seq1 = pF1KE0193.tfa, 1077 bp
seq2 = pF1KE0193/gi568815596r_96607259.tfa (gi568815596r:96607259_96840040), 232782 bp

>pF1KE0193 1077
>gi568815596r:96607259_96840040 (Chr2)

(complement)

1-187  (100001-100187)   100% ->
188-306  (101974-102092)   100% ->
307-424  (105515-105632)   100% ->
425-507  (106440-106522)   100% ->
508-540  (126902-126934)   100% ->
541-702  (128016-128177)   100% ->
703-817  (128271-128385)   100% ->
818-937  (132208-132327)   100% ->
938-1077  (132643-132782)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGACTCTGGGACCCCTTGGGTCGTGGCAGCAGTGGCGGCGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCGACTCTGGGACCCCTTGGGTCGTGGCAGCAGTGGCGGCGATG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTGTCGGCTCGGGATGGGTCCAGGATGTTACTCCTTCTTCTTTTGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTGTCGGCTCGGGATGGGTCCAGGATGTTACTCCTTCTTCTTTTGTTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGTCTGGGCAGGGGCCACAGCAAGTCGGGGCGGGTCAAACGTTCGAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGTCTGGGCAGGGGCCACAGCAAGTCGGGGCGGGTCAAACGTTCGAGTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGAAACGGGAGCACTCGCTGTCGAAGCCCTACCAGG         GTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100151 TTGAAACGGGAGCACTCGCTGTCGAAGCCCTACCAGGGTG...TAGGTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGGCACAGGCAGTTCCTCACTGTGGAATCTGATGGGCAATGCCATGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101978 GGGCACAGGCAGTTCCTCACTGTGGAATCTGATGGGCAATGCCATGGTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGACCCAGTATATCCGCCTTACCCCAGATATGCAAAGTAAACAGGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102028 TGACCCAGTATATCCGCCTTACCCCAGATATGCAAAGTAAACAGGGTGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTGTGGAACCGGGTG         CCATGTTTCCTGAGAGACTGGGAGTT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 102078 TTGTGGAACCGGGTGGTA...TAGCCATGTTTCCTGAGAGACTGGGAGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCAGGTGCACTTCAAAATCCATGGACAAGGAAAGAAGAATCTGCATGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105541 GCAGGTGCACTTCAAAATCCATGGACAAGGAAAGAAGAATCTGCATGGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATGGCTTGGCAATCTGGTACACAAAGGATCGGATGCAGCCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 105591 ATGGCTTGGCAATCTGGTACACAAAGGATCGGATGCAGCCAGGTA...TA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    425  GGCCTGTGTTTGGAAACATGGACAAATTTGTGGGGCTGGGAGTATTTGT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106439 GGGCCTGTGTTTGGAAACATGGACAAATTTGTGGGGCTGGGAGTATTTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGACACCTACCCCAATGAGGAGAAGCAGCAAGAG         GCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 106489 AGACACCTACCCCAATGAGGAGAAGCAGCAAGAGGTA...CAGGCCCAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGAGGCGATATTCTCCAGGAGTCCAG         CGGGTATTCCCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 126909 AGAGGCGATATTCTCCAGGAGTCCAGGTA...CAGCGGGTATTCCCCTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ATCTCAGCCATGGTGAACAACGGCTCCCTCAGCTATGATCATGAGCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128031 ATCTCAGCCATGGTGAACAACGGCTCCCTCAGCTATGATCATGAGCGGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGGGCGGCCTACAGAGCTGGGAGGCTGCACAGCCATTGTCCGCAATCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128081 TGGGCGGCCTACAGAGCTGGGAGGCTGCACAGCCATTGTCCGCAATCTTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ATTACGACACCTTCCTGGTGATTCGCTACGTCAAGAGGCATTTGACG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 128131 ATTACGACACCTTCCTGGTGATTCGCTACGTCAAGAGGCATTTGACGGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    703       ATAATGATGGATATTGATGGCAAGCATGAGTGGAGGGACTGCAT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128181 ...TAGATAATGATGGATATTGATGGCAAGCATGAGTGGAGGGACTGCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGAAGTGCCCGGAGTCCGCCTGCCCCGCGGCTACTACTTCGGCACCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128315 TGAAGTGCCCGGAGTCCGCCTGCCCCGCGGCTACTACTTCGGCACCTCCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CCATCACTGGGGATCTCTCAG         ATAATCATGATGTCATTTCC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 128365 CCATCACTGGGGATCTCTCAGGTA...CAGATAATCATGATGTCATTTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TTGAAGTTGTTTGAACTGACAGTGGAGAGAACCCCAGAAGAGGAAAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132228 TTGAAGTTGTTTGAACTGACAGTGGAGAGAACCCCAGAAGAGGAAAAGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CCATCGAGATGTGTTCTTGCCCTCAGTGGACAATATGAAGCTGCCTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132278 CCATCGAGATGTGTTCTTGCCCTCAGTGGACAATATGAAGCTGCCTGAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938          TGACAGCTCCACTGCCGCCCCTGAGTGGCCTGGCCCTCTTC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132328 GTG...CAGTGACAGCTCCACTGCCGCCCCTGAGTGGCCTGGCCCTCTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CTCATCGTCTTTTTCTCCCTGGTGTTTTCTGTATTTGCCATAGTCATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132684 CTCATCGTCTTTTTCTCCCTGGTGTTTTCTGTATTTGCCATAGTCATTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1029 TATCATACTCTACAACAAATGGCAGGAACAGAGCCGAAAGCGCTTCTAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132734 TATCATACTCTACAACAAATGGCAGGAACAGAGCCGAAAGCGCTTCTAC