seq1 = pF1KE6014.tfa, 942 bp
seq2 = pF1KE6014/gi568815591f_141818876.tfa (gi568815591f:141818876_142019817), 200942 bp

>pF1KE6014 942
>gi568815591f:141818876_142019817 (Chr7)

1-942  (100001-100942)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTGATGAATTACTCTAGTGCCACTGAATTTTATCTCCTTGGCTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTGATGAATTACTCTAGTGCCACTGAATTTTATCTCCTTGGCTTCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGCTCTGAAGAACTACATCATATCCTTTTTGCTATATTCTTCTTTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGCTCTGAAGAACTACATCATATCCTTTTTGCTATATTCTTCTTTTTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTTGGTGACATTAATGGGAAACACAGTCATCATCATGATTGTCTGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTTGGTGACATTAATGGGAAACACAGTCATCATCATGATTGTCTGTGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GATAAACGTCTGCAGTCCCCCATGTATTTCTTCCTCGGCCACCTCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GATAAACGTCTGCAGTCCCCCATGTATTTCTTCCTCGGCCACCTCTCTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTGGAGATCCTGGTCACAACCATAATCGTCCCCGTGATGCTTTGGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTGGAGATCCTGGTCACAACCATAATCGTCCCCGTGATGCTTTGGGGAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCTGCTCCCTGGGATGCAGACAATATATTTGTCTGCCTGTGTTGTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCTGCTCCCTGGGATGCAGACAATATATTTGTCTGCCTGTGTTGTCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCTTCTTGTACCTTGCTGTGGGGACAACAGAGTTCGCATTACTTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTCTTCTTGTACCTTGCTGTGGGGACAACAGAGTTCGCATTACTTGGAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AATGGCTGTGGACCGTTATGTGGCTGTCTGTAACCCTCTGAGGTACAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AATGGCTGTGGACCGTTATGTGGCTGTCTGTAACCCTCTGAGGTACAACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCATTATGAACAGACACACCTGCAACTTTGTGGTTCTTGTGTCATGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCATTATGAACAGACACACCTGCAACTTTGTGGTTCTTGTGTCATGGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTTGGGTTTCTTTTTCAAATCTGGCCGGTCTATGTCATGTTTCAGCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTTGGGTTTCTTTTTCAAATCTGGCCGGTCTATGTCATGTTTCAGCTTAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTACTGCAAATCAAATGTGGTGAACAATTTTTTTTGTGACCGAGGGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTACTGCAAATCAAATGTGGTGAACAATTTTTTTTGTGACCGAGGGCAAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGCTCAAACTATCCTGCAATAATACTCTTTTCACGGAGTTTATCCTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGCTCAAACTATCCTGCAATAATACTCTTTTCACGGAGTTTATCCTCTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTAATGGCTGTTTTTGTTCTCTTTGGTTCTTTGATCCCTACAATTGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTAATGGCTGTTTTTGTTCTCTTTGGTTCTTTGATCCCTACAATTGTCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CAACGCCTACATCATCTCCACCATTCTCAAGATCCCGTCATCCTCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CAACGCCTACATCATCTCCACCATTCTCAAGATCCCGTCATCCTCTGGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGAGGAAATCCTTCTCCACTTGTGCCTCCCACTTCACCTGTGTTGTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGAGGAAATCCTTCTCCACTTGTGCCTCCCACTTCACCTGTGTTGTGATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGCTACGGCAGCTGCTTGTTTCTCTACGTGAAACCCAAGCAAACGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGCTACGGCAGCTGCTTGTTTCTCTACGTGAAACCCAAGCAAACGCAGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AGCTGATTACAATTGGGTAGTTTCCCTGATGGTTTCAGTAGTAACTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AGCTGATTACAATTGGGTAGTTTCCCTGATGGTTTCAGTAGTAACTCCTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCCTCAATCCTTTCATCTTCACCCTCCGGAATGATAAAGTCATAGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCCTCAATCCTTTCATCTTCACCCTCCGGAATGATAAAGTCATAGAGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CTTCGGGATGGGGTGAAACGCTGCTGTCAACTATTCAGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTTCGGGATGGGGTGAAACGCTGCTGTCAACTATTCAGGAAT