# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj01689.fasta.nr -Q ../query/KIAA2007.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA2007, 580 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7797520 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9074+/-0.000185; mu= 11.1539+/- 0.010 mean_var=75.9355+/-14.469, 0's: 29 Z-trim: 217 B-trim: 12 in 1/65 Lambda= 0.147181 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|114675215|ref|XP_001160876.1| PREDICTED: zinc f ( 616) 4038 867.6 0 gi|114675217|ref|XP_524100.2| PREDICTED: zinc fing ( 549) 3826 822.6 0 gi|48734709|gb|AAH71628.1| ZNF266 protein [Homo sa ( 398) 2861 617.5 2.3e-174 gi|114675263|ref|XP_512350.2| PREDICTED: zinc fing ( 536) 2252 488.3 2.4e-135 gi|62089260|dbj|BAD93074.1| zinc finger protein 42 ( 541) 2232 484.1 4.6e-134 gi|34925651|sp|Q9BUY5.1|ZN426_HUMAN RecName: Full= ( 554) 2232 484.1 4.7e-134 gi|109123290|ref|XP_001098009.1| PREDICTED: simila ( 551) 2231 483.9 5.4e-134 gi|211830041|gb|AAI25193.2| ZNF778 protein [Homo s ( 743) 2206 478.7 2.6e-132 gi|109123288|ref|XP_001097611.1| PREDICTED: simila ( 791) 2125 461.5 4.2e-127 gi|211826677|gb|AAH17407.2| ZNF266 protein [Homo s ( 293) 2093 454.3 2.3e-125 gi|16551981|dbj|BAB71213.1| unnamed protein produc ( 790) 2097 455.6 2.6e-125 gi|97219157|sp|Q96MR9.2|ZN560_HUMAN RecName: Full= ( 790) 2096 455.4 3e-125 gi|74194406|dbj|BAE24702.1| unnamed protein produc ( 754) 2051 445.8 2.2e-122 gi|194213205|ref|XP_001491806.2| PREDICTED: simila ( 935) 2034 442.3 3.1e-121 gi|114675255|ref|XP_524101.2| PREDICTED: zinc fing ( 790) 2027 440.7 7.6e-121 gi|119368828|sp|Q96MU6.2|ZN778_HUMAN RecName: Full ( 687) 2021 439.4 1.7e-120 gi|123210392|emb|CAM27283.1| novel KRAB box and zi ( 582) 2007 436.4 1.2e-119 gi|203097404|ref|NP_001128490.1| zinc finger prote ( 604) 1968 428.1 3.7e-117 gi|149020416|gb|EDL78221.1| rCG31665 [Rattus norve ( 639) 1963 427.1 8.1e-117 gi|203097452|ref|NP_001075954.1| zinc finger prote ( 604) 1959 426.2 1.4e-116 gi|74760022|sp|Q8N972.1|ZN709_HUMAN RecName: Full= ( 641) 1927 419.4 1.6e-114 gi|119604682|gb|EAW84276.1| zinc finger protein 70 ( 721) 1927 419.5 1.8e-114 gi|114675515|ref|XP_524120.2| PREDICTED: hypotheti (1305) 1927 419.7 2.7e-114 gi|114664134|ref|XP_511167.2| PREDICTED: hypotheti ( 728) 1902 414.2 7e-113 gi|153792259|ref|NP_872337.2| zinc finger protein ( 729) 1890 411.6 4.1e-112 gi|126324587|ref|XP_001369062.1| PREDICTED: simila ( 614) 1876 408.6 2.9e-111 gi|194213097|ref|XP_001915184.1| PREDICTED: simila ( 937) 1876 408.7 3.9e-111 gi|94730691|sp|Q32M78.1|ZN699_HUMAN RecName: Full= ( 642) 1872 407.7 5.3e-111 gi|123227460|emb|CAM27169.1| novel KRAB box and zi ( 834) 1872 407.8 6.4e-111 gi|194213112|ref|XP_001916328.1| PREDICTED: simila ( 798) 1871 407.6 7.2e-111 gi|109123306|ref|XP_001102914.1| PREDICTED: simila ( 642) 1861 405.4 2.7e-110 gi|148669906|gb|EDL01853.1| mCG58995, isoform CRA_ ( 609) 1860 405.2 3e-110 gi|123232535|emb|CAM21132.1| novel KRAB box and zi ( 610) 1857 404.5 4.7e-110 gi|126342482|ref|XP_001377265.1| PREDICTED: simila ( 864) 1855 404.2 8e-110 gi|169213276|ref|XP_001720310.1| PREDICTED: simila (1088) 1852 403.7 1.5e-109 gi|149250150|ref|XP_001480959.1| PREDICTED: simila ( 641) 1848 402.6 1.8e-109 gi|126343997|ref|XP_001368486.1| PREDICTED: simila (1027) 1837 400.5 1.3e-108 gi|126314668|ref|XP_001374905.1| PREDICTED: simila ( 779) 1829 398.7 3.4e-108 gi|194668302|ref|XP_608466.4| PREDICTED: similar t ( 648) 1826 398.0 4.7e-108 gi|123232533|emb|CAM21130.1| novel KRAB box and zi ( 610) 1823 397.3 6.9e-108 gi|149722053|ref|XP_001494018.1| PREDICTED: zinc f ( 688) 1817 396.1 1.8e-107 gi|109124478|ref|XP_001104516.1| PREDICTED: simila (1233) 1819 396.7 2.1e-107 gi|149250458|ref|XP_001472116.1| PREDICTED: simila ( 569) 1815 395.6 2.1e-107 gi|109125970|ref|XP_001115785.1| PREDICTED: simila ( 738) 1812 395.0 4e-107 gi|205831220|sp|A2VDQ7.1|ZN420_BOVIN RecName: Full ( 687) 1811 394.8 4.4e-107 gi|71153480|sp|Q8TAQ5.1|ZN420_HUMAN RecName: Full= ( 688) 1810 394.6 5.1e-107 gi|73948425|ref|XP_541659.2| PREDICTED: similar to (1259) 1812 395.3 5.9e-107 gi|114676858|ref|XP_512615.2| PREDICTED: zinc fing (1120) 1805 393.7 1.5e-106 gi|114676856|ref|XP_001163591.1| PREDICTED: zinc f (1238) 1805 393.8 1.6e-106 gi|109461612|ref|XP_001078762.1| PREDICTED: simila (1321) 1802 393.2 2.7e-106 >>gi|114675215|ref|XP_001160876.1| PREDICTED: zinc finge (616 aa) initn: 4038 init1: 4038 opt: 4038 Z-score: 4634.9 bits: 867.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 4038; 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