seq1 = pF1KE5362.tfa, 825 bp
seq2 = pF1KE5362/gi568815596r_38481875.tfa (gi568815596r:38481875_38702601), 220727 bp

>pF1KE5362 825
>gi568815596r:38481875_38702601 (Chr2)

(complement)

11-174  (100001-100164)   100% ->
175-293  (110954-111072)   100% ->
294-531  (116721-116958)   100% ->
532-612  (118676-118756)   100% ->
613-714  (120429-120530)   97% ->
715-825  (120617-120727)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     11 GGGAGACGTACGAGGAGGACCGGGAGTACGAGAGCCAGGCCAAGCGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 GGGAGACGTACGAGGAGGACCGGGAGTACGAGAGCCAGGCCAAGCGTCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     61 AAGACCGAGGAGGGGGAGATCGACTACTCGGCCGAGGAAGGCGAGAACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAGACCGAGGAGGGGGAGATCGACTACTCGGCCGAGGAAGGCGAGAACCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    111 CCGGGAAGCGACGCCCCGGGGCGGGGGCGATGGCGGCGGCGGCGGCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGGGAAGCGACGCCCCGGGGCGGGGGCGATGGCGGCGGCGGCGGCCGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    161 GCTTCTCTCAGCCG         GAGGCAGGTGGAAGTCATCATAAAGTT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCTTCTCTCAGCCGGTA...TAGGAGGCAGGTGGAAGTCATCATAAAGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    202 TCTGTTTCACCCGTCGTCCATGTTCGAGGACTCTGTGAATCTGTGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110981 TCTGTTTCACCCGTCGTCCATGTTCGAGGACTCTGTGAATCTGTGGTGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    252 AGCAGACCTCGTGGAAGCGCTGGAAAAATTTGGGACAATATG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 111031 AGCAGACCTCGTGGAAGCGCTGGAAAAATTTGGGACAATATGGTA...CA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    294  CTATGTGATGATGATGCCATTTAAACGACAGGCTCTAGTGGAATTTGAA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116720 GCTATGTGATGATGATGCCATTTAAACGACAGGCTCTAGTGGAATTTGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    343 AACATAGATAGTGCCAAAGAATGTGTGACATTTGCTGCAGATGAACCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116770 AACATAGATAGTGCCAAAGAATGTGTGACATTTGCTGCAGATGAACCCGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    393 GTACATTGCTGGTCAACAGGCTTTTTTCAACTATTCTACAAGCAAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116820 GTACATTGCTGGTCAACAGGCTTTTTTCAACTATTCTACAAGCAAAAGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    443 TCACTCGGCCAGGAAATACTGATGATCCATCAGGAGGCAACAAAGTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116870 TCACTCGGCCAGGAAATACTGATGATCCATCAGGAGGCAACAAAGTTCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    493 CTGCTCTCAATTCAGAATCCGCTTTATCCAATTACAGTG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 116920 CTGCTCTCAATTCAGAATCCGCTTTATCCAATTACAGTGGTA...TAGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    534 TGTTTTATATACTGTATGCAACCCTGTTGGCAAAGTGCAACGTATTGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118678 TGTTTTATATACTGTATGCAACCCTGTTGGCAAAGTGCAACGTATTGTTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    584 TATTCAAGAGAAATGGGATACAAGCAATG         GTTGAGTTTGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>> ||  |||||||
 118728 TATTCAAGAGAAATGGGATACAAGCAATGGTT...GAGCTTATGTTTGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    625 TCAGTCCTTTGTGCCCAGAAAGCTAAAGCAGCACTCAATGGAGCTGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120441 TCAGTCCTTTGTGCCCAGAAAGCTAAAGCAGCACTCAATGGAGCTGATAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    675 ATATGCTGGATGTTGCACACTAAAAATTGAATATGCACGG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 120491 ATATGCTGGATGTTGCACACTAAAAATTGAATATGCACGGGTA...CAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    716 CAACTCGTCTAAATGTTATTAGGAATGACAATGACAGTTGGGACTACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120618 CAACTCGTCTAAATGTTATTAGGAATGACAATGACAGTTGGGACTACACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    766 AAACCATATTTGGGAAGACGAGGTAGGTATTTTATACATTTTAGAATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120668 AAACCATATTTGGGAAGACGAGGTAGGTATTTTATACATTTTAGAATGTA

    850     .    :
    816 CTTGATCTGC
        ||||||||||
 120718 CTTGATCTGC