seq1 = pF1KE4513.tfa, 1626 bp
seq2 = pF1KE4513/gi568815587r_62893240.tfa (gi568815587r:62893240_63114958), 221719 bp

>pF1KE4513 1626
>gi568815587r:62893240_63114958 (Chr11)

(complement)

1-333  (100001-100333)   100% ->
334-437  (114136-114239)   100% ->
438-592  (115117-115271)   100% ->
593-761  (115870-116038)   100% ->
762-885  (118807-118930)   100% ->
886-1001  (119140-119255)   100% ->
1002-1216  (120203-120417)   100% ->
1217-1325  (121081-121189)   100% ->
1326-1529  (121332-121535)   100% ->
1530-1626  (121623-121719)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCTTCTCGGAGATCCTGGACCGTGTGGGAAGCATGGGCCATTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCTTCTCGGAGATCCTGGACCGTGTGGGAAGCATGGGCCATTTCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTCCTGCATGTAGCCATACTGGGCCTCCCGATCCTCAACATGGCCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTTCCTGCATGTAGCCATACTGGGCCTCCCGATCCTCAACATGGCCAACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAACCTGCTGCAGATCTTCACAGCCGCCACCCCTGTCCACCACTGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACAACCTGCTGCAGATCTTCACAGCCGCCACCCCTGTCCACCACTGTCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCGCCCCACAATGCCTCCACAGGGCCTTGGGTGCTCCCCATGGGCCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCGCCCCACAATGCCTCCACAGGGCCTTGGGTGCTCCCCATGGGCCCAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGGGAAGCCTGAGAGGTGCCTCCGTTTTGTACATCCGCCCAATGCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGGGAAGCCTGAGAGGTGCCTCCGTTTTGTACATCCGCCCAATGCCAGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCCCAATGACACCCAGAGGGCCATGGAGCCATGCCTGGATGGCTGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCCCAATGACACCCAGAGGGCCATGGAGCCATGCCTGGATGGCTGGGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TACAACAGCACCAAGGACTCCATTGTGACAGAG         TGGGACTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100301 TACAACAGCACCAAGGACTCCATTGTGACAGAGGTA...CAGTGGGACTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGTGTGCAACTCCAACAAACTGAAGGAGATGGCCCAGTCTATCTTCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114144 GGTGTGCAACTCCAACAAACTGAAGGAGATGGCCCAGTCTATCTTCATGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CAGGTATACTGATTGGAGGGCTCGTGCTTGGAGACCTGTCTGACAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 114194 CAGGTATACTGATTGGAGGGCTCGTGCTTGGAGACCTGTCTGACAGGTG.

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    438      GTTTGGCCGCAGGCCCATCCTGACCTGCAGCTACCTGCTGCTGGC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114244 ..CAGGTTTGGCCGCAGGCCCATCCTGACCTGCAGCTACCTGCTGCTGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AGCCAGCGGCTCCGGTGCAGCCTTCAGCCCCACCTTCCCCATCTACATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115162 AGCCAGCGGCTCCGGTGCAGCCTTCAGCCCCACCTTCCCCATCTACATGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TCTTCCGCTTCCTGTGTGGCTTTGGCATCTCAGGCATTACCCTGAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115212 TCTTCCGCTTCCTGTGTGGCTTTGGCATCTCAGGCATTACCCTGAGCACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GTCATCTTGA         ATGTGGAATGGGTGCCTACCCGGATGCGGGC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 115262 GTCATCTTGAGTG...CAGATGTGGAATGGGTGCCTACCCGGATGCGGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CATCATGTCGACAGCACTCGGGTACTGCTACACCTTTGGCCAGTTCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115901 CATCATGTCGACAGCACTCGGGTACTGCTACACCTTTGGCCAGTTCATTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TGCCCGGCCTGGCCTACGCCATCCCCCAGTGGCGTTGGCTGCAGTTAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115951 TGCCCGGCCTGGCCTACGCCATCCCCCAGTGGCGTTGGCTGCAGTTAACT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GTGTCCATTCCCTTCTTCGTCTTCTTCCTATCATCCTG         GTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 116001 GTGTCCATTCCCTTCTTCGTCTTCTTCCTATCATCCTGGTA...CAGGTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GACACCAGAGTCCATACGCTGGTTGGTCTTGTCTGGAAAGTCCTCGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118810 GACACCAGAGTCCATACGCTGGTTGGTCTTGTCTGGAAAGTCCTCGAAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CCCTGAAGATACTCCGGCGGGTGGCTGTCTTCAATGGCAAGAAGGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118860 CCCTGAAGATACTCCGGCGGGTGGCTGTCTTCAATGGCAAGAAGGAAGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GGAGAAAGGCTCAGCTTGGAG         GAGCTCAAACTCAACCTGCA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 118910 GGAGAAAGGCTCAGCTTGGAGGTA...AAGGAGCTCAAACTCAACCTGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GAAGGAGATCTCCTTGGCCAAGGCCAAGTACACCGCAAGTGACCTGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119160 GAAGGAGATCTCCTTGGCCAAGGCCAAGTACACCGCAAGTGACCTGTTCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GGATACCCATGCTGCGCCGCATGACCTTCTGTCTTTCCCTGGCCTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 119210 GGATACCCATGCTGCGCCGCATGACCTTCTGTCTTTCCCTGGCCTGGTA.

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002      GTTTGCTACCGGTTTTGCCTACTATAGTTTGGCTATGGGTGTGGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119260 ..CAGGTTTGCTACCGGTTTTGCCTACTATAGTTTGGCTATGGGTGTGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 AGAATTTGGAGTCAACCTCTACATCCTCCAGATCATCTTTGGTGGGGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120248 AGAATTTGGAGTCAACCTCTACATCCTCCAGATCATCTTTGGTGGGGTCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 ATGTCCCAGCCAAGTTCATCACCATCCTCTCCTTAAGCTACCTGGGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120298 ATGTCCCAGCCAAGTTCATCACCATCCTCTCCTTAAGCTACCTGGGCCGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 CATACCACTCAGGCCGCTGCCCTGCTCCTGGCAGGAGGGGCCATCTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120348 CATACCACTCAGGCCGCTGCCCTGCTCCTGGCAGGAGGGGCCATCTTGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 TCTCACCTTTGTGCCCTTGG         ACTTGCAGACCGTGAGGACAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 120398 TCTCACCTTTGTGCCCTTGGGTG...CAGACTTGCAGACCGTGAGGACAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TATTGGCTGTGTTTGGGAAGGGATGCCTATCCAGCTCCTTCAGCTGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121102 TATTGGCTGTGTTTGGGAAGGGATGCCTATCCAGCTCCTTCAGCTGCCTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 TTCCTCTACACAAGTGAATTATACCCCACAGTCATCAG         GCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 121152 TTCCTCTACACAAGTGAATTATACCCCACAGTCATCAGGTA...CAGGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 AACAGGTATGGGCGTAAGTAACCTGTGGACCCGCGTGGGAAGCATGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121335 AACAGGTATGGGCGTAAGTAACCTGTGGACCCGCGTGGGAAGCATGGTGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 CCCCGCTGGTGAAAATCACGGGTGAGGTACAGCCCTTCATCCCCAATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121385 CCCCGCTGGTGAAAATCACGGGTGAGGTACAGCCCTTCATCCCCAATATC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 ATCTACGGGATCACCGCCCTCCTCGGGGGCAGTGCTGCCCTCTTCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121435 ATCTACGGGATCACCGCCCTCCTCGGGGGCAGTGCTGCCCTCTTCCTGCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 TGAGACCCTGAATCAGCCCTTGCCAGAGACTATCGAAGACCTGGAAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121485 TGAGACCCTGAATCAGCCCTTGCCAGAGACTATCGAAGACCTGGAAAACT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 G         GTCCCTGCGGGCAAAGAAGCCAAAGCAGGAGCCAGAGGTG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121535 GGTC...TAGGTCCCTGCGGGCAAAGAAGCCAAAGCAGGAGCCAGAGGTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 GAAAAGGCCTCCCAGAGGATCCCTCTACAGCCTCACGGACCAGGCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121663 GAAAAGGCCTCCCAGAGGATCCCTCTACAGCCTCACGGACCAGGCCTGGG

   1700     .
   1620 CTCCAGC
        |||||||
 121713 CTCCAGC