Result of FASTA (ccds) for pF1KA0348
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0348, 1496 aa
  1>>>pF1KA0348 1496 - 1496 aa - 1496 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.5740+/-0.0013; mu= -14.4850+/- 0.078
 mean_var=443.9391+/-92.251, 0's: 0 Z-trim(112.5): 49  B-trim: 38 in 1/53
 Lambda= 0.060871
 statistics sampled from 13232 (13276) to 13232 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.71), E-opt: 0.2 (0.408), width:  16
 Scan time:  5.970

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5254.1 SYNJ2 gene_id:8871|Hs108|chr6           (1496) 10062 899.4       0
CCDS54484.1 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21         (1526) 4066 372.9 4.3e-102
CCDS33540.2 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21         (1350) 3837 352.7 4.4e-96
CCDS33539.2 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21         (1612) 3823 351.5 1.2e-95
CCDS54483.1 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21         (1295) 3777 347.4 1.6e-94
CCDS35394.1 OCRL gene_id:4952|Hs108|chrX           ( 893)  663 73.9 2.5e-12
CCDS35393.1 OCRL gene_id:4952|Hs108|chrX           ( 901)  663 73.9 2.5e-12
CCDS72760.1 INPP5B gene_id:3633|Hs108|chr1         ( 749)  656 73.2 3.3e-12
CCDS41306.1 INPP5B gene_id:3633|Hs108|chr1         ( 913)  656 73.3 3.9e-12
CCDS63455.1 INPP5J gene_id:27124|Hs108|chr22       ( 639)  628 70.7 1.6e-11
CCDS63454.1 INPP5J gene_id:27124|Hs108|chr22       ( 939)  628 70.8 2.2e-11
CCDS63453.1 INPP5J gene_id:27124|Hs108|chr22       (1006)  628 70.8 2.3e-11
CCDS74847.1 INPP5J gene_id:27124|Hs108|chr22       ( 571)  619 69.9 2.5e-11
CCDS46687.1 INPP5J gene_id:27124|Hs108|chr22       ( 638)  619 69.9 2.8e-11
CCDS33745.1 SACM1L gene_id:22908|Hs108|chr3        ( 587)  598 68.1 9.3e-11


>>CCDS5254.1 SYNJ2 gene_id:8871|Hs108|chr6                (1496 aa)
 initn: 10062 init1: 10062 opt: 10062  Z-score: 4792.3  bits: 899.4 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10062; 100.0% identity (100.0% similar) in 1496 aa overlap (1-1496:1-1496)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MALSKGLRLLGRLGAEGDCSVLLEARGRDDCLLFEAGTVATLAPEEKEVIKGQYGKLTDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 MALSKGLRLLGRLGAEGDCSVLLEARGRDDCLLFEAGTVATLAPEEKEVIKGQYGKLTDA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 YGCLGELRLKSGGTSLSFLVLVTGCTSVGRIPDAEIYKITATDFYPLQEEAKEEERLIAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 YGCLGELRLKSGGTSLSFLVLVTGCTSVGRIPDAEIYKITATDFYPLQEEAKEEERLIAL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 KKILSSGVFYFSWPNDGSRFDLTVRTQKQGDDSSEWGNSFFWNQLLHVPLRQHQVSCCDW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 KKILSSGVFYFSWPNDGSRFDLTVRTQKQGDDSSEWGNSFFWNQLLHVPLRQHQVSCCDW
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 LLKIICGVVTIRTVYASHKQAKACLVSRVSCERTGTRFHTRGVNDDGHVSNFVETEQMIY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 LLKIICGVVTIRTVYASHKQAKACLVSRVSCERTGTRFHTRGVNDDGHVSNFVETEQMIY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 MDDGVSSFVQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHHLRLHRGLEANAPAFDRHMVLLKEQYGQQVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 MDDGVSSFVQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHHLRLHRGLEANAPAFDRHMVLLKEQYGQQVV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 VNLLGSRGGEEVLNRAFKKLLWASCHAGDTPMINFDFHQFAKGGKLEKLETLLRPQLKLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 VNLLGSRGGEEVLNRAFKKLLWASCHAGDTPMINFDFHQFAKGGKLEKLETLLRPQLKLH
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 WEDFDVFTKGENVSPRFQKGTLRMNCLDCLDRTNTVQSFIALEVLHLQLKTLGLSSKPIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 WEDFDVFTKGENVSPRFQKGTLRMNCLDCLDRTNTVQSFIALEVLHLQLKTLGLSSKPIV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 DRFVESFKAMWSLNGHSLSKVFTGSRALEGKAKVGKLKDGARSMSRTIQSNFFDGVKQEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 DRFVESFKAMWSLNGHSLSKVFTGSRALEGKAKVGKLKDGARSMSRTIQSNFFDGVKQEA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 IKLLLVGDVYGEEVADKGGMLLDSTALLVTPRILKAMTERQSEFTNFKRIRIAMGTWNVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 IKLLLVGDVYGEEVADKGGMLLDSTALLVTPRILKAMTERQSEFTNFKRIRIAMGTWNVN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 GGKQFRSNVLRTAELTDWLLDSPQLSGATDSQDDSSPADIFAVGFEEMVELSAGNIVNAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 GGKQFRSNVLRTAELTDWLLDSPQLSGATDSQDDSSPADIFAVGFEEMVELSAGNIVNAS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 TTNKKMWGEQLQKAISRSHRYILLTSAQLVGVCLYIFVRPYHVPFIRDVAIDTVKTGMGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 TTNKKMWGEQLQKAISRSHRYILLTSAQLVGVCLYIFVRPYHVPFIRDVAIDTVKTGMGG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 KAGNKGAVGIRFQFHSTSFCFICSHLTAGQSQVKERNEDYKEITQKLCFPMGRNVFSHDY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 KAGNKGAVGIRFQFHSTSFCFICSHLTAGQSQVKERNEDYKEITQKLCFPMGRNVFSHDY
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 VFWCGDFNYRIDLTYEEVFYFVKRQDWKKLLEFDQLQLQKSSGKIFKDFHEGAINFGPTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 VFWCGDFNYRIDLTYEEVFYFVKRQDWKKLLEFDQLQLQKSSGKIFKDFHEGAINFGPTY
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 KYDVGSAAYDTSDKCRTPAWTDRVLWWRKKHPFDKTAGELNLLDSDLDVDTKVRHTWSPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 KYDVGSAAYDTSDKCRTPAWTDRVLWWRKKHPFDKTAGELNLLDSDLDVDTKVRHTWSPG
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 ALQYYGRAELQASDHRPVLAIVEVEVQEVDVGARERVFQEVSSFQGPLDATVVVNLQSPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 ALQYYGRAELQASDHRPVLAIVEVEVQEVDVGARERVFQEVSSFQGPLDATVVVNLQSPT
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 LEEKNEFPEDLRTELMQTLGSYGTIVLVRINQGQMLVTFADSHSALSVLDVDGMKVKGRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 LEEKNEFPEDLRTELMQTLGSYGTIVLVRINQGQMLVTFADSHSALSVLDVDGMKVKGRA
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 VKIRPKTKDWLKGLREEIIRKRDSMAPVSPTANSCLLEENFDFTSLDYESEGDILEDDED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 VKIRPKTKDWLKGLREEIIRKRDSMAPVSPTANSCLLEENFDFTSLDYESEGDILEDDED
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 YLVDEFNQPGVSDSELGGDDLSDVPGPTALAPPSKSPALTKKKQHPTYKDDADLVELKRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 YLVDEFNQPGVSDSELGGDDLSDVPGPTALAPPSKSPALTKKKQHPTYKDDADLVELKRE
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA0 LEAVGEFRHRSPSRSLSVPNRPRPPQPPQRPPPPTGLMVKKSASDASISSGTHGQYSILQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 LEAVGEFRHRSPSRSLSVPNRPRPPQPPQRPPPPTGLMVKKSASDASISSGTHGQYSILQ
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA0 TARLLPGAPQQPPKARTGISKPYNVKQIKTTNAQEAEAAIRCLLEARGGASEEALSAVAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 TARLLPGAPQQPPKARTGISKPYNVKQIKTTNAQEAEAAIRCLLEARGGASEEALSAVAP
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA0 RDLEASSEPEPTPGAAKPETPQAPPLLPRRPPPRVPAIKKPTLRRTGKPLSPEEQFEQQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 RDLEASSEPEPTPGAAKPETPQAPPLLPRRPPPRVPAIKKPTLRRTGKPLSPEEQFEQQT
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA0 VHFTIGPPETSVEAPPVVTAPRVPPVPKPRTFQPGKAAERPSHRKPASDEAPPGAGASVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 VHFTIGPPETSVEAPPVVTAPRVPPVPKPRTFQPGKAAERPSHRKPASDEAPPGAGASVP
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KA0 PPLEAPPLVPKVPPRRKKSAPAAFHLQVLQSNSQLLQGLTYNSSDSPSGHPPAAGTVFPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 PPLEAPPLVPKVPPRRKKSAPAAFHLQVLQSNSQLLQGLTYNSSDSPSGHPPAAGTVFPQ
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KA0 GDFLSTSSATSPDSDGTKAMKPEAAPLLGDYQDPFWNLLHHPKLLNNTWLSKSSDPLDSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 GDFLSTSSATSPDSDGTKAMKPEAAPLLGDYQDPFWNLLHHPKLLNNTWLSKSSDPLDSG
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      
pF1KA0 TRSPKRDPIDPVSAGASAAKAELPPDHEHKTLGHWVTISDQEKRTALQVFDPLAKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 TRSPKRDPIDPVSAGASAAKAELPPDHEHKTLGHWVTISDQEKRTALQVFDPLAKT
             1450      1460      1470      1480      1490      

>>CCDS54484.1 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21              (1526 aa)
 initn: 1577 init1: 1492 opt: 4066  Z-score: 1946.4  bits: 372.9 E(32554): 4.3e-102
Smith-Waterman score: 4088; 45.1% identity (72.4% similar) in 1467 aa overlap (1-1438:1-1419)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MALSKGLRLLGRLGAEGDCSVLLEARGRDDCLLFEAGTVATLAPEEKEVIKGQYGKLTDA
       ::.:::.:.  .:      :...:.: ...::.::.:.::.:.  :::.::: :.:. ::
CCDS54 MAFSKGFRIYHKLDPP-PFSLIVETRHKEECLMFESGAVAVLSSAEKEAIKGTYSKVLDA
               10         20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 YGCLGELRLKSGGTSLSFLVLVTGCTSVGRIPDAEIYKITATDFYPLQEEAKEEERLIAL
       :: :: :::. : : : .::::::: :::.: ..:....:.:.:  :. ....:.:.  .
CCDS54 YGLLGVLRLNLGDTMLHYLVLVTGCMSVGKIQESEVFRVTSTEFISLRIDSSDEDRISEV
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 KKILSSGVFYFSWPNDGSRFDLTVRTQKQGDDSSEWGNSFFWNQLLHVPLRQHQVSCCDW
       .:.:.:: :::.:  .:  .::.. .... ....   : ::::: ::. :... :.: ::
CCDS54 RKVLNSGNFYFAWSASGISLDLSLNAHRSMQEQTT-DNRFFWNQSLHLHLKHYGVNCDDW
     120       130       140       150        160       170        

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 LLKIICGVVTIRTVYASHKQAKACLVSRVSCERTGTRFHTRGVNDDGHVSNFVETEQMIY
       ::...:: : :::.::.::::::::.::.::::.::::..::.::::::.:::::::..:
CCDS54 LLRLMCGGVEIRTIYAAHKQAKACLISRLSCERAGTRFNVRGTNDDGHVANFVETEQVVY
      180       190       200       210       220       230        

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 MDDGVSSFVQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHHLRLHRGLEANAPAFDRHMVLLKEQYGQQVV
       .::.::::.::::::::::::::::::::..:. ::.::::::::::.  ::. ::.:..
CCDS54 LDDSVSSFIQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHRVRMSRGFEANAPAFDRHFRTLKNLYGKQII
      240       250       260       270       280       290        

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 VNLLGSRGGEEVLNRAFKKLLWASCHAGDTPMINFDFHQFAKGGKLEKLETLLRPQLKLH
       ::::::. ::..:..::.. : :: ::.:  :.:::.::..:::: :::...:.::.. .
CCDS54 VNLLGSKEGEHMLSKAFQSHLKASEHAADIQMVNFDYHQMVKGGKAEKLHSVLKPQVQ-K
      300       310       320       330       340       350        

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pF1KA0 WEDFDVFTKGENVSPRFQKGTLRMNCLDCLDRTNTVQSFIALEVLHLQLKTLGLSSKP-I
       . :.  :  . .   : :.::.: ::::::::::.::.:..::.:  ::..:::. :: .
CCDS54 FLDYGFFYFNGSEVQRCQSGTVRTNCLDCLDRTNSVQAFLGLEMLAKQLEALGLAEKPQL
       360       370       380       390       400       410       

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pF1KA0 VDRFVESFKAMWSLNGHSLSKVFTGSRALEGKAKVGKLKDGARSMSRTIQSNFFDGVKQE
       : :: : :..:::.:: :.::...:. :::::::.:::::::::..::::.::::. :::
CCDS54 VTRFQEVFRSMWSVNGDSISKIYAGTGALEGKAKAGKLKDGARSVTRTIQNNFFDSSKQE
       420       430       440       450       460       470       

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pF1KA0 AIKLLLVGDVYGEEVADKGGMLLDSTALLVTPRILKAMTERQSEFTNFKRIRIAMGTWNV
       :: .::.:.. . ..:::.  :: . .: .. ..::.: :   .... :.::. .:::::
CCDS54 AIDVLLLGNTLNSDLADKARALLTTGSLRASSKVLKSMCENFYKYSKPKKIRVCVGTWNV
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pF1KA0 NGGKQFRSNVLRTAELTDWLLDSPQLSGATDSQDD-SSPADIFAVGFEEMVELSAGNIVN
       :::::::: ....  :::::::.:.:.:  . ::  :.:.::::.::::::::.:::::.
CCDS54 NGGKQFRSIAFKNQTLTDWLLDAPKLAGIQEFQDKRSKPTDIFAIGFEEMVELNAGNIVS
       540       550       560       570       580       590       

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pF1KA0 ASTTNKKMWGEQLQKAISRSHRYILLTSAQLVGVCLYIFVRPYHVPFIRDVAIDTVKTGM
       :::::.:.:. .:::.:::...:.::.: :::::::..:.:: :.:::::::.:::::::
CCDS54 ASTTNQKLWAVELQKTISRDNKYVLLASEQLVGVCLFVFIRPQHAPFIRDVAVDTVKTGM
       600       610       620       630       640       650       

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pF1KA0 GGKAGNKGAVGIRFQFHSTSFCFICSHLTAGQSQVKERNEDYKEITQKLCFPMGRNVFSH
       :: .::::::.::. ::.::.::.:::..::::::::::::. ::..:: ::::: .:::
CCDS54 GGATGNKGAVAIRMLFHTTSLCFVCSHFAAGQSQVKERNEDFIEIARKLSFPMGRMLFSH
       660       670       680       690       700       710       

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pF1KA0 DYVFWCGDFNYRIDLTYEEVFYFVKRQDWKKLLEFDQLQLQKSSGKIFKDFHEGAINFGP
       :::::::::::::::  :::  ....:.: .:.  :::  ::..:..:. : :: ..:.:
CCDS54 DYVFWCGDFNYRIDLPNEEVKELIRQQNWDSLIAGDQLINQKNAGQVFRGFLEGKVTFAP
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pF1KA0 TYKYDVGSAAYDTSDKCRTPAWTDRVLWWRKKHPFDKTAGELNLLDSDLDVDTKVRHTWS
       :::::. :  ::::.::::::::::::: :.: :::..: .:.::..... ..:. .::.
CCDS54 TYKYDLFSDDYDTSEKCRTPAWTDRVLWRRRKWPFDRSAEDLDLLNASFQDESKILYTWT
       780       790       800       810       820       830       

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pF1KA0 PGALQYYGRAELQASDHRPVLAIVEVEVQEVDVGARERVFQEVSSFQGPLDATVVVNLQS
       ::.: .::::::..::::::.:...... ::..  :. ...:: . ::: :.::.:...:
CCDS54 PGTLLHYGRAELKTSDHRPVVALIDIDIFEVEAEERQNIYKEVIAVQGPPDGTVLVSIKS
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pF1KA0 PTLEEKNEFPEDLRTELMQTLGSYGTIVLVRINQGQMLVTFADSHSALSVLDVDGMKVKG
        .: :.: : . :  ::.: ..:.: ..:.:. . .: ::: .. :::.::...: .. .
CCDS54 -SLPENNFFDDALIDELLQQFASFGEVILIRFVEDKMWVTFLEGSSALNVLSLNGKELLN
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pF1KA0 RAVKIRPKTKDWLKGLREEIIRKRDSMAPVSPTANSCLLEENFDFTSLDYESEGDILEDD
       :.. :  :. ::.:.:.::.  .. :.:  : :. : :: :. . .. :.. :::.  ::
CCDS54 RTITIALKSPDWIKNLEEEMSLEKISIALPSSTS-STLLGEDAEVAA-DFDMEGDV--DD
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pF1KA0 EDYLVDEFN----QPGVSDSELG-------------GDDLSDVPGPT-ALAP---PSKSP
        .  :.:.     ::. :.: ::             .  .:. : :.  . :   ::..:
CCDS54 YSAEVEELLPQHLQPS-SSSGLGTSPSSSPRTSPCQSPTISEGPVPSLPIRPSRAPSRTP
           1020       1030      1040      1050      1060      1070 

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pF1KA0 ALTKKKQHPTYKDDADLVELKRELEAVGEFRHRSPSRSLSVPNRPRPPQPPQRPPPPTGL
       .  . .. :   . :  .  :   . . : ..  : : .. :.::    ::::::::.: 
CCDS54 GPPSAQSSPIDAQPATPLPQKDPAQPL-EPKRPPPPRPVAPPTRP---APPQRPPPPSGR
            1080      1090       1100      1110         1120       

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pF1KA0 MVKKSASDASISSGTHGQYSILQTARLLPGAPQQPPKARTGISKPYNVKQIKTTNAQEAE
         .. . .:....   . ::   :::     :  ::.: . :: : .  . ... .. . 
CCDS54 --SQPSPQAGLAGPGPAGYS---TAR-----PTIPPRAGV-ISAPQS--HARASAGRLTP
        1130      1140              1150       1160        1170    

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pF1KA0 AAIRCLLEARGGAS--EEALSAVAPRDLEASSEPEPTPGAAKPETPQAPPLLPRRPPPRV
        .     :.  :..   : :.  :    . :: : :.    .: .: : :.    : : .
CCDS54 ESQSKTSETSKGSTFLPEPLKPQAAFPPQ-SSLPPPAQRLQEPLVPVAAPMPQSGPQPNL
         1180      1190      1200       1210      1220      1230   

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pF1KA0 PAIKKPTLR-RTGKPLSPEEQFEQQ--TVHFTIGPPETSVEAPPVVTAP-RVPPVPKPRT
        .  .:  : :... :  : . . :  :  .. :  :. ..  :       .  : : . 
CCDS54 ETPPQPPPRSRSSHSLPSEASSQPQVKTNGISDGKRESPLKIDPFEDLSFNLLAVSKAQL
          1240      1250      1260      1270      1280      1290   

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pF1KA0 FQPGKAAERPSHRKPASDEAPPGAGASVPPPLEAPPLVPKVPPRRKKSAPAAFHLQVLQS
           . .  :. ..    . : .. ..:   .   : .: .: : ...       .. .:
CCDS54 SVQTSPVPTPDPKRLI--QLPSATQSNVLSSVSCMPTMPPIPARSQSQE------NMRSS
          1300        1310      1320      1330      1340           

            1360      1370      1380      1390      1400      1410 
pF1KA0 NSQLLQGLTYNSSDSPSGHPPAAGTVFPQGDFLSTSSATSPDSDGTKAMKPEAAPLLGDY
        . .. ::: ..       : .  :. : . :     : : .:..:. .. :    .. .
CCDS54 PNPFITGLTRTN-------PFSDRTAAPGNPF----RAKSEESEATSWFSKEEPVTISPF
        1350             1360      1370          1380      1390    

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pF1KA0 QDPFWNLLHHPKLLNNTWLSKSSDPLDSGTRSPKRDPIDPVSAGASAAKAELPPDHEHKT
         :  . : : :   .. :.  .: .:                                 
CCDS54 --PSLQPLGHNKSRASSSLDGFKDSFDLQGQSTLKISNPKGWVTFEEEEDFGVKGKSKSA
           1400      1410      1420      1430      1440      1450  

>>CCDS33540.2 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21              (1350 aa)
 initn: 3460 init1: 1484 opt: 3837  Z-score: 1838.5  bits: 352.7 E(32554): 4.4e-96
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pF1KA0                               MALSKGLRLLGRLGAEGDCSVLLEARGRDD
                                     ::.:::.:.  .:      :...:.: ...
CCDS33 GSDAPGGCGGGCGRRRRRSRRKRAASEERRMAFSKGFRIYHKLDPP-PFSLIVETRHKEE
      10        20        30        40        50         60        

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pF1KA0 CLLFEAGTVATLAPEEKEVIKGQYGKLTDAYGCLGELRLKSGGTSLSFLVLVTGCTSVGR
       ::.::.:.::.:.  :::.::: :.:. :::: :: :::. : : : .::::::: :::.
CCDS33 CLMFESGAVAVLSSAEKEAIKGTYSKVLDAYGLLGVLRLNLGDTMLHYLVLVTGCMSVGK
       70        80        90       100       110       120        

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pF1KA0 IPDAEIYKITATDFYPLQEEAKEEERLIALKKILSSGVFYFSWPNDGSRFDLTVRTQKQG
       : ..:....:.:.:  :. ....:.:.  ..:.:.:: :::.:  .:  .::.. .... 
CCDS33 IQESEVFRVTSTEFISLRIDSSDEDRISEVRKVLNSGNFYFAWSASGISLDLSLNAHRSM
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pF1KA0 DDSSEWGNSFFWNQLLHVPLRQHQVSCCDWLLKIICGVVTIRTVYASHKQAKACLVSRVS
       ....   : ::::: ::. :... :.: ::::...:: : :::.::.::::::::.::.:
CCDS33 QEQTT-DNRFFWNQSLHLHLKHYGVNCDDWLLRLMCGGVEIRTIYAAHKQAKACLISRLS
      190        200       210       220       230       240       

              220       230       240       250       260       270
pF1KA0 CERTGTRFHTRGVNDDGHVSNFVETEQMIYMDDGVSSFVQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHH
       :::.::::..::.::::::.:::::::..:.::.::::.::::::::::::::::::::.
CCDS33 CERAGTRFNVRGTNDDGHVANFVETEQVVYLDDSVSSFIQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHR
       250       260       270       280       290       300       

              280       290       300       310       320       330
pF1KA0 LRLHRGLEANAPAFDRHMVLLKEQYGQQVVVNLLGSRGGEEVLNRAFKKLLWASCHAGDT
       .:. ::.::::::::::.  ::. ::.:..::::::. ::..:..::.. : :: ::.: 
CCDS33 VRMSRGFEANAPAFDRHFRTLKNLYGKQIIVNLLGSKEGEHMLSKAFQSHLKASEHAADI
       310       320       330       340       350       360       

              340       350       360       370       380       390
pF1KA0 PMINFDFHQFAKGGKLEKLETLLRPQLKLHWEDFDVFTKGENVSPRFQKGTLRMNCLDCL
        :.:::.::..:::: :::...:.::.. .. :.  :  . .   : :.::.: ::::::
CCDS33 QMVNFDYHQMVKGGKAEKLHSVLKPQVQ-KFLDYGFFYFNGSEVQRCQSGTVRTNCLDCL
       370       380       390        400       410       420      

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pF1KA0 DRTNTVQSFIALEVLHLQLKTLGLSSKP-IVDRFVESFKAMWSLNGHSLSKVFTGSRALE
       ::::.::.:..::.:  ::..:::. :: .: :: : :..:::.:: :.::...:. :::
CCDS33 DRTNSVQAFLGLEMLAKQLEALGLAEKPQLVTRFQEVFRSMWSVNGDSISKIYAGTGALE
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       ::::   :::::::..::::.::::. ::::: .::.:.. . ..:::.  :: . .: :
CCDS33 GKAK---LKDGARSVTRTIQNNFFDSSKQEAIDVLLLGNTLNSDLADKARALLTTGSLRV
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pF1KA0 TP--------RILKAMTERQSEFTNFKRIRIAMGTWNVNGGKQFRSNVLRTAELTDWLLD
       .         ..::.: :   .... :.::. .::::::::::::: ....  :::::::
CCDS33 SEQTLQSASSKVLKSMCENFYKYSKPKKIRVCVGTWNVNGGKQFRSIAFKNQTLTDWLLD
           550       560       570       580       590       600   

             570        580       590       600       610       620
pF1KA0 SPQLSGATDSQDD-SSPADIFAVGFEEMVELSAGNIVNASTTNKKMWGEQLQKAISRSHR
       .:.:.:  . ::  :.:.::::.::::::::.:::::.:::::.:.:. .:::.:::...
CCDS33 APKLAGIQEFQDKRSKPTDIFAIGFEEMVELNAGNIVSASTTNQKLWAVELQKTISRDNK
           610       620       630       640       650       660   

              630       640       650       660       670       680
pF1KA0 YILLTSAQLVGVCLYIFVRPYHVPFIRDVAIDTVKTGMGGKAGNKGAVGIRFQFHSTSFC
       :.::.: :::::::..:.:: :.:::::::.::::::::: .::::::.::. ::.::.:
CCDS33 YVLLASEQLVGVCLFVFIRPQHAPFIRDVAVDTVKTGMGGATGNKGAVAIRMLFHTTSLC
           670       680       690       700       710       720   

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pF1KA0 FICSHLTAGQSQVKERNEDYKEITQKLCFPMGRNVFSHDYVFWCGDFNYRIDLTYEEVFY
       :.:::..::::::::::::. ::..:: ::::: .::::::::::::::::::  :::  
CCDS33 FVCSHFAAGQSQVKERNEDFIEIARKLSFPMGRMLFSHDYVFWCGDFNYRIDLPNEEVKE
           730       740       750       760       770       780   

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pF1KA0 FVKRQDWKKLLEFDQLQLQKSSGKIFKDFHEGAINFGPTYKYDVGSAAYDTSDKCRTPAW
       ....:.: .:.  :::  ::..:..:. : :: ..:.::::::. :  ::::.:::::::
CCDS33 LIRQQNWDSLIAGDQLINQKNAGQVFRGFLEGKVTFAPTYKYDLFSDDYDTSEKCRTPAW
           790       800       810       820       830       840   

              810       820       830       840       850       860
pF1KA0 TDRVLWWRKKHPFDKTAGELNLLDSDLDVDTKVRHTWSPGALQYYGRAELQASDHRPVLA
       :::::: :.: :::..: .:.::..... ..:. .::.::.: .::::::..::::::.:
CCDS33 TDRVLWRRRKWPFDRSAEDLDLLNASFQDESKILYTWTPGTLLHYGRAELKTSDHRPVVA
           850       860       870       880       890       900   

              870       880       890       900       910       920
pF1KA0 IVEVEVQEVDVGARERVFQEVSSFQGPLDATVVVNLQSPTLEEKNEFPEDLRTELMQTLG
       ...... ::..  :. ...:: . ::: :.::.:...: .: :.: : . :  ::.: ..
CCDS33 LIDIDIFEVEAEERQNIYKEVIAVQGPPDGTVLVSIKS-SLPENNFFDDALIDELLQQFA
           910       920       930       940        950       960  

              930       940       950       960       970       980
pF1KA0 SYGTIVLVRINQGQMLVTFADSHSALSVLDVDGMKVKGRAVKIRPKTKDWLKGLREEIIR
       :.: ..:.:. . .: ::: .. :::.::...: .. .:.. :  :. ::.:.:.::.  
CCDS33 SFGEVILIRFVEDKMWVTFLEGSSALNVLSLNGKELLNRTITIALKSPDWIKNLEEEMSL
            970       980       990      1000      1010      1020  

              990      1000      1010      1020          1030      
pF1KA0 KRDSMAPVSPTANSCLLEENFDFTSLDYESEGDILEDDEDYLVDEFN----QPGVSDSEL
       .. :.:  : :. : :: :. . .. :.. :::.  :: .  :.:.     ::. :.: :
CCDS33 EKISIALPSSTS-STLLGEDAEVAA-DFDMEGDV--DDYSAEVEELLPQHLQPS-SSSGL
           1030       1040       1050        1060      1070        

                    1040       1050         1060      1070         
pF1KA0 G-------------GDDLSDVPGPT-ALAP---PSKSPALTKKKQHPTYKDDADLVELKR
       :             .  .:. : :.  . :   ::..:.  . .. :   . :  .  : 
CCDS33 GTSPSSSPRTSPCQSPTISEGPVPSLPIRPSRAPSRTPGPPSAQSSPIDAQPATPLPQKD
      1080      1090      1100      1110      1120      1130       

    1080      1090      1100      1110      1120      1130         
pF1KA0 ELEAVGEFRHRSPSRSLSVPNRPRPPQPPQRPPPPTGLMVKKSASDASISSGTHGQYSIL
         . . : ..  : : .. :.::    ::::::::.:         :   . :. ... .
CCDS33 PAQPL-EPKRPPPPRPVAPPTRP---APPQRPPPPSG---------ARSPAPTRKEFGGI
      1140       1150         1160      1170               1180    

    1140      1150      1160      1170      1180      1190         
pF1KA0 QTARLLPGAPQQPPKARTGISKPYNVKQIKTTNAQEAEAAIRCLLEARGGASEEALSAVA
              ::: .:  ::  .  : .    .  :  ... . .  : . : :.  .   . 
CCDS33 -------GAPPSPGVARREMEAPKSPGTTRKDNIGRSQPSPQAGLAGPGPAGYSTARPTI
                1190      1200      1210      1220      1230       

    1200      1210      1220      1230      1240      1250         
pF1KA0 PRDLEASSEPEPTPGAAKPETPQAPPLLPRRPPPRVPAIKKPTLRRTGKPLSPEEQFEQQ
       :    . : :.    :.      :  : :.       . :  :.    .::.:.  :  :
CCDS33 PPRAGVISAPQSHARAS------AGRLTPESQSKTSETSKGSTF--LPEPLKPQAAFPPQ
      1240      1250            1260      1270        1280         

    1260      1270       1280                1290          1300    
pF1KA0 TVHFTIGPPETSVEAPPV-VTAP----------RVPPVPKPRTFQ----PGKAAERPSHR
       .   .. ::   .. : : :.::          ..:: : ::. .    :..:. .:...
CCDS33 S---SLPPPAQRLQEPLVPVAAPMPQSGPQPNLETPPQPPPRSRSSHSLPSEASSQPQQE
    1290         1300      1310      1320      1330      1340      

         1310      1320      1330      1340      1350      1360    
pF1KA0 KPASDEAPPGAGASVPPPLEAPPLVPKVPPRRKKSAPAAFHLQVLQSNSQLLQGLTYNSS
       .:.                                                         
CCDS33 QPSG                                                        
       1350                                                        

>>CCDS33539.2 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21              (1612 aa)
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pF1KA0                               MALSKGLRLLGRLGAEGDCSVLLEARGRDD
                                     ::.:::.:.  .:      :...:.: ...
CCDS33 GSDAPGGCGGGCGRRRRRSRRKRAASEERRMAFSKGFRIYHKLDPP-PFSLIVETRHKEE
      10        20        30        40        50         60        

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pF1KA0 CLLFEAGTVATLAPEEKEVIKGQYGKLTDAYGCLGELRLKSGGTSLSFLVLVTGCTSVGR
       ::.::.:.::.:.  :::.::: :.:. :::: :: :::. : : : .::::::: :::.
CCDS33 CLMFESGAVAVLSSAEKEAIKGTYSKVLDAYGLLGVLRLNLGDTMLHYLVLVTGCMSVGK
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pF1KA0 IPDAEIYKITATDFYPLQEEAKEEERLIALKKILSSGVFYFSWPNDGSRFDLTVRTQKQG
       : ..:....:.:.:  :. ....:.:.  ..:.:.:: :::.:  .:  .::.. .... 
CCDS33 IQESEVFRVTSTEFISLRIDSSDEDRISEVRKVLNSGNFYFAWSASGISLDLSLNAHRSM
      130       140       150       160       170       180        

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pF1KA0 DDSSEWGNSFFWNQLLHVPLRQHQVSCCDWLLKIICGVVTIRTVYASHKQAKACLVSRVS
       ....   : ::::: ::. :... :.: ::::...:: : :::.::.::::::::.::.:
CCDS33 QEQTT-DNRFFWNQSLHLHLKHYGVNCDDWLLRLMCGGVEIRTIYAAHKQAKACLISRLS
      190        200       210       220       230       240       

              220       230       240       250       260       270
pF1KA0 CERTGTRFHTRGVNDDGHVSNFVETEQMIYMDDGVSSFVQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHH
       :::.::::..::.::::::.:::::::..:.::.::::.::::::::::::::::::::.
CCDS33 CERAGTRFNVRGTNDDGHVANFVETEQVVYLDDSVSSFIQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHR
       250       260       270       280       290       300       

              280       290       300       310       320       330
pF1KA0 LRLHRGLEANAPAFDRHMVLLKEQYGQQVVVNLLGSRGGEEVLNRAFKKLLWASCHAGDT
       .:. ::.::::::::::.  ::. ::.:..::::::. ::..:..::.. : :: ::.: 
CCDS33 VRMSRGFEANAPAFDRHFRTLKNLYGKQIIVNLLGSKEGEHMLSKAFQSHLKASEHAADI
       310       320       330       340       350       360       

              340       350       360       370       380       390
pF1KA0 PMINFDFHQFAKGGKLEKLETLLRPQLKLHWEDFDVFTKGENVSPRFQKGTLRMNCLDCL
        :.:::.::..:::: :::...:.::.. .. :.  :  . .   : :.::.: ::::::
CCDS33 QMVNFDYHQMVKGGKAEKLHSVLKPQVQ-KFLDYGFFYFNGSEVQRCQSGTVRTNCLDCL
       370       380       390        400       410       420      

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pF1KA0 DRTNTVQSFIALEVLHLQLKTLGLSSKP-IVDRFVESFKAMWSLNGHSLSKVFTGSRALE
       ::::.::.:..::.:  ::..:::. :: .: :: : :..:::.:: :.::...:. :::
CCDS33 DRTNSVQAFLGLEMLAKQLEALGLAEKPQLVTRFQEVFRSMWSVNGDSISKIYAGTGALE
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pF1KA0 GKAKVGKLKDGARSMSRTIQSNFFDGVKQEAIKLLLVGDVYGEEVADKGGMLLDSTALLV
       ::::   :::::::..::::.::::. ::::: .::.:.. . ..:::.  :: . .: :
CCDS33 GKAK---LKDGARSVTRTIQNNFFDSSKQEAIDVLLLGNTLNSDLADKARALLTTGSLRV
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pF1KA0 TP--------RILKAMTERQSEFTNFKRIRIAMGTWNVNGGKQFRSNVLRTAELTDWLLD
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CCDS33 SEQTLQSASSKVLKSMCENFYKYSKPKKIRVCVGTWNVNGGKQFRSIAFKNQTLTDWLLD
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       .:.:.:  . ::  :.:.::::.::::::::.:::::.:::::.:.:. .:::.:::...
CCDS33 APKLAGIQEFQDKRSKPTDIFAIGFEEMVELNAGNIVSASTTNQKLWAVELQKTISRDNK
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pF1KA0 YILLTSAQLVGVCLYIFVRPYHVPFIRDVAIDTVKTGMGGKAGNKGAVGIRFQFHSTSFC
       :.::.: :::::::..:.:: :.:::::::.::::::::: .::::::.::. ::.::.:
CCDS33 YVLLASEQLVGVCLFVFIRPQHAPFIRDVAVDTVKTGMGGATGNKGAVAIRMLFHTTSLC
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pF1KA0 FICSHLTAGQSQVKERNEDYKEITQKLCFPMGRNVFSHDYVFWCGDFNYRIDLTYEEVFY
       :.:::..::::::::::::. ::..:: ::::: .::::::::::::::::::  :::  
CCDS33 FVCSHFAAGQSQVKERNEDFIEIARKLSFPMGRMLFSHDYVFWCGDFNYRIDLPNEEVKE
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pF1KA0 FVKRQDWKKLLEFDQLQLQKSSGKIFKDFHEGAINFGPTYKYDVGSAAYDTSDKCRTPAW
       ....:.: .:.  :::  ::..:..:. : :: ..:.::::::. :  ::::.:::::::
CCDS33 LIRQQNWDSLIAGDQLINQKNAGQVFRGFLEGKVTFAPTYKYDLFSDDYDTSEKCRTPAW
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pF1KA0 TDRVLWWRKKHPFDKTAGELNLLDSDLDVDTKVRHTWSPGALQYYGRAELQASDHRPVLA
       :::::: :.: :::..: .:.::..... ..:. .::.::.: .::::::..::::::.:
CCDS33 TDRVLWRRRKWPFDRSAEDLDLLNASFQDESKILYTWTPGTLLHYGRAELKTSDHRPVVA
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pF1KA0 IVEVEVQEVDVGARERVFQEVSSFQGPLDATVVVNLQSPTLEEKNEFPEDLRTELMQTLG
       ...... ::..  :. ...:: . ::: :.::.:...: .: :.: : . :  ::.: ..
CCDS33 LIDIDIFEVEAEERQNIYKEVIAVQGPPDGTVLVSIKS-SLPENNFFDDALIDELLQQFA
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pF1KA0 SYGTIVLVRINQGQMLVTFADSHSALSVLDVDGMKVKGRAVKIRPKTKDWLKGLREEIIR
       :.: ..:.:. . .: ::: .. :::.::...: .. .:.. :  :. ::.:.:.::.  
CCDS33 SFGEVILIRFVEDKMWVTFLEGSSALNVLSLNGKELLNRTITIALKSPDWIKNLEEEMSL
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pF1KA0 KRDSMAPVSPTANSCLLEENFDFTSLDYESEGDILEDDEDYLVDEFN----QPGVSDSEL
       .. :.:  : :. : :: :. . .. :.. :::.  :: .  :.:.     ::. :.: :
CCDS33 EKISIALPSSTS-STLLGEDAEVAA-DFDMEGDV--DDYSAEVEELLPQHLQPS-SSSGL
           1030       1040       1050        1060      1070        

                    1040       1050         1060      1070         
pF1KA0 G-------------GDDLSDVPGPT-ALAP---PSKSPALTKKKQHPTYKDDADLVELKR
       :             .  .:. : :.  . :   ::..:.  . .. :   . :  .  : 
CCDS33 GTSPSSSPRTSPCQSPTISEGPVPSLPIRPSRAPSRTPGPPSAQSSPIDAQPATPLPQKD
      1080      1090      1100      1110      1120      1130       

    1080      1090      1100      1110      1120      1130         
pF1KA0 ELEAVGEFRHRSPSRSLSVPNRPRPPQPPQRPPPPTGLMVKKSASDASISSGTHGQYSIL
         . . : ..  : : .. :.::    ::::::::.:         :   . :. ... .
CCDS33 PAQPL-EPKRPPPPRPVAPPTRP---APPQRPPPPSG---------ARSPAPTRKEFGGI
      1140       1150         1160      1170               1180    

    1140      1150      1160      1170      1180      1190         
pF1KA0 QTARLLPGAPQQPPKARTGISKPYNVKQIKTTNAQEAEAAIRCLLEARGGASEEALSAVA
              ::: .:  ::  .  : .    .  :  ... . .  : . : :.  .   . 
CCDS33 -------GAPPSPGVARREMEAPKSPGTTRKDNIGRSQPSPQAGLAGPGPAGYSTARPTI
                1190      1200      1210      1220      1230       

    1200      1210      1220      1230      1240      1250         
pF1KA0 PRDLEASSEPEPTPGAAKPETPQAPPLLPRRPPPRVPAIKKPTLRRTGKPLSPEEQFEQQ
       :    . : :.    :.      :  : :.       . :  :.    .::.:.  :  :
CCDS33 PPRAGVISAPQSHARAS------AGRLTPESQSKTSETSKGSTF--LPEPLKPQAAFPPQ
      1240      1250            1260      1270        1280         

    1260      1270       1280      1290      1300        1310      
pF1KA0 TVHFTIGPPETSVEAPPV-VTAPRVPPVPKPRTFQPGKAAERP--SHRKPASDEAPPGAG
       .   .. ::   .. : : :.::     :.:    : .   :   ::  :.   . : . 
CCDS33 S---SLPPPAQRLQEPLVPVAAPMPQSGPQPNLETPPQPPPRSRSSHSLPSEASSQPQVK
    1290         1300      1310      1320      1330      1340      

        1320      1330      1340      1350      1360      1370     
pF1KA0 AS-VPPPLEAPPLVPKVPPRRKKSAPAAFHLQVLQSNSQLLQGLTYNSSDSPSGHP----
       .. .    .  ::  :. : .  :    :.: .. :..::    . ..:  :.  :    
CCDS33 TNGISDGKRESPL--KIDPFEDLS----FNLLAV-SKAQL----SVQTSPVPTPDPKRLI
       1350        1360          1370           1380      1390     

                1380      1390      1400      1410        1420     
pF1KA0 --PAA--GTVFPQGDFLSTSSATSPDSDGTKAMKPEAAPLLGDYQ--DPFWNLLHHPKLL
         :.:  ..:. . . . :       :.. . :.    :..      .:: .    :   
CCDS33 QLPSATQSNVLSSVSCMPTMPPIPARSQSQENMRSSPNPFITGLTRTNPFSDRTAAP---
        1400      1410      1420      1430      1440      1450     

        1430      1440      1450      1460      1470      1480     
pF1KA0 NNTWLSKSSDPLDSGTRSPKRDPIDPVSAGASAAKAELPPDHEHKTLGHWVTISDQEKRT
       .: . .:: .  .. .   :..:.  .:   :        ..  ..:  .    : . ..
CCDS33 GNPFRAKSEES-EATSWFSKEEPVT-ISPFPSLQPLGHNKSRASSSLDGFKDSFDLQGQS
           1460       1470       1480      1490      1500      1510

        1490                                                       
pF1KA0 ALQVFDPLAKT                                                 
       .:.. .:                                                     
CCDS33 TLKISNPKGWVTFEEEEDFGVKGKSKSACSDLLGNQPSSFSGSNLTLNDDWNKGTNVSFC
             1520      1530      1540      1550      1560      1570

>>CCDS54483.1 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21              (1295 aa)
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       ::.:::.:.  .:      :...:.: ...::.::.:.::.:.  :::.::: :.:. ::
CCDS54 MAFSKGFRIYHKLDPP-PFSLIVETRHKEECLMFESGAVAVLSSAEKEAIKGTYSKVLDA
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pF1KA0 YGCLGELRLKSGGTSLSFLVLVTGCTSVGRIPDAEIYKITATDFYPLQEEAKEEERLIAL
       :: :: :::. : : : .::::::: :::.: ..:....:.:.:  :. ....:.:.  .
CCDS54 YGLLGVLRLNLGDTMLHYLVLVTGCMSVGKIQESEVFRVTSTEFISLRIDSSDEDRISEV
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pF1KA0 KKILSSGVFYFSWPNDGSRFDLTVRTQKQGDDSSEWGNSFFWNQLLHVPLRQHQVSCCDW
       .:.:.:: :::.:  .:  .::.. .... ....   : ::::: ::. :... :.: ::
CCDS54 RKVLNSGNFYFAWSASGISLDLSLNAHRSMQEQTT-DNRFFWNQSLHLHLKHYGVNCDDW
     120       130       140       150        160       170        

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pF1KA0 LLKIICGVVTIRTVYASHKQAKACLVSRVSCERTGTRFHTRGVNDDGHVSNFVETEQMIY
       ::...:: : :::.::.::::::::.::.::::.::::..::.::::::.:::::::..:
CCDS54 LLRLMCGGVEIRTIYAAHKQAKACLISRLSCERAGTRFNVRGTNDDGHVANFVETEQVVY
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              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 MDDGVSSFVQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHHLRLHRGLEANAPAFDRHMVLLKEQYGQQVV
       .::.::::.::::::::::::::::::::..:. ::.::::::::::.  ::. ::.:..
CCDS54 LDDSVSSFIQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHRVRMSRGFEANAPAFDRHFRTLKNLYGKQII
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              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 VNLLGSRGGEEVLNRAFKKLLWASCHAGDTPMINFDFHQFAKGGKLEKLETLLRPQLKLH
       ::::::. ::..:..::.. : :: ::.:  :.:::.::..:::: :::...:.::.. .
CCDS54 VNLLGSKEGEHMLSKAFQSHLKASEHAADIQMVNFDYHQMVKGGKAEKLHSVLKPQVQ-K
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              370       380       390       400       410          
pF1KA0 WEDFDVFTKGENVSPRFQKGTLRMNCLDCLDRTNTVQSFIALEVLHLQLKTLGLSSKP-I
       . :.  :  . .   : :.::.: ::::::::::.::.:..::.:  ::..:::. :: .
CCDS54 FLDYGFFYFNGSEVQRCQSGTVRTNCLDCLDRTNSVQAFLGLEMLAKQLEALGLAEKPQL
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       : :: : :..:::.:: :.::...:. :::::::   :::::::..::::.::::. :::
CCDS54 VTRFQEVFRSMWSVNGDSISKIYAGTGALEGKAK---LKDGARSVTRTIQNNFFDSSKQE
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pF1KA0 AIKLLLVGDVYGEEVADKGGMLLDSTALLVTP--------RILKAMTERQSEFTNFKRIR
       :: .::.:.. . ..:::.  :: . .: :.         ..::.: :   .... :.::
CCDS54 AIDVLLLGNTLNSDLADKARALLTTGSLRVSEQTLQSASSKVLKSMCENFYKYSKPKKIR
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pF1KA0 IAMGTWNVNGGKQFRSNVLRTAELTDWLLDSPQLSGATDSQDD-SSPADIFAVGFEEMVE
       . .::::::::::::: ....  :::::::.:.:.:  . ::  :.:.::::.:::::::
CCDS54 VCVGTWNVNGGKQFRSIAFKNQTLTDWLLDAPKLAGIQEFQDKRSKPTDIFAIGFEEMVE
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pF1KA0 LSAGNIVNASTTNKKMWGEQLQKAISRSHRYILLTSAQLVGVCLYIFVRPYHVPFIRDVA
       :.:::::.:::::.:.:. .:::.:::...:.::.: :::::::..:.:: :.:::::::
CCDS54 LNAGNIVSASTTNQKLWAVELQKTISRDNKYVLLASEQLVGVCLFVFIRPQHAPFIRDVA
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pF1KA0 IDTVKTGMGGKAGNKGAVGIRFQFHSTSFCFICSHLTAGQSQVKERNEDYKEITQKLCFP
       .::::::::: .::::::.::. ::.::.::.:::..::::::::::::. ::..:: ::
CCDS54 VDTVKTGMGGATGNKGAVAIRMLFHTTSLCFVCSHFAAGQSQVKERNEDFIEIARKLSFP
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pF1KA0 MGRNVFSHDYVFWCGDFNYRIDLTYEEVFYFVKRQDWKKLLEFDQLQLQKSSGKIFKDFH
       ::: .::::::::::::::::::  :::  ....:.: .:.  :::  ::..:..:. : 
CCDS54 MGRMLFSHDYVFWCGDFNYRIDLPNEEVKELIRQQNWDSLIAGDQLINQKNAGQVFRGFL
          720       730       740       750       760       770    

              780       790       800       810       820       830
pF1KA0 EGAINFGPTYKYDVGSAAYDTSDKCRTPAWTDRVLWWRKKHPFDKTAGELNLLDSDLDVD
       :: ..:.::::::. :  ::::.::::::::::::: :.: :::..: .:.::..... .
CCDS54 EGKVTFAPTYKYDLFSDDYDTSEKCRTPAWTDRVLWRRRKWPFDRSAEDLDLLNASFQDE
          780       790       800       810       820       830    

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       .:. .::.::.: .::::::..::::::.:...... ::..  :. ...:: . ::: :.
CCDS54 SKILYTWTPGTLLHYGRAELKTSDHRPVVALIDIDIFEVEAEERQNIYKEVIAVQGPPDG
          840       850       860       870       880       890    

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pF1KA0 TVVVNLQSPTLEEKNEFPEDLRTELMQTLGSYGTIVLVRINQGQMLVTFADSHSALSVLD
       ::.:...: .: :.: : . :  ::.: ..:.: ..:.:. . .: ::: .. :::.::.
CCDS54 TVLVSIKS-SLPENNFFDDALIDELLQQFASFGEVILIRFVEDKMWVTFLEGSSALNVLS
          900        910       920       930       940       950   

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pF1KA0 VDGMKVKGRAVKIRPKTKDWLKGLREEIIRKRDSMAPVSPTANSCLLEENFDFTSLDYES
       ..: .. .:.. :  :. ::.:.:.::.  .. :.:  : :. : :: :. . .. :.. 
CCDS54 LNGKELLNRTITIALKSPDWIKNLEEEMSLEKISIALPSSTS-STLLGEDAEVAA-DFDM
           960       970       980       990       1000       1010 

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pF1KA0 EGDILEDDEDYLVDEFN----QPGVSDSELG-------------GDDLSDVPGPT-ALAP
       :::.  :: .  :.:.     ::. :.: ::             .  .:. : :.  . :
CCDS54 EGDV--DDYSAEVEELLPQHLQPS-SSSGLGTSPSSSPRTSPCQSPTISEGPVPSLPIRP
              1020      1030       1040      1050      1060        

              1060      1070      1080      1090      1100         
pF1KA0 ---PSKSPALTKKKQHPTYKDDADLVELKRELEAVGEFRHRSPSRSLSVPNRPRPPQPPQ
          ::..:.  . .. :   . :  .  :   . . : ..  : : .. :.::    :::
CCDS54 SRAPSRTPGPPSAQSSPIDAQPATPLPQKDPAQPL-EPKRPPPPRPVAPPTRP---APPQ
     1070      1080      1090      1100       1110      1120       

    1110      1120      1130      1140      1150      1160         
pF1KA0 RPPPPTGLMVKKSASDASISSGTHGQYSILQTARLLPGAPQQPPKARTGISKPYNVKQIK
       :::::.:     . : :   .   .  :   : .   :  :  :.:  .   : . .  .
CCDS54 RPPPPSG-----ARSPAPTRKEFGAPKSPGTTRKDNIGRSQPSPQAGLAGPGPAGYSTAR
         1130           1140      1150      1160      1170         

    1170      1180      1190         1200      1210       1220     
pF1KA0 TTNAQEAEAAIRCLLEARGGA---SEEALSAVAPRDLEASSEPEPT-PGAAKPETPQAPP
        :   .: .      .::..:   . :. : ..  .  ..  :::  : :: :  ::.  
CCDS54 PTIPPRAGVISAPQSHARASAGRLTPESQSKTSETSKGSTFLPEPLKPQAAFP--PQSS-
    1180      1190      1200      1210      1220      1230         

        1230      1240      1250      1260      1270      1280     
pF1KA0 LLPRRPPPRVPAIKKPTLRRTGKPLSPEEQFEQQTVHFTIGPPETSVEAPPVVTAPRVPP
            :::          .:  .:: :      :.     :: . ..:.::    :  ::
CCDS54 ----LPPPA---------QRLQEPLVPVAAPMPQS-----GP-QPNLETPP---QP--PP
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pF1KA0 VPKPRTFQPGKAAERPSHRKPASDEAPPGAGASVPPPLEAPPLVPKVPPRRKKSAPAAFH
         .     :..:. .:....:.                                      
CCDS54 RSRSSHSLPSEASSQPQQEQPSG                                     
           1280      1290                                          

>>CCDS35394.1 OCRL gene_id:4952|Hs108|chrX                (893 aa)
 initn: 723 init1: 276 opt: 663  Z-score: 334.8  bits: 73.9 E(32554): 2.5e-12
Smith-Waterman score: 741; 32.6% identity (61.6% similar) in 414 aa overlap (513-917:223-583)

            490       500       510       520       530       540  
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                                     : . ...:..:..:.. .:. .::::::: 
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       .         . :  ::            . : .: ::. .::.:. .::.  .    ..
CCDS35 SP-------DSGLEPWL------------NCDPNPPDIYCIGFQEL-DLSTEAFFYFESV
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       ... :.  .....  . .:  .  ..:::. : ::.:  .  .:::.: .:: ::. :: 
CCDS35 KEQEWSMAVERGLHSKAKYKKVQLVRLVGMMLLIFARKDQCRYIRDIATETVGTGIMGKM
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pF1KA0 GNKGAVGIRFQFHSTSFCFICSHLTAGQSQVKERNEDYKEITQKLCFPMGR------NVF
       ::::.:..:: ::.:.::.. :::.:   . ..::.:::.:  .. : .        :..
CCDS35 GNKGGVAVRFVFHNTTFCIVNSHLAAHVEDFERRNQDYKDICARMSFVVPNQTLPQLNIM
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pF1KA0 SHDYVFWCGDFNYRIDLT-YEEVFYFVKRQDWKKLLEFDQLQLQKSSGKIFKDFHEGAIN
       .:. :.: ::.:::. .   .::  .....: ..::.::::..:... : : ::.:: :.
CCDS35 KHEVVIWLGDLNYRLCMPDANEVKSLINKKDLQRLLKFDQLNIQRTQKKAFVDFNEGEIK
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pF1KA0 FGPTYKYDVGSAAYDTSDKCRTPAWTDRVLWWRKKHPFDKTAGELNLLDSDLDVDTKVRH
       : ::::::  .  .:.: :::.::: ::.::                           : 
CCDS35 FIPTYKYDSKTDRWDSSGKCRVPAWCDRILW---------------------------RG
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pF1KA0 TWSPGALQYYGRAELQASDHRPVLAIVEVEVQEVDVGARERVFQEVSSFQGPLDATVVVN
       : . . :.: .. ::..:::.:: :. .. :. ::    ..::..   ..  ..   .  
CCDS35 T-NVNQLNYRSHMELKTSDHKPVSALFHIGVKVVDERRYRKVFEDSVRIMDRMENDFL--
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          :.::  . ::  :... . .:                                    
CCDS35 ---PSLELSRREFVFENVKFRQLQKEKFQISNNGQVPCHFSFIPKLNDSQYCKPWLRAEP
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>>CCDS35393.1 OCRL gene_id:4952|Hs108|chrX                (901 aa)
 initn: 723 init1: 276 opt: 663  Z-score: 334.7  bits: 73.9 E(32554): 2.5e-12
Smith-Waterman score: 741; 32.6% identity (61.6% similar) in 414 aa overlap (513-917:223-583)

            490       500       510       520       530       540  
pF1KA0 LLLVGDVYGEEVADKGGMLLDSTALLVTPRILKAMTERQSEFTNFKRIRIAMGTWNVNGG
                                     : . ...:..:..:.. .:. .::::::: 
CCDS35 EASNKEQPKVTNTMRKLFVPNTQSGQREGLIKHILAKREKEYVNIQTFRFFVGTWNVNGQ
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pF1KA0 KQFRSNVLRTAELTDWLLDSPQLSGATDSQDDSSPADIFAVGFEEMVELSAGNIVNASTT
       .         . :  ::            . : .: ::. .::.:. .::.  .    ..
CCDS35 SP-------DSGLEPWL------------NCDPNPPDIYCIGFQEL-DLSTEAFFYFESV
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pF1KA0 NKKMWGEQLQKAISRSHRYILLTSAQLVGVCLYIFVRPYHVPFIRDVAIDTVKTGMGGKA
       ... :.  .....  . .:  .  ..:::. : ::.:  .  .:::.: .:: ::. :: 
CCDS35 KEQEWSMAVERGLHSKAKYKKVQLVRLVGMMLLIFARKDQCRYIRDIATETVGTGIMGKM
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pF1KA0 GNKGAVGIRFQFHSTSFCFICSHLTAGQSQVKERNEDYKEITQKLCFPMGR------NVF
       ::::.:..:: ::.:.::.. :::.:   . ..::.:::.:  .. : .        :..
CCDS35 GNKGGVAVRFVFHNTTFCIVNSHLAAHVEDFERRNQDYKDICARMSFVVPNQTLPQLNIM
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pF1KA0 SHDYVFWCGDFNYRIDLT-YEEVFYFVKRQDWKKLLEFDQLQLQKSSGKIFKDFHEGAIN
       .:. :.: ::.:::. .   .::  .....: ..::.::::..:... : : ::.:: :.
CCDS35 KHEVVIWLGDLNYRLCMPDANEVKSLINKKDLQRLLKFDQLNIQRTQKKAFVDFNEGEIK
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pF1KA0 FGPTYKYDVGSAAYDTSDKCRTPAWTDRVLWWRKKHPFDKTAGELNLLDSDLDVDTKVRH
       : ::::::  .  .:.: :::.::: ::.::                           : 
CCDS35 FIPTYKYDSKTDRWDSSGKCRVPAWCDRILW---------------------------RG
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pF1KA0 TWSPGALQYYGRAELQASDHRPVLAIVEVEVQEVDVGARERVFQEVSSFQGPLDATVVVN
       : . . :.: .. ::..:::.:: :. .. :. ::    ..::..   ..  ..   .  
CCDS35 T-NVNQLNYRSHMELKTSDHKPVSALFHIGVKVVDERRYRKVFEDSVRIMDRMENDFL--
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pF1KA0 LQSPTLE-EKNEFP-EDLRTELMQTLGSYGTIVLVRINQGQMLVTFADSHSALSVLDVDG
          :.::  . ::  :... . .:                                    
CCDS35 ---PSLELSRREFVFENVKFRQLQKEKFQISNNGQVPCHFSFIPKLNDSQYCKPWLRAEP
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>>CCDS72760.1 INPP5B gene_id:3633|Hs108|chr1              (749 aa)
 initn: 673 init1: 270 opt: 656  Z-score: 332.6  bits: 73.2 E(32554): 3.3e-12
Smith-Waterman score: 692; 31.5% identity (61.4% similar) in 425 aa overlap (494-910:65-467)

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                                     :.::.  .:.   . .   :.:. . ... 
CCDS72 RGQDKPESLQPRQNKSKSEITDMVRSSTITVSDKA-HILSMQKFGLRDTIVKSHLLQKEE
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pF1KA0 EFTNFKRIRIAMGTWNVNGGKQFRSNVLRTAELTDWLLDSPQLSGATDSQDDSSPADIFA
       ..: .. .:.  ::.::::  :  .. ::      :: .. :           .: :.. 
CCDS72 DYTYIQNFRFFAGTYNVNG--QSPKECLRL-----WLSNGIQ-----------AP-DVYC
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pF1KA0 VGFEEMVELSAGNIVNASTTNKKMWGEQLQKAISRSHRYILLTSAQLVGVCLYIFVRPYH
       :::.:. .::   .   .: ... : . .....  . .:  .   .:::. : ..:.  :
CCDS72 VGFQEL-DLSKEAFFFHDTPKEEEWFKAVSEGLHPDAKYAKVKLIRLVGIMLLLYVKQEH
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pF1KA0 VPFIRDVAIDTVKTGMGGKAGNKGAVGIRFQFHSTSFCFICSHLTAGQSQVKERNEDYKE
       . .: .:  .:: ::. :. ::::.:.::::::.::.: . :::.:   . ..::.:::.
CCDS72 AAYISEVEAETVGTGIMGRMGNKGGVAIRFQFHNTSICVVNSHLAAHIEEYERRNQDYKD
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pF1KA0 ITQKL--CFPMGR----NVFSHDYVFWCGDFNYRID-LTYEEVFYFVKRQDWKKLLEFDQ
       : ...  : :       .. .:: ..: ::.::::. :  :.:  .....:.. :  .::
CCDS72 ICSRMQFCQPDPSLPPLTISNHDVILWLGDLNYRIEELDVEKVKKLIEEKDFQMLYAYDQ
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pF1KA0 LQLQKSSGKIFKDFHEGAINFGPTYKYDVGSAAYDTSDKCRTPAWTDRVLWWRKKHPFDK
       :..: ..  .:. : :: ..: ::::::.::  .:::.:::.::: ::.::  :.    .
CCDS72 LKIQVAAKTVFEGFTEGELTFQPTYKYDTGSDDWDTSEKCRAPAWCDRILWKGKNITQLS
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pF1KA0 TAGELNLLDSDLDVDTKVRHTWSPGALQYYGRAELQASDHRPVLAIVEVEVQEVDVGARE
         ... :  ::    ..:       . .   :  :.    : .  . ....  :... ::
CCDS72 YQSHMALKTSDHKPVSSVFDIGVRVVNDELYRKTLEEIV-RSLDKMENANIPSVSLSKRE
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pF1KA0 RVFQEVSSFQGPLDATVVVNLQSPTLEEKNEFPEDLRTELMQTLGSYGTIVLVRINQGQM
         ::.:. .:  ... .. : : :   :  . :..                         
CCDS72 FCFQNVKYMQLKVESFTIHNGQVPCHFEFINKPDEESYCKQWLNANPSRGFLLPDSDVEI
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pF1KA0 LVTFADSHSALSVLDVDGMKVKGRAVKIRPKTKDWLKGLREEIIRKRDSMAPVSPTANSC
                                                                   
CCDS72 DLELFVNKMTATKLNSGEDKIEDILVLHLDRGKDYFLSVSGNYLPSCFGSPIHTLCYMRE
            500       510       520       530       540       550  

>>CCDS41306.1 INPP5B gene_id:3633|Hs108|chr1              (913 aa)
 initn: 673 init1: 270 opt: 656  Z-score: 331.3  bits: 73.3 E(32554): 3.9e-12
Smith-Waterman score: 692; 31.5% identity (61.4% similar) in 425 aa overlap (494-910:229-631)

           470       480       490       500       510        520  
pF1KA0 MSRTIQSNFFDGVKQEAIKLLLVGDVYGEEVADKGGMLLDSTALLVTPRILKA-MTERQS
                                     :.::.  .:.   . .   :.:. . ... 
CCDS41 RGQDKPESLQPRQNKSKSEITDMVRSSTITVSDKA-HILSMQKFGLRDTIVKSHLLQKEE
      200       210       220       230        240       250       

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pF1KA0 EFTNFKRIRIAMGTWNVNGGKQFRSNVLRTAELTDWLLDSPQLSGATDSQDDSSPADIFA
       ..: .. .:.  ::.::::  :  .. ::      :: .. :           .: :.. 
CCDS41 DYTYIQNFRFFAGTYNVNG--QSPKECLRL-----WLSNGIQ-----------AP-DVYC
       260       270         280            290                    

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pF1KA0 VGFEEMVELSAGNIVNASTTNKKMWGEQLQKAISRSHRYILLTSAQLVGVCLYIFVRPYH
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       . .: .:  .:: ::. :. ::::.:.::::::.::.: . :::.:   . ..::.:::.
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       : ...  : :       .. .:: ..: ::.::::. :  :.:  .....:.. :  .::
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       :..: ..  .:. : :: ..: ::::::.::  .:::.:::.::: ::.::  :.    .
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         ... :  ::    ..:       . .   :  :.    : .  . ....  :... ::
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         ::.:. .:  ... .. : : :   :  . :..                         
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CCDS63 FNFVLVSSVRMQGVILLLFAKYYHLPFLRDVQTDCTRTGLGGYWGNKGGVSVRLAAFGHM
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CCDS63 LCFLNCHLPAHMDKAEQRKDNFQTILSLQQFQGPGAQGILDHDLVFWFGDLNFRIE-SYD
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CCDS63 LHFVKFAIDSDQLHQLWEKDQLNMAKNTWPILKGFQEGPLNFAPTFKFDVGTNKYDTSAK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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