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The Kazusa Metabolomics Portal

ARTRAデータベースは、タカラバイオ社が開発したマイクロアレイのプローブ設計情報を提供するサイトです。これまで、アクセスするためには、ユーザーアカウントの取得が必要でしたが、その制限を解除し、誰でもアクセスできるようにいたしました。

ShiftedIonsFinderShiftedIonsFinderは、二つのクロマトグラフィー-精密質量分析データにおけるマススペクトルを比較し、特定の質量差分を持つピークを検索するためのJava(GUI)ツールです。本ツールを利用することで、安定同位体で標識されたピークや配糖化などの修飾を受けたピークを簡便に検索することができます。

 

LC-精密質量MSのデータ解析ソフトPowerGetのマニュアルが、PDFファイルとしてダウンロード出来るようになりました。旧バージョン(3.3)に対応した内容となっています(日本語版のみ)。バージョン3.3以降に付加された機能については、オンラインマニュアル(準備中)に一部掲載されています。今後はオンライン版を中心に情報提供してゆく予定です。

LC-MSのデータ解析ソフト、PowerGetの正式版、バージョン3.5.0をリリースしました。3.5ベータ2版からの機能的変更はありません。MFSearcherでヒューマン・メタボローム・データベース(HMDB)や、化合物としてより「ありそうな」組成式を提示するExactMassDB-HR2に対して検索ができるようになりました。PowerMatchでのエクスポートのバグ修正の他、Alignment Tableでのカラム表示など、いくつかの修正や機能改善がされています。

Metabolonote 実験条件の詳細情報(メタデータ)を専門で管理するデータベースMetabolonoteで、メタデータの検索機能が大幅にアップしました。生物種や分析装置名など、項目を指定して検索できる「意味的検索」が可能となっています。

 

New KomicMarket Temporary Website 現在、メタボロームデータベースKomicMarketを改装中です。これまでなかった、メタボロームデータをサンプルごとに一括ダウンロードできる機能を実装中です。新KomicMarketのリリースの前に、データだけダウンロードできるサイトとして、この「一時サイト」をオープンしました。データはTogoMDと呼ばれるシンプルなフォーマットで記載されています。

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