# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj07087.fasta.nr -Q ../query/KIAA1793.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1793, 1270 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7805858 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6501+/-0.000213; mu= 8.6416+/- 0.012 mean_var=175.2770+/-34.165, 0's: 39 Z-trim: 138 B-trim: 685 in 2/65 Lambda= 0.096875 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|158564073|sp|Q96JN2.2|CC136_HUMAN RecName: Full (1154) 7420 1050.6 0 gi|115511012|ref|NP_073579.3| coiled-coil domain c (1154) 7416 1050.0 0 gi|109068139|ref|XP_001090156.1| PREDICTED: simila (1155) 7213 1021.7 0 gi|119604094|gb|EAW83688.1| hypothetical protein D (1157) 7189 1018.3 0 gi|194209874|ref|XP_001502803.2| PREDICTED: coiled (1248) 6486 920.1 0 gi|6453420|emb|CAB61359.1| hypothetical protein [H (1033) 6417 910.3 0 gi|114615856|ref|XP_519361.2| PREDICTED: hypotheti (1039) 6268 889.5 0 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