# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/bm01165.fasta.huge -Q ../query/KIAA1859.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1859, 761 aa vs ./tmplib.25089 library 1986744 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9481+/-0.00853; mu= -9.6471+/- 0.573 mean_var=330.1477+/-80.579, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 23 in 1/39 Lambda= 0.070586 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1114 ( 1458 res) fj15925 (1458) 1330 150.0 1.6e-36 KIAA1587 ( 991 res) fj08327 ( 991) 634 78.9 2.7e-15 >>KIAA1114 ( 1458 res) fj15925 (1458 aa) initn: 1385 init1: 1231 opt: 1330 Z-score: 747.4 bits: 150.0 E(): 1.6e-36 Smith-Waterman score: 1425; 41.470% identity (65.742% similar) in 721 aa overlap (88-754:122-796) 60 70 80 90 100 110 KIAA18 EFGAFGGYGTLTSFDIHILRAFGSLGPGLRILSNEP---WELEN-PVLAQTLVEALQLDP : .:.: :. : ::..: . .:: : KIAA11 RPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQ-ISQAL---P 100 110 120 130 140 120 130 140 150 160 170 KIAA18 ETLANETAARAANVARAAASNRAARAAAAAARTAFSQVVASHRVATPQVSGEDTQPTTYA : ...: : ... :. .:. :..: ::. :: ..:. .: :... : KIAA11 TTEVTNTQASSVT-AQPKKANKMKRVTAKAAQG--SQSPTGHEGGTIQLKSP-LQVLKLP 150 160 170 180 190 200 180 190 200 210 220 KIAA18 AEAQGPTPEPPLASPQ-TSQMLVTS---------KMAAPEAPATSAQ-SQTGSPAQEAAT . .:. . :.:. . .:: :.:: : :: .: :.... : ... .. :.: KIAA11 VISQN--IHAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATT 210 220 230 240 250 260 230 240 250 260 KIAA18 EGP---SSACAFSQAPCAREVDAN--RPSTAFLGQNDV-----FDFTQPAGV---SGMAF .: .: . : : :. : . : . ..:. .. :. : .... KIAA11 QGQITNETASIHTTAASIRTKKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVA 270 280 290 300 310 320 270 280 290 300 310 320 KIAA18 PRPKRPAPAQEAATEGPSAASGV---P---QTGPGREVAAT-RPKT-TKSGKALAKTRWV :::. . ...::..::...: . : : .. .::: : : ... :: .:.: . KIAA11 IRPKK-SKGKKAASRGPNSVSEISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARAT 330 340 350 360 370 380 330 340 350 360 KIAA18 EPQNVVAAAAAKAKMAT-----SIPEPEGAAAATA-------QHSAEPWARMGGKRTKKS : :. : .:.::.:. : : . :::. : : : :: .: :::..:: KIAA11 ESQTPNADQGAQAKIASAQTNVSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKS 390 400 410 420 430 440 370 380 390 400 410 420 KIAA18 KHLDDEYESSEEERETPAVPPTWRASQPSLTVRAQLAPRPPMAPRSQIPSRHVLCLPPRN :::. . .:. . :. : : . :: :::. KIAA11 KHLNGDERSGSNYRRIP-----W-------------GRRPA---------------PPRD 450 460 430 440 450 460 470 480 KIAA18 VTLLQERANKLVKYLMIKDYKKIPIKRADMLKDVIREYDEHFPEIIERATYTLEKKFGIH :..::::::::::::..:: ::::::.:::.:::.::::.::::::::.::::: : .. KIAA11 VAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRVN 470 480 490 500 510 520 490 500 510 520 530 540 KIAA18 LKEIDKEEHLYILVCTRDSSARLLGKTKDTPRLSLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEALR ::::::. ::::. :..::: .:: :::::.:.::.:::.:::::::.:::::.::.:: KIAA11 LKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVLR 530 540 550 560 570 580 550 560 570 580 590 600 KIAA18 KMGLRPGVRHPFLGDLRKLITDDFVKQKYLEYKKIPNSNPPEYEFLWGLRARHETSKMRV :.:::::::: ..:..::::::.::::::::::..::: ::::::.::::. ::::::.: KIAA11 KLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMKV 590 600 610 620 630 640 610 620 630 640 650 660 KIAA18 LRFIAQNQNRDPREWKAHFLEAVDDAFKTMDVDMAEEHARAQMRAQMNIGDEALIGRWSW :.: . :..::..: ... :::. .. : .:: .:::. ::::.::.::. : :.: KIAA11 LKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEARAQMGIGEEAVAGPWNW 650 660 670 680 690 700 670 680 690 700 710 720 KIAA18 DDIQVELLTWDEDGDFGDAWARIPFAFWARYHQYILNSNRAN--RRATWRAGVSSGT--- ::.... :: .: :: ..::.:. : . :: .. :. .: : :. ::: :.:. 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KIAA15 SVTLAASEGRNTSRPPTSSEEPSTSVPPTASEVPSTSLPPTPGEGTSTSVPPT-AYEGPS 170 180 190 200 210 160 170 180 190 200 210 KIAA18 TPQVSGEDTQPTTYA--AEAQGPTPEPPLASPQTSQMLVTSKMAAP-EAPATS----AQS : : : :.: . . ..:: :::. .. : :: .:.: :.:.:: : KIAA15 TSVVPTPDEGPSTSVLPTPGEGPGTSVPLAA---TEGLSTSVQATPDEGPSTSVPPTATE 220 230 240 250 260 270 220 230 240 250 260 KIAA18 QTGSPAQEAATEGPSSACAFS--QAPCAREVDA--NRPSTAFL-----GQNDVFDFTQPA ..:. . ::::.. . ..: . . : . : ... :.. : KIAA15 GLSTPVPPTRDEGPSTSVPATPGEGPSTSVLPAASDGQSISLVPTRGKGSSTSVPPTATE 280 290 300 310 320 330 270 280 290 300 310 320 KIAA18 GVSGMAFPRPKRPAPAQEAATEGPSAASGVPQTGPGREVAATRPKTTKSGKALAKTRWV- :.: . : . . .. : : . ...:: :. .:.... : : : . . KIAA15 GLSTSVQPTAGEGSSTSVPPTPGGGLSTSVPPTAT-EELSTSVPPTPGEGPSTSVLPIPG 340 350 360 370 380 390 330 340 350 360 370 380 KIAA18 EPQNVVAAAAAKAKMATSIPEPEGAAAATAQHSAEPWARMGGKRTKKSKHLDDEYESSEE : .. . .:. ::.: : .:.: . . : . .. . .. . . :: KIAA15 EGLSTSVPPTASDGSDTSVPPTPGEGASTLVQPTAPDGPGSSVLPNPGEGPSTLFSSSAS 400 410 420 430 440 450 390 400 410 420 KIAA18 ERETPA----VPPTWRASQPSLTVRAQLAPRPPMAP------RS-QIP----------SR ..:. : :. :... :. .. .:. .: :. . : :: KIAA15 VDRNPSKCSLVLPSPRVTKASVDSDSE-GPKGAEGPIEFEVLRDCESPNSISIMGLNTSR 460 470 480 490 500 510 430 440 450 460 470 480 KIAA18 HVLCLPPRNVTLLQERANKLVKYLMIKDYKKIPIKRADMLKDVIREYDEHFPEIIERATY .. : :.. ... . .:...:..:: .: ::....: . ...:: ..::::..::. KIAA15 VAITLKPQDP--MEQNVAELLQFLLVKDQSKYPIRESEMREYIVKEYRNQFPEILRRAAA 520 530 540 550 560 570 490 500 510 520 530 KIAA18 TLEKKFGIHLKEIDKEEHLYILVCTRDSSARLLG--KTKDTPRLSLLLVILGVIFMNGNR :: : ..:.:.: : : :::. .. . . . : .. . :...::..::: ::.:::. KIAA15 HLECIFRFELRELDPEAHTYILL-NKLGPVPFEGLEESPNGPKMGLLMMILGQIFLNGNQ 580 590 600 610 620 630 540 550 560 570 580 590 KIAA18 ASEAVLWEALRKMGLRPGVRHPFLGDLRKLITDDFVKQKYLEYKKIPNSNPPEYEFLWGL :.:: .:: : .::.. : ..:. ..:.. .:: :.::.:. . . .: ::::.:: KIAA15 AKEAEIWEMLWRMGVQRERRLSIFGNPKRLLSVEFVWQRYLDYRPVTDCKPVEYEFFWGP 640 650 660 670 680 690 600 610 620 630 640 650 KIAA18 RARHETSKMRVLRFIAQNQNRDPREWKAHFLEAVDDAFKTMDVDMAEEHARAQMRAQMNI :.. ::.::..:.:.:. :.:: .: .. ::... KIAA15 RSHLETTKMKILKFMAKIYNKDPMDWPEKYNEALEEDAARAFAEGWQALPHFRRPFFEEA 700 710 720 730 740 750 660 670 680 690 700 710 KIAA18 GDEALIGRWSWDDIQVELLTWDEDGDFGDAWARIPFAFWARYHQYILNSNRANRRATWRA KIAA15 AAEVPSPDSEVSSYSSKYAPHSWPESRLESKARKLVQLFLLMDSTKLPIPKKGILYYIGR 760 770 780 790 800 810 761 residues in 1 query sequences 1986744 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:19:46 2008 done: Thu Dec 18 15:19:47 2008 Total Scan time: 0.580 Total Display time: 0.070 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]