# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj07087.fasta.huge -Q ../query/KIAA1793.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1793, 1270 aa vs ./tmplib.25089 library 1986235 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.4153+/-0.0114; mu= -23.5441+/- 0.766 mean_var=544.1604+/-134.094, 0's: 0 Z-trim: 27 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.054981 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1601 ( 690 res) fj10228 ( 690) 430 49.6 2.1e-06 KIAA1565 ( 1313 res) bf00184 (1313) 327 41.7 0.00097 KIAA1749 ( 1047 res) pj02119y1 (1047) 309 40.2 0.0022 KIAA1512 ( 2010 res) fg04660y1 (2010) 313 40.7 0.0029 >>KIAA1601 ( 690 res) fj10228 (690 aa) initn: 353 init1: 307 opt: 430 Z-score: 206.8 bits: 49.6 E(): 2.1e-06 Smith-Waterman score: 430; 30.986% identity (63.380% similar) in 355 aa overlap (129-470:313-655) 100 110 120 130 140 150 KIAA17 EGCERKKGQRWGSLERRGMQAMEGEVLLPALYEEEEEEEEEEEEVEEEEEQVQKGGSVGS : .:. .. ... .:..... . : KIAA16 VEGHLTKAVEETKLSKENQTRAKESDFSDTLSPSKEKSSDDTTDAQMDEQDLNEPLAKVS 290 300 310 320 330 340 160 170 180 190 200 210 KIAA17 LSVNKHRGLSLTETELEELRAQVLQLVAELEETRELAGQHEDDSLELQGLLEDERLASAQ : . .: ...:.: . .. .: :: :..::: .. .:::.:::.:: : . 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KIAA15 LESNLLPKHQKHLNPSGTMNPTEQEKLSLKREC-DQFQKEQSPANRKVSQMNSLEQELET 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA17 LQLQYQASMDEQGRLLVVQEQLEGQLQCCQEELRQLREKRPSVVKEARGKNANKNMNKNA ..:. .. .: .: .::: KIAA15 IHLENEGLKKKQVKL---DEQLMENSVVGSSREGCSSLPEIVCEDAAPEVHCDA 1270 1280 1290 1300 1310 >>KIAA1749 ( 1047 res) pj02119y1 (1047 aa) initn: 154 init1: 65 opt: 309 Z-score: 152.6 bits: 40.2 E(): 0.0022 Smith-Waterman score: 416; 24.217% identity (56.268% similar) in 702 aa overlap (164-827:372-1030) 140 150 160 170 180 190 KIAA17 EEEEEEEEEVEEEEEQVQKGGSVGSLSVNKHRGLSLTETELEELRAQVLQLVAELEETRE .: :.: . .... . .. :.::: : KIAA17 QGNNQACNSTSEVKDLLEQKSKLTIEVAELQRQLQLEVKNQQNIKEERERMRANLEELRS 350 360 370 380 390 400 200 210 220 230 240 KIAA17 LAGQH-EDDSLELQGLLEDERLASAQQAEVFTKQIQ--QLQGELRSLREEISLLEHE--- ... :..: : : :.: . :.: ... : : :.:.:....: .. : KIAA17 QHNEKVEENSTLQQRLEESEGELRKNLEELFQVKMEREQHQTEIRDLQDQLSEMHDELDS 410 420 430 440 450 460 250 260 270 280 290 KIAA17 -KESELKE---IEQELHLAQAEIQSL---RQAAEDSATEHESDIASLQEDLCR-MQNELE :.:: .: . .:: :. ..:.: .. :: ..: ....:. : . .... . KIAA17 AKRSEDREKGALIEELLQAKQDLQDLLIAKEEQEDLLRKRERELTALKGALKEEVSSHDQ 470 480 490 500 510 520 300 310 320 330 340 350 KIAA17 DMERIRGDYEMEIASLRAEMEMKSSEPSGSLGLSDYSGLQEELQELRERYHFLNEEYRAL .:.... .:. :. .:: .: ... . :. : .. :.: . : KIAA17 EMDKLKEQYDAELQALRESVEEATKNVEVLASRSNTSEQDQAGTEMR---------VKLL 530 540 550 560 570 360 370 380 390 400 410 KIAA17 QESNSSLTGQLADLESERTQRATERWLQSQTLSMTSAESQTSEMDFLEPDPEMQLLRQQL :: : .: :. .:: . .: :: : .. . :....: . . . :.. :.. : KIAA17 QEENEKLQGRSEELERRVAQ------LQRQIEDLKGDEAKAKET-LKKYEGEIRQLEEAL 580 590 600 610 620 420 430 440 450 460 470 KIAA17 RDAEEQMHGMKNKCQELCCELEELQHHRQVSEEEQRRLQRELK--CAQNEVLRFQTSHSV :... . . . : ::: : . . . .::..:...:: :.: :: .. KIAA17 VHARKEEKEAVSARRALENELEAAQGNLSQTTQEQKQLSEKLKEESEQKEQLRRLKNEME 630 640 650 660 670 680 480 490 500 510 520 530 KIAA17 TQNEELKSRLCTLQKKY-DTSQDEQNELLKMQLQL----QTELRQLKVMKSTLVENQSEK .. .: . . :::.. : . .. :..: :: . . :.: :. : :. : KIAA17 NERWHLGKTIEKLQKEMADIVEASRTSTLELQNQLDEYKEKNRRELAEMQRQLKEKTLEA 690 700 710 720 730 740 540 550 560 570 580 KIAA17 ELLCRLQKLHLQHQNVTCEKE---------KLLERQQQLQEELQCHEAELQ---HLRDTV : :: ...: . :.: . : ..: :.. :. : ::. ::.: KIAA17 EK-SRLTAMKMQDEMRLMEEELRDYQRAQDEALTKRQLLEQTLKDLEYELEAKSHLKDDR 750 760 770 780 790 800 590 600 610 620 630 KIAA17 ASF-KESNEKDTETHAQLQEMKQLYQASKDELERQKHMYDQLEQDLLLCQLELKELKASH . . :. ..: .. . .:.: .. . .... :......:....:: .: : . KIAA17 SRLVKQMEDKVSQLEMELEEERNNSDLLSERISRSREQMEQVRNELL------QERAARQ 810 820 830 840 850 640 650 660 670 680 690 KIAA17 PIPEDKGKCANKCDTLLSRLTELQEKYKASQKEMGQLQMEQCELLEDQRRMQEEQGQLQ- . :: . . : ::. .:. .:..: :: .::: :. : . .:. KIAA17 DLECDKISLERQNKDLKSRIIHLEGSYRSS-KEGLVVQMEA--------RIAELEDRLES 860 870 880 890 900 700 710 720 730 740 750 KIAA17 EELHRLTLPLPKSGLLLKSQELLTKLEDLCELQLLYQGMQEEQKKLIQNQDCVLKEQLE- :: : .: : . : : .::. ...: .:.: .:: .. . ..:.:.: KIAA17 EERDRANLQLSNRRLERKVKELVMQVDDE-HLSLT------DQKDQLSLRLKAMKRQVEE 910 920 930 940 950 960 760 770 780 790 800 810 KIAA17 IHEELRRFKESH--FQEVLENPDDSKLAKSSKCNRNKQSKLLMEQMQALQVMYDAGQAKQ .::. :.. :. .:. ::. : . ... : :.. : .... . .:. : . . 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KIAA15 TQEKNDLALQLQAEQDNLADAEERCHLLIKSKVQ-LEGKVKELSERLEDEEEVNADLAAR 960 970 980 990 1000 1010 200 210 220 230 240 250 KIAA17 H---EDDSLELQGLLEDERLASAQQAEVFTKQIQQLQGELRSLREEISLLEHEKESELKE . ::. ::. ..: .:. :. :: :. : ......: ::.. :. :. ..: . KIAA15 RRKLEDECTELKKDIDDLELTLAK-AE---KEKQATENKVKNLTEEMAALD-ESVARLTK 1020 1030 1040 1050 1060 1070 260 270 280 290 300 310 KIAA17 IEQELHLAQAEIQSLRQAAEDSATEHESDIASLQEDLCRMQNELEDMERIRGDYEMEIAS .. :. :. . . :: :: .. . :.... .. ::. ...: : : :. KIAA15 EKKALQEAHQQALGDLQAEEDRVSALTKAKLRLEQQVEDLECSLEQEKKLRMDTER--AK 1080 1090 1100 1110 1120 320 330 340 350 360 370 KIAA17 LRAEMEMKSSEPSGSLGLSDYSGLQEELQELRERYHFLNEEYRALQESNSSLTGQLADLE . : ..: .. : . . .: . :.:.:.. . :. . . : .... .. .:. KIAA15 RKLEGDLKLTQESVADAAQDKQQLEEKLKKKDSELSQLSLRVEDEQLLGAQMQKKIKELQ 1130 1140 1150 1160 1170 1180 380 390 400 410 420 430 KIAA17 SERTQRATERWLQSQTLSMTSAESQTSEMDFLEPDPEMQLLRQQLRDAEEQMHGMKNKCQ . :... :. :... . . .:.: .: :.. : ..:..: :... :. KIAA15 A-RAEELEEE-LEAERAARARVEKQRAEAA-----RELEELSERLEEAGGASAGQREGCR 1190 1200 1210 1220 1230 1240 440 450 460 470 480 490 KIAA17 ELCCELEELQHHRQVSEEEQRRLQRELKCAQNEVLRFQTSHSVTQNEELKSRLCTLQKKY . : : ::.:::. : .:: ... .. . .. .. : .. KIAA15 K--------------REAELGRLRRELEEA---ALRHEATVAALRRKQAEGA-AELGEQV 1250 1260 1270 1280 500 510 520 530 540 550 KIAA17 DTSQDEQNELLKMQLQLQTELRQLKVMKSTLVENQSEKELLCRLQKLHLQHQNVTCEK-E :. : ...: : . .:. :. .: . ::.. .. : ::: . .:.. .. :. . KIAA15 DSLQRVRQKLEKEKSELRMEVDDLAANVETLTRAKASAEKLCRTYEDQLSEAKIKVEELQ 1290 1300 1310 1320 1330 1340 560 570 580 590 600 610 KIAA17 KLLERQQQLQEELQCHEAELQHLRDTVASFKESNEKDTETHAQ-LQEMK-QLYQASKDE- . : . . .:: . .::..: . . . . :: :.:.. :: . :: . KIAA15 RQLADASTQRGRLQTESGELSRLLEEKECLISQLSRGKALAAQSLEELRRQLEEESKAKS 1350 1360 1370 1380 1390 1400 620 630 640 650 660 KIAA17 -----LERQKHMYDQL-EQ--DLLLCQLELKEL--KASHPIPEDKGKCANKCDTLLSRLT .. .: : : :: . : ::..: ::. . . ..: . :.. .: KIAA15 ALAHAVQALRHDCDLLREQHEEEAEAQAELQRLLSKANAEVAQWRSK--YEADAI-QRTE 1410 1420 1430 1440 1450 1460 670 680 690 700 710 KIAA17 ELQEKYKA-----SQKEMG-QLQMEQCELLEDQR-RMQEEQGQLQEELHRLTLPLPKSGL ::.: : .. : : . .: :: . :.: :. .. ::.: : .. KIAA15 ELEEAKKKLALRLQEAEEGVEAANAKCSSLEKAKLRLQTESEDVTLELERAT---SAAAA 1470 1480 1490 1500 1510 720 730 740 750 760 770 KIAA17 LLKSQELLTKLEDLCELQLLYQGMQEEQKKLIQNQDCVLKEQLEIHEELRRFKESHFQEV : :.:. : . :. . .: :..: : .:. . :: :....: .:. KIAA15 LDKKQRHLER-----ALEERRRQEEEMQRELEAAQ----RESRGLGTELFRLRHGH-EEA 1520 1530 1540 1550 1560 780 790 800 810 820 830 KIAA17 LENPDDSKLAKSSKCNRNKQSKLLMEQMQAL--QVMYDAGQAKQELLQQEQGRLLEERKR :: . : ...: :.:... : :: .:.. ::: .. . : :... 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