seq1 = pF1KE0277.tfa, 963 bp
seq2 = pF1KE0277/gi568815587r_5099738.tfa (gi568815587r:5099738_5300700), 200963 bp

>pF1KE0277 963
>gi568815587r:5099738_5300700 (Chr11)

(complement)

1-963  (100001-100963)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTTCTCAGTTCCAGAATGATTACTTCAGTAAGCCCTAGCACCAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTTCTCAGTTCCAGAATGATTACTTCAGTAAGCCCTAGCACCAGCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAATTCTTCCTTTCTTCTCACTGGATTTTCTGGCATGGAGCAGCAATACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAATTCTTCCTTTCTTCTCACTGGATTTTCTGGCATGGAGCAGCAATACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTGGCTTTCCATCCCCTTCTCCTCAATCTATGCCATGGTGCTTTTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTGGCTTTCCATCCCCTTCTCCTCAATCTATGCCATGGTGCTTTTGGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AATTGCATGGTTCTCCATGTGATATGGACTGAGCCAAGCCTGCACCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AATTGCATGGTTCTCCATGTGATATGGACTGAGCCAAGCCTGCACCAGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TATGTTTTACTTCCTGTCCATGCTGGCCCTCACTGACCTGTGCATGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TATGTTTTACTTCCTGTCCATGCTGGCCCTCACTGACCTGTGCATGGGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGTCCACTGTGTACACAGTGCTGGGGATCCTGTGGGGGATCATTCGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGTCCACTGTGTACACAGTGCTGGGGATCCTGTGGGGGATCATTCGAGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATCAGCTTGGATTCCTGCATTGCCCAGTCCTATTTCATCCATGGTCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATCAGCTTGGATTCCTGCATTGCCCAGTCCTATTTCATCCATGGTCTGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTTCATGGAGTCCTCTGTCCTCCTCACTATGGCCTTTGACCGGTACATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTTCATGGAGTCCTCTGTCCTCCTCACTATGGCCTTTGACCGGTACATTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CAATTTGCAATCCACTACGTTATTCCTCCATCCTGACTAATTCCAGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CAATTTGCAATCCACTACGTTATTCCTCCATCCTGACTAATTCCAGAATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATCAAAATTGGGCTCACTATAATAGGTAGGAGTTTTTTCTTTATTACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATCAAAATTGGGCTCACTATAATAGGTAGGAGTTTTTTCTTTATTACACC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCCCATCATCTGTCTGAAATTTTTTAATTACTGTCATTTCCACATCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCCCATCATCTGTCTGAAATTTTTTAATTACTGTCATTTCCACATCCTTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTCACTCTTTCTGCCTGCACCAGGATCTTCTCCGCTTAGCCTGTTCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTCACTCTTTCTGCCTGCACCAGGATCTTCTCCGCTTAGCCTGTTCAGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCCGATTCAATAGTTACTATGCCCTGATGCTGGTTATTTGCATACTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATCCGATTCAATAGTTACTATGCCCTGATGCTGGTTATTTGCATACTGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GTTGGATGCTATACTCATCCTTTTCTCCTACATCCTGATTCTTAAGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GTTGGATGCTATACTCATCCTTTTCTCCTACATCCTGATTCTTAAGTCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCCTGGCAGTTGCCTCTCAGGAAGAGAGGCATAAATTATTTCAGACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCCTGGCAGTTGCCTCTCAGGAAGAGAGGCATAAATTATTTCAGACCTGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATCTCCCACATCTGTGCTGTCCTTGTGTTCTACATCCCTATCATTAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATCTCCCACATCTGTGCTGTCCTTGTGTTCTACATCCCTATCATTAGCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CACAATGGTGCACCGTTTTGGCAAGCACCTTTCCCCCGTGGCCCACGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CACAATGGTGCACCGTTTTGGCAAGCACCTTTCCCCCGTGGCCCACGTTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCATTGGCAACATCTACATCCTTTTCCCACCTTTAATGAATCCCATCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCATTGGCAACATCTACATCCTTTTCCCACCTTTAATGAATCCCATCATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TACAGTGTCAAGACCCAACAGATTCATACCAGAATGCTTAGACTCTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TACAGTGTCAAGACCCAACAGATTCATACCAGAATGCTTAGACTCTTTTC

    950     .    :
    951 TCTGAAAAGATAT
        |||||||||||||
 100951 TCTGAAAAGATAT