seq1 = pF1KE0137.tfa, 516 bp
seq2 = pF1KE0137/gi568815575r_152727844.tfa (gi568815575r:152727844_152929761), 201918 bp

>pF1KE0137 516
>gi568815575r:152727844_152929761 (ChrX)

(complement)

1-162  (99999-100160)   98% ->
163-291  (100485-100613)   100% ->
292-429  (101088-101225)   100% ->
430-516  (101832-101918)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTCCAACTTTAAAAAGGCAAACATGGCATCAAGTTCTCAGCGAAA
        | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
  99999 AAGGCCTCCAACTTTAAGAAGGCAAACATGGCATCAAGTTCTCAGCGAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAGAATGAGCCCTAAGCCTGAGCTTACTGAAGAGCAAAAGCAGGAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100049 AAGAATGAGCCCTAAGCCTGAGCTTACTGAAGAGCAAAAGCAGGAGATCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGAAGCTTTTGATCTTTTCGATGCGGATGGAACTGGCACCATAGATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100099 GGGAAGCTTTTGATCTTTTCGATGCGGATGGAACTGGCACCATAGATGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAAGAACTGAAG         GTGGCAATGAGGGCCCTGGGCTTTGAACC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100149 AAAGAACTGAAGGCA...TAGGTGGCAATGAGGGCCCTGGGCTTTGAACC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAGAAAGAAGAAATTAAGAAAATGATAAGTGAAATTGATAAGGAAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100514 CAAGAAAGAAGAAATTAAGAAAATGATAAGTGAAATTGATAAGGAAGGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGGAAAAATGAACTTTGGTGACTTTTTAACTGTGATGACCCAGAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100564 CAGGAAAAATGAACTTTGGTGACTTTTTAACTGTGATGACCCAGAAAATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292          TCTGAGAAAGATACTAAAGAAGAAATCCTGAAAGCTTTCAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100614 GTA...AAGTCTGAGAAAGATACTAAAGAAGAAATCCTGAAAGCTTTCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCTCTTTGATGATGATGAAACTGGGAAGATTTCGTTCAAAAATCTGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101129 GCTCTTTGATGATGATGAAACTGGGAAGATTTCGTTCAAAAATCTGAAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCGTGGCCAAGGAGTTGGGTGAGAACCTGACTGATGAGGAGCTGCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 101179 GCGTGGCCAAGGAGTTGGGTGAGAACCTGACTGATGAGGAGCTGCAGGTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    430       GAAATGATTGATGAAGCTGATCGAGATGGAGATGGAGAGGTCAG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101229 ...TAGGAAATGATTGATGAAGCTGATCGAGATGGAGATGGAGAGGTCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGAGCAAGAGTTCCTGCGCATCATGAAAAAGACCAGCCTCTAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101876 TGAGCAAGAGTTCCTGCGCATCATGAAAAAGACCAGCCTCTAT