# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/bh00052.fasta.huge -Q ../query/KIAA1994.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1994, 1117 aa vs ./tmplib.25089 library 1986388 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.5314+/-0.0113; mu= -29.9628+/- 0.766 mean_var=610.1141+/-144.098, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.051924 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0669 ( 825 res) hk02346 ( 825) 613 61.5 5.8e-10 KIAA1818 ( 1157 res) hg00622 (1157) 339 41.1 0.0011 KIAA1002 ( 962 res) hk09859 ( 962) 324 39.9 0.0021 KIAA0181 ( 2079 res) ha02522s1 (2079) 331 40.7 0.0026 >>KIAA0669 ( 825 res) hk02346 (825 aa) initn: 794 init1: 337 opt: 613 Z-score: 270.8 bits: 61.5 E(): 5.8e-10 Smith-Waterman score: 1032; 31.529% identity (53.086% similar) in 1053 aa overlap (105-1115:20-820) 80 90 100 110 120 130 KIAA19 RGSGSGSASALNAAGTGVGSNATSSEDFPPPSLLQPPPPAASSTSG-PQPPPPQSLNLLS : : : :.. .: : :: ... 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