# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj03131.fasta.nr -Q ../query/KIAA1927.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1927, 1325 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7817404 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5037+/-0.000205; mu= 9.6061+/- 0.011 mean_var=142.7708+/-27.698, 0's: 36 Z-trim: 45 B-trim: 411 in 1/64 Lambda= 0.107338 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|168278987|dbj|BAG11373.1| sperm-specific antige (1259) 8146 1274.3 0 gi|134047924|sp|P28290.3|SSFA2_HUMAN RecName: Full (1259) 8137 1272.9 0 gi|22382234|gb|AAH28706.1| Sperm specific antigen (1256) 7940 1242.4 0 gi|109100270|ref|XP_001101290.1| PREDICTED: simila (1256) 7692 1204.0 0 gi|21757109|dbj|BAC05027.1| unnamed protein produc (1106) 7118 1115.0 0 gi|51476675|emb|CAH18314.1| hypothetical protein [ (1106) 7106 1113.2 0 gi|194222370|ref|XP_001501324.2| PREDICTED: sperm (1250) 6907 1082.4 0 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Ssfa2 protein [Mus musc ( 264) 1360 222.8 2.4e-55 gi|194389882|dbj|BAG60457.1| unnamed protein produ ( 306) 1201 198.2 6.9e-48 gi|158253471|gb|AAI53947.1| LOC792383 protein [Dan ( 320) 995 166.3 2.9e-38 gi|109732257|gb|AAI15800.1| Ssfa2 protein [Mus mus ( 189) 911 153.1 1.6e-34 gi|92097733|gb|AAI15223.1| Ssfa2 protein [Danio re ( 436) 633 110.4 2.7e-21 gi|189523709|ref|XP_001918979.1| PREDICTED: Ssfa2 (1245) 633 110.8 5.5e-21 gi|119617203|gb|EAW96797.1| hCG21937, isoform CRA_ ( 549) 515 92.2 9.9e-16 gi|109097005|ref|XP_001092963.1| PREDICTED: simila ( 488) 489 88.1 1.5e-14 gi|211828649|gb|AAH64065.2| 5830405N20Rik protein ( 374) 469 84.9 1.1e-13 gi|115313851|gb|AAI24477.1| Ssfa2 protein [Danio r ( 277) 461 83.6 2e-13 gi|114612715|ref|XP_001166783.1| PREDICTED: hypoth ( 896) 429 79.1 1.4e-11 gi|74188124|dbj|BAE37162.1| unnamed protein produc ( 238) 414 76.2 2.8e-11 gi|109066960|ref|XP_001083949.1| PREDICTED: simila ( 907) 420 77.7 3.8e-11 gi|51105858|gb|EAL24442.1| hypothetical protein LO ( 896) 403 75.1 2.3e-10 gi|74711238|sp|Q6ZRS4.1|CC129_HUMAN RecName: Full= ( 896) 403 75.1 2.3e-10 gi|55731556|emb|CAH92487.1| hypothetical protein [ ( 214) 384 71.5 6.6e-10 >>gi|168278987|dbj|BAG11373.1| sperm-specific antigen 2 (1259 aa) initn: 8146 init1: 8146 opt: 8146 Z-score: 6820.6 bits: 1274.3 E(): 0 Smith-Waterman score: 8146; 100.000% identity (100.000% similar) in 1259 aa overlap (67-1325:1-1259) 40 50 60 70 80 90 KIAA19 GRALTARAGVPAAALSRAGSGWGSGAPSAAMDRPLSSSAEAEEELEWQVASRRRKAWAKC :::::::::::::::::::::::::::::: gi|168 MDRPLSSSAEAEEELEWQVASRRRKAWAKC 10 20 30 100 110 120 130 140 150 KIAA19 RSSWQASETEDLSTEATTQDEEEDEEEDLPGAQLPAAGGRGNVPNEKIAIWLKDCRTPLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|168 RSSWQASETEDLSTEATTQDEEEDEEEDLPGAQLPAAGGRGNVPNEKIAIWLKDCRTPLG 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 KIAA19 ASLDEQSSSTLKGVLVRNGGSFEDDLSLGAEANHLHESDAQIENCNNILAKERRLQFHQK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|168 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