seq1 = pF1KE0110.tfa, 777 bp
seq2 = pF1KE0110/gi568815580r_47008685.tfa (gi568815580r:47008685_47236439), 227755 bp

>pF1KE0110 777
>gi568815580r:47008685_47236439 (Chr18)

(complement)

1-101  (100001-100101)   100% ->
102-310  (101736-101944)   100% ->
311-395  (106112-106196)   100% ->
396-612  (121092-121308)   100% ->
613-676  (123400-123463)   100% ->
677-777  (127655-127755)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGCATGCCGTGCATTAAAAGCTGTTTTGGTAGATCTCAGTGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGCATGCCGTGCATTAAAAGCTGTTTTGGTAGATCTCAGTGGCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACTTCACATTGAAGATGCAGCTGTGCCAGGCGCACAGGAAGCTCTTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACTTCACATTGAAGATGCAGCTGTGCCAGGCGCACAGGAAGCTCTTAAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 G         GTTACGTGGTGCTTCTGTAATCATTAGGTTTGTGACCAAT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGCA...CAGGTTACGTGGTGCTTCTGTAATCATTAGGTTTGTGACCAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACAACCAAAGAGAGCAAGCAAGACCTGTTAGAAAGGTTGAGAAAATTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101776 ACAACCAAAGAGAGCAAGCAAGACCTGTTAGAAAGGTTGAGAAAATTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ATTTGATATCTCTGAAGATGAAATATTCACATCTCTGACTGCAGCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101826 ATTTGATATCTCTGAAGATGAAATATTCACATCTCTGACTGCAGCCAGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GTTTACTAGAGCGGAAACAAGTCAGACCCATGCTGCTAGTTGATGATCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101876 GTTTACTAGAGCGGAAACAAGTCAGACCCATGCTGCTAGTTGATGATCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCACTACCTGATTTCAAAG         GAATACAAACAAGTGATCCTAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 101926 GCACTACCTGATTTCAAAGGTA...CAGGAATACAAACAAGTGATCCTAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGCTGTGGTCATGGGATTGGCACCAGAACATTTTCATTATCAAATTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106134 TGCTGTGGTCATGGGATTGGCACCAGAACATTTTCATTATCAAATTCTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATCAAGCATTCCG         GTTACTCCTGGATGGAGCACCTCTGATA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 106184 ATCAAGCATTCCGGTA...TAGGTTACTCCTGGATGGAGCACCTCTGATA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCAATCCACAAAGCCAGGTATTACAAGAGGAAAGATGGCTTAGCCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121120 GCAATCCACAAAGCCAGGTATTACAAGAGGAAAGATGGCTTAGCCCTGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCCTGGACCATTTGTGACTGCTTTAGAGTATGCCACAGATACCAAAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121170 GCCTGGACCATTTGTGACTGCTTTAGAGTATGCCACAGATACCAAAGCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CAGTCGTGGGGAAACCAGAGAAGACGTTCTTTTTGGAAGCATTGCGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121220 CAGTCGTGGGGAAACCAGAGAAGACGTTCTTTTTGGAAGCATTGCGGGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ACTGGCTGTGAACCTGAGGAGGCTGTCATGATAGGAGAT         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 121270 ACTGGCTGTGAACCTGAGGAGGCTGTCATGATAGGAGATGTA...TAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TTGCAGGGATGATGTTGGTGGGGCTCAAGATGTCGGCATGCTGGGCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123402 TTGCAGGGATGATGTTGGTGGGGCTCAAGATGTCGGCATGCTGGGCATCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TAGTAAAGACTG         GGAAATATCGAGCATCAGATGAAGAAAAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 123452 TAGTAAAGACTGGTA...CAGGGAAATATCGAGCATCAGATGAAGAAAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ATTAATCCACCTCCTTACTTAACTTGTGAGAGTTTCCCTCATGCTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127684 ATTAATCCACCTCCTTACTTAACTTGTGAGAGTTTCCCTCATGCTGTGGA

    800     .    :    .    :
    756 CCACATTCTGCAGCACCTATTG
        ||||||||||||||||||||||
 127734 CCACATTCTGCAGCACCTATTG