FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4332, 341 aa 1>>>pF1KE4332 341 - 341 aa - 341 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8140+/-0.000716; mu= 14.4218+/- 0.043 mean_var=84.9115+/-16.685, 0's: 0 Z-trim(111.0): 72 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.139185 statistics sampled from 11969 (12043) to 11969 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.738), E-opt: 0.2 (0.37), width: 16 Scan time: 2.930 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS33107.1 KIR2DL3 gene_id:3804|Hs108|chr19 ( 341) 2343 479.9 1.3e-135 CCDS12904.1 KIR2DL1 gene_id:3802|Hs108|chr19 ( 348) 2118 434.7 5.4e-122 CCDS42621.1 KIR3DL1 gene_id:3811|Hs108|chr19 ( 444) 1865 384.0 1.3e-106 CCDS12906.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 ( 455) 1821 375.1 6e-104 CCDS58677.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 ( 438) 1139 238.2 9.8e-63 CCDS12903.1 KIR3DL3 gene_id:115653|Hs108|chr19 ( 410) 1051 220.5 1.9e-57 CCDS42620.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 ( 273) 1046 219.4 2.8e-57 CCDS42619.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 ( 342) 892 188.5 6.8e-48 CCDS33105.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 ( 631) 703 150.7 3e-36 CCDS46175.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 ( 632) 703 150.7 3e-36 CCDS62803.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 634) 702 150.5 3.4e-36 CCDS42615.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 651) 629 135.9 9.1e-32 CCDS42614.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 652) 629 135.9 9.1e-32 CCDS42617.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 650) 627 135.5 1.2e-31 CCDS42616.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 651) 627 135.5 1.2e-31 CCDS42610.1 LILRA6 gene_id:79168|Hs108|chr19 ( 481) 606 131.2 1.7e-30 CCDS62791.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 482) 584 126.8 3.7e-29 CCDS62792.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 510) 584 126.8 3.9e-29 CCDS12886.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 598) 584 126.8 4.4e-29 CCDS42612.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 597) 582 126.4 5.9e-29 CCDS12890.1 LILRA4 gene_id:23547|Hs108|chr19 ( 499) 572 124.4 2e-28 CCDS12901.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 ( 489) 571 124.1 2.3e-28 CCDS46179.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 483) 563 122.5 7e-28 CCDS74453.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 454) 556 121.1 1.8e-27 CCDS12900.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 466) 556 121.1 1.8e-27 CCDS42611.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 491) 552 120.3 3.3e-27 CCDS12885.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 590) 552 120.4 3.8e-27 CCDS46176.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 591) 552 120.4 3.8e-27 CCDS12888.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19 ( 299) 524 114.6 1.1e-25 CCDS12889.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19 ( 287) 505 110.7 1.5e-24 CCDS46182.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 287) 470 103.7 1.9e-22 CCDS46181.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 303) 449 99.5 3.7e-21 CCDS12911.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 304) 449 99.5 3.7e-21 CCDS62802.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 ( 289) 431 95.9 4.4e-20 CCDS46184.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 339) 368 83.3 3.2e-16 CCDS42626.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 620) 368 83.4 5.2e-16 CCDS58678.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 321) 339 77.4 1.7e-14 CCDS62789.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 271) 303 70.2 2.3e-12 CCDS74444.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 282) 298 69.2 4.7e-12 CCDS12876.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 286) 298 69.2 4.7e-12 CCDS12874.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 252) 291 67.7 1.1e-11 CCDS42622.1 FCAR gene_id:2204|Hs108|chr19 ( 265) 287 67.0 2.1e-11 CCDS12875.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 263) 286 66.7 2.4e-11 CCDS12873.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 267) 286 66.8 2.4e-11 CCDS46173.1 TARM1 gene_id:441864|Hs108|chr19 ( 271) 285 66.6 2.8e-11 CCDS82395.1 TARM1 gene_id:441864|Hs108|chr19 ( 279) 278 65.2 7.5e-11 >>CCDS33107.1 KIR2DL3 gene_id:3804|Hs108|chr19 (341 aa) initn: 2343 init1: 2343 opt: 2343 Z-score: 2548.0 bits: 479.9 E(32554): 1.3e-135 Smith-Waterman score: 2343; 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CCDS42 HAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPVVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDI 90 100 110 120 130 140 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 RFQHFLLHREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSA :.::.::.:: :: .:.:. ::::::::::::::: :::::::::::::.:::::: CCDS42 MFEHFFLHKEGISKDPSRLVGQIHDGVSKANFSIGPMMLALAGTYRCYGSVTHTPYQLSA 150 160 170 180 190 200 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSA ::::::::.:: :::::::::::: : :::::::::::::::::::::::: :::::. : CCDS42 PSDPLDIVVTGPYEKPSLSAQPGPKVQAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGGAHERRLPA 210 220 230 240 250 260 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 GPKVNGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWLSPTE ::: :::::::::::::::::::::::: ::::::. :::::::::::::.:: :::: CCDS42 VRKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRHSPYEWSDPSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTE 270 280 290 300 310 320 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 PSSETGNPRHLHVLIGTSVVIILFILLLFFLLHRWCCNKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDS :::..:::::::.:::::::::::::::::::: :: :::::.:::::::::::.: ::: CCDS42 PSSKSGNPRHLHILIGTSVVIILFILLLFFLLHLWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTANSEDS 330 340 350 360 370 380 300 310 320 330 340 pF1KE4 DEQDPQEVTYAQLNHCVFTQRKITHPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAEP :::::.:::::::.::::::::::.::::::::::: :.:::::::.: CCDS42 DEQDPEEVTYAQLDHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDTILYTELPNAKPRSKVVSCP 390 400 410 420 430 440 >-- initn: 303 init1: 193 opt: 310 Z-score: 340.1 bits: 71.7 E(32554): 1.3e-12 Smith-Waterman score: 310; 43.9% identity (64.2% similar) in 123 aa overlap (1-123:1-118) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFQHFLL ::::::::.:::.::.: : :: : . :: : : :. .: : :.: ::..:.: CCDS42 MSLMVVSMACVGLFLVQRAGPHMGGQDKPFLSAWPSAVVPRGGHVTLRCHYRHRFNNFML 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 HREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI ..: : .: : : . . .:...:. ::.: : :: ::: ::::.:. : CCDS42 YKE----DRIH-IPIFHGRIFQESFNMSPVTTAHAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPVVI 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVNGT ..: CCDS42 MVTGNHRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDIMFEHFFLHKEGISKDPSRLVGQIHDGV 120 130 140 150 160 170 >>CCDS12906.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 (455 aa) initn: 1821 init1: 1821 opt: 1821 Z-score: 1979.7 bits: 375.1 E(32554): 6e-104 Smith-Waterman score: 1821; 84.3% identity (91.2% similar) in 318 aa overlap (24-341:119-436) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDV : :::::::::::::.:: ::::::::::: CCDS12 HAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDV 90 100 110 120 130 140 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 RFQHFLLHREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSA :.::.::::: .: .:.:. :::::::::::::.: ::::::::::: :::::::: CCDS12 MFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGVSKANFSIGPLMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSA 150 160 170 180 190 200 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSA :::::::::::::::::::::::::: :::.::::::: ::::.:::::::::::::. : CCDS12 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSWSSYDIYHLSREGEAHERRLRA 210 220 230 240 250 260 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 GPKVNGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWLSPTE :::: :::::::::::::::::::::::: : :::::::::::::::::.:: :::: CCDS12 VPKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRALPCVWSNSSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTE 270 280 290 300 310 320 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 PSSETGNPRHLHVLIGTSVVIILFILLLFFLLHRWCCNKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDS :::..: :::::::::::::.::::::::::.::: :::::.::::::::.:::::.:: CCDS12 PSSKSGICRHLHVLIGTSVVIFLFILLLFFLLYRWCSNKKNAAVMDQEPAGDRTVNRQDS 330 340 350 360 370 380 300 310 320 330 340 pF1KE4 DEQDPQEVTYAQLNHCVFTQRKITHPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAEP :::::::::::::.:::: ::::..:::::::: :: :::::::::: CCDS12 DEQDPQEVTYAQLDHCVFIQRKISRPSQRPKTPLTDTSVYTELPNAEPRSKVVSCPRAPQ 390 400 410 420 430 440 CCDS12 SGLEGVF 450 >-- initn: 307 init1: 187 opt: 331 Z-score: 362.7 bits: 75.9 E(32554): 7e-14 Smith-Waterman score: 331; 47.2% identity (62.6% similar) in 123 aa overlap (1-123:1-118) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFQHFLL ::: ::::.:::::::::::: : . :: : :.:. .: : ::: :..:.: CCDS12 MSLTVVSMACVGFFLLQGAWPLMGGQDKPFLSARPSTVVPRGGHVALQCHYRRGFNNFML 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 HREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI ..: : : . : . . .: .::. :::::: :: :: ::::.:: : CCDS12 YKE----DRSH-VPIFHGRIFQESFIMGPVTPAHAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVI 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVNGT ..: CCDS12 MVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDVMFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGV 120 130 140 150 160 170 >>CCDS58677.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 (438 aa) initn: 1192 init1: 1139 opt: 1139 Z-score: 1239.8 bits: 238.2 E(32554): 9.8e-63 Smith-Waterman score: 1681; 80.2% identity (86.2% similar) in 318 aa overlap (24-341:119-419) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDV : :::::::::::::.:: ::::::::::: CCDS58 HAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDV 90 100 110 120 130 140 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 RFQHFLLHREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSA :.::.::::: .: .:.:. :::::::::::::.: ::::::::::: :::::::: CCDS58 MFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGVSKANFSIGPLMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSA 150 160 170 180 190 200 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSA :::::::::::::::::::::::::: :::.::::::: ::::.:::::::::::::. : CCDS58 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSWSSYDIYHLSREGEAHERRLRA 210 220 230 240 250 260 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 GPKVNGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWLSPTE :::: :::::::::::::::::::::::: : :::::::::::::: CCDS58 VPKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRALPCVWSNSSDPLLVSVTGIC--------- 270 280 290 300 310 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 PSSETGNPRHLHVLIGTSVVIILFILLLFFLLHRWCCNKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDS :::::::::::::.::::::::::.::: :::::.::::::::.:::::.:: CCDS58 --------RHLHVLIGTSVVIFLFILLLFFLLYRWCSNKKNAAVMDQEPAGDRTVNRQDS 320 330 340 350 360 370 300 310 320 330 340 pF1KE4 DEQDPQEVTYAQLNHCVFTQRKITHPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAEP :::::::::::::.:::: ::::..:::::::: :: :::::::::: CCDS58 DEQDPQEVTYAQLDHCVFIQRKISRPSQRPKTPLTDTSVYTELPNAEPRSKVVSCPRAPQ 380 390 400 410 420 430 CCDS58 SGLEGVF >-- initn: 307 init1: 187 opt: 331 Z-score: 362.9 bits: 75.9 E(32554): 6.8e-14 Smith-Waterman score: 331; 47.2% identity (62.6% similar) in 123 aa overlap (1-123:1-118) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFQHFLL ::: ::::.:::::::::::: : . :: : :.:. .: : ::: :..:.: CCDS58 MSLTVVSMACVGFFLLQGAWPLMGGQDKPFLSARPSTVVPRGGHVALQCHYRRGFNNFML 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 HREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI ..: : : . : . . .: .::. :::::: :: :: ::::.:: : CCDS58 YKE----DRSH-VPIFHGRIFQESFIMGPVTPAHAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVI 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVNGT ..: CCDS58 MVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDVMFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGV 120 130 140 150 160 170 >>CCDS12903.1 KIR3DL3 gene_id:115653|Hs108|chr19 (410 aa) initn: 2201 init1: 1051 opt: 1051 Z-score: 1144.7 bits: 220.5 E(32554): 1.9e-57 Smith-Waterman score: 1560; 75.7% identity (85.4% similar) in 309 aa overlap (24-332:119-410) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDV :::::::::::::::::: ::::::::::: CCDS12 HAGTYRCCSSHPHSPTGWSAPSNPVVIMVTGVHRKPSLLAHPGPLVKSGETVILQCWSDV 90 100 110 120 130 140 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 RFQHFLLHREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSA ::..::::::: .: :.:.:. ::. :..:.:.::: :::::::.::::: ::.::: CCDS12 RFERFLLHREGITEDPLRLVGQLHDAGSQVNYSMGPMTPALAGTYRCFGSVTHLPYELSA 150 160 170 180 190 200 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSA ::::::::..::: :::::::::::: :::.::::::::: .:.::::::.:: : :..: CCDS12 PSDPLDIVVVGLYGKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSLFDIYHLSREAEAGELRLTA 210 220 230 240 250 260 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 GPKVNGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWLSPTE .:::::::.:::::.::::.:::::::: :. ::. :::: :::::: CCDS12 VLRVNGTFQANFPLGPVTHGGNYRCFGSFRALPHAWSDPSDPLPVSVTGNS--------- 270 280 290 300 310 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 PSSETGNPRHLHVLIGTSVVIILFILLLFFLLHRWCCNKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDS :.:::::::::::: : .:::::::::: ::::::::::::::::::::::: CCDS12 --------RNLHVLIGTSVVIIPFAILLFFLLHRWCANKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDS 320 330 340 350 360 370 300 310 320 330 340 pF1KE4 DEQDPQEVTYAQLNHCVFTQRKITHPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAEP ::::::::::::::::::::::::.::::::::::: : CCDS12 DEQDPQEVTYAQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDTSV 380 390 400 410 >-- initn: 356 init1: 231 opt: 348 Z-score: 381.8 bits: 79.3 E(32554): 6e-15 Smith-Waterman score: 348; 47.2% identity (66.7% similar) in 123 aa overlap (1-123:1-118) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFQHFLL ::::::::.:::::::.: ::: : . :: : : :: .:. . : ::: : . :..: : CCDS12 MSLMVVSMACVGFFLLEGPWPHVGGQDKPFLSAWPGTVVSEGQHVTLQCRSRLGFNEFSL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 HREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI .: : . . : .. . . .: .::. :::::: .: ::: ::::.:. : CCDS12 SKE----DGMP-VPELYNRIFRNSFLMGPVTPAHAGTYRCCSSHPHSPTGWSAPSNPVVI 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVNGT ..: CCDS12 MVTGVHRKPSLLAHPGPLVKSGETVILQCWSDVRFERFLLHREGITEDPLRLVGQLHDAG 120 130 140 150 160 170 >>CCDS42620.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 (273 aa) initn: 1002 init1: 914 opt: 1046 Z-score: 1141.8 bits: 219.4 E(32554): 2.8e-57 Smith-Waterman score: 1046; 59.3% identity (75.5% similar) in 273 aa overlap (1-273:3-270) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFQHF :: :. ..:.:::: :..: : : . :: : :. .: . : :.: :. : CCDS42 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 LLHREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPL :.. :: . . : .. . .: :.:. :::::: : ::: . ::::.:: CCDS42 TLYK----KDGVP-VPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 DIVITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVN :..:::::::::.:.::::: :::.:::::::.::.:.::::::::::: :. : :..: CCDS42 VIMVTGLYEKPSLTARPGPTVRAGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSIN 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 GTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWLSPTEPSSET ::::::::::::::: ::::::::. ::::::. :::: ::::::::.:: :::::: .: CCDS42 GTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKT 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 GNPRHLHVLIGTSVVIILFILLLFFLLHRWCCNKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDSDEQDP : ::::..: ::.:::: .: :::::::: .:: CCDS42 GIARHLHAVIRYSVAIILFTILPFFLLHRWCSKKKMLL 240 250 260 270 300 310 320 330 340 pF1KE4 QEVTYAQLNHCVFTQRKITHPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAEP >>CCDS42619.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 (342 aa) initn: 1032 init1: 760 opt: 892 Z-score: 973.3 bits: 188.5 E(32554): 6.8e-48 Smith-Waterman score: 1178; 56.6% identity (69.8% similar) in 341 aa overlap (1-341:3-303) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFQHF :: :. ..:.:::: :..: : : . :: : :. .: . : :.: :. : CCDS42 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 LLHREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPL :.. :: . . : .. . .: :.:. :::::: : ::: . ::::.:: CCDS42 TLYK----KDGVP-VPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 DIVITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVN :..:::::::::.:.::::: :::.:::::::.::.:.::::::::::: :. : :..: CCDS42 VIMVTGLYEKPSLTARPGPTVRAGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSIN 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 GTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWLSPTEPSSET ::::::::::::::: ::::::::. ::::::. :::: ::::::::.:: :::::: .: CCDS42 GTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKT 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 GNPRHLHVLIGTSVVIILFILLLFFLLHRWCCNKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDSDEQDP .:.::.:::::.::::::::::::: CCDS42 -----------------------------------DAAVMNQEPAGHRTVNREDSDEQDP 240 250 260 300 310 320 330 340 pF1KE4 QEVTYAQLNHCVFTQRKITHPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAEP ::::::::.::.::::::: :::: : : :: : ::::::: CCDS42 QEVTYAQLDHCIFTQRKITGPSQRSKRPSTDTSVCIELPNAEPRALSPAHEHHSQALMGS 270 280 290 300 310 320 CCDS42 SRETTALSQTQLASSNVPAAGI 330 340 >>CCDS33105.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 (631 aa) initn: 409 init1: 398 opt: 703 Z-score: 764.3 bits: 150.7 E(32554): 3e-36 Smith-Waterman score: 735; 39.9% identity (67.2% similar) in 338 aa overlap (24-341:220-551) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDV :: ::::::. ::.. ... ::: ::: CCDS33 HRWRFTCYYYYTNTPWVWSHPSDPLEILPSGVSRKPSLLTLQGPVLAPGQSLTLQCGSDV 190 200 210 220 230 240 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 RFQHFLLHREGKFKDTLHLIGEH-HDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLS ...:.:..::. .: :. :.. . :.:.:::..::. .. .: :::::. . : . : CCDS33 GYDRFVLYKEGE-RDFLQRPGQQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGAHNLSS-EWS 250 260 270 280 290 300 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 APSDPLDIVITG-LYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRF ::::::::.::: .:. :::::::::: .::..:: :.::. .: . :..:: :: CCDS33 APSDPLDILITGQIYDTVSLSAQPGPTVASGENMTLLCQSRGYFDTFLLTKEGAAHPPLR 310 320 330 340 350 360 180 190 200 210 220 pF1KE4 SAGPKVNGTFQADFPLGPAT--HGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWL . .::.::..:.: :.:::::.:: ..:. : :.:: . :.:. ..: : CCDS33 LRSMYGAHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSRSSNPHLLSFPSEPLELMVSGHSGGSSL 370 380 390 400 410 420 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 SPTEPSSETGNPRHLHVLIGTSVVIILFILLLFFLL--------HRWCCNKKNAVVMDQE :: : : : :.:.::::.::...:...::.::: :: ..:. :. CCDS33 PPTGPPSTPGLGRYLEVLIGVSVAFVLLLFLLLFLLLLRQRHSKHRTSDQRKTDF---QR 430 440 450 460 470 480 290 300 310 320 330 pF1KE4 PAG-------NRTVNREDSDEQDPQEVT-YAQLNHCVFTQRKITHPSQRPKTPPTDIIVY ::: .: . :..: : :: . :: .. . .. .. :: :. . ..: CCDS33 PAGAAETEPKDRGLLRRSSPAADVQEENLYAAVKD-TQSEDRVELDSQSPHDEDPQAVTY 490 500 510 520 530 540 340 pF1KE4 TELPNAEP . . .. : CCDS33 APVKHSSPRREMASPPSSLSGEFLDTKDRQVEEDRQMDTEAAASEASQDVTYAQLHSLTL 550 560 570 580 590 600 >-- initn: 312 init1: 197 opt: 447 Z-score: 486.5 bits: 99.3 E(32554): 8.9e-21 Smith-Waterman score: 447; 35.1% identity (64.0% similar) in 222 aa overlap (1-218:1-216) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFQHFLL :. .....:.:. : . . : ::.: :.:: ... : . : .... :.. : CCDS33 MTPALTALLCLGLSLGPRTRMQAGPFPKPTLWAEPGSVISWGSPVTIWCQGSLEAQEYQL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 HREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI .::. . . .. . .:: ::: : : :: :::. .: : :::::.. 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CCDS46 PPTGPPSTPGLGRYLEVLIGVSVAFVLLLFLLLFLLLLRQRHSKHRTSDQRKTDF---QR 430 440 450 460 470 480 290 300 310 320 330 pF1KE4 PAG-------NRTVNREDSDEQDPQEVT-YAQLNHCVFTQRKITHPSQRPKTPPTDIIVY ::: .: . :..: : :: . :: .. .: .: :. . ..: CCDS46 PAGAAETEPKDRGLLRRSSPAADVQEENLYAAVKDTQSEDRVELDSQQSPHDEDPQAVTY 490 500 510 520 530 540 340 pF1KE4 TELPNAEP . . .. : CCDS46 APVKHSSPRREMASPPSSLSGEFLDTKDRQVEEDRQMDTEAAASEASQDVTYAQLHSLTL 550 560 570 580 590 600 >-- initn: 312 init1: 197 opt: 447 Z-score: 486.5 bits: 99.3 E(32554): 8.9e-21 Smith-Waterman score: 447; 35.1% identity (64.0% similar) in 222 aa overlap (1-218:1-216) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFQHFLL :. .....:.:. : . . : ::.: :.:: ... : . : .... :.. : CCDS46 MTPALTALLCLGLSLGPRTRMQAGPFPKPTLWAEPGSVISWGSPVTIWCQGSLEAQEYQL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 HREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI .::. . . .. . .:: ::: : : :: :::. .: : :::::.. CCDS46 DKEGSPEPWDR--NNPLEPKNKARFSIPSMTQHHAGRYRCH---YYSSAGWSEPSDPLEL 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE4 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHE--RRFSAGPKVN :.::.:.::.::: :.:.: .: ..:: :.:...: . : .::: :. : ... . CCDS46 VMTGFYNKPTLSALPSPVVASGGNMTLRCGSQKGYHHFVLMKEGE-HQLPRTLDSQQLHS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 GTFQADFPLGPAT--HGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWLSPTEPSS : ::: ::.::.: : . :. . ..:. ::. :::: . CCDS46 GGFQALFPVGPVTPSHRWRFTCYYYYTNTPWVWSHPSDPLEILPSGVSRKPSLLTLQGPV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 ETGNPRHLHVLIGTSVVIILFILLLFFLLHRWCCNKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDSDEQ CCDS46 LAPGQSLTLQCGSDVGYDRFVLYKEGERDFLQRPGQQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQY 240 250 260 270 280 290 341 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 02:15:38 2016 done: Sun Nov 6 02:15:38 2016 Total Scan time: 2.930 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]