seq1 = pF1KE2657.tfa, 591 bp
seq2 = pF1KE2657/gi568815590f_22061829.tfa (gi568815590f:22061829_22264038), 202210 bp

>pF1KE2657 591
>gi568815590f:22061829_22264038 (Chr8)

1-42  (100001-100042)   100% ->
43-201  (100746-100904)   100% ->
202-324  (101252-101374)   100% ->
325-435  (101608-101718)   99% ->
436-591  (102055-102210)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGTGGGCAGCAAAGAGGTCCTGATGGAGAGCCCGCCG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100001 ATGGATGTGGGCAGCAAAGAGGTCCTGATGGAGAGCCCGCCGGTG...CA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     43  GACTACTCCGCAGCTCCCCGGGGCCGATTTGGCATTCCCTGCTGCCCAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100745 GGACTACTCCGCAGCTCCCCGGGGCCGATTTGGCATTCCCTGCTGCCCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGCACCTGAAACGCCTTCTTATCGTGGTGGTGGTGGTGGTCCTCATCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100795 TGCACCTGAAACGCCTTCTTATCGTGGTGGTGGTGGTGGTCCTCATCGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGGTGATTGTGGGAGCCCTGCTCATGGGTCTCCACATGAGCCAGAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100845 GTGGTGATTGTGGGAGCCCTGCTCATGGGTCTCCACATGAGCCAGAAACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CACGGAGATG         GTTCTGGAGATGAGCATTGGGGCGCCGGAAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100895 CACGGAGATGGTG...CAGGTTCTGGAGATGAGCATTGGGGCGCCGGAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCCAGCAACGCCTGGCCCTGAGTGAGCACCTGGTTACCACTGCCACCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101283 CCCAGCAACGCCTGGCCCTGAGTGAGCACCTGGTTACCACTGCCACCTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TCCATCGGCTCCACTGGCCTCGTGGTGTATGACTACCAGCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 101333 TCCATCGGCTCCACTGGCCTCGTGGTGTATGACTACCAGCAGGTG...TA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    325  CTGCTGATCGCCTACAAGCCAGCCCCTGGCACCTGCTGCTACATCATGA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101607 GCTGCTGATCGCCTACAAGCCAGCCCCTGGCACCTGCTGCTACATCATGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGATAGCTCCAGAGAGCATCCCCAGTCTTGAGGCTCTCAATAGAAAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 101657 AGATAGCTCCAGAGAGCATCCCCAGTCTTGAGGCTCTCACTAGAAAAGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CACAACTTCCAG         ATGGAATGCTCTCTGCAGGCCAAGCCCGC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 101707 CACAACTTCCAGGTG...CAGATGGAATGCTCTCTGCAGGCCAAGCCCGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AGTGCCTACGTCTAAGCTGGGCCAGGCAGAGGGGCGAGATGCAGGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102084 AGTGCCTACGTCTAAGCTGGGCCAGGCAGAGGGGCGAGATGCAGGCTCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CACCCTCCGGAGGGGACCCGGCCTTCCTGGGCATGGCCGTGAACACCCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 102134 CACCCTCCGGAGGGGACCCGGCCTTCCTGGGCATGGCCGTGAGCACCCTG

    600     .    :    .    :    .
    565 TGTGGCGAGGTGCCGCTCTACTACATC
        |||||||||||||||||||||||||||
 102184 TGTGGCGAGGTGCCGCTCTACTACATC