# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj22769.fasta.nr -Q ../query/KIAA1804.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1804, 490 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7822332 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6554+/-0.000194; mu= 10.0015+/- 0.011 mean_var=97.9038+/-18.543, 0's: 45 Z-trim: 54 B-trim: 0 in 0/65 Lambda= 0.129621 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|56204190|emb|CAI23047.1| mitogen-activated prot ( 482) 3257 619.3 6.7e-175 gi|71153820|sp|Q5TCX8.1|M3KL4_HUMAN RecName: Full= (1036) 3225 613.7 7.4e-173 gi|17736731|emb|CAC84640.1| mixed lineage kinase 4 (1036) 3170 603.4 9.2e-170 gi|109019961|ref|XP_001103092.1| PREDICTED: mixed (1040) 2933 559.1 2e-156 gi|194206119|ref|XP_001492336.2| PREDICTED: simila ( 808) 2234 428.2 3.8e-117 gi|119918343|ref|XP_873070.2| PREDICTED: similar t (1048) 2052 394.3 8e-107 gi|194042582|ref|XP_001928249.1| PREDICTED: simila (1054) 1669 322.7 2.9e-85 gi|28461322|gb|AAH46448.1| BC021891 protein [Mus m ( 600) 887 176.2 2e-41 gi|18257338|gb|AAH21891.1| BC021891 protein [Mus m (1001) 887 176.4 3e-41 gi|158563928|sp|Q8VDG6.2|M3KL4_MOUSE RecName: Full (1002) 887 176.4 3e-41 gi|125833227|ref|XP_690016.2| PREDICTED: similar t ( 976) 876 174.4 1.2e-40 gi|109508285|ref|XP_226572.4| PREDICTED: similar t ( 996) 867 172.7 4e-40 gi|21410177|gb|AAH30944.1| Map3k9 protein [Mus mus ( 732) 590 120.8 1.2e-24 gi|123787448|sp|Q3U1V8.1|M3K9_MOUSE RecName: Full= (1077) 590 120.9 1.6e-24 gi|148670775|gb|EDL02722.1| mitogen-activated prot ( 989) 417 88.5 8.5e-15 gi|149025065|gb|EDL81432.1| similar to mixed-linea ( 726) 410 87.1 1.7e-14 gi|149263376|ref|XP_001472780.1| PREDICTED: simila (1164) 404 86.2 5.1e-14 gi|126282421|ref|XP_001368552.1| PREDICTED: simila (1121) 402 85.8 6.5e-14 gi|109478448|ref|XP_576071.2| PREDICTED: similar t (1115) 396 84.7 1.4e-13 gi|125833621|ref|XP_689128.2| PREDICTED: similar t (1009) 292 65.2 9.3e-08 gi|148679860|gb|EDL11807.1| cDNA sequence BC021891 ( 595) 268 60.5 1.4e-06 gi|149043233|gb|EDL96765.1| similar to Mixed linea ( 653) 259 58.8 4.9e-06 gi|126632512|emb|CAM56453.1| novel protein similar ( 972) 259 59.0 6.5e-06 gi|189531821|ref|XP_689424.3| PREDICTED: similar t (1050) 259 59.0 6.9e-06 gi|47225019|emb|CAF97434.1| unnamed protein produc ( 835) 253 57.8 1.3e-05 gi|82240490|sp|Q7T2V3.1|M3K10_XENLA RecName: Full= (1005) 250 57.3 2.2e-05 gi|47218131|emb|CAG10051.1| unnamed protein produc ( 810) 240 55.4 6.7e-05 gi|220967737|gb|EED86119.1| predicted protein [Tha ( 494) 210 49.6 0.0023 gi|971420|emb|CAA62351.1| mixed lineage kinase 2 [ ( 954) 208 49.4 0.0048 >>gi|56204190|emb|CAI23047.1| mitogen-activated protein (482 aa) initn: 3257 init1: 3257 opt: 3257 Z-score: 3296.3 bits: 619.3 E(): 6.7e-175 Smith-Waterman score: 3257; 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98.326% identity (99.372% similar) in 478 aa overlap (13-490:559-1036) 10 20 30 40 KIAA18 LLWLIWLIMFFLVTSDESNKTWGRNTVFRQEEFEDVKRNFKK .::::::::::::::::::::::::::::: gi|177 PNLDKRRSLNSSSSSPPSSPTMMPRLRAIQLTSDESNKTWGRNTVFRQEEFEDVKRNFKK 530 540 550 560 570 580 50 60 70 80 90 100 KIAA18 KGCTWGPNSIQMKDRTDCKERIRPLSDGNSPWSTILIKNQKTMPLASLFVDQPGSCEEPK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|177 KGCTWGPNSIQMKDRTDCKERIRPLSDGNSPWSTILIKNQKTMPLASLFVDQPGSCEEPK 590 600 610 620 630 640 110 120 130 140 150 160 KIAA18 LSPDGLEHRKPKQIKLPSQAYIDLPLGKDAQRENPAEAESWEEAASANAATVSIEMTPTN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::.:::.::: gi|177 LSPDGLEHRKPKQIKLPSQAYIDLPLGKDAQRENPAEAGSWEEAASANAATVTIEMAPTN 650 660 670 680 690 700 170 180 190 200 210 220 KIAA18 SLSRSPQRKKTESALYGCTVLLASVALGLDLRELHKAQAAEEPLPKEEKKKREGIFQRAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|177 SLSRSPQRKKTESALYGCTVLLASVALGLDLRELHKAQAAEEPLPKEEKKKREGIFQRAS 710 720 730 740 750 760 230 240 250 260 270 280 KIAA18 KSRRSASPPTSLPSTCGEASSPPSLPLSSALGILSTPSFSTKCLLQMDSEDPLVDSAPVT :::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|177 KSRRSASPPTSLSSTCGEASSPPSLPLSSALGILSTPSFSTKCLLQMDSEDPLVDSAPVT 770 780 790 800 810 820 290 300 310 320 330 340 KIAA18 CDSEMLTPDFCPTAPGSGREPALMPRLDTDCSVSRNLPSSFLQQTCGNVPYCASSKHRPS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::: gi|177 CDSEMLTPDFCPTAPGSGREPALMPRLDTDCSVSRNLPSSFLQRTCGNVPYCASSKHRPS 830 840 850 860 870 880 350 360 370 380 390 400 KIAA18 HHRRTMSDGNPTPTGATIISATGASALPLCPSPAPHSHLPREVSPKKHSTVHIVPQRRPA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|177 HHRRTMSDGNPTPTGATIISATGASALPLCPSPAPHSHLPREVSPKKHSTVHIVPQRRPA 890 900 910 920 930 940 410 420 430 440 450 460 KIAA18 SLRSRSDLPQAYPQTAVSQLAQTACVVGRPGPHPTQFLAAKERTKSHVPSLLDADVEGQS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: gi|177 SLRSRSDLPQAYPQTAVSQLAQTACVVGRPGPHPTQFLAAKERTKSHVPSLLDVDVEGQS 950 960 970 980 990 1000 470 480 490 KIAA18 RDYTVPLCRMRSKTSRPSIYELEKEFLS ::::::: :::::::::::::::::::: gi|177 RDYTVPLGRMRSKTSRPSIYELEKEFLS 1010 1020 1030 >>gi|109019961|ref|XP_001103092.1| PREDICTED: mixed line (1040 aa) initn: 2933 init1: 2933 opt: 2933 Z-score: 2964.4 bits: 559.1 E(): 2e-156 Smith-Waterman score: 2933; 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