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Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1760, 2219 aa vs ./tmplib.25089 library 1985286 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.6374+/-0.0119; mu= -28.4903+/- 0.801 mean_var=956.3918+/-226.824, 0's: 0 Z-trim: 45 B-trim: 5 in 1/39 Lambda= 0.041472 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 43, opt: 31, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0344 ( 2066 res) hg01568 (2066) 2163 146.9 5.5e-35 KIAA1566 ( 1313 res) fh21445 (1313) 537 49.4 7.9e-06 KIAA0458 ( 1552 res) ef01252 (1552) 499 47.2 4.2e-05 KIAA1471 ( 1421 res) fj02383s1 (1421) 477 45.9 0.0001 KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053) 480 46.4 0.00014 KIAA1681 ( 1236 res) fh23697 (1236) 452 44.3 0.00026 KIAA1887 ( 967 res) fk02232 ( 967) 439 43.4 0.00038 KIAA1142 ( 467 res) hh05864 ( 467) 397 40.5 0.0013 >>KIAA0344 ( 2066 res) hg01568 (2066 aa) initn: 2880 init1: 1990 opt: 2163 Z-score: 720.0 bits: 146.9 E(): 5.5e-35 Smith-Waterman score: 2777; 34.023% identity (54.665% similar) in 2272 aa overlap (34-2217:9-2015) 10 20 30 40 50 60 KIAA17 DVPGTLMEPGRGAGPAGMAEPRAKAARPGPQRFLRRSVV-ESDQE--EPPGLEAAEAPGP .::.::::. .:. : ::: . : : KIAA03 AATTTTTEHRFFRRSVICDSNATALELPGLPLS-LPQP 10 20 30 70 80 90 100 110 KIAA17 QPPQPLQRRVLLLCKTRRLIAERARGRPAAPAPAALVAQPGAPGAPADAGPEP--VGTQE . : . . . . .. .. : .. : ::: .::: : ::: : : .. 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KIAA15 SLPGDPEAY--PAAVSSGGAIHLQTGVETEEMRSAIAPDPIPLTRESTADTRALNRCKAM 800 810 820 830 840 850 1730 1740 1750 1760 1770 KIAA17 GSPRKRPEQQDVSSPAKTVGR---FSV--VSTQDEWTLASPHSLRYSAPPD-VYLDEAPS .. .: . : .. : . .. :.. .:. .: . .: ... .: . : .. : . KIAA15 SGSFQRGRFQVITIPQQQSAKMTSFGIEHISVFSETNHSSEEAFIKTAKSQLVEIEPATQ 860 870 880 890 900 910 1780 1790 1800 1810 1820 KIAA17 SPDVKLAVRRAQTAS-SIEVGVGEPVSSDS-------GDEGPRARPPVQKQASLPVSGSV .: .... .. :. . . . . : : ..:. . . : .. ..:: KIAA15 NPKTSFSYEKLQALQETCKENKGVPKQGDNFLSFSAACETDVSSVTPEKEFEETSATGSS 920 930 940 950 960 970 1830 1840 1850 1860 KIAA17 ---AGDFVKKATAFL---QRPSR--------AGS------LGPET----PSRVGMKVPTI ..... : .: ..:: ::: :::. : . . KIAA15 MQSGSELLLKEREILTAGKQPSSDSEFSASLAGSGKSVAKTGPESNQCLPHHEEQAYAQT 980 990 1000 1010 1020 1030 1870 1880 1890 1900 1910 1920 KIAA17 SVTSFHSQSSYISSDNDSELEDADIKKELQSLREKHLKEISELQSQQKQEIEALYRRLG- . . :.: :: .:::..::.:: :.: ::: :::::..:. .::.::..:.. ::.:: KIAA15 QSSLFYSPSSPMSSDDESEIEDEDLKVELQRLREKHIQEVVNLQTQQNKELQELYERLRS 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1930 1940 1950 1960 1970 1980 KIAA17 -KPLPPNVGFFHTAPPTGRRRKTSKSKLKAGKLLNPLVRQLKVVASSTGHLADSSRGPPA : . . : . :: .. ::::.. KIAA15 IKDSKTQSTEIPLPPASPRRPRSFKSKLRSRPQSLTHVDNGIVATDPLCVESNAASCQQS 1100 1110 1120 1130 1140 1150 >>KIAA0458 ( 1552 res) ef01252 (1552 aa) initn: 274 init1: 153 opt: 499 Z-score: 183.4 bits: 47.2 E(): 4.2e-05 Smith-Waterman score: 559; 25.026% identity (44.317% similar) in 959 aa overlap (591-1509:658-1503) 570 580 590 600 610 620 KIAA17 GPPVPLQVQVTYHAQAGQPGPPEPEEPEADQHLLPPTLPTSATSLASDSTFDSGQGSTVY :.. :. :. . . .::: . .:: KIAA04 SPLKSNKRQREKVASDTEEADRTSSKKTKTQEISRPNSPSEGEGESSDSRSVNDEGS--- 630 640 650 660 670 680 630 640 650 660 670 680 KIAA17 SDSQSSQQSVMLGSLADAAPSPAQCVCSPPVSEGPVLPQSLPSLGAYQQPTAAPGLPVGS :: .. .:. : . . ::: . . : . :. : : : :: : KIAA04 SDPKDIDQDNR--STSPSIPSPQDNESDSDSSAQQQMLQAQPP--ALQAPT-------GV 690 700 710 720 730 690 700 710 720 730 KIAA17 VPAPACPPSLQQHFPDPAMS-FAPVLPPPSTPMPT-GPGQP-APPGQQPPPLAQPTPL-- .:::. : ..: :. . : ..:: ..: . .:.:: :: . : : .: KIAA04 TPAPSSAPPGTPQLPTPGPTPSATAVPPQGSPTASQAPNQPQAPTAPVPHTHIQQAPALH 740 750 760 770 780 790 740 750 760 770 780 790 KIAA17 PQVLAPQPVVPLQPVP-PHLPPYLAPASQVGAPAQLKPLQMPQAPLQPLA-QVPP--QMP :: :.: : .: : : : : . :.: .::.. .: :.: : . :. : : : KIAA04 PQR-PPSPHPPPHPSPHPPLQPLTGSAGQPSAPSHAQPPLHGQGPPGPHSLQAGPLLQHP 800 810 820 830 840 850 800 810 820 830 840 850 KIAA17 PIPVVPPITPLAGIDGLPPALPDLPTATVPPVPPPQYFSPAVILPSLAAPLPPASPALPL :: :. :::: . : :::. : . :: .. :: KIAA04 G----PP-QPF----GLPPQ--------ASQGQAPLGTSPAAAYPHTSLQLPASQSALQS 860 870 880 890 860 870 880 890 900 KIAA17 QAVKLPHP-PGAPLAMPC-----RTIVPNAPATIPLLAVAPPGVAALSIHSAVAQLPGQP : .: : :::::: : .:. :: : :: ... : : :.:: : KIAA04 QQPPREQPLPPAPLAMPHIKPPPTTPIPQLPA--PQAHKHPPHLSGPSPFSMNANLP-PP 900 910 920 930 940 950 910 920 930 940 950 960 KIAA17 VYPAAFPQMA-PTDVPPSPHHTVQNMRATPPQPALPPQPTLPPQPVLPPQPTLPPQPVLP :: : . : ::: : :: .: . :: .:. :: : . :: KIAA04 --PALKPLSSLSTHHPPSAH--------PPPLQLMPQSQPLPSSPAQPP--GLTQSQNLP 960 970 980 990 1000 970 980 990 1000 1010 1020 KIAA17 PQP-TRPPQPV--LPPQPMLPPQPVLPPQPALPVRPEPLQPHLPEQAAPAATPGSQILLG : : ..:: . . ::: . .: .: : :. : : : ..: : ::.. KIAA04 PPPASHPPTGLHQVAPQPPFAQHPFVPGGPP-PITP----PTCPSTSTPPAGPGTSA--Q 1010 1020 1030 1040 1050 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA17 HPAPYAVDVAAQVP---TVPVPPAAVLSPPLPEVLLPAAPELLPQFPSSLATVSASVQSV : :. .... . :.: . . : .. : .: :. :: :: ... : KIAA04 PPCSGAAASGGSIAGGSSCPLPTVQIKEEALDDAEEPESPPPPPRSPSPEPTV-VDTPSH 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1080 1090 1100 1110 1120 1130 KIAA17 PTQTATLLPPANPPLPGGPGIASPCPTVQLTVEPVQEEQASQDKPPGLPQSCESYGGSDV .:.: . . : : : ..: :. . .. . .. .. . . . . KIAA04 ASQSARFYKHLDR------GYNS-CARTDLYFMPLAGSKLAKKREEAIEKA-KREAEQKA 1120 1130 1140 1150 1160 1140 1150 1160 1170 1180 1190 KIAA17 TSGKELSDSCEGAFGGGRLEGRAARKHHRRSTRARSRQERASRPRLTILNVCNTGDKMVE .: : : . : :.. . :. :. . : : :.: .: .. KIAA04 REEREREKEKEKEREREREREREAERAAKASSSAH--EGRLSDPQL-------SGPGHMR 1170 1180 1190 1200 1210 1200 1210 1220 1230 1240 1250 KIAA17 CQLETHNHKMVTFKFDLDGDAPD--EIATYMVEHDFILQAERETFIEQMKDVMDKAEDML ..: ... . :.: .. : : ... .. : .. .. .: KIAA04 PSFEPPPTTIAAVPPYIGPDTPALRTLSEYARPH--VMSPTNRNHPFYMP--LNPTDPLL 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1260 1270 1280 1290 1300 1310 KIAA17 SEDTDADRGSDPGTSPPHLSTCGLGTGEESRQSQANAPVYQQNVLHTGKRWFIICPVAE- . . . :: .: .: :. . . .... . : : . : KIAA04 AYHMPGLYNVDPTIRERELRE------REIRERE----IRERELRERMKPGFEVKPPELD 1280 1290 1300 1310 1320 1320 1330 1340 1350 1360 1370 KIAA17 --HPAPEAPESSPPLPLSSLPPEASQDS-APYKDQLSSKEQPSFLASQQLLSQAGPSNPP ::: . : ..:: :. : .. :. :. . :. :::. : KIAA04 PLHPAANPMEHFARHSALTIPPTAGPHPFASFHPGLNPLER-------ERLALAGPQLRP 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 KIAA17 GAPPAPLAPSSPPVTALPQDGAAPATSTMPEPASGTASQAGGPGTPQG--LTSELETSQ- : : : . : .: .: . : : . :.:. : KIAA04 -------EMSYPDRLAAERIHAERMASLTSDPLARLQMFNVTPHHHQHSHIHSHLHLHQQ 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 KIAA17 -PLAETHEAPLAVQPLVVGLAPCTPAPEAASTRDASAPREPLPP---PAP----EPSPHS :: . .: :.::: : : .:. : : : :: : : : : KIAA04 DPLHQGSAGP--VHPLV---DPLTAGPHLA--------RFPYPPGTLPNPLLGQPPHEHE 1430 1440 1450 1460 1470 1490 1500 1510 1520 1530 1540 KIAA17 GTPQPALGQPAPL-LPAAVGAVSLATSQLPSPPLGPTVPPQPPSALESDGEGPPPRVGFV .:..: : : ::.:. :. :: KIAA04 MLRHPVFGTPYPRDLPGAIPPPMSAAHQLQAMHAQSAELQRLAMEQQWLHGHPHMHGGHL 1480 1490 1500 1510 1520 1530 >>KIAA1471 ( 1421 res) fj02383s1 (1421 aa) initn: 165 init1: 165 opt: 477 Z-score: 176.7 bits: 45.9 E(): 0.0001 Smith-Waterman score: 541; 29.175% identity (46.833% similar) in 521 aa overlap (677-1184:756-1223) 650 660 670 680 690 700 KIAA17 CSPPVSEGPVLPQSLPSLGAYQQPTAAPGLPVGSVPAPACP---PSLQQHFPDPAMSFAP : ..: : : : . :: . KIAA14 ALLERTQSTCQAREAARQQLLDRELKKKPPPRPTAPKPLLPRREESEAVEAGDPPEELRS 730 740 750 760 770 780 710 720 730 740 750 760 KIAA17 VLPPPSTPMPTGPGQPAPP-GQQPPPLAQPTPLPQVLAPQPVVPLQPVPPHLPPYLAPAS ::: : .:: : :. : :.:.:. .: : :.:: : .: . KIAA14 -LPPD---MVAGPRLPDTFLGSATPLHFPPSPFPSSTGPGPHYLSGPLPPG--TYSGP-T 790 800 810 820 830 770 780 790 800 810 820 KIAA17 QVGAPAQLKPLQMPQAPLQPLAQVPPQMPPIPVVPPITPLAGIDGLP--PALPDLPTATV :. : : :: :: : .: : . .:: .: :. . : . : :.: . KIAA14 QLIQPRAPGPHAMPVAPGPALYPAPAYTPELGLVPRSSPQHGVVSSPYVGVGPAPPVAGL 840 850 860 870 880 890 830 840 850 860 870 KIAA17 PPVPPPQYFSPAVILPSLAAPLPPASPALPLQAVKLPHPPG-APLAMPCRTIVPNAPATI : .::::. .: :: . ::. . ..... : : :: : .: : KIAA14 PSAPPPQFSGPE-----LAMAVRPATTT--VDSIQAPIPSHTAPRPNP----TPAPPP-- 900 910 920 930 940 880 890 900 910 920 930 KIAA17 PLLAVAPPGVAALSIHSAVAQLPGQPVYPAAFPQMAPTDVPPSPHHTVQNMRATPPQPAL : . : :: :: .:::. : : :. :: ... . : : . 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KIAA14 PQAAPLTIRGPSSAGQSTPSPHLVPSPAPS---PGPGPVPPRPPAAEPPPCLRRGAAAAD 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1120 1130 1140 1150 1160 1170 KIAA17 EEQASQDKPPGLPQSCESYGGSDVTSGKELSDSCEGAFGGG-RLEGRAARKHHRRSTRAR ..: .. : :: ::. . . .. :. :: . :: : .: .: : KIAA14 LLSSSPESQHGGTQS--PGGGQPLLQPTKV-DAAEGRRPQALRLIERDPYEHPER-LRQL 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1180 1190 1200 1210 1220 1230 KIAA17 SRQERASRPRLTILNVCNTGDKMVECQLETHNHKMVTFKFDLDGDAPDEIATYMVEHDFI ... .: : .: KIAA14 QQELEAFRGQLGDVGALDTVWRELQDAQEHDARGRSIAIARCYSLKNRHQDVMPYDSNRV 1220 1230 1240 1250 1260 1270 >>KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053 aa) initn: 270 init1: 128 opt: 480 Z-score: 173.9 bits: 46.4 E(): 0.00014 Smith-Waterman score: 582; 23.532% identity (45.922% similar) in 1925 aa overlap (555-2213:1205-3045) 530 540 550 560 570 580 KIAA17 KSIRDRVALIQWRRERIWPALQPKEQQDVGSPDKARGPP--VPLQVQVTYHAQAGQPGP- ::. . . : .:: .. :. .. ::: KIAA03 RLPTPTLGTARAPMPTPTLVRPLLKLVHSPSPEVSASAPGAAPLTISSPLHVPSSLPGPA 1180 1190 1200 1210 1220 1230 590 600 610 620 KIAA17 --PEP---EEPEAD----------QHLLPPTLPTSATSLASDS-TFDSGQGSTVYSDSQS : : : :. . :: ..::. . :: :. . :: ... . 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KIAA03 DGALLAITPPAVKRRRGRPPKKNRS---PADAGRGVDEAPSSTLKGKTN-GADPVPGPET 2670 2680 2690 2700 2710 2720 1920 1930 1940 1950 1960 1970 KIAA17 LYRRLGKP-LPPNV--GFFHTAP-PTGRRRKTSKSKLKAGKLLNPLVRQLKV--VASSTG : .. : : :.. : .: :. : . : . : .:.: . . ::.: KIAA03 LI--VADPVLEPQLIPGPQPLGPQPVHRPNPLLSPVEKRRRGRPPKARDLPIPGTISSAG 2730 2740 2750 2760 2770 2780 1980 1990 2000 2010 KIAA17 HLADSSRGPPAKDPAQ------------ASVGLTADSTGLSGKAVQTQQ------PCSVR . :: : :. :.:. :. .. .: . . .. : : : KIAA03 DGNSESRTQPPPHPSPLTPLPPLLVCPTATVANTVTTVTISTSPPKRKRGRPPKNPPSPR 2790 2800 2810 2820 2830 2840 2020 2030 2040 2050 2060 KIAA17 AS----LSSDICSGLASDGGGAR----GQGWTVYHPTSERVTYKSSSKPRARFLSGPVSV : :. : : : : : : : ::: . ..: ..:.: .:. . . KIAA03 PSQLPVLDRDSTSVLESCGLGRRRQPQGQGESEGSSSDE-----DGSRPLTRLARLRLEA 2850 2860 2870 2880 2890 2070 2080 2090 2100 2110 2120 KIAA17 SIWSALKR---LCLGKEHSSRSSTSSLAPGPEPGPQPALHVQAQVNNSNNKKGTFTDDLH . : . .. ... . ..: : : : :.. . .. .. . :... :. 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KIAA11 KMIRDNLPPRLKNLHKV-SPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVP 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 KIAA17 EEDHGRKSTIALRLWVEDPKKLKGKPKDNGAIEFTFDLEKETPDEVAQEMIESGFFHESD KIAA11 LMRQNRTR 460 2219 residues in 1 query sequences 1985286 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:15:47 2008 done: Thu Dec 18 15:15:50 2008 Total Scan time: 1.140 Total Display time: 0.970 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]