FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4357, 374 aa 1>>>pF1KE4357 374 - 374 aa - 374 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0124+/-0.000805; mu= 13.9446+/- 0.048 mean_var=93.1487+/-19.070, 0's: 0 Z-trim(110.1): 75 B-trim: 441 in 1/52 Lambda= 0.132888 statistics sampled from 11307 (11389) to 11307 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.713), E-opt: 0.2 (0.35), width: 16 Scan time: 3.080 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12904.1 KIR2DL1 gene_id:3802|Hs108|chr19 ( 348) 1644 325.1 5.8e-89 CCDS33107.1 KIR2DL3 gene_id:3804|Hs108|chr19 ( 341) 1510 299.4 3.1e-81 CCDS42621.1 KIR3DL1 gene_id:3811|Hs108|chr19 ( 444) 1207 241.4 1.2e-63 CCDS12906.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 ( 455) 1199 239.9 3.4e-63 CCDS58677.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 ( 438) 1091 219.1 5.7e-57 CCDS12903.1 KIR3DL3 gene_id:115653|Hs108|chr19 ( 410) 1012 204.0 2e-52 CCDS42620.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 ( 273) 919 186.0 3.3e-47 CCDS42619.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 ( 342) 916 185.5 5.9e-47 CCDS42617.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 650) 668 138.2 2e-32 CCDS42615.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 651) 667 138.0 2.3e-32 CCDS42616.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 651) 667 138.0 2.3e-32 CCDS42614.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 652) 646 133.9 3.8e-31 CCDS62791.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 482) 614 127.7 2.1e-29 CCDS12886.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 598) 614 127.8 2.5e-29 CCDS42612.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 597) 610 127.0 4.2e-29 CCDS62792.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 510) 605 126.0 7.2e-29 CCDS42611.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 491) 576 120.4 3.3e-27 CCDS12885.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 590) 576 120.5 3.8e-27 CCDS46176.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 591) 576 120.5 3.8e-27 CCDS62803.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 634) 569 119.2 1e-26 CCDS33105.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 ( 631) 556 116.7 5.7e-26 CCDS46175.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 ( 632) 556 116.7 5.8e-26 CCDS12901.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 ( 489) 544 114.3 2.3e-25 CCDS42610.1 LILRA6 gene_id:79168|Hs108|chr19 ( 481) 542 113.9 3e-25 CCDS12890.1 LILRA4 gene_id:23547|Hs108|chr19 ( 499) 524 110.5 3.3e-24 CCDS46179.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 483) 520 109.7 5.6e-24 CCDS74453.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 454) 503 106.4 5.1e-23 CCDS12900.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 466) 503 106.4 5.2e-23 CCDS12888.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19 ( 299) 452 96.5 3.2e-20 CCDS46182.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 287) 445 95.2 7.8e-20 CCDS12889.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19 ( 287) 440 94.2 1.5e-19 CCDS62802.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 ( 289) 426 91.5 9.8e-19 CCDS46181.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 303) 424 91.2 1.3e-18 CCDS12911.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 304) 424 91.2 1.3e-18 CCDS46184.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 339) 354 77.8 1.6e-14 CCDS42626.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 620) 354 78.0 2.6e-14 CCDS58678.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 321) 349 76.8 3e-14 CCDS12907.1 FCAR gene_id:2204|Hs108|chr19 ( 287) 348 76.6 3.1e-14 CCDS12909.1 FCAR gene_id:2204|Hs108|chr19 ( 275) 329 72.9 3.7e-13 CCDS42622.1 FCAR gene_id:2204|Hs108|chr19 ( 265) 303 67.9 1.1e-11 CCDS62789.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 271) 298 67.0 2.3e-11 CCDS74444.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 282) 288 65.1 8.9e-11 CCDS12876.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 286) 288 65.1 9e-11 >>CCDS12904.1 KIR2DL1 gene_id:3802|Hs108|chr19 (348 aa) initn: 1642 init1: 1642 opt: 1644 Z-score: 1710.7 bits: 325.1 E(32554): 5.8e-89 Smith-Waterman score: 2311; 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76.7% identity (83.5% similar) in 352 aa overlap (24-374:119-444) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDV : ::::::::::: :.:: ::::::::::: CCDS12 HAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDV 90 100 110 120 130 140 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 MFEHFLLHREGMFNDTLRLIGEHHDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCYGSVTHSPYQVSA :::::.:::::. .: ::.:. :::::::::::. . ::::::::::: :::::.:: CCDS12 MFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGVSKANFSIGPLMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSA 150 160 170 180 190 200 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 PSDPLDIVIIGLYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPA ::::::::: ::::::::::: :::: ::::::::::: ::::.:::::::::::::: : CCDS12 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSWSSYDIYHLSREGEAHERRLRA 210 220 230 240 250 260 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 GPKVNGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTE :::: :::::::::::::::::::::::. : ::.::::::::::::::.::::::: CCDS12 VPKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRALPCVWSNSSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTE 270 280 290 300 310 320 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 PSSKTERMFHHVGQACLKLPTSSDPTVSACQSNPRHLHILIGTSVVIILFILL-FFLLHR ::::. . : ::::.::::::::.::::: ::::.: CCDS12 PSSKS----------------------GIC----RHLHVLIGTSVVIFLFILLLFFLLYR 330 340 350 360 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 WCSNKKNAAVMDQESAGNRTANSEDSDEQDPQEVTYTQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPP :::::::::::::: ::.::.: .::::::::::::.::.:::: ::::.::::::::: CCDS12 WCSNKKNAAVMDQEPAGDRTVNRQDSDEQDPQEVTYAQLDHCVFIQRKISRPSQRPKTPL 370 380 390 400 410 420 360 370 pF1KE4 TDIIVYTELPNAESRSKVVSCP :: ::::::::: :::::::: CCDS12 TDTSVYTELPNAEPRSKVVSCPRAPQSGLEGVF 430 440 450 >>CCDS58677.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 (438 aa) initn: 1615 init1: 1091 opt: 1091 Z-score: 1136.3 bits: 219.1 E(32554): 5.7e-57 Smith-Waterman score: 1606; 72.7% identity (78.7% similar) in 352 aa overlap (24-374:119-427) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDV : ::::::::::: :.:: ::::::::::: CCDS58 HAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDV 90 100 110 120 130 140 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 MFEHFLLHREGMFNDTLRLIGEHHDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCYGSVTHSPYQVSA :::::.:::::. .: ::.:. :::::::::::. . ::::::::::: :::::.:: CCDS58 MFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGVSKANFSIGPLMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSA 150 160 170 180 190 200 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 PSDPLDIVIIGLYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPA ::::::::: ::::::::::: :::: ::::::::::: ::::.:::::::::::::: : CCDS58 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSWSSYDIYHLSREGEAHERRLRA 210 220 230 240 250 260 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 GPKVNGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTE :::: :::::::::::::::::::::::. : ::.::::::::::: CCDS58 VPKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRALPCVWSNSSDPLLVSVTG----------- 270 280 290 300 310 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 PSSKTERMFHHVGQACLKLPTSSDPTVSACQSNPRHLHILIGTSVVIILFILL-FFLLHR : ::::.::::::::.::::: ::::.: CCDS58 --------------IC------------------RHLHVLIGTSVVIFLFILLLFFLLYR 320 330 340 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 WCSNKKNAAVMDQESAGNRTANSEDSDEQDPQEVTYTQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPP :::::::::::::: ::.::.: .::::::::::::.::.:::: ::::.::::::::: CCDS58 WCSNKKNAAVMDQEPAGDRTVNRQDSDEQDPQEVTYAQLDHCVFIQRKISRPSQRPKTPL 350 360 370 380 390 400 360 370 pF1KE4 TDIIVYTELPNAESRSKVVSCP :: ::::::::: :::::::: CCDS58 TDTSVYTELPNAEPRSKVVSCPRAPQSGLEGVF 410 420 430 >>CCDS12903.1 KIR3DL3 gene_id:115653|Hs108|chr19 (410 aa) initn: 2117 init1: 1012 opt: 1012 Z-score: 1054.8 bits: 204.0 E(32554): 2e-52 Smith-Waterman score: 1435; 68.1% identity (77.3% similar) in 335 aa overlap (24-357:119-410) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDV ::::::::::::: :::: ::::::::::: CCDS12 HAGTYRCCSSHPHSPTGWSAPSNPVVIMVTGVHRKPSLLAHPGPLVKSGETVILQCWSDV 90 100 110 120 130 140 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 MFEHFLLHREGMFNDTLRLIGEHHDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCYGSVTHSPYQVSA ::.:::::::. .: :::.:. ::. :..:.:.. :: :::::::.::::: ::..:: CCDS12 RFERFLLHREGITEDPLRLVGQLHDAGSQVNYSMGPMTPALAGTYRCFGSVTHLPYELSA 150 160 170 180 190 200 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 PSDPLDIVIIGLYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPA ::::::::..::: ::::::: :::: ::::::::::::: .:.::::::.:: : :: : CCDS12 PSDPLDIVVVGLYGKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSLFDIYHLSREAEAGELRLTA 210 220 230 240 250 260 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 GPKVNGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTE .:::::::.:::::.::::.:::::::. :. :: :::: :::::: CCDS12 VLRVNGTFQANFPLGPVTHGGNYRCFGSFRALPHAWSDPSDPLPVSVTGNS--------- 270 280 290 300 310 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 PSSKTERMFHHVGQACLKLPTSSDPTVSACQSNPRHLHILIGTSVVIILF-ILLFFLLHR :.::.::::::::: : ::::::::: CCDS12 ----------------------------------RNLHVLIGTSVVIIPFAILLFFLLHR 320 330 340 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 WCSNKKNAAVMDQESAGNRTANSEDSDEQDPQEVTYTQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPP ::.:::::.::::: :::::.: :::::::::::::.::::::::::::::::::::::: CCDS12 WCANKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDSDEQDPQEVTYAQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPP 350 360 370 380 390 400 360 370 pF1KE4 TDIIVYTELPNAESRSKVVSCP :: : CCDS12 TDTSV 410 >-- initn: 433 init1: 232 opt: 328 Z-score: 346.1 bits: 72.8 E(32554): 5.9e-13 Smith-Waterman score: 328; 46.3% identity (65.9% similar) in 123 aa overlap (1-122:1-117) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDVMFEHFLL :::.::::::::::::.: ::: : . :: : : :: .:. . : ::: : . :..: : CCDS12 MSLMVVSMACVGFFLLEGPWPHVGGQDKPFLSAWPGTVVSEGQHVTLQCRSRLGFNEFSL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 HRE-GMFNDTLRLIGEHHDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCYGSVTHSPYQVSAPSDPLD .: :: . : .. . . .: .. .: :::::: .: ::: ::::.:. CCDS12 SKEDGMP------VPELYNRIFRNSFLMGPVTPAHAGTYRCCSSHPHSPTGWSAPSNPVV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 IVIIGLYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPAGPKVNG :.. CCDS12 IMVTGVHRKPSLLAHPGPLVKSGETVILQCWSDVRFERFLLHREGITEDPLRLVGQLHDA 120 130 140 150 160 170 >>CCDS42620.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 (273 aa) initn: 982 init1: 799 opt: 919 Z-score: 961.0 bits: 186.0 E(32554): 3.3e-47 Smith-Waterman score: 999; 56.5% identity (68.9% similar) in 299 aa overlap (1-298:3-270) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDVMFEHF :: :. .::.:::: :..: : : . :: : :. .: . : :.: :. : CCDS42 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 LLHREGMFNDTLRLIGEHHDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCYGSVTHSPYQVSAPSDPL :... : . . : .. . .: :: .: :::::: : ::: . ::::.:: CCDS42 TLYKK----DGVP-VPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 DIVIIGLYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPAGPKVN :.. ::::::::.:. :::: :::::::::::.::.:.::::::::::: :::: :..: CCDS42 VIMVTGLYEKPSLTARPGPTVRAGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSIN 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 GTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSKT ::::::::::::::: ::::::::: :::::: :::: ::::::::.::::::::: :: CCDS42 GTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKT 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 ERMFHHVGQACLKLPTSSDPTVSACQSNPRHLHILIGTSVVIILFILL-FFLLHRWCSNK : : :::: .: ::.:::: .: :::::::::.: CCDS42 -------GIA-------------------RHLHAVIRYSVAIILFTILPFFLLHRWCSKK 240 250 260 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 KNAAVMDQESAGNRTANSEDSDEQDPQEVTYTQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDIIV : CCDS42 KMLL 270 >>CCDS42619.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 (342 aa) initn: 1379 init1: 795 opt: 916 Z-score: 956.5 bits: 185.5 E(32554): 5.9e-47 Smith-Waterman score: 1122; 53.0% identity (64.1% similar) in 368 aa overlap (1-368:3-305) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDVMFEHF :: :. .::.:::: :..: : : . :: : :. .: . : :.: :. : CCDS42 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 LLHREGMFNDTLRLIGEHHDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCYGSVTHSPYQVSAPSDPL :... : . . : .. . .: :: .: :::::: : ::: . ::::.:: CCDS42 TLYKK----DGVP-VPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 DIVIIGLYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPAGPKVN :.. ::::::::.:. :::: :::::::::::.::.:.::::::::::: :::: :..: CCDS42 VIMVTGLYEKPSLTARPGPTVRAGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSIN 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 GTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSKT ::::::::::::::: ::::::::: :::::: :::: ::::::::.::::::::: :: CCDS42 GTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKT 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 ERMFHHVGQACLKLPTSSDPTVSACQSNPRHLHILIGTSVVIILFILLFFLLHRWCSNKK . CCDS42 D----------------------------------------------------------- 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 NAAVMDQESAGNRTANSEDSDEQDPQEVTYTQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDIIVY ::::.:: ::.::.: :::::::::::::.::.::.::::::: :::: : : :: : CCDS42 -AAVMNQEPAGHRTVNREDSDEQDPQEVTYAQLDHCIFTQRKITGPSQRSKRPSTDTSVC 240 250 260 270 280 290 360 370 pF1KE4 TELPNAESRSKVVSCP :::::: :. CCDS42 IELPNAEPRALSPAHEHHSQALMGSSRETTALSQTQLASSNVPAAGI 300 310 320 330 340 >>CCDS42617.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 (650 aa) initn: 639 init1: 361 opt: 668 Z-score: 695.5 bits: 138.2 E(32554): 2e-32 Smith-Waterman score: 671; 37.7% identity (64.7% similar) in 377 aa overlap (24-374:221-578) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDV :: .:::: ..:: .: :::. ::: ::. CCDS42 RRWWYRCYAYDSNSPYEWSLPSDLLELLVLGVSKKPSLSVQPGPIVAPEETLTLQCGSDA 200 210 220 230 240 250 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 MFEHFLLHREGMFNDTLRLIGEH-HDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCYGSVTHSPYQVS ...:.:...: : :.: : . . :.:.:::... .... .: :::::. . : . : CCDS42 GYNRFVLYKDGE-RDFLQLAGAQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGAHNLSS-EWS 260 270 280 290 300 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 APSDPLDIVIIG-LYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHER-R ::::::::.: : .:.. :::.: :::: .:::::: :.:.. .. . :..:: : . : CCDS42 APSDPLDILIAGQFYDRVSLSVQPGPTVASGENVTLLCQSQGWMQTFLLTKEGAADDPWR 310 320 330 340 350 360 180 190 200 210 220 pF1KE4 LPAGPKVNGTFQADFPLGPAT--HGGTYRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSW : . . . .::.::.::.: :.:::::.:: ..:: .. :::: . :.: ::.. CCDS42 LRSTYQ-SQKYQAEFPMGPVTSAHAGTYRCYGSQSSKPYLLTHPSDPLELVVSG-PSGGP 370 380 390 400 410 420 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 PSPTE-PSSKTERMFHHVGQACLKL-PTSSDPTVSACQSN-PRHLHILIGTSVVIILFIL ::: :.: . : : ::.::: ::. ::: ..:: :..::..: CCDS42 SSPTTGPTSTS-------GPEDQPLTPTGSDP-----QSGLGRHLGVVIGILVAVILLLL 430 440 450 460 470 290 300 310 320 pF1KE4 LFFLL-----HR-----WCSNKKNAAVMDQESAG-------NRTANSEDSDEQDPQEVT- :..:: :: : :....: :. :: .: . ..: : :: . CCDS42 LLLLLFLILRHRRQGKHWTSTQRKADF--QHPAGAVGPEPTDRGLQWRSSPAADAQEENL 480 490 500 510 520 530 330 340 350 360 370 pF1KE4 YTQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAESRSKVVSCP :. ..: . . .. :. . ..:.:. ... : ...: : CCDS42 YAAVKHTQ-PEDGVEMDTRSPHDEDPQAVTYAEVKHSRPRREMASPPSPLSGEFLDTKDR 540 550 560 570 580 590 CCDS42 QAEEDRQMDTEAAASEAPQDVTYAQLHSLTLRREATEPPPSQEGPSPAVPSIYATLAIH 600 610 620 630 640 650 >-- initn: 373 init1: 182 opt: 410 Z-score: 428.2 bits: 88.7 E(32554): 1.6e-17 Smith-Waterman score: 410; 35.9% identity (61.8% similar) in 220 aa overlap (1-216:1-215) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDVMFEHFLL :. ... . :.:. : . . : ::.: :.:: .. . : :.: . ... : CCDS42 MTPILTVLICLGLSLGPRTHVQAGHLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGGQETQEYRL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 HREGMFNDTLRLIGEHHDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCY-GSVTHSPYQVSAPSDPLD .:: . : . . :.:..: : .: . .: :::: :: : . : ::::. CCDS42 YREKKTAPWITRIPQ--ELVKKGQFPIPSITWEHTGRYRCYYGSDTAGR---SESSDPLE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 IVIIGLYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGE-AHERRLPAGPKVN .:. : : ::.:::: .:.: .: ::::.:.:. ..: . : .::: : . : . :.. CCDS42 LVVTGAYIKPTLSAQPSPVVNSGGNVTLQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSQPHAR 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 GTFQADFPLGPATHGGT--YRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSS :. .: : .::.. . :::.. .:::::: :: : CCDS42 GSSRAIFSVGPVSPSRRWWYRCYAYDSNSPYEWSLPSDLLELLVLGVSKKPSLSVQPGPI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 KTERMFHHVGQACLKLPTSSDPTVSACQSNPRHLHILIGTSVVIILFILLFFLLHRWCSN CCDS42 VAPEETLTLQCGSDAGYNRFVLYKDGERDFLQLAGAQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQY 240 250 260 270 280 290 >>CCDS42615.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 (651 aa) initn: 659 init1: 361 opt: 667 Z-score: 694.5 bits: 138.0 E(32554): 2.3e-32 Smith-Waterman score: 673; 37.7% identity (65.0% similar) in 377 aa overlap (24-374:221-579) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDV :: .:::: ..:: .: :::. ::: ::. CCDS42 RRWWYRCYAYDSNSPYEWSLPSDLLELLVLGVSKKPSLSVQPGPIVAPEETLTLQCGSDA 200 210 220 230 240 250 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 MFEHFLLHREGMFNDTLRLIGEH-HDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCYGSVTHSPYQVS ...:.:...: : :.: : . . :.:.:::... .... .: :::::. . : . : CCDS42 GYNRFVLYKDGE-RDFLQLAGAQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGAHNLSS-EWS 260 270 280 290 300 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 APSDPLDIVIIG-LYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHER-R ::::::::.: : .:.. :::.: :::: .:::::: :.:.. .. . :..:: : . : CCDS42 APSDPLDILIAGQFYDRVSLSVQPGPTVASGENVTLLCQSQGWMQTFLLTKEGAADDPWR 310 320 330 340 350 360 180 190 200 210 220 pF1KE4 LPAGPKVNGTFQADFPLGPAT--HGGTYRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSW : . . . .::.::.::.: :.:::::.:: ..:: .. :::: . :.: ::.. CCDS42 LRSTYQ-SQKYQAEFPMGPVTSAHAGTYRCYGSQSSKPYLLTHPSDPLELVVSG-PSGGP 370 380 390 400 410 420 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 PSPTE-PSSKTERMFHHVGQACLKL-PTSSDPTVSACQSN-PRHLHILIGTSVVIILFIL ::: :.: . .: : ::.::: ::. ::: ..:: :..::..: CCDS42 SSPTTGPTSTS------AGPEDQPLTPTGSDP-----QSGLGRHLGVVIGILVAVILLLL 430 440 450 460 470 290 300 310 320 pF1KE4 LFFLL-----HR-----WCSNKKNAAVMDQESAG-------NRTANSEDSDEQDPQEVT- :..:: :: : :....: :. :: .: . ..: : :: . 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