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ShiftedIonsFinder

Shifted Ions Finderは、二つのクロマトグラフィー-精密質量分析データにおけるマススペクトルを比較し、特定の質量差分を持つピークを検索するためのJava(GUI)ツールです。本ツールを利用することで、安定同位体で標識されたピークや配糖化などの修飾を受けたピークを簡便に検索することができます。

動作環境:

本アプリケーションソフトは、プログラム言語のJavaを用いて開発しています。Javaプログラムを動作させるためには、Java Runtime Environment(以下JREと表記)が必要になります。インストールされていない場合や、仕様で定めているJREのVersion(1.6.0_10)よりも前の環境の場合は、JREをインストールする必要があります。推奨環境を以下に示します。

  • OS: Windows XP以上, MacOS X (10.9で動作確認)
  • CPU: Intel Core 2 Duo相当以上
  • メモリ: 512 MB以上(処理するファイルによっては、512 MB以上必要)
  • Java: JRE Version(1.6.0_10)以上

ダウンロード:

ShiftedIonsFinder 1.1.6 (10.1 MB)

上記をクリックした後、ダウンロードが開始されるまで数秒~数十秒かかります。しばらくそのままお待ちください。

インストール:

ダウンロードしたzip圧縮ファイルを解凍しすると、「ShiftedIonsFinder_*.*.*.*」(末尾はバージョン番号)というフォルダができます。このフォルダをローカルのドライブ(任意の場所)に配置することで完了となります。

マニュアル:

ShiftedIonsFinder 1.1.6 ユーザーマニュアル(英語版) (1.40 MB)

※同マニュアルは、ShiftedIonsFinderを起動後、メインウィンドウの[Help]->[Open Manual]メニューからも参照できます。

論文:

ShiftedIonsFinder: A standalone Java tool for finding peaks with specified mass differences by comparing mass spectra of isotope-labeled and unlabeled data sets.
Kera K, Ogata Y, Ara T, Nagashima Y, Shimada N, Sakurai N, Shibata D, Suzuki H
Plant Biotechnology (2014) 31: 269-274

URLの記載:

ShiftedIonsFinderについて論文等に記載される際は、以下のURLをご利用ください。今ご覧のウェブページのURLは変更される可能性があるため、使わないでください。

http://www.kazusa.or.jp/komics/software/ShiftedIonsFinder

お問い合わせ:

こちらまでメールでお寄せください。

解良 康太, E-mail: kera AT kazusa.or.jp (ATは半角の@に直してください)

ライセンス:

本アプリケーションソフトの利用には,下記の事項についてご同意いただくことを条件としています。

  1. 研究目的にのみ使用すること。もし、商業目的等に使用するには、別途、公益財団法人かずさDNA研究所(以下、当研究所という。)と協議すること。権利の一部を請求することがあります。
  2. 使用は、請求者の研究室のみとし、本ソフトウェアを第三者に譲渡しないこと。
  3. 本アプリケーションソフトを使用して得られた研究成果を公表する場合は、当研究所から提供された本アプリケーションソフトを使用したことを明記すること。
  4. 本アプリケーションソフトは無償で提供されるものであり、当研究所は、本アプリケーションソフトに対して何らの保証はしないこと。また、当研究所は、本アプリケーションソフトの使用または使用不能から生じたいかなる損害も一切責任を負わないこと。