# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh17057.fasta.nr -Q ../query/KIAA1824.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1824, 958 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7816568 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0312+/-0.000196; mu= 10.3521+/- 0.011 mean_var=104.9567+/-20.119, 0's: 29 Z-trim: 76 B-trim: 539 in 1/66 Lambda= 0.125190 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|114653632|ref|XP_510028.2| PREDICTED: Breakpoin (1219) 6474 1180.7 0 gi|109084142|ref|XP_001104318.1| PREDICTED: Breakp (1224) 6405 1168.2 0 gi|47606200|sp|Q96JK2.2|WDR22_HUMAN RecName: Full= ( 942) 6387 1164.8 0 gi|119601387|gb|EAW80981.1| WD repeat domain 22, i ( 941) 6370 1161.8 0 gi|62650923|ref|XP_234345.3| PREDICTED: similar to (1118) 5954 1086.7 0 gi|148670715|gb|EDL02662.1| WD repeat domain 22, i (1008) 5911 1078.9 0 gi|149051570|gb|EDM03743.1| WD repeat domain 22 [R ( 946) 5854 1068.6 0 gi|47606143|sp|Q80T85.2|WDR22_MOUSE RecName: Full= ( 946) 5813 1061.2 0 gi|119601385|gb|EAW80979.1| WD repeat domain 22, i ( 860) 5806 1059.9 0 gi|21732294|emb|CAD38589.1| hypothetical protein [ ( 860) 5798 1058.4 0 gi|55726813|emb|CAH90166.1| hypothetical protein [ ( 860) 5759 1051.4 0 gi|194225132|ref|XP_001494913.2| PREDICTED: simila ( 890) 5603 1023.2 0 gi|27769249|gb|AAH42567.1| Wdr22 protein [Mus musc ( 905) 5530 1010.1 0 gi|194670821|ref|XP_001253728.2| PREDICTED: simila ( 932) 5466 998.5 0 gi|73963363|ref|XP_547871.2| PREDICTED: similar to ( 865) 5455 996.5 0 gi|73963361|ref|XP_866993.1| PREDICTED: similar to ( 754) 4703 860.6 0 gi|119601386|gb|EAW80980.1| WD repeat domain 22, i ( 644) 4208 771.2 0 gi|51259512|gb|AAH79428.1| Wdr22 protein [Rattus n ( 658) 3872 710.5 6.5e-202 gi|67969565|dbj|BAE01131.1| unnamed protein produc ( 562) 3791 695.8 1.5e-197 gi|30268186|emb|CAD38537.2| hypothetical protein [ ( 519) 3467 637.3 5.7e-180 gi|3002953|gb|AAC08965.1| breakpoint cluster regio ( 510) 3427 630.0 8.4e-178 gi|120537380|gb|AAI29051.1| LOC100036835 protein [ ( 936) 3022 557.1 1.4e-155 gi|115313400|gb|AAI24495.1| Zgc:153934 [Danio reri ( 789) 2822 520.9 9.2e-145 gi|21410112|gb|AAH30857.1| Wdr22 protein [Mus musc ( 418) 2172 403.3 1.2e-109 gi|26330091|dbj|BAC28784.1| unnamed protein produc ( 379) 2077 386.1 1.7e-104 gi|18605803|gb|AAH22967.1| WDR22 protein [Homo sap ( 326) 2022 376.1 1.5e-101 gi|194038467|ref|XP_001924289.1| PREDICTED: simila ( 300) 2020 375.7 1.8e-101 gi|210129596|gb|EEA77270.1| hypothetical protein B ( 433) 1837 342.8 2.1e-91 gi|47208194|emb|CAF95916.1| unnamed protein produc ( 674) 1825 340.8 1.3e-90 gi|110756875|ref|XP_395601.3| PREDICTED: similar t ( 743) 1712 320.4 2e-84 gi|156552597|ref|XP_001601625.1| PREDICTED: simila (1865) 1672 313.5 5.9e-82 gi|210129609|gb|EEA77283.1| hypothetical protein B ( 417) 1624 304.3 7.7e-80 gi|189241176|ref|XP_966575.2| PREDICTED: similar t ( 748) 1567 294.2 1.5e-76 gi|108869253|gb|EAT33478.1| wd-repeat protein [Aed (1016) 1537 288.9 8.1e-75 gi|167864550|gb|EDS27933.1| wd-repeat protein [Cul ( 983) 1536 288.7 9e-75 gi|21740364|emb|CAD39189.1| hypothetical protein [ ( 219) 1516 284.6 3.5e-74 gi|198427423|ref|XP_002124806.1| PREDICTED: simila ( 434) 1356 255.9 3e-65 gi|215494307|gb|EEC03948.1| WD-repeat protein, put ( 592) 1345 254.0 1.5e-64 gi|193892631|gb|EDV91497.1| GH17476 [Drosophila gr ( 579) 1265 239.6 3.3e-60 gi|194152530|gb|EDW67964.1| GJ22805 [Drosophila vi ( 581) 1240 235.1 7.5e-59 gi|194166699|gb|EDW81600.1| GK10939 [Drosophila wi ( 587) 1236 234.4 1.2e-58 gi|194185658|gb|EDW99269.1| GE23294 [Drosophila ya ( 597) 1226 232.6 4.4e-58 gi|190655677|gb|EDV52909.1| GG11847 [Drosophila er ( 601) 1221 231.7 8.3e-58 gi|190625953|gb|EDV41477.1| GF17505 [Drosophila an ( 590) 1214 230.4 2e-57 gi|220903267|gb|AAF57203.3| CG42233 [Drosophila me ( 773) 1213 230.3 2.7e-57 gi|212515033|gb|EEB17240.1| WD-repeat protein, put (1352) 1212 230.3 4.7e-57 gi|198132091|gb|EAL28098.2| GA15250 [Drosophila ps ( 573) 1205 228.7 5.9e-57 gi|194201591|gb|EDX15167.1| GD16239 [Drosophila si ( 582) 1205 228.8 6e-57 gi|194102189|gb|EDW24232.1| GL23501 [Drosophila pe ( 574) 1198 227.5 1.4e-56 gi|220678733|emb|CAX14737.1| novel protein similar ( 499) 1088 207.6 1.2e-50 >>gi|114653632|ref|XP_510028.2| PREDICTED: Breakpoint cl (1219 aa) initn: 6474 init1: 6474 opt: 6474 Z-score: 6317.3 bits: 1180.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 6474; 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