Result of FASTA (ccds) for
pFN21ASDA0053
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0053, 638 aa
1>>>pF1KSDA0053 638 - 638 aa - 638 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9627+/-0.00109; mu= 3.5556+/- 0.066
mean_var=222.6607+/-44.171, 0's: 0 Z-trim(111.1): 137 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.085951
statistics sampled from 11991 (12129) to 11991 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.716), E-opt: 0.2 (0.373), width: 16
Scan time: 4.080
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46312.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2 ( 638) 4247 539.9 3.9e-153
CCDS54364.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2 ( 639) 4235 538.4 1.1e-152
CCDS33214.2 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2 ( 646) 4157 528.8 9.1e-150
CCDS54363.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2 ( 606) 3228 413.5 4.1e-115
CCDS7227.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 ( 698) 1351 180.8 5.3e-45
CCDS58081.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 ( 704) 1346 180.2 8.2e-45
CCDS34025.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4 ( 748) 1239 167.0 8.5e-41
CCDS58079.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 ( 608) 1031 141.1 4.2e-33
CCDS58080.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 ( 714) 955 131.7 3.3e-30
CCDS43246.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4 ( 653) 952 131.3 4e-30
CCDS3611.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4 ( 655) 860 119.9 1.1e-26
>>CCDS46312.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2 (638 aa)
initn: 4247 init1: 4247 opt: 4247 Z-score: 2862.7 bits: 539.9 E(32554): 3.9e-153
Smith-Waterman score: 4247; 100.0% identity (100.0% similar) in 638 aa overlap (1-638:1-638)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSLGQSACLFLSIARSRSVMTGEQMAAFHPSSTPNPLERPIKMGWLKKQRSIVKNWQQRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MSLGQSACLFLSIARSRSVMTGEQMAAFHPSSTPNPLERPIKMGWLKKQRSIVKNWQQRY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWDQNRMGQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWDQNRMGQD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCGVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCGVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQLNCAVNKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQLNCAVNKM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDIPLSPPAQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDIPLSPPAQK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD NDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSFSSMTSDSDTTSPTGQQPSDAFPEDSSKVPRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSFSSMTSDSDTTSPTGQQPSDAFPEDSSKVPRE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KPGDWKMQSRKRTQTLPNRKCFLTSAFQGANSSKMEIFKNEFWSPSSEAKAGEGHRRTMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KPGDWKMQSRKRTQTLPNRKCFLTSAFQGANSSKMEIFKNEFWSPSSEAKAGEGHRRTMS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QDLRQLSDSQRTSTYDNVPSLPGSPGEEASALSSQACDSKGDTLASPNSETGPGKKNSGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QDLRQLSDSQRTSTYDNVPSLPGSPGEEASALSSQACDSKGDTLASPNSETGPGKKNSGE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD EEIDSLQRMVQELRKEIETQKQMYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLNEELEKEKKKSAALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EEIDSLQRMVQELRKEIETQKQMYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLNEELEKEKKKSAALE
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KSD ISLRNMERSREDVEKRNKALEEEVKEFVKSMKEPKTEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ISLRNMERSREDVEKRNKALEEEVKEFVKSMKEPKTEA
610 620 630
>>CCDS54364.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2 (639 aa)
initn: 4233 init1: 3226 opt: 4235 Z-score: 2854.6 bits: 538.4 E(32554): 1.1e-152
Smith-Waterman score: 4235; 99.8% identity (99.8% similar) in 639 aa overlap (1-638:1-639)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSLGQSACLFLSIARSRSVMTGEQMAAFHPSSTPNPLERPIKMGWLKKQRSIVKNWQQRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MSLGQSACLFLSIARSRSVMTGEQMAAFHPSSTPNPLERPIKMGWLKKQRSIVKNWQQRY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWDQNRMGQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWDQNRMGQD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KSD SYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCG-VFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEF
:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCGAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD VPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQLNCAVNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQLNCAVNK
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD MSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDIPLSPPAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDIPLSPPAQ
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD KNDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSFSSMTSDSDTTSPTGQQPSDAFPEDSSKVPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KNDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSFSSMTSDSDTTSPTGQQPSDAFPEDSSKVPR
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD EKPGDWKMQSRKRTQTLPNRKCFLTSAFQGANSSKMEIFKNEFWSPSSEAKAGEGHRRTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EKPGDWKMQSRKRTQTLPNRKCFLTSAFQGANSSKMEIFKNEFWSPSSEAKAGEGHRRTM
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD SQDLRQLSDSQRTSTYDNVPSLPGSPGEEASALSSQACDSKGDTLASPNSETGPGKKNSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SQDLRQLSDSQRTSTYDNVPSLPGSPGEEASALSSQACDSKGDTLASPNSETGPGKKNSG
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD EEEIDSLQRMVQELRKEIETQKQMYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLNEELEKEKKKSAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EEEIDSLQRMVQELRKEIETQKQMYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLNEELEKEKKKSAAL
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630
pF1KSD EISLRNMERSREDVEKRNKALEEEVKEFVKSMKEPKTEA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EISLRNMERSREDVEKRNKALEEEVKEFVKSMKEPKTEA
610 620 630
>>CCDS33214.2 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2 (646 aa)
initn: 4155 init1: 3226 opt: 4157 Z-score: 2802.3 bits: 528.8 E(32554): 9.1e-150
Smith-Waterman score: 4157; 99.8% identity (99.8% similar) in 627 aa overlap (13-638:20-646)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSLGQSACLFLSIARSRSVMTGEQMAAFHPSSTPNPLERPIKMGWLKKQRSIV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MSLKLPRNWDFNLKVEAAKIARSRSVMTGEQMAAFHPSSTPNPLERPIKMGWLKKQRSIV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD KNWQQRYFVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KNWQQRYFVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD QNRMGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCG-VFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QNRMGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCGAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPIL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD VEKCAEFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VEKCAEFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD RDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQ
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD LNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDI
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD PLSPPAQKNDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSFSSMTSDSDTTSPTGQQPSDAFPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PLSPPAQKNDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSFSSMTSDSDTTSPTGQQPSDAFPE
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD DSSKVPREKPGDWKMQSRKRTQTLPNRKCFLTSAFQGANSSKMEIFKNEFWSPSSEAKAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DSSKVPREKPGDWKMQSRKRTQTLPNRKCFLTSAFQGANSSKMEIFKNEFWSPSSEAKAG
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD EGHRRTMSQDLRQLSDSQRTSTYDNVPSLPGSPGEEASALSSQACDSKGDTLASPNSETG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EGHRRTMSQDLRQLSDSQRTSTYDNVPSLPGSPGEEASALSSQACDSKGDTLASPNSETG
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD PGKKNSGEEEIDSLQRMVQELRKEIETQKQMYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLNEELEKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PGKKNSGEEEIDSLQRMVQELRKEIETQKQMYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLNEELEKE
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630
pF1KSD KKKSAALEISLRNMERSREDVEKRNKALEEEVKEFVKSMKEPKTEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KKKSAALEISLRNMERSREDVEKRNKALEEEVKEFVKSMKEPKTEA
610 620 630 640
>>CCDS54363.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2 (606 aa)
initn: 3882 init1: 3226 opt: 3228 Z-score: 2180.1 bits: 413.5 E(32554): 4.1e-115
Smith-Waterman score: 3808; 93.8% identity (93.8% similar) in 626 aa overlap (13-638:20-606)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSLGQSACLFLSIARSRSVMTGEQMAAFHPSSTPNPLERPIKMGWLKKQRSIV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MSLKLPRNWDFNLKVEAAKIARSRSVMTGEQMAAFHPSSTPNPLERPIKMGWLKKQRSIV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD KNWQQRYFVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KNWQQRYFVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIP----
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD QNRMGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCGVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILV
:::::::::::::::::::::::::
CCDS54 -----------------------------------VFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILV
120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KSD EKCAEFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EKCAEFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLR
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KSD DLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQL
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KSD NCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDIP
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LSPPAQKNDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSFSSMTSDSDTTSPTGQQPSDAFPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LSPPAQKNDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSFSSMTSDSDTTSPTGQQPSDAFPED
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KSD SSKVPREKPGDWKMQSRKRTQTLPNRKCFLTSAFQGANSSKMEIFKNEFWSPSSEAKAGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SSKVPREKPGDWKMQSRKRTQTLPNRKCFLTSAFQGANSSKMEIFKNEFWSPSSEAKAGE
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KSD GHRRTMSQDLRQLSDSQRTSTYDNVPSLPGSPGEEASALSSQACDSKGDTLASPNSETGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GHRRTMSQDLRQLSDSQRTSTYDNVPSLPGSPGEEASALSSQACDSKGDTLASPNSETGP
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KSD GKKNSGEEEIDSLQRMVQELRKEIETQKQMYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLNEELEKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GKKNSGEEEIDSLQRMVQELRKEIETQKQMYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLNEELEKEK
510 520 530 540 550 560
600 610 620 630
pF1KSD KKSAALEISLRNMERSREDVEKRNKALEEEVKEFVKSMKEPKTEA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KKSAALEISLRNMERSREDVEKRNKALEEEVKEFVKSMKEPKTEA
570 580 590 600
>>CCDS7227.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 (698 aa)
initn: 1544 init1: 837 opt: 1351 Z-score: 921.4 bits: 180.8 E(32554): 5.3e-45
Smith-Waterman score: 1521; 42.9% identity (65.4% similar) in 679 aa overlap (14-620:12-673)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSLGQSACLFLSIARSRSVMTGEQMAAFHPSSTPNPLER-PI-KMGWLKKQRSIVKNWQQ
:::.:.. ::: . :. : : . :. : :::::::::.:::::
CCDS72 MLSPKIRQARRARSKSLVMGEQ--SRSPGRMPCPHRLGPVLKAGWLKKQRSIMKNWQQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD RYFVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWDQNR--
:.::::..::.::::... :::: . : : . :. .::. :: .::: :.. . .
CCDS72 RWFVLRGDQLFYYKDKDEIKPQGFISLQGTQVTELPPGPEDPGKHLFEISPGGAGEREKV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD -MGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCG--VFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILV
. .. .:::::: .::.::. .::: .: : .:::::.::: .:.:.::.:.:.::
CCDS72 PANPEALLLMASSQRDMEDWVQAIRRVIWAPLGGGIFGQRLEETVHHERKYGPRLAPLLV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD EKCAEFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLR
:.:..:: :.: .:::.::.::: :::..:.:.:: ::.: :: :::::::::::::::
CCDS72 EQCVDFIRERGLTEEGLFRMPGQANLVRDLQDSFDCGEKPLFDSTTDVHTVASLLKLYLR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD DLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQL
.:::::::...:: :: :.:: . ::... :: ::.: ::. ::.:: :::.:: :.:
CCDS72 ELPEPVVPFARYEDFLSCAQLLTKDEGEGTLELAKQVSNLPQANYNLLRYICKFLDEVQA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD NCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDIP
::::::.:::::.: :..: .::::..::.:: .:..::..:: : :: . .:
CCDS72 YSNVNKMSVQNLATVFGPNILRPQVEDPVTIMEGTSLVQHLMTVLIRKHSQLF--TAPVP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LSPPAQKNDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSFSSMTSDSDTTSPTGQQPSDAFPED
.: . .. . : ::: . : : :. . . :.: : :
CCDS72 EGPTSPRGGLQCA------VGWGSEEVTRDSQGEPGGPGLPAHRTSSLDGA----AVAVL
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460
pF1KSD SSKVPREKPGDWKMQSRKRTQTLPNRKC-F-----LTSAFQGANSS-KMEIFKNEF-WSP
: .: ::. . . :..::::. : : :... .:..:: .. :... :
CCDS72 SRTAPT-GPGS-RCSPGKKVQTLPSWKSSFRQPRSLSGSPKGGGSSLEVPIISSGGNWLM
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510
pF1KSD SSEAKAGEGHRRTMSQD-LRQLSDSQRTSTYDNVPS---LPGSPGEEASALS--SQACDS
.. .. .::::. : : :.. .. :: :::::::. .:: :. . : : :.. .:
CCDS72 NGLSSL-RGHRRASSGDRLKDSGSVQRLSTYDNVPAPGLVPGIPSVASMAWSGASSSESS
470 480 490 500 510 520
520 530
pF1KSD KGDTLAS--------------------------PNS--------------ETGPGKKNSG
: .:.: :.: :.: : .::
CCDS72 VGGSLSSCTACRASDSSARSSLHTDWALEPSPLPSSSEDPKSLDLDHSMDEAGAGASNSE
530 540 550 560 570 580
540 550 560 570 580
pF1KSD EEEIDS-----------LQRMVQELRKEIETQKQMYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLNEE
: :: :: .: ::: :. :. ::...: .:. . :. .. ::.::
CCDS72 PSEPDSPTREHARRSEALQGLVTELRAELCRQRTEYERSVKRIEEGSADLRKRMSRLEEE
590 600 610 620 630 640
590 600 610 620 630
pF1KSD LEKEKKKSAALEISLRNMERSREDVEKRNKALEEEVKEFVKSMKEPKTEA
:..:::: :::.::: ::.:::.:.::. :
CCDS72 LDQEKKKYIMLEIKLRNSERAREDAERRNQLLQREMEEFFSTLGSLTVGAKGARAPK
650 660 670 680 690
>>CCDS58081.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 (704 aa)
initn: 1539 init1: 837 opt: 1346 Z-score: 918.0 bits: 180.2 E(32554): 8.2e-45
Smith-Waterman score: 1516; 42.8% identity (65.3% similar) in 678 aa overlap (15-620:19-679)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSLGQSACLFLSIARSRSVMTGEQMAAFHPSSTPNPLER-PI-KMGWLKKQRSIVK
::.:.. ::: . :. : : . :. : :::::::::.:
CCDS58 MLPTASSKRRTFAARYFTRSKSLVMGEQSRS--PGRMPCPHRLGPVLKAGWLKKQRSIMK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD NWQQRYFVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWDQ
:::::.::::..::.::::... :::: . : : . :. .::. :: .::: :.. .
CCDS58 NWQQRWFVLRGDQLFYYKDKDEIKPQGFISLQGTQVTELPPGPEDPGKHLFEISPGGAGE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KSD NR---MGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCG--VFGQRLDETVAYEQKFGPHLV
. . .. .:::::: .::.::. .::: .: : .:::::.::: .:.:.::.:.
CCDS58 REKVPANPEALLLMASSQRDMEDWVQAIRRVIWAPLGGGIFGQRLEETVHHERKYGPRLA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD PILVEKCAEFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLK
:.:::.:..:: :.: .:::.::.::: :::..:.:.:: ::.: :: :::::::::::
CCDS58 PLLVEQCVDFIRERGLTEEGLFRMPGQANLVRDLQDSFDCGEKPLFDSTTDVHTVASLLK
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD LYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLH
::::.:::::::...:: :: :.:: . ::... :: ::.: ::. ::.:: :::.::
CCDS58 LYLRELPEPVVPFARYEDFLSCAQLLTKDEGEGTLELAKQVSNLPQANYNLLRYICKFLD
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD EIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKS
:.: ::::::.:::::.: :..: .::::..::.:: .:..::..:: : :: .
CCDS58 EVQAYSNVNKMSVQNLATVFGPNILRPQVEDPVTIMEGTSLVQHLMTVLIRKHSQLF--T
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD KDIPLSPPAQKNDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSFSSMTSDSDTTSPTGQQPSDA
.: .: . .. . : ::: . : : :. . . :.: : :
CCDS58 APVPEGPTSPRGGLQCA------VGWGSEEVTRDSQGEPGGPGLPAHRTSSLDGA----A
360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KSD FPEDSSKVPREKPGDWKMQSRKRTQTLPNRKC-F-----LTSAFQGANSS-KMEIFKNEF
: .: ::. . . :..::::. : : :... .:..:: .. :...
CCDS58 VAVLSRTAPT-GPGS-RCSPGKKVQTLPSWKSSFRQPRSLSGSPKGGGSSLEVPIISSGG
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510
pF1KSD -WSPSSEAKAGEGHRRTMSQD-LRQLSDSQRTSTYDNVPS---LPGSPGEEASALS--SQ
: .. .. .::::. : : :.. .. :: :::::::. .:: :. . : : :.
CCDS58 NWLMNGLSSL-RGHRRASSGDRLKDSGSVQRLSTYDNVPAPGLVPGIPSVASMAWSGASS
470 480 490 500 510 520
520 530
pF1KSD ACDSKGDTLAS--------------------------PNS--------------ETGPGK
. .: : .:.: :.: :.: :
CCDS58 SESSVGGSLSSCTACRASDSSARSSLHTDWALEPSPLPSSSEDPKSLDLDHSMDEAGAGA
530 540 550 560 570 580
540 550 560 570 580
pF1KSD KNSGEEEIDS-----------LQRMVQELRKEIETQKQMYEEQIKNLEKENYDVWAKVVR
.:: : :: :: .: ::: :. :. ::...: .:. . :. .. :
CCDS58 SNSEPSEPDSPTREHARRSEALQGLVTELRAELCRQRTEYERSVKRIEEGSADLRKRMSR
590 600 610 620 630 640
590 600 610 620 630
pF1KSD LNEELEKEKKKSAALEISLRNMERSREDVEKRNKALEEEVKEFVKSMKEPKTEA
:.:::..:::: :::.::: ::.:::.:.::. :
CCDS58 LEEELDQEKKKYIMLEIKLRNSERAREDAERRNQLLQREMEEFFSTLGSLTVGAKGARAP
650 660 670 680 690 700
CCDS58 K
>>CCDS34025.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4 (748 aa)
initn: 1471 init1: 846 opt: 1239 Z-score: 845.9 bits: 167.0 E(32554): 8.5e-41
Smith-Waterman score: 1248; 42.2% identity (67.3% similar) in 535 aa overlap (32-498:7-535)
10 20 30 40 50
pF1KSD SLGQSACLFLSIARSRSVMTGEQMAAFHPSSTPNPLE-----RPIKMGWLKKQRSIVKNW
:: :: . :: :::.:: ..::.:
CCDS34 MEENNDSTENPQQGQGRQNAIKCGWLRKQGGFVKTW
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KSD QQRYFVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWDQNR
. :.:::...::::.:::..::: : ..::: ..: : :. :::.::..:.. :..:
CCDS34 HTRWFVLKGDQLYYFKDEDETKPLGTIFLPGNKVSEHPCNEENPGKFLFEVVPGG-DRDR
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KSD M--GQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCG--VFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPIL
: ...::.::::.: .::.::: .::: : : .:::.:..:: ::...: .:.:.:
CCDS34 MTANHESYLLMASTQNDMEDWVKSIRRVIWGPFGGGIFGQKLEDTVRYEKRYGNRLAPML
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KSD VEKCAEFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYL
::.:..:: ..: .:::.:::::: ::::.:.:::: ::.:::: .::::::::::::::
CCDS34 VEQCVDFIRQRGLKEEGLFRLPGQANLVKELQDAFDCGEKPSFDSNTDVHTVASLLKLYL
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD RDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQ
:.:::::.:...:: :: :..: . .: . .:: ::.. :: ::.::.:::::: :.:
CCDS34 RELPEPVIPYAKYEDFLSCAKLLSKEEEAGVKELAKQVKSLPVVNYNLLKYICRFLDEVQ
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD LNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDI
.::::::.:::::.: :..: ::::: .::.:: .:..:..:: :. ::::. ..
CCDS34 SYSGVNKMSVQNLATVFGPNILRPKVEDPLTIMEGTVVVQQLMSVMISKHDCLFPKDAEL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390
pF1KSD PLSPP--------AQK------------NDPKKAPVARSSVGWDATED-LRISRTDSFSS
.: :: :. : .: . : :: .:. : : ... .
CCDS34 QSKPQDGVSNNNEIQKKATMGQLQNKENNNTKDSPSRQCS--WDKSESPQRSSMNNGSPT
340 350 360 370 380 390
400 410 420 430
pF1KSD MTSDSDTTSP--------TGQQP------SDAFPEDSSKVPREKPGDWKMQSRKRTQTLP
: : :.:: ....: . :: . :. : . .. . .. ..::: :
CCDS34 ALSGSKTNSPKNSVHKLDVSRSPPLMVKKNPAFNKGSGIVTNGSFSSSNAEGLEKTQTTP
400 410 420 430 440 450
440 450 460 470
pF1KSD N------RKCFL--TSAFQGANSS-----KMEIF-----------KNEFWSPSSEAKAGE
: :. : ... .:..: .: :. .: : :.. . .
CCDS34 NGSLQARRSSSLKVSGTKMGTHSVQNGTVRMGILNSDTLGNPTNVRNMSWLPNGYVTLRD
460 470 480 490 500 510
480 490 500 510 520 530
pF1KSD GHRRTMSQDLRQLSDSQRTSTYDNVPSLPGSPGEEASALSSQACDSKGDTLASPNSETGP
.... .. .: : .: ::::::
CCDS34 NKQKEQAGELGQ---HNRLSTYDNVHQQFSMMNLDDKQSIDSATWSTSSCEISLPENSNS
520 530 540 550 560 570
>>CCDS58079.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 (608 aa)
initn: 1254 init1: 837 opt: 1031 Z-score: 707.7 bits: 141.1 E(32554): 4.2e-33
Smith-Waterman score: 1201; 42.2% identity (64.1% similar) in 569 aa overlap (120-620:31-583)
90 100 110 120 130 140
pF1KSD IKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWDQNRMGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCG-
.. .:::::: .::.::. .::: .: :
CCDS58 MPFWPIRCLKRSRRMPRGGAGEREKVPANPEALLLMASSQRDMEDWVQAIRRVIWAPLGG
10 20 30 40 50 60
150 160 170 180 190 200
pF1KSD -VFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAF
.:::::.::: .:.:.::.:.:.:::.:..:: :.: .:::.::.::: :::..:.:.:
CCDS58 GIFGQRLEETVHHERKYGPRLAPLLVEQCVDFIRERGLTEEGLFRMPGQANLVRDLQDSF
70 80 90 100 110 120
210 220 230 240 250 260
pF1KSD DAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELM
: ::.: :: :::::::::::::::.:::::::...:: :: :.:: . ::... ::
CCDS58 DCGEKPLFDSTTDVHTVASLLKLYLRELPEPVVPFARYEDFLSCAQLLTKDEGEGTLELA
130 140 150 160 170 180
270 280 290 300 310 320
pF1KSD KQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRG
::.: ::. ::.:: :::.:: :.: ::::::.:::::.: :..: .::::..::.:
CCDS58 KQVSNLPQANYNLLRYICKFLDEVQAYSNVNKMSVQNLATVFGPNILRPQVEDPVTIMEG
190 200 210 220 230 240
330 340 350 360 370 380
pF1KSD TPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDIPLSPPAQKNDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTD
: .:..::..:: : :: . .: .: . .. . : ::: . : : :. .
CCDS58 TSLVQHLMTVLIRKHSQLF--TAPVPEGPTSPRGGLQCA------VGWGSEEVTRDSQGE
250 260 270 280 290
390 400 410 420 430 440
pF1KSD SFSSMTSDSDTTSPTGQQPSDAFPEDSSKVPREKPGDWKMQSRKRTQTLPNRKC-F----
. :.: : : : .: ::. . . :..::::. : :
CCDS58 PGGPGLPAHRTSSLDGA----AVAVLSRTAPT-GPGS-RCSPGKKVQTLPSWKSSFRQPR
300 310 320 330 340
450 460 470 480 490
pF1KSD -LTSAFQGANSSKME---IFKNEFWSPSSEAKAGEGHRRTMSQD-LRQLSDSQRTSTYDN
:... .:..:: .: : .. : .. .. .::::. : : :.. .. :: :::::
CCDS58 SLSGSPKGGGSS-LEVPIISSGGNWLMNGLSSL-RGHRRASSGDRLKDSGSVQRLSTYDN
350 360 370 380 390 400
500 510 520
pF1KSD VPS---LPGSPGEEASALS--SQACDSKGDTLAS--------------------------
::. .:: :. . : : :.. .: : .:.:
CCDS58 VPAPGLVPGIPSVASMAWSGASSSESSVGGSLSSCTACRASDSSARSSLHTDWALEPSPL
410 420 430 440 450 460
530 540 550 560
pF1KSD PNS--------------ETGPGKKNSGEEEIDS-----------LQRMVQELRKEIETQK
:.: :.: : .:: : :: :: .: ::: :. :.
CCDS58 PSSSEDPKSLDLDHSMDEAGAGASNSEPSEPDSPTREHARRSEALQGLVTELRAELCRQR
470 480 490 500 510 520
570 580 590 600 610 620
pF1KSD QMYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLNEELEKEKKKSAALEISLRNMERSREDVEKRNKALE
::...: .:. . :. .. ::.:::..:::: :::.::: ::.:::.:.::. :
CCDS58 TEYERSVKRIEEGSADLRKRMSRLEEELDQEKKKYIMLEIKLRNSERAREDAERRNQLLQ
530 540 550 560 570 580
630
pF1KSD EEVKEFVKSMKEPKTEA
CCDS58 REMEEFFSTLGSLTVGAKGARAPK
590 600
>>CCDS58080.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 (714 aa)
initn: 1550 init1: 843 opt: 955 Z-score: 655.8 bits: 131.7 E(32554): 3.3e-30
Smith-Waterman score: 1494; 42.2% identity (64.2% similar) in 695 aa overlap (14-620:12-689)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSLGQSACLFLSIARSRSVMTGEQMAAFHPSSTPNPLER-PI-KMGWLKKQRSIVKNWQQ
:::.:.. ::: . :. : : . :. : :::::::::.:::::
CCDS58 MLSPKIRQARRARSKSLVMGEQ--SRSPGRMPCPHRLGPVLKAGWLKKQRSIMKNWQQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD RYFVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWDQNR--
:.::::..::.::::... :::: . : : . :. .::. :: .::: :.. . .
CCDS58 RWFVLRGDQLFYYKDKDEIKPQGFISLQGTQVTELPPGPEDPGKHLFEISPGGAGEREKV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150
pF1KSD -MGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRV------AGT------------PCGVFGQRLDET
. .. .:::::: .::.::. .::: .:: : :.:::::.::
CCDS58 PANPEALLLMASSQRDMEDWVQAIRRVIWAPLGGGTARRSHAHPLEPLPPGIFGQRLEET
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KSD VAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDR
: .:.:.::.:.:.:::.:..:: :.: .:::.::.::: :::..:.:.:: ::.: ::
CCDS58 VHHERKYGPRLAPLLVEQCVDFIRERGLTEEGLFRMPGQANLVRDLQDSFDCGEKPLFDS
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KSD DTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDN
:::::::::::::::.:::::::...:: :: :.:: . ::... :: ::.: ::. :
CCDS58 TTDVHTVASLLKLYLRELPEPVVPFARYEDFLSCAQLLTKDEGEGTLELAKQVSNLPQAN
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KSD YSLLSYICRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTM
:.:: :::.:: :.: ::::::.:::::.: :..: .::::..::.:: .:..::.
CCDS58 YNLLRYICKFLDEVQAYSNVNKMSVQNLATVFGPNILRPQVEDPVTIMEGTSLVQHLMTV
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KSD MIRDHEVLFPKSKDIPLSPPAQKNDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSFSSMTSDSD
.:: : :: . .: .: . .. . : ::: . : : :. . .
CCDS58 LIRKHSQLF--TAPVPEGPTSPRGGLQCA------VGWGSEEVTRDSQGEPGGPGLPAHR
360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KSD TTSPTGQQPSDAFPEDSSKVPREKPGDWKMQSRKRTQTLPNRKC-F-----LTSAFQGAN
:.: : : : .: ::. . . :..::::. : : :... .:..
CCDS58 TSSLDGA----AVAVLSRTAPT-GPGS-RCSPGKKVQTLPSWKSSFRQPRSLSGSPKGGG
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500
pF1KSD SS-KMEIFKNEF-WSPSSEAKAGEGHRRTMSQD-LRQLSDSQRTSTYDNVPS---LPGSP
:: .. :... : .. .. .::::. : : :.. .. :: :::::::. .:: :
CCDS58 SSLEVPIISSGGNWLMNGLSSL-RGHRRASSGDRLKDSGSVQRLSTYDNVPAPGLVPGIP
470 480 490 500 510 520
510 520
pF1KSD GEEASALS--SQACDSKGDTLAS--------------------------PNS--------
. . : : :.. .: : .:.: :.:
CCDS58 SVASMAWSGASSSESSVGGSLSSCTACRASDSSARSSLHTDWALEPSPLPSSSEDPKSLD
530 540 550 560 570 580
530 540 550 560 570
pF1KSD ------ETGPGKKNSGEEEIDS-----------LQRMVQELRKEIETQKQMYEEQIKNLE
:.: : .:: : :: :: .: ::: :. :. ::...: .:
CCDS58 LDHSMDEAGAGASNSEPSEPDSPTREHARRSEALQGLVTELRAELCRQRTEYERSVKRIE
590 600 610 620 630 640
580 590 600 610 620 630
pF1KSD KENYDVWAKVVRLNEELEKEKKKSAALEISLRNMERSREDVEKRNKALEEEVKEFVKSMK
. . :. .. ::.:::..:::: :::.::: ::.:::.:.::. :
CCDS58 EGSADLRKRMSRLEEELDQEKKKYIMLEIKLRNSERAREDAERRNQLLQREMEEFFSTLG
650 660 670 680 690 700
pF1KSD EPKTEA
CCDS58 SLTVGAKGARAPK
710
>>CCDS43246.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4 (653 aa)
initn: 1228 init1: 846 opt: 952 Z-score: 654.4 bits: 131.3 E(32554): 4e-30
Smith-Waterman score: 961; 41.3% identity (65.8% similar) in 441 aa overlap (119-498:5-440)
90 100 110 120 130 140
pF1KSD TIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWDQNRMGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCG
..::.::::.: .::.::: .::: : :
CCDS43 MTANHESYLLMASTQNDMEDWVKSIRRVIWGPFG
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KSD --VFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDA
.:::.:..:: ::...: .:.:.:::.:..:: ..: .:::.:::::: ::::.:.::
CCDS43 GGIFGQKLEDTVRYEKRYGNRLAPMLVEQCVDFIRQRGLKEEGLFRLPGQANLVKELQDA
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KSD FDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQEL
:: ::.:::: .:::::::::::::::.:::::.:...:: :: :..: . .: . .::
CCDS43 FDCGEKPSFDSNTDVHTVASLLKLYLRELPEPVIPYAKYEDFLSCAKLLSKEEEAGVKEL
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KSD MKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMR
::.. :: ::.::.:::::: :.: .::::::.:::::.: :..: ::::: .::.
CCDS43 AKQVKSLPVVNYNLLKYICRFLDEVQSYSGVNKMSVQNLATVFGPNILRPKVEDPLTIME
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360
pF1KSD GTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDIPLSPP--------AQK------------NDPKKA
:: .:..:..:: :. ::::. .. .: :: :. : .
CCDS43 GTVVVQQLMSVMISKHDCLFPKDAELQSKPQDGVSNNNEIQKKATMGQLQNKENNNTKDS
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410
pF1KSD PVARSSVGWDATED-LRISRTDSFSSMTSDSDTTSP--------TGQQP------SDAFP
: . : :: .:. : : ... . : : :.:: ....: . ::
CCDS43 PSRQCS--WDKSESPQRSSMNNGSPTALSGSKTNSPKNSVHKLDVSRSPPLMVKKNPAFN
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450
pF1KSD EDSSKVPREKPGDWKMQSRKRTQTLPN------RKCFL--TSAFQGANSS-----KMEIF
. :. : . .. . .. ..::: :: :. : ... .:..: .: :.
CCDS43 KGSGIVTNGSFSSSNAEGLEKTQTTPNGSLQARRSSSLKVSGTKMGTHSVQNGTVRMGIL
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500
pF1KSD -----------KNEFWSPSSEAKAGEGHRRTMSQDLRQLSDSQRTSTYDNVPSLPGSPGE
.: : :.. . ..... .. .: : .: ::::::
CCDS43 NSDTLGNPTNVRNMSWLPNGYVTLRDNKQKEQAGELGQ---HNRLSTYDNVHQQFSMMNL
400 410 420 430 440
510 520 530 540 550 560
pF1KSD EASALSSQACDSKGDTLASPNSETGPGKKNSGEEEIDSLQRMVQELRKEIETQKQMYEEQ
CCDS43 DDKQSIDSATWSTSSCEISLPENSNSCRSSTTTCPEQDFFGGNFEDPVLDGPPQDDLSHP
450 460 470 480 490 500
638 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 23:39:25 2016 done: Wed Nov 2 23:39:26 2016
Total Scan time: 4.080 Total Display time: 0.180
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]