# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/pj02017.fasta.huge -Q ../query/KIAA2011.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA2011, 1091 aa vs ./tmplib.25089 library 1986414 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.8304+/-0.0107; mu= -6.4633+/- 0.722 mean_var=522.6176+/-126.468, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 16 in 1/39 Lambda= 0.056103 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0942 ( 537 res) hh04979s1 ( 537) 1904 169.1 1.5e-42 KIAA1110 ( 740 res) hh04831b(revised) ( 740) 318 40.9 0.00079 KIAA0763 ( 843 res) hk04726 ( 843) 306 40.0 0.0017 KIAA0248 ( 1880 res) ha02775s1 (1880) 297 39.8 0.0045 KIAA0522 ( 1555 res) hg01393 (1555) 289 39.0 0.0063 >>KIAA0942 ( 537 res) hh04979s1 (537 aa) initn: 1920 init1: 981 opt: 1904 Z-score: 855.9 bits: 169.1 E(): 1.5e-42 Smith-Waterman score: 1938; 59.010% identity (81.980% similar) in 505 aa overlap (595-1090:45-535) 570 580 590 600 610 620 KIAA20 EPPSPCHSEDSLGLGAAPLGSEPPLSQLVSDSDSELDSTERLALGSTDTLSNGQKADLEA .. ::. ::: : . ..:::: ....:: KIAA09 GWSRRTPGVAMGSSWCLYGCCNAGVKTTRLEAHSEMGSTEILEKETPENLSNGTSSNVEA 20 30 40 50 60 70 630 640 650 660 670 680 KIAA20 AQRLAKRLYRLDGFRKADVARHLGKNNDFSKLVAGEYLKFFVFTGMTLDQALRVFLKELA :.:::::::.:: :...:::.::::::.:::::: :::::: ::::::::.:: :.: .. 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