# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fk11517.fasta.nr -Q ../query/KIAA2026.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA2026, 858 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7820512 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8673+/-0.000198; mu= 5.1087+/- 0.011 mean_var=115.6472+/-22.084, 0's: 30 Z-trim: 46 B-trim: 191 in 1/67 Lambda= 0.119263 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|148612838|ref|NP_001017969.2| hypothetical prot (2103) 5381 937.6 0 gi|109111621|ref|XP_001108823.1| PREDICTED: simila (2073) 5185 903.8 0 gi|194224829|ref|XP_001917272.1| PREDICTED: simila (2059) 4678 816.6 0 gi|194669478|ref|XP_874176.3| PREDICTED: similar t (2103) 4414 771.2 0 gi|109460021|ref|XP_219779.4| PREDICTED: similar t (2087) 3300 579.5 5e-162 gi|77415417|gb|AAI05764.1| RGD1311595 protein [Rat ( 521) 2320 410.5 9.3e-112 gi|149062680|gb|EDM13103.1| rCG47386 [Rattus norve ( 500) 2235 395.9 2.3e-107 gi|26331772|dbj|BAC29616.1| unnamed protein produc ( 509) 2232 395.4 3.3e-107 gi|10801614|dbj|BAB16724.1| hypothetical protein [ ( 375) 1982 352.3 2.3e-94 gi|74623606|sp|Q96WV6.1|YHU2_SCHPO RecName: Full=U (3971) 534 103.7 1.6e-18 gi|115643124|ref|XP_001191767.1| PREDICTED: hypoth (1249) 463 91.2 2.9e-15 gi|134065504|emb|CAM43271.1| proteophosphoglycan p (5384) 460 91.1 1.4e-14 gi|134073236|emb|CAM71958.1| proteophosphoglycan p (5967) 458 90.8 1.9e-14 gi|70905642|gb|AAZ14281.1| proteophosphoglycan 5 [ (17392) 438 87.6 4.9e-13 gi|70905641|gb|AAZ14280.1| proteophosphoglycan ppg (7194) 427 85.5 8.9e-13 gi|167736355|ref|NP_060876.4| mucin 4 isoform a [H (5284) 412 82.8 4.1e-12 gi|74622204|sp|Q8TFG4.1|YL54_SCHPO RecName: Full=U ( 800) 382 77.2 3.2e-11 gi|221104309|ref|XP_002170103.1| PREDICTED: hypoth (1127) 384 77.6 3.3e-11 gi|212001255|gb|EEB06915.1| predicted protein [Sch (1678) 382 77.4 5.8e-11 gi|109493395|ref|XP_221384.4| PREDICTED: similar t (2499) 368 75.1 4.3e-10 gi|154700274|gb|EDO00013.1| hypothetical protein S (1653) 364 74.3 4.9e-10 gi|17566006|ref|NP_505150.1| hypothetical protein (1079) 361 73.6 4.9e-10 gi|189539975|ref|XP_697571.3| PREDICTED: hypotheti (1233) 359 73.3 7e-10 gi|51869311|emb|CAE54436.1| secreted mucin MUC17 [ (4262) 365 74.7 9.4e-10 gi|74708733|sp|Q685J3.1|MUC17_HUMAN RecName: Full= (4493) 365 74.7 9.9e-10 gi|91982772|ref|NP_001035194.1| mucin 17 [Homo sap (4493) 365 74.7 9.9e-10 gi|33310026|gb|AAQ03243.1|AF414112_1 putative cell (1121) 353 72.3 1.3e-09 gi|51704284|sp|P41809.2|HKR1_YEAST RecName: Full=H (1802) 350 71.9 2.8e-09 gi|115695762|ref|XP_001201322.1| PREDICTED: hypoth ( 959) 344 70.7 3.4e-09 gi|545660|gb|AAB30051.1| Hkr1p [Saccharomyces cere (1802) 347 71.4 4e-09 gi|32452989|gb|AAP82647.1| Hypothetical protein K0 ( 825) 336 69.3 7.8e-09 gi|3834293|gb|AAC70889.1| Hypothetical protein K06 (1032) 336 69.3 9.4e-09 gi|150849363|gb|EDN24556.1| hypothetical protein B (1626) 338 69.8 1.1e-08 gi|146423800|ref|XP_001487825.1| hypothetical prot (1750) 338 69.8 1.1e-08 gi|163667088|gb|ABY33454.1| autotransporter-associ (1320) 336 69.4 1.1e-08 gi|115770339|ref|XP_001176616.1| PREDICTED: simila (1518) 336 69.4 1.3e-08 gi|122890548|emb|CAM14118.1| novel protein contain (1044) 332 68.6 1.5e-08 gi|194678438|ref|XP_001255603.2| PREDICTED: simila (1908) 336 69.5 1.6e-08 gi|190345248|gb|EDK37104.2| hypothetical protein P (1750) 335 69.3 1.6e-08 gi|168334905|ref|ZP_02693025.1| cell surface prote (1647) 333 68.9 2e-08 gi|194218864|ref|XP_001916050.1| PREDICTED: simila (1104) 330 68.3 2e-08 gi|189526387|ref|XP_001344867.2| PREDICTED: simila (1783) 333 68.9 2.1e-08 gi|7206750|gb|AAF39909.1| Hypothetical protein H43 (1203) 329 68.2 2.5e-08 gi|187026492|emb|CAP34062.1| Hypothetical protein (1034) 327 67.8 2.8e-08 gi|2497227|sp|Q04893.1|YM96_YEAST RecName: Full=Un (1140) 321 66.8 6.1e-08 gi|38567068|emb|CAE76365.1| related to glucan 1, 4 (1625) 323 67.2 6.4e-08 gi|187983863|gb|EDU49351.1| predicted protein [Pyr ( 930) 318 66.2 7.4e-08 gi|6984160|gb|AAF34780.1| srpA [Streptococcus cris (3381) 326 67.9 8.2e-08 gi|728850|sp|P08640.2|MUC1_YEAST RecName: Full=Muc (1367) 319 66.5 9e-08 gi|49648188|emb|CAG80506.1| YALI0D02299p [Yarrowia ( 901) 315 65.7 1e-07 >>gi|148612838|ref|NP_001017969.2| hypothetical protein (2103 aa) initn: 5381 init1: 5381 opt: 5381 Z-score: 5000.1 bits: 937.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 5381; 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