# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj00752s2.fasta.huge -Q ../query/KIAA1773.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1773, 3434 aa vs ./tmplib.25089 library 1984071 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7547+/-0.00798; mu= 9.1532+/- 0.542 mean_var=266.7551+/-63.453, 0's: 0 Z-trim: 14 B-trim: 5 in 1/39 Lambda= 0.078527 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 47, opt: 35, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0327 ( 898 res) hg00605 ( 898) 1078 137.5 2.5e-32 KIAA0588 ( 938 res) hj02685 ( 938) 1041 133.3 4.8e-31 KIAA1621 ( 787 res) hj04505 ( 787) 954 123.4 4e-28 KIAA0279 ( 2854 res) ff05612 (2854) 732 99.0 3.2e-20 KIAA1775 ( 858 res) hk03826 ( 858) 705 95.2 1.3e-19 KIAA1774 ( 1041 res) hk10268 (1041) 701 94.9 2e-19 KIAA0345 ( 845 res) hg01491 ( 845) 650 89.0 9.7e-18 KIAA0811 ( 1123 res) hj04806 (1123) 635 87.4 3.7e-17 KIAA1400 ( 1093 res) hk08136 (1093) 548 77.6 3.4e-14 KIAA1812 ( 803 res) hh13045 ( 803) 512 73.3 4.8e-13 KIAA1562 ( 1136 res) fh20205 (1136) 477 69.5 9.2e-12 >>KIAA0327 ( 898 res) hg00605 (898 aa) initn: 657 init1: 344 opt: 1078 Z-score: 672.1 bits: 137.5 E(): 2.5e-32 Smith-Waterman score: 1078; 33.694% identity (58.863% similar) in 739 aa overlap (104-813:37-744) 80 90 100 110 120 130 KIAA17 LPGGLTAAGRRPSTGRGSPRRAEVREPELEPGPQWDLTQSLRSSWAQSLAWSWSPRHSWT : : : .. .. .: . . . : : KIAA03 WKTNATENTQISHLTKTRRCHKLTAGLQRNPTPVWRHSRFPEDCHLHSCGKKLNKTHLCT 10 20 30 40 50 60 140 150 160 170 180 190 KIAA17 TLVMQKELGIVPSCPGMKSPRPHLLLPLLLLLLLLLGAGVPGAW--GQAGSLDLQIDEEQ . ... :. : : .:. . :.:: :::. : :. :.. .. :: KIAA03 VKILR---GFC-SKTTMAAPQSRPRRGELILLCALLGT----LWEIGR-GQIRYSVPEET 70 80 90 100 110 200 210 220 230 240 KIAA17 PAGTLIGDISAGL---PAGTAAPLMYFISAQEGSGVGTDLAIDEHSGVVRTARVLDRE-- :...:.:: : : : . ..: : .:.. .:: . :: .::: KIAA03 DKGSFVGNISKDLGLDPRKLAKHGVRIVS----RGRTQLFALNPRSGSLITAGRIDREEL 120 130 140 150 160 170 250 260 270 280 290 300 KIAA17 --QRDRYRF---TAVTPDGATVEVTVRVADINDHAPAFPQARAALQVPEHTAFGTRYPLE : : . : : : : ... ::::. : : ... : .. :.:::: KIAA03 CAQSPRCLININTLVEDKGKLFGVEIEIIDINDNNPKFQVEDLEVKINEIAVPGARYPLP 180 190 200 210 220 230 310 320 330 340 350 360 KIAA17 PARDADAGRLGTQGYALSGDGAGETFRLETRPGPDGTPVPELVVTGELDRENRSHYMLQL : : :.: . :.: :: . . : :... : .:. ::::. ::::... . : : KIAA03 EAVDPDVGVNSLQSYQLSPN---HHFSLDVQTGDNGAINPELVLERALDREEEAAHHLVL 240 250 260 270 280 290 370 380 390 400 410 420 KIAA17 EAYDGGSPPRRAQALLDVTLLDINDHAPAFNQSRYHAVVSESLAPGSPVLQVFASDADAG : :::.::: . . . ::.:: ::.::.: . :.. : :.. ::. .: : ::: : : KIAA03 TASDGGKPPRSSTVRIHVTVLDTNDNAPVFPHPIYRVKVLENMPPGTRLLTVTASDPDEG 300 310 320 330 340 350 430 440 450 460 470 480 KIAA17 VNGAVTYEINRRQSEGDGP-FSIDAHTGLLQLERPLDFEQRRVHELVVQARDGGAHPELG .:: :.:.. :. .: . : :... .:: ... . ::.:. .:. .::.: :: :: KIAA03 INGKVAYKF-RKINEKQTPLFQLNENTGEISIAKSLDYEECSFYEMEIQAEDVGA--LLG 360 370 380 390 400 490 500 510 520 530 540 KIAA17 SAFVTVHVRDANDNQPSMTVIFLSADGSPQVSEAAPPGQLVARISVSDPDDGDFAHVNVS . . . :.:.:::.: . . : :: : : . :: ..: .:: : :.: ..: : KIAA03 RTKLLISVEDVNDNRPEVIITSLF---SP-VLENSLPGTVIAFLSVHDQDSGKNGQV-VC 410 420 430 440 450 460 550 560 570 580 590 600 KIAA17 LEGGEGHFALSTQDSVIYLVCVARRLDREERDAYNLRVTATDSGSPPLRAEAAFVLHVTD . : : . . : . . . ::::. . ::. : :.: :.::: .:. ..:::.: KIAA03 YTRDNLPFKLEKSIGNYYRLVTRKYLDRENVSIYNITVMASDLGTPPLSTETQIALHVAD 470 480 490 500 510 520 610 620 630 640 650 KIAA17 VNDNAPAFDRQLYRPEPLPEVALPGSFVVRVTARDPDQGTNGQVTYSLAP----GAH-TH .::: :.: . : : : : :. . .::.:::. :.:::::.. :: . 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KIAA03 YPALPTDGSTGVELAPRSAERGYLVTKVVAVDRDSGQNAWLSYRL---LKASEPGLFSVG 650 660 670 680 690 770 780 790 800 810 820 KIAA17 AHSGDVCTTRTL-DRDQGPSSFDFTVTAVDGGG---LKSMVYVKVFLSDENDNPPQFYPR :.:.: :.:.: ::: .:. :.::. : :.. : . : ..: KIAA03 LHTGEVRTARALLDRDALKQSL---VVAVQDHGQPPLSATVTLTVAVADSIPEVLTELGS 700 710 720 730 740 750 830 840 850 860 870 880 KIAA17 EYAASISAQSPPGTAVLRLRAHDPDQGSHGRLSYHILAGNSPPLFTLDEQSGLLTVAWPL KIAA03 LKPSVDPNDSSLTLYLVVAVAAISCVFLAFVAVLLGLRLRRWHKSRLLQDSGGRLVGVPA 760 770 780 790 800 810 >>KIAA0588 ( 938 res) hj02685 (938 aa) initn: 810 init1: 342 opt: 1041 Z-score: 649.3 bits: 133.3 E(): 4.8e-31 Smith-Waterman score: 1041; 34.412% identity (58.676% similar) in 680 aa overlap (166-820:19-676) 140 150 160 170 180 190 KIAA17 VMQKELGIVPSCPGMKSPRPHLLLPLLLLLLLLLGAGVPGAWGQAGSLDLQ--IDEEQPA :.::: . : ..: ... . :: KIAA05 FWRKIRMIPARLHRDYKGLVLLGILLGTLW-ETGCTQIRYSVPEELEK 10 20 30 40 200 210 220 230 240 KIAA17 GTLIGDISAGL---PAGTAAPLMYFISAQEGSGVGTDLAIDEHSGVVRTARVLDREQ--- :. .:::: : : : . .: : .:.. .:: . :: .:::. 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KIAA05 VLITVLDVNDNAPE--VVLTSLASS--VPENSPRGTLIALLNVNDQDSEENGQV-ICFIQ 340 350 360 370 380 390 550 560 570 580 590 600 KIAA17 GEGHFALSTQDSVIYLVCVARRLDREERDAYNLRVTATDSGSPPLRAEAAFVLHVTDVND :. : : . . : . . ::::. .::. ::::: :.::: .:. . :.:.:.:: KIAA05 GNLPFKLEKSYGNYYSLVTDIVLDREQVPSYNITVTATDRGTPPLSTETHISLNVADTND 400 410 420 430 440 450 610 620 630 640 650 KIAA17 NAPAFDRQLYRPEPLPEVALPGSFVVRVTARDPDQGTNGQVTYSLAP----GAH-THWFS : :.: . : .:: : .: :::.::: :.:.::::: :: . . : KIAA05 NPPVFPQASYSAY-IPENNPRGVSLVSVTAHDPDCEENAQITYSLAENTIQGASLSSYVS 460 470 480 490 500 510 660 670 680 690 700 710 KIAA17 IDPTSGIITTAASLDYELEPQPQLIVVATDGGLPPLASSATVSVALQDVNDNEPQ--FQR :. .:.. . .:.::: . :. :.: :.: :::.:....:. . : ::: :. . KIAA05 INSDTGVLYALSSFDYEQFRDLQVKVMARDNGHPPLSSNVSLSLFVLDQNDNAPEILYPA 520 530 540 550 560 570 720 730 740 750 760 770 KIAA17 TFYNASL-----PEGTQPGTCFLQVTATDADSGPFGLLSYSLGAGLGSSGSPPFRIDAHS ..: :....:: .:.:.: ::: . ::: : : .: : . :. KIAA05 LPTDGSTGVELAPRSAEPGYLVTKVVAVDRDSGQNAWLSYRL---LKASEPGLFSVGLHT 580 590 600 610 620 780 790 800 810 820 830 KIAA17 GDVCTTRTL-DRDQGPSSFDFTVTAVDGGGLKSMVYVKVFLSDENDNPPQFYPREYAASI :.: :.:.: ::: .:. :.::. : . . .. :. :: KIAA05 GEVRTARALLDRDALKQSL---VVAVQDHGQPPLSATVTLTVAVADSIPQVLADLGSLES 630 640 650 660 670 680 840 850 860 870 880 890 KIAA17 SAQSPPGTAVLRLRAHDPDQGSHGRLSYHILAGNSPPLFTLDEQSGLLTVAWPLARRANS KIAA05 PANSETSDLTLYLVVAVAAVSCVFLAFVILLLALRLRRWHKSRLLQASGGGLTGAPASHF 690 700 710 720 730 740 >>KIAA1621 ( 787 res) hj04505 (787 aa) initn: 766 init1: 339 opt: 954 Z-score: 596.8 bits: 123.4 E(): 4e-28 Smith-Waterman score: 1028; 33.193% identity (59.524% similar) in 714 aa overlap (150-841:17-701) 120 130 140 150 160 170 KIAA17 QSLAWSWSPRHSWTTLVMQKELGIVPSCPGMKSPRPHLLLPLLLLLLLLLGAGVPGAWGQ :.. : . .: ....:: : :::. . KIAA16 SFCEPTFQEKAMEIGWMHNRRQRQVL-VFFVLLSLSGAGA-----E 10 20 30 40 180 190 200 210 220 230 KIAA17 AGSLDLQIDEEQPAGTLIGDISAGLPAGTAAPLMYFISAQEGS-GVGTDLAIDEHSGVVR :: . . :: :....... : : . : .:. : : : . ..: . KIAA16 LGSYS--VVEETERGSFVANLGKDLGLGLTE--MSTRKARIISQGNKQHLQLKAQTGDLL 50 60 70 80 90 240 250 260 270 280 290 KIAA17 TARVLDREQRDR------YRFTAVTPDGATV-EVTVRVADINDHAPAFPQARAALQVPEH . ::::. .: .. . . .. .:: :::::.: : . . :..::. KIAA16 INEKLDREELCGPTEPCILHFQVLMENPLEIFQAELRVIDINDHSPMFTEKEMILKIPEN 100 110 120 130 140 150 300 310 320 330 340 350 KIAA17 TAFGTRYPLEPARDADAGRLGTQGYALSGDGAGETFRLETRPGPDGTPVPELVVTGELDR . .::..::. : : :.: ..:.: .: .. ::. . :: ::::. :::: KIAA16 SPLGTEFPLNHALDLDVGSNNVQNYKISPSSH---FRVLIHEFRDGRKYPELVLDKELDR 160 170 180 190 200 210 360 370 380 390 400 410 KIAA17 ENRSHYMLQLEAYDGGSPPRRAQALLDVTLLDINDHAPAFNQSRYHAVVSESLAPGSPVL :.. . : : : ::::::: . : . . ..::::.:: :.: :.. . :. :: : KIAA16 EEEPQLRLTLTALDGGSPPRSGTAQVRIEVVDINDNAPEFEQPIYKVQIPENSPLGSLVA 220 230 240 250 260 270 420 430 440 450 460 470 KIAA17 QVFASDADAGVNGAVTYEINRRQSEGDGPFSIDAHTGLLQLERPLDFEQRRVHELVVQAR : : : :.:.:: ..: . . . . . . .. :: ..:.. .:::. .:. ..: KIAA16 TVSARDLDGGANGKISYTLFQPSEDISKTLEVNPMTGEVRLRKQVDFEMVTSYEVRIKAT 280 290 300 310 320 330 480 490 500 510 520 530 KIAA17 DGGAHPELGSAFVTVHVRDANDNQPSMTVIFLSADGSPQVSEAAPPGQLVARISVSDPDD :::. :. . ..: :.::: :..: .:: :: . : .: .:: .::::::. KIAA16 DGGGLS--GKCTLLLQVVDVNDNPPQVT---MSALTSP-IPENSPE-IVVAVFSVSDPDS 340 350 360 370 380 540 550 560 570 580 590 KIAA17 GDFAHVNVSLEGGEGHFALSTQDSVIYLVCVARRLDREERDAYNLRVTATDSGSPPLRAE :. ... :.. . : :. . . .: . . : :::: : ::. .:.:: :.: :..: KIAA16 GNNGKTISSIQE-DLPFLLKPSVKNFYTLVTERALDREARAEYNITLTVTDMGTPRLKTE 390 400 410 420 430 440 600 610 620 630 640 650 KIAA17 AAFVLHVTDVNDNAPAFDRQLYRPEPLPEVALPGSFVVRVTARDPDQGTNGQVTYSLAPG ......:::::::.: . : . : :. . :.: : :.: :.:::::: : KIAA16 HNITVQISDVNDNAPTFTQTSYT-LFVRENNSPALHIGSVSATDRDSGINAQVTYSLLPP 450 460 470 480 490 500 660 670 680 690 700 KIAA17 AHTHW-----FSIDPTSGIITTAASLDYELEPQPQLIVVATDGGLPPLASSATVSVALQD : ::. .: . . ::::: . .. : ::: : : :.: : : : . : KIAA16 QDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALREFEFRVSATDRGSPALSSEALVRVLVLD 510 520 530 540 550 560 710 720 730 740 750 760 KIAA17 VNDNEPQFQRTFYNAS------LPEGTQPGTCFLQVTATDADSGPFGLLSYSLGAGLGSS .::: : . :.: .:....:: .:.:.:.::: . :::.: : .. KIAA16 ANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNAWLSYQL---LKAT 570 580 590 600 610 620 770 780 790 800 810 KIAA17 GSPPFRIDAHSGDVCTTRTL-DRDQGPSSFDFTVTAVDGG--GLKSMVYVKVFLSDENDN : . ::.:.: :.: : .:: .. ..: . :.: .. . ..:.: : .. KIAA16 EPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDA--AKHRLVVLVKDNGEPPCSATATLHVLLVDGFSQ 630 640 650 660 670 820 830 840 850 860 870 KIAA17 PPQFYPREYAASISAQSPPGTAVLRLRAHDPDQGSHGRLSYHILAGNSPPLFTLDEQSGL : : : :: ..:. :. : KIAA16 P--FLPLPEAAPGQTQANSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVVVRLCRRSRAASVGRCS 680 690 700 710 720 730 >>KIAA0279 ( 2854 res) ff05612 (2854 aa) initn: 1093 init1: 348 opt: 732 Z-score: 454.8 bits: 99.0 E(): 3.2e-20 Smith-Waterman score: 1535; 33.692% identity (60.431% similar) in 1021 aa overlap (1677-2651:107-1110) 1650 1660 1670 1680 1690 1700 KIAA17 LLVEATDRPANASRRRAARVSARVFVTDENDNAPVFASPS-RVRLPEDQPPGPAALHVVA ..:: : :: .. .::.:: : . . : KIAA02 QSCKLAQAPGLRAGERSPEESLGGRRKRNVNTAPQFQPPSYQATVPENQPAGTPVASLRA 80 90 100 110 120 130 1710 1720 1730 1740 1750 1760 KIAA17 RDPDLGEAARVSYRLASGGDGH----FRLHSSTGALSVVRPLDREQRAEHVLTVVASDHG ::: :::.:. : . . :.. : : :::..... :::: .. ::. :.:.::: KIAA02 IDPDEGEAGRLEYTMDALFDSRSNQFFSLDPVTGAVTTAEELDRETKSTHVFRVTAQDHG 140 150 160 170 180 190 1770 1780 1790 1800 1810 1820 KIAA17 SPPRSATQVLTVSVADVNDEAPTFQQQEYSVLLRENNPPGTSLLTLRATDPDVGANGQVT : ::: .::. :.:.::. :.:.::::. :::: : .::.:::: :. :... KIAA02 MPRRSALATLTILVTDTNDHDPVFEQQEYKESLRENLEVGYEVLTVRATDGDAPPNANIL 200 210 220 230 240 250 1830 1840 1850 1860 1870 KIAA17 Y------GGVSSESFSLDPDTGVLTTLRALDREEQEEINLTVYAQDRG-SP-PQLTHVTV : :: :: : .:: .::. : .:::: : .::: :.:.: .: :. : ..: KIAA02 YRLLEGSGGSPSEVFEIDPRSGVIRTRGPVDREEVESYQLTVEASDQGRDPGPRSTTAAV 260 270 280 290 300 310 1880 1890 1900 1910 1920 1930 KIAA17 RVAVEDENDHAPTFGSAHLSLEVPEGQDPQTLTM-LRASDPDVGANGQLQYRILDGDPSG ..:::.::.:: :. . ..: : : . .. . ::: : :.:. ..: :..:. : KIAA02 FLSVEDDNDNAPQFSEKRYVVQVREDVTPGAPVLRVTASDRDKGSNAVVHYSIMSGNARG 320 330 340 350 360 370 1940 1950 1960 1970 1980 1990 KIAA17 AFVLDLASGEFGTMRPLDREVEPAFQLRIEARDGGQPALS-ATLLLTVTVLDANDHAPAF : :: .: . .. ::: :. . ::..:.:::.: :: .. :.:: ::: ::.:: : KIAA02 QFYLDAQTGALDVVSPLDYETTKEYTLRVRAQDGGRPPLSNVSGLVTVQVLDINDNAPIF 380 390 400 410 420 430 2000 2010 2020 2030 2040 2050 KIAA17 PVPAYSVEVPEDVPAGTLLLQLQAHDPDAGANGHVTYYL-GAGTAGAFLLEPSSGELRTA ... : :.:: : :.:..:: : ::: :... : : :.: : .. ..: . .: KIAA02 VSTPFQATVLESVPLGYLVLHVQAIDADAGDNARLEYRLAGVGHDFPFTINNGTGWISVA 440 450 460 470 480 490 2060 2070 2080 2090 2100 KIAA17 AALDREQCPSYTFSVSAVD-GAAAGPLSTTVSVTITVRDVNDHAPTFPTSPLRLRLPRPG : ::::. :.:.: : : :. : :....::..:: ::::. ::: .:: . . KIAA02 AELDREEVDFYSFGVEARDHGTPA--LTASASVSVTVLDVNDNNPTFTQPEYTVRLNEDA 500 510 520 530 540 550 2110 2120 2130 2140 2150 2160 KIAA17 PSFSTPTLALATLRAEDRDAGANASILYRL-AGTPPPGTTVDSYTGEIRVARS-PVALG- .. ..:. : ::: :.. : :.. .:. .. : .: :. . :. KIAA02 AVGTS----VVTVSAVDRD--AHSVITYQITSGNTRNRFSITSQSGGGLVSLALPLDYKL 560 570 580 590 600 2170 2180 2190 2200 2210 2220 KIAA17 PRDRVLFIVATDLGRPARSATGVIIVGLQGEAERGPRFPRASSEATIRENAPPGTPIVSP :. :: ..:.: .:. :. :.:.. . : : . ... :. : :: .: KIAA02 ERQYVLAVTASD---GTRQDTAQIVVNVTDANTHRPVFQSSHYTVNVNEDRPAGTTVVLI 610 620 630 640 650 660 2230 2240 2250 2260 2270 2280 KIAA17 RAVHAG-GTNGPITYSILSGNEKGTFSIQPSTGAITVRSAEGLDFEVSPRLRLVLQAESG :. : :. ::: . .. . : :. .:::.:.. :: ::.: . :.. :... KIAA02 SATDEDTGENARITYFMEDSIPQ--FRIDADTGAVTTQ-AE-LDYEDQVSYTLAITARDN 670 680 690 700 710 720 2290 2300 2310 2320 2330 2340 KIAA17 GAFA---FTVLTLTLQDANDNAPRFLRPHYVAFLPESRPLEGPLLQVEADDLDQGSGGQI : : : . ..:.:::::.::: : . . :. : .::. : : :.: .:.. KIAA02 GIPQKSDTTYLEILVNDVNDNAPQFLRDSYQGSVYEDVPPFTSVLQISATDRDSGLNGRV 730 740 750 760 770 780 2350 2360 2370 2380 2390 2400 KIAA17 SYSLAASQPARGLFHVDPTTGTITTTAILDREIWAETRLVLMATDRGSPALVGSATLTVM :.. ... . : : :. :.: . : :::: :. : .:.:.: : .:: KIAA02 FYTFQGGDDGDGDFIVESTSGIVRTLRRLDRENVAQYVLRAYAVDKGMPPARTPMEVTVT 790 800 810 820 830 840 2410 2420 2430 2440 2450 KIAA17 VIDTNDNRPTIPQP-WELRVSEDALLGSEIAQVTGNDVDSGP---VLWYVLSPSGPQDPF :.:.::: :.. : ... : :.. .: .:.::..: : : ... .. . :. : KIAA02 VLDVNDNPPVFEQDEFDVFVEENSPIGLAVARVTATDPDEGTNAQIMYQIVEGNIPE-VF 850 860 870 880 890 900 2460 2470 2480 2490 2500 2510 KIAA17 SVGRYGGRVSLTGPLDFEQCDRYQLQLLAHDGPHEGRANLTVLVEDVNDNAPAFS--QSL .. ..:... ::.:. .: : . : ..: .::.. : . : ::: :... . : KIAA02 QLDIFSGELTALVDLDYEDRPEYVLVIQATSAPLVSRATVHVRLLDRNDNPPVLGNFEIL 910 920 930 940 950 960 2520 2530 2540 2550 2560 KIAA17 YQVMLLEHTP--PGSAILSVSATDRD-------SGANGH-ISYHLASPADG---FSVDPN .. .. ... ::.:: : : : : : :. .: : . . : .: . KIAA02 FNNYVTNRSSSFPGGAIGRVPAHDPDISDSLTYSFERGNELSLVLLNASTGELKLSRALD 970 980 990 1000 1010 1020 2570 2580 2590 2600 2610 2620 KIAA17 NGTLFTIVGTVALGHDGSGAVDVVLEARDHGAPGRAARATVHVQLQDQNDH---APSFTL :. . . .: : :: .: . : . .. ..:.:.. . .: . : KIAA02 NNRPLEAIMSV-LVSDGVHSVTAQCALRVTIITDEMLTHSITLRLEDMSPERFLSPLLGL 1030 1040 1050 1060 1070 2630 2640 2650 2660 2670 2680 KIAA17 SHYRVAVTEDLPPGSTLLTLEATDADGSRSHAAVDYSIISGNWGRVFQLEPRLAEAGESA ::.: :: ... :.:. .: KIAA02 FIQAVAATLATPPDHVVVFNVQRDTDAPGGHILNVSLSVGQPPGPGGGPPFLPSEDLQER 1080 1090 1100 1110 1120 1130 2690 2700 2710 2720 2730 2740 KIAA17 GPGPRALGCLVLLEPLDFESLTQYNLTVAAADRGQPPQSSVVPVTVTVLDVNDNPPVFTR KIAA02 LYLNRSLLTAISAQRVLPFDDNICLREPCENYMRCVSVLRFDSSAPFIASSSVLFRPIHP 1140 1150 1160 1170 1180 1190 >>KIAA1775 ( 858 res) hk03826 (858 aa) initn: 369 init1: 276 opt: 705 Z-score: 444.0 bits: 95.2 E(): 1.3e-19 Smith-Waterman score: 739; 29.915% identity (56.268% similar) in 702 aa overlap (2287-2943:7-677) 2260 2270 2280 2290 2300 KIAA17 TGAITVRSAEGLDFEVSPRLRLVLQAESGGAFAFTVLTLTLQDANDNAPRFL-------R :.:. .: : : .:: ::.:. KIAA17 RRCRWAALALGLLRLCLAQAN-FAPHFFDNGVGSTN 10 20 30 2310 2320 2330 2340 2350 2360 KIAA17 PHYVAF-LPESRPLEGPLLQVEADDLDQGSGGQISYSLAASQPARGLFHVDPTTGTITTT ... : :::. :. . . ... : . : ::: .. . .:..: :::: :.:: . KIAA17 GNMALFSLPEDTPVGSHVYTLNGTDPE---GDPISYHISFDPSTRSVFSVDPTFGNITLV 40 50 60 70 80 90 2370 2380 2390 2400 2410 2420 KIAA17 AILDREIWAETRLVLMATDRGSPALVGSATLTVMVIDTNDNRPT-IPQPWELRVSEDALL :::: : . .. .: . :: . ....: :.::. : : .:. : :: KIAA17 EELDREREDEIEAIISISD--GLNLV-AEKVVILVTDANDEAPRFIQEPYVALVPEDIPA 100 110 120 130 140 2430 2440 2450 2460 2470 2480 KIAA17 GSEIAQVTGNDVD--SGPVLWYVLSPSGPQDPFSVGRYGG--RVSLTGPLDFEQCDRYQL :: : .: . : : :: . : :. . ..::.: :..: :.. . ::.:. . . KIAA17 GSIIFKVHAVDRDTGSGGSVTYFLQ--NLHSPFAVDRHSGVLRLQAGATLDYERSRTHYI 150 160 170 180 190 200 2490 2500 2510 2520 2530 KIAA17 QLLAHDGP---H------EGRANLTVLVEDVNDNAPAFSQSLYQVMLLEHTPPGSAILSV ..:.:: : . ...:: ::::.: ::.: . : .. : : ::: .:.: KIAA17 TVVAKDGGGRLHGADVVFSATTTVTVNVEDVQDMAPVFVGTPYYGYVYEDTLPGSEVLKV 210 220 230 240 250 260 2540 2550 2560 2570 2580 2590 KIAA17 SATDRDSGANGHISYHLASPADG-FSVDPNNGTLFTIVGTVALGHDGSGAVDV-VLEARD : : : : ..: : :.. :: : .. ..:.. .:. . : . . : : : KIAA17 VAMDGDRGKPNRILYSLVNGNDGAFEINETSGAI-SITQSPAQLQREVYELHVQVTEMSP 270 280 290 300 310 320 2600 2610 2620 2630 2640 KIAA17 HGAPGRAARATVHVQLQDQNDHAPSF-----TLSHYRVAVTEDLPPGSTLLTLEATDADG :.:. : . : ... : :.: :.: ........: : : : :. : :. KIAA17 AGSPAAQATVPVTIRIVDLNNHPPTFYGESGPQNRFELSMNEHPPQGEILRGLKITVNDS 330 340 350 360 370 380 2650 2660 2670 2680 2690 2700 KIAA17 SR-SHAAVDYSIISGNWGRVFQLEPR--LAEAGESAGPGPRALGCLVLLEPLDFESLTQY .. ..: . ... : : .:.. :. : :: . : .:::. KIAA17 DQGANAKFNLQLV-GPRG-IFRVVPQTVLNEAQVTIIVENSA--------AIDFEKSKVL 390 400 410 420 430 2710 2720 2730 2740 2750 2760 KIAA17 NLTVAAADRGQPPQ-SSVVPVTVTVLDVNDNPPVFTRASYRVTVPEDTPVGAELLHVEAS .. . :.. . : . ::.. :.. .::.::: : : : . .::..: :. .. : : KIAA17 TFKLLAVEVNTPEKFSSTADVVIQLLDTNDNVPKFDSLYYVARIPENAPGGSSVVAVTAV 440 450 460 470 480 490 2770 2780 2790 2800 2810 2820 KIAA17 DADPGPHGLVRFTVSSGDPSGLFELDESSGTLRLAH--ALDCETQARHQLVVQAADPAGA : : :: : :... . : . :: . :.: . .:: :. ::... :.: : : KIAA17 DPDTGPWGEVKYS-TYGTGADLFLIHPSTGLIYTQPWASLDAEATARYNFYVKAEDMEG- 500 510 520 530 540 550 2830 2840 2850 2860 2870 2880 KIAA17 HFALAPVTIEVQDVNDHGPAFPLNLLSTSVAENQPPGTLVTTLHAIDGDAGAFGRL-RYS ....: : : . ::::: : : .. . ... . : . ..::: :: . : :: KIAA17 KYSVAEVFITLLDVNDHPPQFGKSVQKKTMVLGTP-----VKIEAIDEDAEEPNNLVDYS 560 570 580 590 600 2890 2900 2910 2920 2930 KIAA17 LLEAGPGPEGREAFALNSSTGE--LRARV-PFDYEHTES------FRLLVGAADAGNLSA . .: :. ..: .:: ::: :. . .: :. . . : : : : :. : KIAA17 ITHAEPA----NVFDINSHTGEIWLKNSIRSLDALHNITPGRDCLWSLEVQAKDRGSPSF 610 620 630 640 650 660 2940 2950 2960 2970 2980 2990 KIAA17 SVTVSVLVTGEDEYDPVFLAPAFHFQVPEGARRGHSLGHVQATDEDGGADGLVLYSLATS :.:. . . : KIAA17 STTALLKIDITDAETLSRSPMAAFLIQTKDNPMKAVGVLAGTMATVVAITVLISTATFWR 670 680 690 700 710 720 >>KIAA1774 ( 1041 res) hk10268 (1041 aa) initn: 633 init1: 311 opt: 701 Z-score: 440.6 bits: 94.9 E(): 2e-19 Smith-Waterman score: 867; 32.272% identity (56.585% similar) in 691 aa overlap (1557-2192:106-779) 1530 1540 1550 1560 1570 1580 KIAA17 ARPLDFEAGPPWRALTVRAEGPGGAGARLLRVQVQVQDENEHAPAFARDPLALA-----L .. :.: : :...: : :.... . KIAA17 RELVATYEVTLSVIDNASDLPERSVSVPNAKLTVNVLDVNDNTPQFK--PFGITYYMERI 80 90 100 110 120 130 1590 1600 1610 1620 1630 1640 KIAA17 PENPEPGAALYTFRASDADGPGPNSDVRYRLLRQEPPVPALRLDARTGALSAPRGLDRET :. ::..: . : : : : :. : : :: :: . :. .: . : : .: : KIAA17 LEGATPGTTLIAVAAVDPD-KGLNGLVTYTLLDLVPPGYVQLEDSSAGKVIANRTVDYEE 140 150 160 170 180 190 1650 1660 1670 1680 1690 1700 KIAA17 TPALLLLVEATDRPANASRRRAARVSARVFVTDENDNAPVFASPSRVR-LPEDQPPGPAA . : . :.:.: :.: :::.. . . ..: ::: :.: .:: . . :: : : KIAA17 VHWLNFTVRASD---NGSPPRAAEIPVYLEIVDINDNNPIFDQPSYQEAVFEDVPVGTII 200 210 220 230 240 1710 1720 1730 1740 1750 1760 KIAA17 LHVVARDPDLGEAARVSYRLASGGDGHFRLHSSTGALSVVRPLDREQRAEHVLTVVASDH : :.: : : :. : . : :..: ...: .. .:: . :. ::::.. ...::..:.:. KIAA17 LTVTATDADSGNFALIEYSLGDG-ESKFAINPTTGDIYVLSSLDREKKDHYILTALAKDN 250 260 270 280 290 300 1770 1780 1790 1800 1810 KIAA17 ----GSPPRSATQVLTVSVADVNDEAPTFQQQEYSVLLRENNPPGTSLLTLRATDPDVGA .: : . ....: :::: : :.. ..:. . ::.: :::..:. ::: : : KIAA17 PGDVASNRRENSVQVVIQVLDVNDCRPQFSKPQFSTSVYENEPAGTSVITMMATDQDEGP 310 320 330 340 350 360 1820 1830 1840 1850 1860 1870 KIAA17 NGQVTYG--GVSSESFSLDPDTGVLTTLRALDREEQEEINLTVYAQDRGSPPQLTHVTVR ::..::. : . :.: .: :.:..:: : : . :...::: : : : :: . . KIAA17 NGELTYSLEGPGVEAFHVDMDSGLVTTQRPL--QSYEKFSLTVVATDGGEPPLWGTTMLL 370 380 390 400 410 420 1880 1890 1900 1910 1920 KIAA17 VAVEDENDHAPTF-----GSA-HLSLEVPEGQDPQTLTMLRASDPDVGANGQLQYRILD- : : : ::. :.: :. :. :.: .. . . :.: : : :: ..: .: KIAA17 VEVIDVNDNRPVFVRPPNGTILHIREEIPLRSN---VYEVYATDKDEGLNGAVRYSFLKT 430 440 450 460 470 480 1930 1940 1950 1960 1970 1980 KIAA17 -GDPSGAF-VLDLASGEFGTMRPLDREVEPAFQLRIEARDGGQPALSATLL-LTVTVLDA :. . : ..: :: . : . :::: . ...: . : : :::. :. : :.. : KIAA17 AGNRDWEFFIIDPISGLIQTAQRLDRESQAVYSLILVASDLGQPVPYETMQPLQVALEDI 490 500 510 520 530 540 1990 2000 2010 2020 2030 KIAA17 NDHAPAF--P---VPAYSV-EVPEDVPAGTLLLQLQ-AHDPDAGANGHVTYYLGAGTA-G .:. : : : : :.. ::: : :::. .. : : : : :. : :...::. KIAA17 DDNEPLFVRPPKGSPQYQLLTVPEHSPRGTLVGNVTGAVDADEGPNAIVYYFIAAGNEEK 550 560 570 580 590 600 2040 2050 2060 2070 2080 KIAA17 AFLLEPSSGELRTAAALDREQCPSYTFSVSAVDGAA----AGPLST-------TVS-VTI : :.:. : : . ::::. ..: :.: .. . :: : :.. : . KIAA17 NFHLQPD-GCLLVLRDLDREREAIFSFIVKASSNRSWTPPRGPSPTLDLVADLTLQEVRV 610 620 630 640 650 660 2090 2100 2110 2120 2130 2140 KIAA17 TVRDVNDHAPTFPTSPLRLRLPRPGPSFSTPTLALATLRAEDRDAGANASILYRLAG--- ...:.::. : : . . . : : . : : : : :. ..: . . KIAA17 VLEDINDQPPRFTKAEYTAGVATDAKVGS----ELIQVLALDADIGNNSLVFYSILAIHY 670 680 690 700 710 2150 2160 2170 2180 2190 KIAA17 -------TPPPGT--TVDSYTGEIRVARSPVALGPRDRVLFIVATDL-GRPARSATGVII . : :. :. : .:. .: .: :. ::: :: :. . :. : KIAA17 FRALANDSEDVGQVFTMGSMDGILRTFDLFMAYSPGYFVVDIVARDLAGHNDTAIIGIYI 720 730 740 750 760 770 2200 2210 2220 2230 2240 2250 KIAA17 VGLQGEAERGPRFPRASSEATIRENAPPGTPIVSPRAVHAGGTNGPITYSILSGNEKGTF . KIAA17 LRDDQRVKIVINEIPDRVRGFEEEFIHLLSNITGAIVNTDNVQFHVDKKGRVNFAQTELL 780 790 800 810 820 830 >>KIAA0345 ( 845 res) hg01491 (845 aa) initn: 536 init1: 261 opt: 650 Z-score: 410.4 bits: 89.0 E(): 9.7e-18 Smith-Waterman score: 984; 33.949% identity (57.670% similar) in 704 aa overlap (162-840:17-697) 140 150 160 170 180 190 KIAA17 WTTLVMQKELGIVPSCPGMKSPRPHLLLPLLLLLLLLLGAGVPGAWGQAGSLDLQIDEEQ ::: ::.:. : :. :.: .. :: KIAA03 VFEMLYSSRGDPEGQPLLLSLLILAMWVVGS----GQLHYSVPEEA 10 20 30 40 200 210 220 230 240 KIAA17 PAGTLIGDISA--GLPAGTAAPLMYFISAQEGSGVGTDLAIDEHSGVVRTARVLDREQ-- ::..: :. :: . .: .. .... : : : .. ..:.. . .:::. KIAA03 EHGTFVGRIAQDLGLELAELVPRLFQLDSK---GRGDLLEVNLQNGILFVNSRIDREELC 50 60 70 80 90 250 260 270 280 290 300 KIAA17 -RD---RYRFTAVTPDGATV-EVTVRVADINDHAPAFPQARAALQVPEHTAFGTRYPLEP :. .. ... : .: :.: ::::. :.:: .. : . : . .:.::: KIAA03 GRSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVDVEVKDINDNPPVFPATQKNLFIAESRPLDSRFPLEG 100 110 120 130 140 150 310 320 330 340 350 360 KIAA17 ARDADAGRLGTQGYALSGDGAGETFRLETRPGPDGTPVPE-LVVTGELDRENRSHYMLQL : ::: :. . : :: . : : :.. : . : ::. ::::. . : : KIAA03 ASDADIGENALLTYRLSPN---EYFFLDV-PTSNQQVKPLGLVLRKLLDREETPELHLLL 160 170 180 190 200 210 370 380 390 400 410 420 KIAA17 EAYDGGSPPRRAQALLDVTLLDINDHAPAFNQSRYHAVVSESLAPGSPVLQVFASDADAG : :::.: . . : .:.:: ::.::.:... : . . :... :. :.. ::: : : KIAA03 TATDGGKPELTGTVQLLITVLDNNDNAPVFDRTLYTVKLPENVSIGTLVIHPNASDLDEG 220 230 240 250 260 270 430 440 450 460 470 480 KIAA17 VNGAVTYEINRRQSEG-DGPFSIDAHTGLLQLERPLDFEQRRVHELVVQARDGGAHPELG .:: . : .. : . : .: .: . . .:::. :.:.. :.: : : : : KIAA03 LNGDIIYSFSSDVSPDIKSKFHMDPLSGAITVIGHMDFEESRAHKIPVEAVDKGFPPLAG 280 290 300 310 320 330 490 500 510 520 530 540 KIAA17 SAFVTVHVRDANDNQPSMTVIFLSADGSPQVSEAAPPGQLVARISVSDPDDGDFAHVNVS . :.: :.::: :..:. ::. : :.: : : ..: ::: : : ..:. : KIAA03 HCTLLVEVVDVNDNAPQLTIKTLSV---P-VKEDAQLGTVIALISVIDLDADANGQVTCS 340 350 360 370 380 390 550 560 570 580 590 600 KIAA17 LEGGEGHFALSTQDSVIYLVCVARRLDREERDAYNLRVTATDSGSPPLRAEAAFVLHVTD : . : : . . : . . : :::: .::.: ::: :.::: : : : ..:.: KIAA03 LTP-HVPFKLVSTYKNYYSLVLDRALDRESVSAYELVVTARDGGSPSLWATARVSVEVAD 400 410 420 430 440 450 610 620 630 640 650 KIAA17 VNDNAPAFDRQLYRPEPLPEVALPGSFVVRVTARDPDQGTNGQVTYSLAP---GAHT--H :::::::: .. : . : :: . :.::: : :. :.:::. : .. 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KIAA08 TSVHVHVTEQSHYA----------PSA-LPLEIFITVGEDEFQGGMVGKIHATDRDPQDT 380 390 400 410 420 1510 1520 1530 1540 1550 1560 KIAA17 LTYTLVGGADPEGTFALDAASGRLYLARPLDFEAGPPWRALTVRAEGPGGAGARLLRVQV :::.:. :.. : .:.. :. : KIAA08 LTYSLAEEETLGRHFSVGAPDGKIIAAQGLPRGHYSFNVTVSDGTFTTTAGVHVYVWHVG 430 440 450 460 470 480 >>KIAA1400 ( 1093 res) hk08136 (1093 aa) initn: 564 init1: 250 opt: 548 Z-score: 346.7 bits: 77.6 E(): 3.4e-14 Smith-Waterman score: 965; 31.593% identity (58.379% similar) in 728 aa overlap (135-818:32-738) 110 120 130 140 150 160 KIAA17 GPQWDLTQSLRSSWAQSLAWSWSPRHSWTTLVMQKELGIVPSCPGMKSPRPHLLLPLLLL .:. . .: . .: : : .:: ...: KIAA14 KRSKIFKDRKPQEPPRSALLFVFFQIFFCFVVVGEVIGWLTGC-GKLLP---FLLEMIVL 10 20 30 40 50 170 180 190 200 210 220 KIAA17 LLLLLGAGVPGAWGQAGSLDLQIDEEQPAGTLIGDISAGLPAG-TAAPLMYFISAQEGSG ::. : : :...: : ..::: ::..:.:. : : : .. .. 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KIAA18 AFQSSGEKETSQFPGKELR--REPGPSKAQNRAAFT------EPLAEAP--LLGSKQAQE 740 750 760 770 780 2200 2210 2220 2230 2240 2250 KIAA17 ERGPRFPRASSEATIRENAPPGTPIVSPRAVHAGGTNGPITYSILSGNEKGTFSIQPSTG ::.: .:: ... .. : : KIAA18 ERAP-LPREQAQQLQGSEGEKGGP 790 800 3434 residues in 1 query sequences 1984071 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:16:22 2008 done: Thu Dec 18 15:16:25 2008 Total Scan time: 1.500 Total Display time: 1.040 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]