# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj00752s2.fasta.nr -Q ../query/KIAA1773.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1773, 3434 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7820360 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5663+/-0.000198; mu= 12.1086+/- 0.011 mean_var=121.1070+/-23.188, 0's: 38 Z-trim: 79 B-trim: 3 in 1/64 Lambda= 0.116544 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 47, opt: 35, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|20139065|sp|Q96JQ0.1|PCD16_HUMAN RecName: Full= (3298) 21809 3680.2 0 gi|109107523|ref|XP_001100797.1| PREDICTED: simila (3386) 21631 3650.3 0 gi|194213731|ref|XP_001918122.1| PREDICTED: dachso (3293) 20735 3499.6 0 gi|94381170|ref|XP_987639.1| PREDICTED: similar to (3291) 20412 3445.3 0 gi|148684875|gb|EDL16822.1| mCG19711 [Mus musculus (3278) 20345 3434.0 0 gi|149068442|gb|EDM17994.1| dachsous 1 (Drosophila (3278) 20229 3414.5 0 gi|73988750|ref|XP_853733.1| PREDICTED: similar to (3354) 12650 2140.2 0 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