# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/af00171.fasta.huge -Q ../query/KIAA1769.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1769, 2114 aa vs ./tmplib.25089 library 1985391 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8556+/-0.00502; mu= 14.8767+/- 0.340 mean_var=107.8645+/-24.885, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 13 in 1/39 Lambda= 0.123491 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 43, opt: 31, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0054 ( 1943 res) ha00503s1 (1943) 770 149.4 8.7e-36 KIAA1955 ( 947 res) fk07007 ( 947) 433 89.1 6.1e-18 KIAA1008 ( 935 res) hh04776s1 ( 935) 323 69.5 4.8e-12 KIAA1631 ( 1032 res) fh15959s1 (1032) 275 61.0 1.9e-09 KIAA0083 ( 1077 res) ha03631 (1077) 198 47.3 2.7e-05 KIAA0221 ( 1151 res) ha02799 (1151) 188 45.5 9.7e-05 >>KIAA0054 ( 1943 res) ha00503s1 (1943 aa) initn: 906 init1: 229 opt: 770 Z-score: 734.4 bits: 149.4 E(): 8.7e-36 Smith-Waterman score: 931; 40.955% identity (66.332% similar) in 398 aa overlap (40-417:700-1087) 10 20 30 40 50 60 KIAA17 VLRGSSAGHTVGALADSTEAPSKKPMSSSPSRSAADIYIREYFHSHVSGGHPEATPLRVM : ::::.::..:.: .: .:.:.: ::::. 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KIAA00 FRIRAELRKKRLSDVNVERVLNVQGKQFRVLFLSTVRTRHTCKHKQTPIKKKEQLLEDST 970 980 990 1000 1010 1020 360 370 380 390 400 KIAA17 ------FFTDARVLNTVLTRAQSQLVVVGDAVALCSFGACGKLWESFIRECVERHSVCPE :... ..:::..::::: ..:::: .::::.: : :.:: :: : : :. . KIAA00 EDLDYGFLSNYKLLNTAITRAQSLVAVVGDPIALCSIGRCRKFWERFIALCHENSSL--H 1030 1040 1050 1060 1070 410 420 430 440 450 460 KIAA17 GLSMEQVEQGVAQRRRWPPRGTQAGAAGNWEAAPEPVGDLAEEQAAVVTAMVKAEPGDEA :...::.. KIAA00 GITFEQIKAQLEALELKKTYVLNPLAPEFIPRALRLQHSGSTNKQQQSPPKGKSLHHTQN 1080 1090 1100 1110 1120 1130 >>KIAA1955 ( 947 res) fk07007 (947 aa) initn: 284 init1: 185 opt: 433 Z-score: 414.0 bits: 89.1 E(): 6.1e-18 Smith-Waterman score: 496; 24.624% identity (52.941% similar) in 731 aa overlap (525-1199:84-757) 500 510 520 530 540 KIAA17 VKEDVVPGACAAGAAAAAGVESTEAEDAEADFWPWDGELNAD----DAIL---RELLDES .::: .:.: :.:: :: .:: KIAA19 VMVTEDEEAIQQYGSETEGVFVITFKNYLDNFWP---DLKAAHELCDSILQSRRERENES 60 70 80 90 100 110 550 560 570 580 590 600 KIAA17 QKVMVTVGEDGLLDTVARPESLQQARLYENLPPAA-LRKLLRAEPERYRHCSFVPETFER :. . :.. :: : : .. . .. .: .. .: . .:: .. KIAA19 QE---SHGKE-------YPEHLPLEVLEAGIKSGRYIQGILNVNKHRAQIEAFV--RLQG 120 130 140 150 610 620 630 640 650 660 KIAA17 ASAIPLDDASSGPIQVRGRLDCGMAFAGDEVLVQLLSGDKAPEGRLRGRVLGVLKRKRHE ::. : .:. : ..: . .. :: :.:.:: :... .::.... . . 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KIAA19 DLDEKSRQAKLEELVWAIGKLTDIARHVRAKRDGCGALELEGVEVCVQLDDKKNIHDLIP 510 520 530 540 550 560 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA17 EYMIQFNRLVAEFLVGSECTRTVTPLRWQPAPRSQQLKALCEKHGDRVPLSLHLGHHLHG . .. .. ::: .. . .. :. :. :. .:: ..: : KIAA19 KQPLEVHETVAECMILA--NHWVAKKIWESFPH----QALLRQH----P----------- 570 580 590 600 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA17 GGGSPPDTRLHL-LASLWKQVQFAARTQDYEQMVD-LVTTDDMH-PFLAPAGRDL-RKAL :: .. : : : :.. . ..: : ...: : :.. :.. .:. KIAA19 ----PPHQEFFSELRECAKAKGFFIDTRSNKTLADSLDNANDPHDPIVNRLLRSMATQAM 610 620 630 640 650 1110 1120 1130 1140 1150 KIAA17 ERSAF---GRCARGHQQQGGHYSLQVDWYTWATSPIRRYLDVVLQRQILLALGHG----- . . : :: ... ::.: .: :: ::::::: :.:..: .. :... KIAA19 SNALYFSTGSCA---EEEFHHYGLALDKYTHFTSPIRRYSDIVVHRLLMAAISKDKKMEI 660 670 680 690 700 710 1160 1170 1180 1190 1200 1210 KIAA17 -GSAYSARDIDGLCQAFSLQHALAQSYQRRARSLHLAVQLKAQPLDKLGFVVDVEAGSRC :. .: .:.. ::. .. .. :: :... : . .: KIAA19 KGNLFSNKDLEELCRHINNRNQAAQHSQKQSTELFQCMYFKDKDPATEERCISDGVIYSI 720 730 740 750 760 770 1220 1230 1240 1250 1260 1270 KIAA17 FRLLFPSNRETLPDPCPVPYGSLQLAEHPHALAGRPGLRLLWRRRVYSAQGSSPPLPLPG KIAA19 RTNGVLLFIPRFGIKGAAYLKNKDGLVISCGPDSCSEWKPGSLQRFQNKITSTTTDGESV 780 790 800 810 820 830 >>KIAA1008 ( 935 res) hh04776s1 (935 aa) initn: 290 init1: 123 opt: 323 Z-score: 308.1 bits: 69.5 E(): 4.8e-12 Smith-Waterman score: 424; 24.014% identity (53.226% similar) in 558 aa overlap (654-1201:320-820) 630 640 650 660 670 680 KIAA17 GRLDCGMAFAGDEVLVQLLSGDKAPEGRLRGRVLGVLKRKRHELAFVCRMDTWDPRIMVP :::.:..::. : : KIAA10 EGQNEEDVEKEEERERMLKTAVSEKMLKPTGRVVGIIKRN------------WRPYC--- 290 300 310 320 330 690 700 710 720 730 740 KIAA17 INGSVTKIFVAELKDPSQVPIYSLRKGRLQRVGLERLTAEARHSRLFWVQIVLWRQGFYY : ..: ...:. :. ... :. :. .: : . ..: . : : : .. : KIAA10 --GMLSK---SDIKE-SRRHLFTPADKRIPRIRIETRQASTLEGRRIIVAIDGWPRNSRY 340 350 360 370 380 750 760 770 780 790 800 KIAA17 PLGIVREVLPEASTWEQGLRILGLEYSLRVPPSDQATITKVLQKYHTELGRVAGRREDCR : : . : ... : ..: ::... : .::... . . . . ::: : KIAA10 PNGHFVRNLGDVGEKETETEVLLLEHDVPHQPFSQAVLSFLPKMPWSITEKDMKNREDLR 390 400 410 420 430 440 810 820 830 840 850 860 KIAA17 AFLTFTVDPQGACNLDDALSVRDL-GPRCEVAVHITDVASFVPRDGVLDVEARRQGAAFY . .::: : ..:::: :.: . ::.:::.::. :. ..:: :. :.:.. : KIAA10 HLCICSVDPPGCTDIDDALHCRELENGNLEVGVHIADVSHFIRPGNALDQESARRGTTVY 450 460 470 480 490 500 870 880 890 900 910 920 KIAA17 APGREPVPMLPASLCQDVLSLLPGRDRLAISLFLTMEKASGQLKSLRFAPSVVQSDRQLS .. . :.: : ... :: ::::.: . :.. . ::. .:. ::..: .:. KIAA10 LCEKR-IDMVPELLSSNLCSLKCDVDRLAFSCIWEMNHNAEILKT-KFTKSVINSKASLT 510 520 530 540 550 560 930 940 950 960 970 980 KIAA17 YEEAEEVIRQHPGAGRELPARLDSVDACVVAACYFSRLLRRHRLRSDCFYEQPDEDGTLG : ::. : .:. . :.. . . . ....:...:... . . : KIAA10 YAEAQLRI---DSANMN-----DDITTSLRGLNKLAKILKKRRIEKGALTLSSPEVRFHM 570 580 590 600 610 990 1000 1010 1020 1030 KIAA17 FRAAH----IMVKEYMIQFNRLVAEFLVGSECTRTVTPLRWQPAPRSQQLKALCEKHGDR .: ...:: . . : .: ::.. .. . . : . :. ... KIAA10 DSETHDPIDLQTKE-LRETNSMVEEFMLLANISVA---------------KKIHEEFSEH 620 630 640 650 660 1040 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA17 VPLSLHLGHHLHGGGGSPPDTRLHLLASLWKQVQFAARTQDYEQMVDLVTTDD--MHPFL . : : .:: . ..:.. .. .. .:. ..... . . :.: KIAA10 ALLRKH---------PAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKTDTAKSLAESLDQAESPTFPYL 670 680 690 700 710 1100 1110 1120 1130 1140 1150 KIAA17 APAGRDLRKALERSAFGRCARGHQQQGGHYSLQVDWYTWATSPIRRYLDVVLQRQILLAL : : .: :. : ... ::.: :: ::::::: ::...: . .:. KIAA10 NTLLRILATRCMMQAVYFCS-GMDNDFHHYGLASPIYTHFTSPIRRYADVIVHRLLAVAI 720 730 740 750 760 770 1160 1170 1180 1190 1200 1210 KIAA17 GHGGSAYSARD---IDGLCQAFSLQHALAQSYQRRARSLHLAVQLKAQPLDKLGFVVDVE : . : . .:. ....: .:: :: . ..: . .:.. KIAA10 GADCTYPELTDKHKLADICKNLNFRHKMAQYAQRASVAFHTQLFFKSKGIVSEEAYILFV 780 790 800 810 820 830 1220 1230 1240 1250 1260 1270 KIAA17 AGSRCFRLLFPSNRETLPDPCPVPYGSLQLAEHPHALAGRPGLRLLWRRRVYSAQGSSPP KIAA10 RKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKDKPNPQLIYDDEIPSLKIEDTVFHVFDKVKVKIMLDS 840 850 860 870 880 890 >>KIAA1631 ( 1032 res) fh15959s1 (1032 aa) initn: 336 init1: 141 opt: 275 Z-score: 261.3 bits: 61.0 E(): 1.9e-09 Smith-Waterman score: 418; 26.009% identity (49.477% similar) in 669 aa overlap (1491-2093:393-968) 1470 1480 1490 1500 1510 1520 KIAA17 ENCADINFSCCYLCIRLEGLLAPTASPRPGPSSLGPGLNVDPGTYTWVAHGQTEDWDQER : . : .. .: : . : ::. . KIAA16 RNYEVKLRLLLHLEELQMEHDIRHYDLESVPMTWDP-VDQNPRLLTLEVPGVTESRPSVL 370 380 390 400 410 420 1530 1540 1550 1560 KIAA17 RADR----------QEAPRRVHLFVHHMGMEKVPEEV-------LRPGTLFTVELLPKQL :.:. :: : . :::.. ...: . : : :.. .. KIAA16 RGDHLFALLSSETHQEDPITYKGFVHKVELDRVKLSFSMSLLSRFVDGLTFKVNFTFNRQ 430 440 450 460 470 480 1570 1580 1590 1600 1610 KIAA17 PDLRKEEAVRGLEEAS-----PLVTSIALGRPVPQPLCRVIPSRFLERQTYNIPGGRHKL : :: .. :.:: .. :.. .: : :: : . .. .:. . : ..: KIAA16 P-LRVQH--RALELTGRWLLWPMLFPVA-PRDVPL-LPSDVKLKLYDRSLESNP---EQL 490 500 510 520 530 1620 1630 1640 1650 1660 1670 KIAA17 NPSQNVAVREALEKPFTVIQGPPGTGKTIVGLHIVFWFHKSNQEQVQPGGPPRGEKRLGG . ..... . :. .: ::::::::.. .. . .:: :.: KIAA16 QAMRHIVTGTTRPAPY-IIFGPPGTGKTVTLVEAI--------KQVV--------KHLPK 540 550 560 570 1680 1690 1700 1710 1720 1730 KIAA17 PCILYCGPSNKSVDVLAGLLLRRMELKPLRVYSEQAEASEFPVPRVGSRKLLRKSPREGR :: :.:::...:.: : :..: : .: : . . .: :.. . KIAA16 AHILACAPSNSGADLLCQRL--RVHL-PSSIYRLLAPSRD-----------IRMVPEDIK 580 590 600 610 620 1740 1750 1760 1770 1780 1790 KIAA17 PNQSLRSITLHHRIRQAPNPYSSEIKAFDTRLQRGELFSREDLVWYKKVLWEARKFELDR : . .:.. .:: .. :.: .:.. KIAA16 PCCN-----------------------WDAK--KGEY------------VFPAKK-KLQE 630 640 1800 1810 1820 1830 1840 KIAA17 HEVILCTCSCAA---SASLKILDVRQILVDEAGMATEPETLIPLVQFPQAE-------KV ..:.. : :. ::.. : .:..:::: :::.:. .. . ... .. KIAA16 YRVLITTLITAGRLVSAQFPIDHFTHIFIDEAGHCMEPESLVAIAGLMEVKETGDPGGQL 650 660 670 680 690 700 1850 1860 1870 1880 1890 KIAA17 VLLGDHKQLRPVVKNERLQNLGLDRSLFER-------YHEDAHMLDTQ--------YRMH :: :: .:: ::... :. :: ::.:: :.. : : :: : KIAA16 VLAGDPRQLGPVLRSPLTQKHGLGYSLLERLLTYNSLYKKGPDGYDPQFITKLLRNYRSH 710 720 730 740 750 760 1900 1910 1920 1930 1940 1950 KIAA17 EGICAFPSVAFYKSKLKTWQGLRRPPSVLGHAG--KESCPVIFGHVQGHERSLLVSTDEG : .:. .:...:.. . :: ... :.:: :.:... :: KIAA16 PTILDIPNQLYYEGELQACADVVDRERFCRWAGLPRQGFPIIFHGVMGKDER------EG 770 780 790 800 810 1960 1970 1980 1990 2000 KIAA17 NENSKANLEEVAEVVRITKQLTL-----GRT-VEPQDIAVLTPYNAQASEIS---KALRR : : : ::.: :. : : :.. . :....:..:: :. .: : : KIAA16 NSPSFFNPEEAATVTSYLKLLLAPSSKKGKARLSPRSVGVISPYRKQVEKIRYCITKLDR 820 830 840 850 860 870 2010 2020 2030 2040 2050 KIAA17 E-----GIAGVAVSSITKSQGSEWRYVLVSTVRTC---AKSDLDQRPTKSWLKKFLGFVV : : . :.:. . ::.: .:.::::. .. ::: :::. KIAA16 ELRGLDDIKDLKVGSVEEFQGQERSVILISTVRSSQSFVQLDLDFN---------LGFLK 880 890 900 910 920 2060 2070 2080 2090 2100 2110 KIAA17 DPNQVNVAVTRAQEGLCLIGDHLLLRCCPLWRSLLDFCEAQQTLVPAGQVRVCRRPTMPS .:.. :::::::. : ..:. ::: : :. .:.::. 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