGAMADQSAGQPSPVSLSPTPPSTPSPYGLSYPQGYSLASGQLSPAAAPPLASPSVFT
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 STLSKSRPTPKPRQRPTLPPPQPPTVNLSASSPQSTEAPMLDGMSPGESMSTDLVHFDIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::        
CCDS82 STLSKSRPTPKPRQRPTLPPPQPPTVNLSASSPQSTEAPMLDGMSPGESMSTAV      
              730       740       750       760       770          

              790       800       810        
pF1KA0 SIHIELGSTLRLSPLEHMRRHSVTDKRDSEEESESTAL

>>CCDS32408.1 ARHGAP17 gene_id:55114|Hs108|chr16          (803 aa)
 initn: 1945 init1: 1324 opt: 2325  Z-score: 940.3  bits: 184.9 E(32554): 4.7e-46
Smith-Waterman score: 2325; 47.5% identity (73.7% similar) in 809 aa overlap (1-788:1-783)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MKKQFNRMRQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQVEKRLELVKQVSHSTHKKLTACLQGQQGA
       ::::::::.::::::::::::::::::::::.:.::. :... : .::.:.::.:::.:.
CCDS32 MKKQFNRMKQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQIERRLDTVRSICHHSHKRLVACFQGQHGT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 EADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVERDV
       .:..: ::::::.::: ..:.:. : .:.::::::. ::..:..:: :: . :. ::...
CCDS32 DAERRHKKLPLTALAQNMQEASTQL-EDSLLGKMLETCGDAENQLALELSQHEVFVEKEI
               70        80         90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 IEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSLQPAGAKADALR
       ..::. .:::::::::::::.::.:::: :: :.::.:. ::::  ...:   .: :.:.
CCDS32 VDPLYGIAEVEIPNIQKQRKQLARLVLDWDSVRARWNQAHKSSG--TNFQGLPSKIDTLK
     120       130       140       150       160         170       

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 EEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHRKSLTLLQAVLPQI
       :::.::.:.:: :.:::.::::.:.::: .:...: ::.:.::.::::.:..:. .::..
CCDS32 EEMDEAGNKVEQCKDQLAADMYNFMAKEGEYGKFFVTLLEAQADYHRKALAVLEKTLPEM
       180       190       200       210       220       230       

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 KAQQEAWVEKPSFGKPLEEHLTISGREIAFPIEACVTMLLECGMQEEGLFRVAPSASKLK
       .:.:. :.:::.:: ::::::  ::::::.:::::: .::: ::.::::::.. .:::::
CCDS32 RAHQDKWAEKPAFGTPLEEHLKRSGREIALPIEACVMLLLETGMKEEGLFRIGAGASKLK
       240       250       260       270       280       290       

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 KLKAALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALKSYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKL
       :::::::: .  ..:. .::::.::::::::::::::::::.::.:: :...::.:::::
CCDS32 KLKAALDCSTSHLDEFYSDPHAVAGALKSYLRELPEPLMTFNLYEEWTQVASVQDQDKKL
       300       310       320       330       340       350       

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 QALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKLSEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNIT
       : :: .:.:::  :  :.:::::::.::.. .:::::::::.:::::::::: . ::...
CCDS32 QDLWRTCQKLPPQNFVNFRYLIKFLAKLAQTSDVNKMTPSNIAIVLGPNLLWARNEGTLA
       360       370       380       390       400       410       

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 EMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGEIEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPA
       :: ...:...:..::::::::::::: :.:::..  .  :. .. ..:.:   . : : .
CCDS32 EMAAATSVHVVAVIEPIIQHADWFFPEEVEFNVSEAF-VPL-TTPSSNHSFHTGNDSDSG
       420       430       440       450         460       470     

              490       500       510          520              530
pF1KA0 DRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDGLRKIQ---SMGVRVMDTN--WVAR-----RGS
         ..    .:: :.:.  :  .. ::..  : .   : .: .   :   .:      ...
CCDS32 TLER----KRPASMAV--MEGDLVKKESPPKPKDPVSAAVPAPGRNNSQIASGQNQPQAA
             480         490       500       510       520         

              540       550         560       570         580      
pF1KA0 SAGRKVSCAPPSMQPPAPPAEL--AAPLPSPLPEQPLDSPAA-PA-LSPSGLGLQPGPER
       ......: . :       :  :  :.  :.: : .: . : . :.  : :: . .: :  
CCDS32 AGSHQLSMGQPHNAAGPSPHTLRRAVKKPAPAPPKPGNPPPGHPGGQSSSGTSQHP-PSL
     530       540       550       560       570       580         

        590       600       610       620        630         640   
pF1KA0 TSTTKSKELSPGSAQKGSPGSSQGTACAGTQPGAQPGA-QPGASPS--PSQPPADQSP--
       .    ..  :: . . :.: .. ..    . :    .. .:  .:.  : :::.. .:  
CCDS32 SPKPPTRSPSPPTQHTGQPPGQPSAPSQLSAPRRYSSSLSPIQAPNHPPPQPPTQATPLM
      590       600       610       620       630       640        

             650       660       670       680       690       700 
pF1KA0 HTLRKVSKKLAPIPPKVPFGQPGAMADQSAGQLSPVSLSPTPPSTPSPYGLSYPQGYSLA
       ::     :  .  ::. :.. :.  . .. ..  :   .::::::: : : . :   :: 
CCDS32 HT-----KPNSQGPPN-PMALPSEHGLEQPSHTPP--QTPTPPSTP-PLGKQNP---SLP
      650             660       670         680        690         

             710       720       730       740        750       760
pF1KA0 SGQLSPAAAPPLASPSVFTSTLSKSRPTPKPRQRPTLPPP-QPPTVNLSASSPQSTEAPM
       . :   .. :  :.:   ..:: . ::.::::.::..::: ::: :. ...:  .. :: 
CCDS32 APQTLAGGNPETAQPH--AGTLPRPRPVPKPRNRPSVPPPPQPPGVHSAGDSSLTNTAPT
        700       710         720       730       740       750    

              770        780       790       800       810        
pF1KA0 LDGMSPGESMSTDLVHFDI-PSIHIELGSTLRLSPLEHMRRHSVTDKRDSEEESESTAL
        . .    .  ..  : .: : .: . .:                              
CCDS32 ASKIVTDSNSRVSEPHRSIFPEMHSDSASKDVPGRILLDIDNDTESTAL          
          760       770       780       790       800             

>>CCDS32409.1 ARHGAP17 gene_id:55114|Hs108|chr16          (881 aa)
 initn: 1963 init1: 1324 opt: 2193  Z-score: 887.8  bits: 175.3 E(32554): 4e-43
Smith-Waterman score: 2432; 51.3% identity (76.0% similar) in 772 aa overlap (1-759:1-736)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MKKQFNRMRQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQVEKRLELVKQVSHSTHKKLTACLQGQQGA
       ::::::::.::::::::::::::::::::::.:.::. :... : .::.:.::.:::.:.
CCDS32 MKKQFNRMKQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQIERRLDTVRSICHHSHKRLVACFQGQHGT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 EADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVERDV
       .:..: ::::::.::: ..:.:. : .:.::::::. ::..:..:: :: . :. ::...
CCDS32 DAERRHKKLPLTALAQNMQEASTQL-EDSLLGKMLETCGDAENQLALELSQHEVFVEKEI
               70        80         90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 IEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSLQPAGAKADALR
       ..::. .:::::::::::::.::.:::: :: :.::.:. ::::  ...:   .: :.:.
CCDS32 VDPLYGIAEVEIPNIQKQRKQLARLVLDWDSVRARWNQAHKSSG--TNFQGLPSKIDTLK
     120       130       140       150       160         170       

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 EEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHRKSLTLLQAVLPQI
       :::.::.:.:: :.:::.::::.:.::: .:...: ::.:.::.::::.:..:. .::..
CCDS32 EEMDEAGNKVEQCKDQLAADMYNFMAKEGEYGKFFVTLLEAQADYHRKALAVLEKTLPEM
       180       190       200       210       220       230       

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 KAQQEAWVEKPSFGKPLEEHLTISGREIAFPIEACVTMLLECGMQEEGLFRVAPSASKLK
       .:.:. :.:::.:: ::::::  ::::::.:::::: .::: ::.::::::.. .:::::
CCDS32 RAHQDKWAEKPAFGTPLEEHLKRSGREIALPIEACVMLLLETGMKEEGLFRIGAGASKLK
       240       250       260       270       280       290       

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 KLKAALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALKSYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKL
       :::::::: .  ..:. .::::.::::::::::::::::::.::.:: :...::.:::::
CCDS32 KLKAALDCSTSHLDEFYSDPHAVAGALKSYLRELPEPLMTFNLYEEWTQVASVQDQDKKL
       300       310       320       330       340       350       

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 QALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKLSEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNIT
       : :: .:.:::  :  :.:::::::.::.. .:::::::::.:::::::::: . ::...
CCDS32 QDLWRTCQKLPPQNFVNFRYLIKFLAKLAQTSDVNKMTPSNIAIVLGPNLLWARNEGTLA
       360       370       380       390       400       410       

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 EMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGEIEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPA
       :: ...:...:..::::::::::::: :.:::..  .  :. .. ..:.:   . : : .
CCDS32 EMAAATSVHVVAVIEPIIQHADWFFPEEVEFNVSEAF-VPL-TTPSSNHSFHTGNDSDSG
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              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 DRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDGLRKIQSMGVRVMDTNWVARRGSSAGRKVSCAP
         ..    .:: :.:.  :  .. ::.      :.::..:: . . :::.. .::     
CCDS32 TLER----KRPASMAV--MEGDLVKKE------SFGVKLMDFQ-AHRRGGTLNRK--HIS
             480         490             500        510         520

              550       560       570             580       590    
pF1KA0 PSMQPPAPPAELAAPLPSPLPEQPLDSPAAPALS-----PSGLG-LQPGPERTSTTKSKE
       :..::: ::.. .. .:.  :: : .:  : . :     ::. : :. ::   . .  : 
CCDS32 PAFQPPLPPTDGSTVVPAG-PEPPPQSSRAESSSGGGTVPSSAGILEQGPSPGDGSPPKP
              530        540       550       560       570         

          600       610        620       630       640       650   
pF1KA0 LSPGSAQKGSPGSSQGTACAG-TQPGAQPGAQPGASPSPSQPPADQSPHTLRKVSKKLAP
        .: ::   .:: ...   .: .:: :  :..  .  .: .  :  ::::::.. :: ::
CCDS32 KDPVSAAVPAPGRNNSQIASGQNQPQAAAGSHQLSMGQPHNA-AGPSPHTLRRAVKKPAP
     580       590       600       610       620        630        

              660       670       680        690       700         
pF1KA0 IPPKV---PFGQPGAMADQSAGQLSPVSLSPTPPS-TPSPYGLSYPQGYSLASGQLSPAA
        :::    : :.::........:  : :::: ::. .:::      :  .   ::  :.:
CCDS32 APPKPGNPPPGHPGGQSSSGTSQ-HPPSLSPKPPTRSPSP----PTQHTGQPPGQ--PSA
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pF1KA0 APPLASPSVFTSTLSKSRPTPKPRQRPTLPPPQPPT--VNLSASSPQSTEAPMLDGMSPG
          :..:  ..:.::       : : :. :::::::  . :  ..:.:   :        
CCDS32 PSQLSAPRRYSSSLS-------PIQAPNHPPPQPPTQATPLMHTKPNSQGPPNPMALPSE
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pF1KA0 ESMSTDLVHFDIPSIHIELGSTLRLSPLEHMRRHSVTDKRDSEEESESTAL         
                                                                   
CCDS32 HGLEQPSHTPPQTPTPPSTPPLGKQNPSLPAPQTLAGGNPETAQPHAGTLPRPRPVPKPR
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pF1KA0  MKKQFNRMRQLANQ-TVGRAEKT-EVLSEDLLQVEKRLELVKQVSHSTHKKLTACLQGQ
        ::.:..::::::.  ..::. .: : :.:::::::.::: .:...:. ::.: ::::::
CCDS13 MMKRQLHRMRQLAQTGSLGRTPETAEFLGEDLLQVEQRLEPAKRAAHNIHKRLQACLQGQ
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pF1KA0 QGAEADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVE
       .::. ::: ::::: .:.  . :.   :  :. .:: :..    ...::. : .::. .:
CCDS13 SGADMDKRVKKLPLMALSTTMAESFKELDPDSSMGKALEMSCAIQNQLARILAEFEMTLE
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pF1KA0 RDVIEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSL--QPAG--
       :::..::  :.: :.: : :..: : ::: : .. ..: .:..:.:: :..:  .:..  
CCDS13 RDVLQPLSRLSEEELPAILKHKKSLQKLVSDWNTLKSRLSQATKNSGSSQGLGGSPGSHS
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pF1KA0 -----AKADALREEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHRK
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CCDS13 HTTMANKVETLKEEEEELKRKVEQCRDEYLADLYHFVTKEDSYANYFIRLLEIQADYHRR
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      230       240       250                260       270         
pF1KA0 SLTLLQAVLPQIKAQQEAWVEKPS---------FGKPLEEHLTISGREIAFPIEACVTML
       ::. :...: ... ..    ..::         .:  :  ::   :::::.:::::: ::
CCDS13 SLSSLDTALAELRENHGQADHSPSMTATHFPRVYGVSLATHLQELGREIALPIEACVMML
              250       260       270       280       290       300

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       :  ::.::::::.: .:: ::.:: ..     ...:. .::::.::::::::::::::::
CCDS13 LSEGMKEEGLFRLAAGASVLKRLKQTMASDPHSLEEFCSDPHAVAGALKSYLRELPEPLM
              310       320       330       340       350       360

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       ::.:::.:..:....:   .:::: ..: .::  : .:.:::.:::..:.: :.::::::
CCDS13 TFDLYDDWMRAASLKEPGARLQALQEVCSRLPPENLSNLRYLMKFLARLAEEQEVNKMTP
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       ::.::::::::::: . ::. ...   .. :.:.::..: .:: :: .:::.:.::..: 
CCDS13 SNIAIVLGPNLLWPPEKEGDQAQLDAASVSSIQVVGVVEALIQSADTLFPGDINFNVSGL
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pF1KA0 YG--------SPVHVNHNANYSSMPSPDMDPADRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDG
       ..        :   ....   ...:.:   ::    :  :  :                 
CCDS13 FSAVTLQDTVSDRLASEELPSTAVPTPATTPAPAPAPAPAPAP-----------------
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          . : ...    . :  : .:   ::. .::  .  ::  ..:     : : .:   :
CCDS13 --ALASAATKERTESEVPPRPASP--KVTRSPP--ETAAPVEDMARRTKRPAPARPTMPP
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CCDS13 --PQVSGS----------RSSPPAPPLPPGS---GSPGT----------PQALPRRLVGS
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       :  .:. ::                :.::  :  ::.    .  .. ::.: :: .: :.
CCDS13 SLRAPTVPP----------------PLPPTPP--QPA----RRQSRRSPASPSPASPGPA
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CCDS13 SPSPVSLSNPAQVDL--GAATAEGGAPEAISGV---------PTP-----PAIPPQPRPR
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CCDS13 SLASETN                                                     
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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