seq1 = pF1KSDA0647.tfa, 3585 bp
seq2 = pF1KSDA0647/gi568815581r_58391666.tfa (gi568815581r:58391666_58612942), 221277 bp

>pF1KSDA0647 3585
>gi568815581r:58391666_58612942 (Chr17)

(complement)

1-93  (100000-100091)   98% ->
94-210  (100437-100553)   100% ->
211-293  (101432-101514)   100% ->
294-454  (104102-104262)   100% ->
455-551  (104379-104475)   98% ->
552-665  (104669-104782)   100% ->
666-862  (105624-105820)   100% ->
863-991  (106072-106200)   100% ->
992-1103  (107360-107471)   100% ->
1104-1299  (107969-108164)   100% ->
1300-1485  (108455-108640)   100% ->
1486-1656  (108723-108893)   100% ->
1657-1811  (109045-109199)   100% ->
1812-3210  (116613-118011)   100% ->
3211-3321  (119991-120101)   100% ->
3322-3410  (120344-120432)   100% ->
3411-3585  (121103-121277)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGTGAGGAGGGGCCCCCCAGCCTGGAGTACATCCAAGCCAAGGATCT
        |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100000 A GGGTGAGGAGGGGCCCCCCAGCCTGGAGTACATCCAAGCCAAGGATCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTCCCCCCCAAGGAACTAGTGAAGGAGGAAGAGAATCTTCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100049 GTTCCCCCCCAAGGAACTAGTGAAGGAGGAAGAGAATCTTCAGGTA...C

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     94   GTCCCCTTCACAGTGCTGCAGGGTGAGGGAGTAGAGTTCCTGGGCCGG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100435 AGGTCCCCTTCACAGTGCTGCAGGGTGAGGGAGTAGAGTTCCTGGGCCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCAGCCGATGCCCTCATTGCCATCTCTAACTACCGGCTGCATATCAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100485 GCAGCCGATGCCCTCATTGCCATCTCTAACTACCGGCTGCATATCAAATT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAGGACTCTGTCATCAAC         GTCCCCCTCCGGATGATTGACA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100535 CAAGGACTCTGTCATCAACGTG...CAGGTCCCCCTCCGGATGATTGACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTGTGGAGAGCCGTGATATGTTCCAGTTGCACATTTCCTGCAAGGACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101454 GTGTGGAGAGCCGTGATATGTTCCAGTTGCACATTTCCTGCAAGGACTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAAGTGGTGAG         GTGCCACTTCTCCACTTTTAAGCAGTGCCA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101504 AAAGTGGTGAGGTG...CAGGTGCCACTTCTCCACTTTTAAGCAGTGCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGAGTGGCTCTCACGGCTAAGCCGAGCCACAGCAAGACCTGCCAAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104132 AGAGTGGCTCTCACGGCTAAGCCGAGCCACAGCAAGACCTGCCAAGCCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAGACCTCTTTGCCTTTGCCTACCATGCCTGGTGCCTGGGGCTGACCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104182 AAGACCTCTTTGCCTTTGCCTACCATGCCTGGTGCCTGGGGCTGACCGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAGGACCAGCACACTCACCTATGTCAGCCAG         GTGAGCACAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 104232 GAGGACCAGCACACTCACCTATGTCAGCCAGGTG...CAGGTGAGCACAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 ACGTTGTCGACAGGAGGCGGAGCTTGCAAGGATGGGCTTTGACGTGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 104389 ACGTTGTCGACAGGAGGCGGAGCTTGCAAGGATGGGCTTTGACCTGCAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACGTCTGGAGAGTCTCACACATCAACAGCAACTACAA         ATTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 104439 ACGTCTGGAGAGTCTCACACATCAACAGCAACTACAAGTG...CAGATTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TGCCCCAGTTACCCCCAGAAGCTGCTGGTTCCTGTGTGGATCACTGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104673 TGCCCCAGTTACCCCCAGAAGCTGCTGGTTCCTGTGTGGATCACTGACAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AGAGCTGGAGAACGTGGCTTCCTTCCGCTCCTGGAAGCGGATTCCCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104723 AGAGCTGGAGAACGTGGCTTCCTTCCGCTCCTGGAAGCGGATTCCCGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TTGTGTATAG         ACACTTGCGCAATGGGGCTGCCATCGCCCGC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 104773 TTGTGTATAGGTG...CAGACACTTGCGCAATGGGGCTGCCATCGCCCGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TGCAGCCAGCCAGAGATCAGCTGGTGGGGCTGGCGCAATGCTGATGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105655 TGCAGCCAGCCAGAGATCAGCTGGTGGGGCTGGCGCAATGCTGATGATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GTACCTGGTCACGTCCATTGCTAAAGCCTGTGCCCTGGACCCGGGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105705 GTACCTGGTCACGTCCATTGCTAAAGCCTGTGCCCTGGACCCGGGGACAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GGGCCACTGGGGGCTCCCTCAGCACCGGGAATAATGATACCAGCGAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105755 GGGCCACTGGGGGCTCCCTCAGCACCGGGAATAATGATACCAGCGAGGCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TGTGATGCTGACTTTG         ATTCTTCTCTGACTGCGTGCTCTGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 105805 TGTGATGCTGACTTTGGTA...TAGATTCTTCTCTGACTGCGTGCTCTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 AGTGGAGAGCACAGCAGCTCCTCAAAAGCTGCTGATCCTGGATGCGCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106097 AGTGGAGAGCACAGCAGCTCCTCAAAAGCTGCTGATCCTGGATGCGCGAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CCTACACGGCAGCAGTGGCCAACCGGGCCAAGGGTGGAGGCTGTGAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106147 CCTACACGGCAGCAGTGGCCAACCGGGCCAAGGGTGGAGGCTGTGAATGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GAAG         AGTACTATCCCAACTGTGAGGTCGTGTTCATGGGAAT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106197 GAAGGTA...CAGAGTACTATCCCAACTGTGAGGTCGTGTTCATGGGAAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GGCCAACATCCATGCCATCCGGAACAGCTTTCAGTACCTCCGGGCTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107397 GGCCAACATCCATGCCATCCGGAACAGCTTTCAGTACCTCCGGGCTGTGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GTAGCCAGATGCCGGATCCTAGCAA         CTGGTTGTCGGCACTG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 107447 GTAGCCAGATGCCGGATCCTAGCAAGTA...TAGCTGGTTGTCGGCACTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GAGAGTACCAAATGGCTGCAGCACTTGTCGGTGATGCTAAAAGCAGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107985 GAGAGTACCAAATGGCTGCAGCACTTGTCGGTGATGCTAAAAGCAGCTGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GCTGGTGGCTAATACAGTAGACCGGGAAGGCCGGCCTGTGCTGGTACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108035 GCTGGTGGCTAATACAGTAGACCGGGAAGGCCGGCCTGTGCTGGTACACT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 GCTCAGATGGCTGGGACCGCACACCGCAGATCGTAGCCCTGGCCAAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108085 GCTCAGATGGCTGGGACCGCACACCGCAGATCGTAGCCCTGGCCAAAATA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 TTACTGGACCCATATTACAGGACGTTGGAG         GGCTTCCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 108135 TTACTGGACCCATATTACAGGACGTTGGAGGTA...CAGGGCTTCCAAGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GTTAGTGGAGTCTGACTGGCTGGATTTTGGGCACAAGTTTGGAGATCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108466 GTTAGTGGAGTCTGACTGGCTGGATTTTGGGCACAAGTTTGGAGATCGCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 GTGGCCACCAAGAGAATGTGGAGGACCAAAACGAACAATGCCCTGTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108516 GTGGCCACCAAGAGAATGTGGAGGACCAAAACGAACAATGCCCTGTGTTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 CTCCAGTGGCTTGATTCTGTTCATCAGTTGCTTAAGCAGTTCCCCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108566 CTCCAGTGGCTTGATTCTGTTCATCAGTTGCTTAAGCAGTTCCCCTGCCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 GTTTGAATTTAATGAAGCATTCCTG         GTAAAACTGGTGCAAC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 108616 GTTTGAATTTAATGAAGCATTCCTGGTA...TAGGTAAAACTGGTGCAAC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 ACACATACTCCTGCCTCTACGGCACCTTCCTGGCCAACAACCCCTGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108739 ACACATACTCCTGCCTCTACGGCACCTTCCTGGCCAACAACCCCTGTGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 CGAGAGAAGCGCAACATCTACAAGCGGACCTGCTCTGTGTGGGCGCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108789 CGAGAGAAGCGCAACATCTACAAGCGGACCTGCTCTGTGTGGGCGCTCCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 TCGAGCTGGCAATAAAAACTTTCATAACTTCCTCTACACACCCAGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108839 TCGAGCTGGCAATAAAAACTTTCATAACTTCCTCTACACACCCAGCTCAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 ACATG         GTCCTGCATCCTGTTTGTCATGTCCGGGCCCTGCAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108889 ACATGGTG...TAGGTCCTGCATCCTGTTTGTCATGTCCGGGCCCTGCAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 CTCTGGACAGCTGTTTATCTGCCAGCATCATCTCCATGCACACTTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109081 CTCTGGACAGCTGTTTATCTGCCAGCATCATCTCCATGCACACTTGGGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 AGAAAACATGGATCTTTACCTTTCCCCAGTGGCCCAGAGCCAGGAGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109131 AGAAAACATGGATCTTTACCTTTCCCCAGTGGCCCAGAGCCAGGAGTTCT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 CTGGCCGCTCTCTGGACAG         ATTACCTAAAACCAGATCCATG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 109181 CTGGCCGCTCTCTGGACAGGTA...CAGATTACCTAAAACCAGATCCATG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 GATGATCTTCTTTCTGCCTGTGACACAAGCAGCCCCCTGACTCGTACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116635 GATGATCTTCTTTCTGCCTGTGACACAAGCAGCCCCCTGACTCGTACATC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 CAGTGACCCTAACCTGAATAACCACTGTCAGGAGGTCAGGGTAGGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116685 CAGTGACCCTAACCTGAATAACCACTGTCAGGAGGTCAGGGTAGGCCTGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 AGCCCTGGCACAGCAATCCTGAGGGATCAGAGACAAGCTTTGTGGACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116735 AGCCCTGGCACAGCAATCCTGAGGGATCAGAGACAAGCTTTGTGGACTCT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 GGGGTAGGAGGGCCTCAGCAAACTGTAGGAGAAGTGGGTCTTCCTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116785 GGGGTAGGAGGGCCTCAGCAAACTGTAGGAGAAGTGGGTCTTCCTCCTCC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 TCTGCCCAGCAGCCAGAAAGACTACTTGAGCAATAAACCTTTCAAGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116835 TCTGCCCAGCAGCCAGAAAGACTACTTGAGCAATAAACCTTTCAAGAGTC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 ACAAAAGCTGTTCTCCAAGTTACAAACTGCTTAATACCGCAGTGCCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116885 ACAAAAGCTGTTCTCCAAGTTACAAACTGCTTAATACCGCAGTGCCTCGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 GAAATGAAGAGCAACACCTCTGATCCTGAGATCAAAGTCCTAGAAGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116935 GAAATGAAGAGCAACACCTCTGATCCTGAGATCAAAGTCCTAGAAGAGAC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2184 TAAGGGACCAGCTCCAGACCCTTCTGCCCAGGATGAGCTGGGTAGGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116985 TAAGGGACCAGCTCCAGACCCTTCTGCCCAGGATGAGCTGGGTAGGACTT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2234 TAGATGGCATAGGGGAGCCACCTGAACATTGTCCTGAAACAGAAGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117035 TAGATGGCATAGGGGAGCCACCTGAACATTGTCCTGAAACAGAAGCTGTC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2284 AGTGCACTCTCCAAGGTCATTTCTAACAAGTGTGATGGAGTTTGTAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117085 AGTGCACTCTCCAAGGTCATTTCTAACAAGTGTGATGGAGTTTGTAATTT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2334 TCCTGAGTCTTCCCAGAACTCTCCTACAGGTACGCCCCAACAGGCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117135 TCCTGAGTCTTCCCAGAACTCTCCTACAGGTACGCCCCAACAGGCCCAGC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2384 CAGACTCCATGCTAGGTGTGCCCTCCAAGTGTGTTCTTGATCACAGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117185 CAGACTCCATGCTAGGTGTGCCCTCCAAGTGTGTTCTTGATCACAGCCTC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2434 AGCACCGTTTGCAACCCACCGAGTGCTGCCTGCCAAACTCCTCTAGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117235 AGCACCGTTTGCAACCCACCGAGTGCTGCCTGCCAAACTCCTCTAGACCC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2484 AAGCACTGACTTCCTCAACCAAGATCCCTCAGGGTCTGTGGCAAGTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117285 AAGCACTGACTTCCTCAACCAAGATCCCTCAGGGTCTGTGGCAAGTATCT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2534 CCCACCAGGAACAACTGAGTTCTGTGCCGGATCTGACCCATGGGGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117335 CCCACCAGGAACAACTGAGTTCTGTGCCGGATCTGACCCATGGGGAGGAA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2584 GACATTGGTAAAAGAGGAAATAATAGGAATGGGCAGTTATTGGAAAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117385 GACATTGGTAAAAGAGGAAATAATAGGAATGGGCAGTTATTGGAAAATCC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2634 TCGCTTTGGGAAAATGCCATTGGAATTGGTCCGGAAGCCAATTTCTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117435 TCGCTTTGGGAAAATGCCATTGGAATTGGTCCGGAAGCCAATTTCTCAGA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2684 GCCAGATCAGTGAGTTCTCTTTTCTAGGGTCCAACTGGGACAGCTTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117485 GCCAGATCAGTGAGTTCTCTTTTCTAGGGTCCAACTGGGACAGCTTCCAA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2734 GGGATGGTGACTTCATTCCCAAGTGGGGAGGCCACCCCTCGGCGGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117535 GGGATGGTGACTTCATTCCCAAGTGGGGAGGCCACCCCTCGGCGGCTGCT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2784 TTCCTATGGCTGTTGTAGCAAGAGGCCAAACAGTAAGCAGATGCGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117585 TTCCTATGGCTGTTGTAGCAAGAGGCCAAACAGTAAGCAGATGCGGGCCA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2834 CAGGGCCCTGCTTTGGGGGCCAGTGGGCTCAGAGAGAAGGTGTGAAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117635 CAGGGCCCTGCTTTGGGGGCCAGTGGGCTCAGAGAGAAGGTGTGAAGTCA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2884 CCTGTCTGTTCTAGTCATTCCAATGGACATTGTACTGGCCCAGGAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117685 CCTGTCTGTTCTAGTCATTCCAATGGACATTGTACTGGCCCAGGAGGAAA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2934 GAACCAGATGTGGTTGTCCAGTCATCCAAAGCAAGTCTCTAGCACAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117735 GAACCAGATGTGGTTGTCCAGTCATCCAAAGCAAGTCTCTAGCACAAAGC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2984 CCGTTCCACTGAACTGCCCTTCTCCAGTGCCTCCTCTGTATTTGGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117785 CCGTTCCACTGAACTGCCCTTCTCCAGTGCCTCCTCTGTATTTGGATGAT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3034 GATGGACTCCCCTTTCCCACGGATGTGATCCAGCATAGGTTACGGCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117835 GATGGACTCCCCTTTCCCACGGATGTGATCCAGCATAGGTTACGGCAAAT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3084 CGAAGCAGGGTACAAACAAGAGGTGGAGCAGCTACGTCGACAGGTGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117885 CGAAGCAGGGTACAAACAAGAGGTGGAGCAGCTACGTCGACAGGTGCGTG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3134 AGCTTCAGATGAGGCTGGACATCCGTCACTGCTGTGCCCCTCCAGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117935 AGCTTCAGATGAGGCTGGACATCCGTCACTGCTGTGCCCCTCCAGCAGAG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3184 CCCCCCATGGACTATGAGGATGATTTT         ACATGTTTGAAGGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 117985 CCCCCCATGGACTATGAGGATGATTTTGTA...CAGACATGTTTGAAGGA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3225 GTCAGATGGCAGTGATACTGAGGATTTTGGCTCTGATCACAGTGAAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120005 GTCAGATGGCAGTGATACTGAGGATTTTGGCTCTGATCACAGTGAAGACT

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3275 GCCTTTCAGAAGCAAGCTGGGAACCTGTTGATAAGAAAGAGACTGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 120055 GCCTTTCAGAAGCAAGCTGGGAACCTGTTGATAAGAAAGAGACTGAGGTA

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3322       GTGACTCGCTGGGTTCCAGACCATATGGCATCACACTGCTATAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120105 ...TAGGTGACTCGCTGGGTTCCAGACCATATGGCATCACACTGCTATAA

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3366 CTGTGACTGTGAATTCTGGTTGGCCAAACGAAGACACCATTGCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 120388 CTGTGACTGTGAATTCTGGTTGGCCAAACGAAGACACCATTGCAGGTA..

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3411     AAATTGTGGGAATGTATTTTGTGCTGGATGCTGCCACCTGAAGCTG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120438 .CAGAAATTGTGGGAATGTATTTTGTGCTGGATGCTGCCACCTGAAGCTG

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3457 CCCATTCCTGATCAGCAACTCTATGACCCAGTTCTCGTCTGTAACTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121149 CCCATTCCTGATCAGCAACTCTATGACCCAGTTCTCGTCTGTAACTCATG

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3507 TTACGAACACATTCAAGTCTCTCGTGCCAGGGAACTCATGAGCCAACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121199 TTACGAACACATTCAAGTCTCTCGTGCCAGGGAACTCATGAGCCAACAGC

   3700     .    :    .    :    .
   3557 TGAAGAAACCCATTGCTACAGCTTCCAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||
 121249 TGAAGAAACCCATTGCTACAGCTTCCAGT