seq1 = pF1KE0812.tfa, 936 bp
seq2 = pF1KE0812/gi568815587f_124085270.tfa (gi568815587f:124085270_124286205), 200936 bp

>pF1KE0812 936
>gi568815587f:124085270_124286205 (Chr11)

1-936  (100001-100936)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGTGAAGAACTGCTGCATGGTGACAGAGTTCATCCTTTTGGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGTGAAGAACTGCTGCATGGTGACAGAGTTCATCCTTTTGGGAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCACACACAGAGGGGCTGGAGATGACACTTTTTGTCTTATTCTTGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCACACACAGAGGGGCTGGAGATGACACTTTTTGTCTTATTCTTGCCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTATGCCTGCACTCTACTGGGAAATGTGTCTATCCTTGTTGCTGTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTATGCCTGCACTCTACTGGGAAATGTGTCTATCCTTGTTGCTGTTATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCTTCTGCTCGCCTTCACACACCTATGTATTTCTTCCTGGGAAACTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCTTCTGCTCGCCTTCACACACCTATGTATTTCTTCCTGGGAAACTTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGTGTTTGACATGGGTTTCTCCTCAGTGACTTGTCCCAAAATGCTGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGTGTTTGACATGGGTTTCTCCTCAGTGACTTGTCCCAAAATGCTGCTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCTTATGGGGCTGAGCCGACTCATCTCCTACAAAGACTGTGTCTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACCTTATGGGGCTGAGCCGACTCATCTCCTACAAAGACTGTGTCTGCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTTTTCTTCTTCCATTTCCTCGGGAGCATTGAGTGCTTCTTGTTTACGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTTTTCTTCTTCCATTTCCTCGGGAGCATTGAGTGCTTCTTGTTTACGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GATGGCCTATGACCGCTTCACTGCCATCTGTTATCCTCTGCGATACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GATGGCCTATGACCGCTTCACTGCCATCTGTTATCCTCTGCGATACACAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCATCATGAACCCAAGGATCTGTGTGGCCCTGGCTGTGGGCACATGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCATCATGAACCCAAGGATCTGTGTGGCCCTGGCTGTGGGCACATGGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTAGGGTGCATTCATTCCAGTATCTTGACCTCCCTCACCTTCACCTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTAGGGTGCATTCATTCCAGTATCTTGACCTCCCTCACCTTCACCTTGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ATACTGTGGTCCCAATGAAGTGGATCACTTCTTCTGTGACATTCCAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ATACTGTGGTCCCAATGAAGTGGATCACTTCTTCTGTGACATTCCAGCAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGTTGCCCTTGGCCTGTGCTGACACATCCTTAGCCCAGAGGGTGAGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGTTGCCCTTGGCCTGTGCTGACACATCCTTAGCCCAGAGGGTGAGCTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACCAACGTTGGCCTCATATCTCTTGTCTGCTTTCTGCTAATTCTTTTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACCAACGTTGGCCTCATATCTCTTGTCTGCTTTCTGCTAATTCTTTTATC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTACACTAGAATCACAATATCTATCTTAAGCATTCGTACAACTGAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTACACTAGAATCACAATATCTATCTTAAGCATTCGTACAACTGAGGGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GTCGCCGTGCCTTCTCCACCTGCAGTGCTCACCTCATTGCCATCCTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GTCGCCGTGCCTTCTCCACCTGCAGTGCTCACCTCATTGCCATCCTCTGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCCTATGGGCCCATCATCACTGTCTACCTGCAGCCCACACCCAACCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCCTATGGGCCCATCATCACTGTCTACCTGCAGCCCACACCCAACCCCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCTGGGAACCGTGGTACAAATTCTCATGAATCTGGTAGGACCAATGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCTGGGAACCGTGGTACAAATTCTCATGAATCTGGTAGGACCAATGCTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACCCTTTGATCTATACCTTGAGGAATAAGGAAGTAAAAACAGCCCTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ACCCTTTGATCTATACCTTGAGGAATAAGGAAGTAAAAACAGCCCTGAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .
    901 ACAATATTGCACAGGACAGGCCATGTTCCTGAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ACAATATTGCACAGGACAGGCCATGTTCCTGAGAGT