seq1 = pF1KE2074.tfa, 2211 bp
seq2 = pF1KE2074/gi568815579r_48869291.tfa (gi568815579r:48869291_49093112), 223822 bp

>pF1KE2074 2211
>gi568815579r:48869291_49093112 (Chr19)

(complement)

1-118  (100001-100118)   100% ->
119-300  (101630-101811)   100% ->
301-492  (105728-105919)   100% ->
493-678  (107078-107263)   100% ->
679-823  (107508-107652)   100% ->
824-941  (110276-110393)   100% ->
942-1062  (110738-110858)   100% ->
1063-1169  (111477-111583)   100% ->
1170-1229  (114956-115015)   100% ->
1230-1308  (115111-115189)   100% ->
1309-1422  (118380-118493)   100% ->
1423-1549  (118774-118900)   100% ->
1550-1645  (122090-122185)   100% ->
1646-1809  (122404-122567)   100% ->
1810-1890  (123258-123338)   100% ->
1891-2211  (123502-123822)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTTTAAACCGCACTTTGTCCATGTCCTCACTGCCAGGACTGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTTTAAACCGCACTTTGTCCATGTCCTCACTGCCAGGACTGGAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGGGAGGATGAATTCGACCTGGAGAACGCAGTGCTCTTCGAAGTGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGGGAGGATGAATTCGACCTGGAGAACGCAGTGCTCTTCGAAGTGGCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGAGGTGGCTAACAAGG         TGGGTGGCATCTACACGGTGCTG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100101 GGGAGGTGGCTAACAAGGGTG...CAGTGGGTGGCATCTACACGGTGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGACGAAGGCGAAGGTGACAGGGGACGAATGGGGCGACAACTACTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101653 CAGACGAAGGCGAAGGTGACAGGGGACGAATGGGGCGACAACTACTTCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGTGGGGCCGTACACGGAGCAGGGCGTGAGGACCCAGGTGGAACTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101703 GGTGGGGCCGTACACGGAGCAGGGCGTGAGGACCCAGGTGGAACTGCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGGCCCCCACCCCGGCCCTGAAGAGGACACTGGATTCCATGAACAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101753 AGGCCCCCACCCCGGCCCTGAAGAGGACACTGGATTCCATGAACAGCAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGCTGCAAG         GTGTATTTCGGGCGCTGGCTGATCGAGGGAGG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 101803 GGCTGCAAGGTG...CAGGTGTATTTCGGGCGCTGGCTGATCGAGGGAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCCTCTGGTGGTGCTCCTGGACGTGGGTGCCTCAGCTTGGGCCCTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105760 CCCTCTGGTGGTGCTCCTGGACGTGGGTGCCTCAGCTTGGGCCCTGGAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCTGGAAGGGAGAGCTCTGGGATACCTGCAACATCGGAGTGCCGTGGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105810 GCTGGAAGGGAGAGCTCTGGGATACCTGCAACATCGGAGTGCCGTGGTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GACCGCGAGGCCAACGACGCTGTCCTCTTTGGCTTTCTGACCACCTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105860 GACCGCGAGGCCAACGACGCTGTCCTCTTTGGCTTTCTGACCACCTGGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCTGGGTGAG         TTCCTGGCACAGAGTGAGGAGAAGCCACATG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 105910 CCTGGGTGAGGTA...CAGTTCCTGGCACAGAGTGAGGAGAAGCCACATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGGTTGCTCACTTCCATGAGTGGTTGGCAGGCGTTGGACTCTGCCTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107109 TGGTTGCTCACTTCCATGAGTGGTTGGCAGGCGTTGGACTCTGCCTGTGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CGTGCCCGGCGACTGCCTGTAGCAACCATCTTCACCACCCATGCCACGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107159 CGTGCCCGGCGACTGCCTGTAGCAACCATCTTCACCACCCATGCCACGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GCTGGGGCGCTACCTGTGTGCCGGTGCCGTGGACTTCTACAACAACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107209 GCTGGGGCGCTACCTGTGTGCCGGTGCCGTGGACTTCTACAACAACCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGAAC         TTCAACGTGGACAAGGAAGCAGGGGAGAGGCAGATC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107259 AGAACGTG...CAGTTCAACGTGGACAAGGAAGCAGGGGAGAGGCAGATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TACCACCGATACTGCATGGAAAGGGCGGCAGCCCACTGCGCTCACGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107544 TACCACCGATACTGCATGGAAAGGGCGGCAGCCCACTGCGCTCACGTCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CACTACTGTGTCCCAGATCACCGCCATCGAGGCACAGCACTTGCTCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107594 CACTACTGTGTCCCAGATCACCGCCATCGAGGCACAGCACTTGCTCAAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 GGAAACCAG         ATATTGTGACCCCCAATGGGCTGAATGTGAAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 107644 GGAAACCAGGTA...CAGATATTGTGACCCCCAATGGGCTGAATGTGAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AAGTTTTCTGCCATGCATGAGTTCCAGAACCTCCATGCTCAGAGCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110308 AAGTTTTCTGCCATGCATGAGTTCCAGAACCTCCATGCTCAGAGCAAGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TCGAATCCAGGAGTTTGTGCGGGGCCATTTTTATGG         GCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 110358 TCGAATCCAGGAGTTTGTGCGGGGCCATTTTTATGGGTA...TAGGCATC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TGGACTTCAACTTGGACAAGACCTTATACTTCTTTATCGCCGGCCGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110743 TGGACTTCAACTTGGACAAGACCTTATACTTCTTTATCGCCGGCCGCTAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GAGTTCTCCAACAAGGGTGCTGACGTCTTCCTGGAGGCATTGGCTCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110793 GAGTTCTCCAACAAGGGTGCTGACGTCTTCCTGGAGGCATTGGCTCGGCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CAACTATCTGCTCAGA         GTGAACGGCAGCGAGCAGACAGTGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 110843 CAACTATCTGCTCAGAGTG...CAGGTGAACGGCAGCGAGCAGACAGTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TTGCCTTCTTCATCATGCCAGCGCGGACCAACAATTTCAACGTGGAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111502 TTGCCTTCTTCATCATGCCAGCGCGGACCAACAATTTCAACGTGGAAACC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CTCAAAGGCCAAGCTGTGCGCAAACAGCTTTG         GGACACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 111552 CTCAAAGGCCAAGCTGTGCGCAAACAGCTTTGGTT...CAGGGACACGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CAACACGGTGAAGGAAAAGTTCGGGAGGAAGCTTTATGAATCCTTACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114965 CAACACGGTGAAGGAAAAGTTCGGGAGGAAGCTTTATGAATCCTTACTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 T         TGGGAGCCTTCCCGACATGAACAAGATGCTGGATAAGGAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115015 TGTG...CAGTGGGAGCCTTCCCGACATGAACAAGATGCTGGATAAGGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GACTTCACTATGATGAAGAGAGCCATCTTTGCAACGCAG         CG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 115151 GACTTCACTATGATGAAGAGAGCCATCTTTGCAACGCAGGTA...CAGCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GCAGTCTTTCCCCCCTGTGTGCACCCACAATATGCTGGATGACTCCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118382 GCAGTCTTTCCCCCCTGTGTGCACCCACAATATGCTGGATGACTCCTCAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 ACCCCATCCTGACCACCATCCGCCGAATCGGCCTCTTCAATAGCAGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118432 ACCCCATCCTGACCACCATCCGCCGAATCGGCCTCTTCAATAGCAGTGCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 GACAGGGTGAAG         GTGATTTTCCACCCGGAGTTCCTCTCCTC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 118482 GACAGGGTGAAGGTG...CAGGTGATTTTCCACCCGGAGTTCCTCTCCTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 CACAAGCCCCCTGCTCCCTGTGGACTATGAGGAGTTTGTCCGTGGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118803 CACAAGCCCCCTGCTCCCTGTGGACTATGAGGAGTTTGTCCGTGGCTGTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 ACCTTGGAGTCTTCCCCTCCTACTATGAGCCTTGGGGCTACACACCGG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 118853 ACCTTGGAGTCTTCCCCTCCTACTATGAGCCTTGGGGCTACACACCGGGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1550        CTGAGTGCACGGTTATGGGAATCCCCAGTATCTCCACCAATCT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118903 G...CAGCTGAGTGCACGGTTATGGGAATCCCCAGTATCTCCACCAATCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 CTCCGGCTTCGGCTGCTTCATGGAGGAACACATCGCAGACCCCTCAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122133 CTCCGGCTTCGGCTGCTTCATGGAGGAACACATCGCAGACCCCTCAGCTT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 ACG         GTATCTACATTCTTGACCGGCGGTTCCGCAGCCTGGAT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122183 ACGGTC...CAGGTATCTACATTCTTGACCGGCGGTTCCGCAGCCTGGAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 GATTCCTGCTCGCAGCTCACCTCCTTCCTCTACAGTTTCTGTCAGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122442 GATTCCTGCTCGCAGCTCACCTCCTTCCTCTACAGTTTCTGTCAGCAGAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 CCGGCGGCAGCGTATCATCCAGCGGAACCGCACGGAGCGCCTCTCCGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122492 CCGGCGGCAGCGTATCATCCAGCGGAACCGCACGGAGCGCCTCTCCGACC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 TTCTGGACTGGAAATACCTAGGCCGG         TACTATATGTCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 122542 TTCTGGACTGGAAATACCTAGGCCGGGTA...TAGTACTATATGTCTGCG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 CGCCACATGGCGCTGTCCAAGGCCTTTCCAGAGCACTTCACCTACGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123273 CGCCACATGGCGCTGTCCAAGGCCTTTCCAGAGCACTTCACCTACGAGCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 CAACGAGGCGGATGCG         GCCCAGGGGTACCGCTACCCACGGC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 123323 CAACGAGGCGGATGCGGTG...CAGGCCCAGGGGTACCGCTACCCACGGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 CAGCCTCGGTGCCACCGTCGCCCTCGCTGTCACGACACTCCAGCCCGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123527 CAGCCTCGGTGCCACCGTCGCCCTCGCTGTCACGACACTCCAGCCCGCAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 CAGAGTGAGGACGAGGAGGATCCCCGGAACGGGCCGCTGGAGGAAGACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123577 CAGAGTGAGGACGAGGAGGATCCCCGGAACGGGCCGCTGGAGGAAGACGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 CGAGCGCTACGATGAGGACGAGGAGGCCGCCAAGGACCGGCGCAACATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123627 CGAGCGCTACGATGAGGACGAGGAGGCCGCCAAGGACCGGCGCAACATCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 GTGCACCAGAGTGGCCGCGCCGAGCGTCCTGCACCTCCTCCACCAGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123677 GTGCACCAGAGTGGCCGCGCCGAGCGTCCTGCACCTCCTCCACCAGCGGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 AGCAAGCGCAACTCTGTGGACACGGCCACCTCCAGCTCACTCAGCACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123727 AGCAAGCGCAACTCTGTGGACACGGCCACCTCCAGCTCACTCAGCACCCC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2166 GAGCGAGCCCCTCAGCCCCACCAGCTCCCTGGGCGAGGAGCGTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123777 GAGCGAGCCCCTCAGCCCCACCAGCTCCCTGGGCGAGGAGCGTAAC