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The Kazusa Metabolomics Portal

 

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かずさDNA研究所では、主に精密質量分析装置(フーリエ変換型MS、オービトラップMS)を用いて、ノンターゲットな代謝産物の検出と化合物ピークの効率的なアノテーションに関する研究開発を行っている。また、遺伝子発現解析と合わせた統合解析にも取り組んできた。KOMICSは、その中で開発されてきたデータベースや、データ解析ソフトウェアを公開するポータルサイトだ。
各種分析プラットフォーム用のデータ解析ソフトウェア(PowerGet、MatchedIonsFiner、FragmentAlign、SpiecHit)やウェブサービス(MFSearcher)、シロイヌナズナの遺伝子機能解析に役立つツール(KATANA、KAGIANA、DAGViz、ARTRA)などを公開している。データベースとしては、メタボロミクスのデータをより多くフリーで提供することを目指し、世界最大級の生データのリポジトリ(MassBase)やピークアノテーションデータベース(KomicMarket)を構築している。また、メタボロミクスとトランスクリプトミクスのデータを統合した解析ツール(RnR)や、遺伝子機能解析に役立つツール(CoP、KaPPA-View)等、データ解析のための基盤も整備している。

 

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