# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/pg00239.fasta.nr -Q ../query/KIAA1728.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1728, 1644 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7807946 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0266+/-0.000197; mu= 12.1753+/- 0.011 mean_var=108.2385+/-20.848, 0's: 32 Z-trim: 148 B-trim: 408 in 1/65 Lambda= 0.123277 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|119631823|gb|EAX11418.1| tetratricopeptide repe (1841) 10817 1936.0 0 gi|166987401|sp|Q9C0D5.2|TANC1_HUMAN RecName: Full (1861) 10817 1936.0 0 gi|109099814|ref|XP_001093114.1| PREDICTED: simila (1696) 10542 1887.0 0 gi|109099812|ref|XP_001093218.1| PREDICTED: simila (1860) 10542 1887.1 0 gi|194222245|ref|XP_001492440.2| PREDICTED: tetrat (1869) 10017 1793.7 0 gi|166987402|sp|Q0VGY8.2|TANC1_MOUSE RecName: Full (1856) 9807 1756.3 0 gi|111598498|gb|AAH79914.1| Tetratricopeptide repe (1856) 9803 1755.6 0 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