# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fk05496.fasta.nr -Q ../query/KIAA1913.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1913, 509 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7827041 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1895+/-0.00019; mu= 11.7997+/- 0.011 mean_var=73.8140+/-14.494, 0's: 41 Z-trim: 43 B-trim: 722 in 1/64 Lambda= 0.149281 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|149722944|ref|XP_001504320.1| PREDICTED: transm ( 491) 3035 662.9 5.3e-188 gi|119901437|ref|XP_589121.2| PREDICTED: similar t ( 491) 3010 657.6 2.2e-186 gi|194035417|ref|XP_001927918.1| PREDICTED: transm ( 491) 3002 655.8 7.4e-186 gi|81899273|sp|Q8C817.1|T200A_MOUSE RecName: Full= ( 491) 2951 644.8 1.5e-182 gi|26328381|dbj|BAC27929.1| unnamed protein produc ( 491) 2943 643.1 4.9e-182 gi|149039673|gb|EDL93835.1| rCG57409, isoform CRA_ ( 485) 2892 632.1 9.9e-179 gi|194377350|dbj|BAG57623.1| unnamed protein produ ( 367) 2378 521.3 1.7e-145 gi|82077799|sp|Q5RGQ8.1|T200A_DANRE RecName: Full= ( 497) 2035 447.6 3.7e-123 gi|189540635|ref|XP_001340900.2| PREDICTED: simila ( 266) 548 127.1 5.7e-27 gi|189537097|ref|XP_001342745.2| PREDICTED: simila ( 453) 537 124.9 4.5e-26 gi|47228493|emb|CAG05313.1| unnamed protein produc ( 166) 520 120.9 2.6e-25 gi|149412488|ref|XP_001508831.1| PREDICTED: hypoth ( 642) 512 119.7 2.4e-24 gi|47219138|emb|CAG01801.1| unnamed protein produc ( 665) 478 112.3 4e-22 gi|118101598|ref|XP_425776.2| PREDICTED: similar t ( 402) 350 84.6 5.4e-14 gi|148706395|gb|EDL38342.1| mCG18208 [Mus musculus ( 259) 344 83.2 9.4e-14 gi|82995005|ref|XP_892179.1| PREDICTED: similar to ( 637) 348 84.3 1e-13 gi|126321819|ref|XP_001364637.1| PREDICTED: simila ( 660) 345 83.7 1.7e-13 gi|47223049|emb|CAG07136.1| unnamed protein produc ( 410) 338 82.0 3.3e-13 gi|218675767|gb|AAI69201.2| hypothetical protein L ( 348) 335 81.3 4.6e-13 gi|205830737|sp|A6NKL6.2|TTMA_HUMAN RecName: Full= ( 621) 335 81.5 7.1e-13 gi|119916256|ref|XP_001254415.1| PREDICTED: hypoth ( 592) 334 81.3 8e-13 gi|125809373|ref|XP_001338484.1| PREDICTED: simila ( 403) 330 80.3 1.1e-12 gi|114672382|ref|XP_529940.2| PREDICTED: similar t ( 551) 330 80.4 1.4e-12 gi|40352905|gb|AAH64538.1| TMEM200B protein [Homo ( 306) 313 76.6 1.1e-11 gi|74736342|sp|Q69YZ2.1|T200B_HUMAN RecName: Full= ( 307) 313 76.6 1.1e-11 gi|73950499|ref|XP_854805.1| PREDICTED: hypothetic ( 307) 311 76.1 1.5e-11 gi|126328826|ref|XP_001373498.1| PREDICTED: hypoth ( 308) 309 75.7 2e-11 gi|119888699|ref|XP_590778.3| PREDICTED: similar t ( 307) 303 74.4 4.9e-11 gi|119622046|gb|EAX01641.1| hCG1646228 [Homo sapie ( 152) 211 54.4 2.6e-05 gi|118111451|ref|XP_001232592.1| PREDICTED: simila ( 80) 194 50.5 0.0002 gi|210096088|gb|EEA44239.1| hypothetical protein B ( 362) 193 50.8 0.00075 gi|210097938|gb|EEA46058.1| hypothetical protein B ( 241) 189 49.8 0.001 gi|210097943|gb|EEA46063.1| hypothetical protein B ( 241) 186 49.1 0.0016 gi|194207795|ref|XP_001500335.2| PREDICTED: simila ( 241) 183 48.5 0.0024 >>gi|149722944|ref|XP_001504320.1| PREDICTED: transmembr (491 aa) initn: 3035 init1: 3035 opt: 3035 Z-score: 3531.4 bits: 662.9 E(): 5.3e-188 Smith-Waterman score: 3035; 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