# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/pg00239.fasta.huge -Q ../query/KIAA1728.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1728, 1644 aa vs ./tmplib.25089 library 1985861 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9329+/-0.00846; mu= -0.0756+/- 0.574 mean_var=304.1767+/-76.355, 0's: 0 Z-trim: 28 B-trim: 103 in 1/39 Lambda= 0.073538 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1636 ( 1864 res) ff02660 (1864) 5518 600.7 9.4e-172 KIAA1223 ( 1089 res) pg00513 (1089) 606 79.3 5e-15 KIAA1250 ( 1777 res) pf01137 (1777) 402 57.9 2.2e-08 KIAA0379 ( 1059 res) hh00505s1 (1059) 346 51.7 9.8e-07 KIAA1334 ( 989 res) fh15842 ( 989) 322 49.1 5.5e-06 KIAA0396 ( 627 res) hg00180s1 ( 627) 306 47.2 1.3e-05 KIAA1561 ( 1416 res) fh20178s1 (1416) 308 47.8 1.9e-05 KIAA0229 ( 1180 res) ha02570 (1180) 302 47.1 2.7e-05 KIAA1785 ( 617 res) fh12727 ( 617) 293 45.8 3.4e-05 KIAA1977 ( 606 res) fh18284(revised) ( 606) 281 44.5 8.1e-05 KIAA1981 ( 862 res) fk03148(revised) ( 862) 280 44.6 0.00011 KIAA1876 ( 803 res) pf01162s1 ( 803) 275 44.0 0.00015 KIAA0957 ( 693 res) hj05670 ( 693) 264 42.8 0.00031 KIAA0946 ( 667 res) hj04787 ( 667) 262 42.5 0.00035 KIAA1139 ( 1124 res) hk00330 (1124) 261 42.7 0.00053 KIAA1758 ( 1662 res) fh20539(revised) (1662) 264 43.2 0.00055 KIAA0697 ( 2486 res) hk04486s1 (2486) 262 43.2 0.00083 KIAA2015 ( 996 res) fk09763 ( 996) 246 41.0 0.0015 >>KIAA1636 ( 1864 res) ff02660 (1864 aa) initn: 3434 init1: 2827 opt: 5518 Z-score: 3175.3 bits: 600.7 E(): 9.4e-172 Smith-Waterman score: 5574; 52.365% identity (73.138% similar) in 1839 aa overlap (1-1644:47-1864) 10 20 30 KIAA17 TLESKDSGIIATITSSSENDDRSGSSLEWN ::::.:::::::.:: ::: .:. . : . KIAA16 ASSPCSTLPPISTNATAKDCSYGAVTSPTSTLESRDSGIIATLTSYSENVERTKYAGESS 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 KIAA17 KDGSLRLGVQKGVLHDRRADNCSPVAEEETTGSAESTLPKAESSAGDGPVPYSQGSSSL- :. . ... . :.: ..:. :.:. : : : . . : : : KIAA16 KELGSGGNIKPWQSQKSSMDSCLYRVDENMTASTYS-LNKIPERNLETVLSQSVQSIPLY 80 90 100 110 120 130 90 100 110 120 130 140 KIAA17 IMPRPNSVAATSSTKLEDLSYLDGQRNAPLRTSIRLPWHNTAGGRAQE-VKARFAPYKPQ .::::::::::::..::::.::: ::..:::::.:.: .. .:.:.:. ...:::::.: KIAA16 LMPRPNSVAATSSAHLEDLAYLDEQRHTPLRTSLRMPRQSMGGARTQQDLRVRFAPYRPP 140 150 160 170 180 190 150 160 170 180 190 200 KIAA17 DILLKPLLFEVPSITTDSVFVGRDWLFHQIEENLRNTELAENRGAVVVGNVGFGKTAIIS :: :::::::::::::.::::::::.::.:. .:.... . :.:.:.:::.::::::::: KIAA16 DISLKPLLFEVPSITTESVFVGRDWVFHEIDAQLQSSNASVNQGVVIVGNIGFGKTAIIS 200 210 220 230 240 250 210 220 230 240 250 260 KIAA17 KLVALSCHGSRMRQIASNSPGSSPKTSDPTQDLHFTPLLSPSSSTSASSTAKTPLGSISA .::::::::.:::::::.:: .::: : ...: :: .: :. :. .... : :. KIAA16 RLVALSCHGTRMRQIASDSPHASPKHVDANREL---PLTQPPSAHSSITSGSCP-GT--P 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 320 KIAA17 ENQRPREDAVKYLASKVVAYHYCQADNTYTCLVPEFVHSIAALLCRSHQLAAYRDLLIKE : .: .:.:.. :::.:::::::::::.::::::::::..::::::: ::.:::. :..: KIAA16 EMRRRQEEAMRRLASQVVAYHYCQADNAYTCLVPEFVHNVAALLCRSPQLTAYREQLLRE 310 320 330 340 350 360 330 340 350 360 370 380 KIAA17 PQLQSMLSLRSCVQDPVAAFKRGVLEPLTNLRNEQKIPEEEYIILIDGLNEAEFHKPDYG :.::::::::::::::.:.:.::::::: ::..:.:::.:..:::::::::::::::::: KIAA16 PHLQSMLSLRSCVQDPMASFRRGVLEPLENLHKERKIPDEDFIILIDGLNEAEFHKPDYG 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 440 KIAA17 DTLSSFITKIISKFPAWLKLIVTVRANFQEIISALPFVKLSLDDFPDNKDIHSDLHAYVQ ::. ::..:.:.:::.:::::::::...::: . ::: .. :: . .:. : .::.::. KIAA16 DTIVSFLSKMIGKFPSWLKLIVTVRTSLQEITKLLPFHRIFLDRLEENEAIDQDLQAYIL 430 440 450 460 470 480 450 460 470 480 490 500 KIAA17 HRVHSSQDILSNISLNGKADATLIGKVSSHLVLRSLGSYLYLKLTLDLFQRGHLVIKSAS ::.:::..: .::::::: : : .::.:::: : :::::::::.::...:.::.::.: KIAA16 HRIHSSSEIQNNISLNGKMDNTTFGKLSSHLKTLSQGSYLYLKLTFDLIEKGYLVLKSSS 490 500 510 520 530 540 510 520 530 540 550 560 KIAA17 YKVVPVSLSELYLLQCNMKFMTQSAFERALPILNVALASLHPMTDEQIFQAINAGHIQGE ::::::::::.::::::::: :::.:.:..:.::::.:::::.:::.:::::::: :.: KIAA16 YKVVPVSLSEVYLLQCNMKFPTQSSFDRVMPLLNVAVASLHPLTDEHIFQAINAGSIEGT 550 560 570 580 590 600 570 580 590 600 610 620 KIAA17 QGWEDFQQRMDALSCFLIKRRDKTRMFCHPSFREWLVWRADGENTAFLCEPRNGHALLAF ::::::::. :: ::::::: :::: ::::::::.:: .::.: :::.::.::.:::: KIAA16 LEWEDFQQRMENLSMFLIKRRDMTRMFVHPSFREWLIWREEGEKTKFLCDPRSGHTLLAF 610 620 630 640 650 660 630 640 650 660 670 680 KIAA17 MFSRQEGKLNRQQTMELGHHILKAHIFKGLSKKTGISSSHLQALWIGYSTEGLSAALASL :::::::::::::.::::::::::::::::::.:.::: ::.:::.::::::: ::::: KIAA16 WFSRQEGKLNRQQTIELGHHILKAHIFKGLSKKVGVSSSILQGLWISYSTEGLSMALASL 670 680 690 700 710 720 690 700 710 720 730 740 KIAA17 RNLYTPNVKVSRLLILGGANVNYRTEVLNNAPILCVQSHLGHEEVVTLLLEFGACLDGTS :::::::.::::::::::::.::::::::::::::::::::. :.:.::::::: .:..: KIAA16 RNLYTPNIKVSRLLILGGANINYRTEVLNNAPILCVQSHLGYTEMVALLLEFGANVDASS 730 740 750 760 770 780 750 760 770 780 790 800 KIAA17 ENGMTALCYAAAAGHMKLVCLLTKKGVRVDHLDKKGQCALVHSALRGHGDILQYLLTCEW :.:.: : ::::::....: :: :: ..::::::.:::::::.::::: .....:. :.: KIAA16 ESGLTPLGYAAAAGYLSIVVLLCKKRAKVDHLDKNGQCALVHAALRGHLEVVKFLIQCDW 790 800 810 820 830 840 810 820 830 840 850 860 KIAA17 SPGPPQPGTLRKSHALQQALTAAASMGHSSVVQCLLGM-EK-EHEVE---VNGTDTLWGE . . : :...::::.:::: ::::::.. .:. :: . :: :.::: .:. :.:::: KIAA16 TMAGQQQGVFKKSHAIQQALIAAASMGYTEIVSYLLDLPEKDEEEVERAQINSFDSLWGE 850 860 870 880 890 900 870 880 890 900 910 920 KIAA17 TALTAAAGRGKLEVCELLLGHGAAVSRTNRRGVPPLFCAARQGHWQIVRLLLERGCDVNL :::::::::::::::.::: .::::.. ::::. ::: ..:::::::: ::: .: :::. KIAA16 TALTAAAGRGKLEVCRLLLEQGAAVAQPNRRGAVPLFSTVRQGHWQIVDLLLTHGADVNM 910 920 930 940 950 960 930 940 950 960 970 980 KIAA17 SDKQGRTPLMVAACEGHLSTVEFLLSKGAALSSLDKEGLSALSWACLKGHRAVVQYLVEE .:::::::::.:: ::::.::.:::..::... .:::::.:::::::::: .::. ::.. KIAA16 ADKQGRTPLMMAASEGHLGTVDFLLAQGASIALMDKEGLTALSWACLKGHLSVVRSLVDN 970 980 990 1000 1010 1020 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA17 GAAIDQTDKNGRTPLDLAAFYGDAETVLYLVEKGAVIEHVDHSGMRPLDRAIGCRNTSVV ::: :..::::::::::::::::::.: .::..::.:::::.:::::::::.:::::::: KIAA16 GAATDHADKNGRTPLDLAAFYGDAEVVQFLVDHGAMIEHVDYSGMRPLDRAVGCRNTSVV 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA17 VALLRKGAKLGNAAWAMATSKPDILIILLQKLMEEGNVMYKKGKMKEAAQRYQYALRKFP :.::.::::.: :.::::::::::.::::.::::::...:::::.:::::::::::.::: KIAA16 VTLLKKGAKIGPATWAMATSKPDIMIILLSKLMEEGDMFYKKGKVKEAAQRYQYALKKFP 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA17 REGFGEDMRPFNELRVSLYLNLSRCRRKTNDFGMAEEFASKALELKPKSYEAFYARARAK :::::::.. : ::.::: ::::::::: ::::::::::.::::::::::::.::::::: KIAA16 REGFGEDLKTFRELKVSLLLNLSRCRRKMNDFGMAEEFATKALELKPKSYEAYYARARAK 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1170 1180 1190 1200 1210 1220 KIAA17 RNSRQFVAALADLQEAVKLCPTNQEVKRLLARVEEECKQLQRSQQQKQQGPLPAPLNDSE :.::::.::: ::.::.::::.:.:..::: ::::::.:. :: :: : : ... KIAA16 RSSRQFAAALEDLNEAIKLCPNNREIQRLLLRVEEECRQM----QQPQQPPPPPQPQQQL 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1230 1240 1250 1260 KIAA17 NEEDTPTPGLSDHFHSEETEEEETSPQE-ESVS--------PT---PRSQ-PSSSVP--- :: : : : . .. ::: :. :.:: :. : : : :: : KIAA16 PEEAEPEPQHEDIYSVQDIFEEEYLEQDVENVSIGLQTEARPSQGLPVIQSPPSSPPHRD 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1270 1280 1290 1300 1310 1320 KIAA17 SSYIRNLQEGLQSKGRPVSPQSRAGIGKSLREPVAQPGLLLQPSKQAQIVKTSQHLGSGQ :.:: . : . . . .: ...:. :. . . :.:..: . . : : KIAA16 SAYISSSPLG---SHQVFDFRSSSSVGSPTRQTYQSTSPALSPTHQNSHYRPSPPHTS-- 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1330 1340 1350 1360 1370 KIAA17 SAVRNGSMKVQ---ISSQ-----NPPPSPM---PGRIAAAPAGSRTQHLEGTGT---FTT : ..::.. . ...: .:::::. : :. :: : . . .:. . KIAA16 PAHQGGSYRFSPPPVGGQGKEYPSPPPSPLRRGPQYRASPPAESMSVYRSQSGSPVRYQQ 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1380 1390 KIAA17 RAGCGHFGDR----LG----------------PSQNVRLQCGE------NGP-------- ... ... : :. :.:..::: .. : : KIAA16 ETSVSQLPGRPKSPLSKMAQRPYQMPQLPVAVPQQGLRLQPAKAQIVRSNQPSPAVHSST 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1400 1410 1420 KIAA17 ----------AHPLPSKTKTTE--------RLLSHSSVA--VDAAPPNQ----------- :: . :: .... ::. ..:.. : . : : KIAA16 VIPTGAYGQVAHSMASKYQSSQGDIGVSQSRLVYQGSIGGIVGDGRPVQHVQASLSAGAI 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1430 1440 1450 KIAA17 ---GGLATCSDVRHPASL--------------------------------TSSGSSGSPS :::. . ..:.: ::.. :::. KIAA16 CQHGGLTKEDLPQRPSSAYRGGVRYSQTPQIGRSQSASYYPVCHSKLDLERSSSQLGSPD 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1460 1470 KIAA17 SS-------------------------------IKMSSSTSSLTSSSSFSDGFK----VQ : ...: :..:..:.:... :. .: KIAA16 VSHLIRRPISVNPNEIKPHPPTPRPLLHSQSVGLRFSPSSNSISSTSNLTPTFRPSSSIQ 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1480 1490 1500 1510 1520 KIAA17 GPDTRIK-------DKV--VTHVQSG--TAEHRPRNTPFMGIMDKTARFQQQSN--PPSR . .: :.. :. .:.: . : :.::::::.::::: :: . .: KIAA16 QMEIPLKPAYERSCDELSPVSPTQGGYPSEPTRSRTTPFMGIIDKTARTQQYPHLHQQNR 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1530 1540 1550 1560 1570 KIAA17 SWHCPAPEGLLTNTSSAAGLQSANTEKPSLMQVGGYNNQAKTCSVSTLSA----SVH--- .: . . .:. :: . : . :: .. .. :.... . . : : : KIAA16 TWAVSSVDTVLSPTSPGNLPQPESFSPPSSISNIAFYNKTNNAQNGHLLEDDYYSPHGML 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1580 1590 1600 1610 1620 1630 KIAA17 -NGAQVKELEESKCQIPVHSQENRITKT--VSHLYQESISKQQPHISNEAHRSHLTAAKP ::.. .: : : . . ....: :.. ::... .: .: ...... . :: KIAA16 ANGSR-GDLLERVSQASSYP-DVKVARTLPVAQAYQDNLYRQ---LSRDSRQGQTSPIKP 1810 1820 1830 1840 1850 1640 KIAA17 KRSFIESNV :: :.:::: KIAA16 KRPFVESNV 1860 >>KIAA1223 ( 1089 res) pg00513 (1089 aa) initn: 555 init1: 455 opt: 606 Z-score: 361.7 bits: 79.3 E(): 5e-15 Smith-Waterman score: 799; 25.887% identity (54.521% similar) in 1128 aa overlap (528-1618:1-1015) 500 510 520 530 540 550 KIAA17 QRGHLVIKSASYKVVPVSLSELYLLQCNMKFMTQSAFERALPILNVALASLHPMTDEQIF ..... : .. ::::: ::. .:.: ... KIAA12 LFVRKQFAKVQPILNVILAACRPLTITELY 10 20 30 560 570 580 590 600 610 KIAA17 QAINAGHIQGEQGWEDFQQRMDALSCFLIKRRDKTRMFCHPSFREWLVWRADGENTAFLC .:. . ... ::::...: :: .:. .:... : :: :::. . . .:: KIAA12 HAVWTKNMS--LTLEDFQRKLDILSKLLVDGLGNTKILFHYSFAEWLL-DVKHCTQKYLC 40 50 60 70 80 620 630 640 650 660 670 KIAA17 EPRNGHALLAFMFSRQEGKLNRQQTMELGHHILKAHIFKGLSKKTGISSSHLQALWIGYS . .:: .::. .. : .:. ...:.. :...... . ...: :::. .. KIAA12 NAAEGHRMLAMSYTCQAKNLTPLEAQEFALHLINSNL--------QLETAEL-ALWMIWN 90 100 110 120 130 680 690 700 710 720 730 KIAA17 TEGLSAALASLRNLYTPNVKVSRLLILGGANVNYRTEVLNNAPILC-VQSHLGHEEVVTL : . . :: .: . .: .::. .::.:: . . . : :.. : .:. . KIAA12 --G-TPVRDSLSTLIPKEQEVLQLLVKAGAHVNSEDDRTS-----CIVRQALEREDSIRT 140 150 160 170 180 190 740 750 760 770 780 790 KIAA17 LLEFGACLDGTSENGMTALCYAAAAGHMKLVCLLTKKGVRVDHLDKKGQCALVHSALRGH ::. :: .. . :: : : :: .: . .: ::...:. .. : .:. :. .: .:: KIAA12 LLDNGASVNQCDSNGRTLLANAAYSGSLDVVNLLVSRGADLEIEDAHGHTPLTLAARQGH 200 210 220 230 240 250 800 810 820 830 840 850 KIAA17 GDILQYLLTCEWSPG-PPQPGTLRKSHALQQALTAAASMGHSSVVQCLLGMEKEHEVEVN ... :. : . . : : :: .:: ::. ::. :: :.:. KIAA12 TKVVNCLIGCGANINHTDQDG--------WTALRSAAWGGHTEVVSALLYA----GVKVD 260 270 280 290 860 870 880 890 900 910 KIAA17 GTDTLWGETALTAAAGRGKLEVCELLLGHGAAVSRTNRRGVPPLFCAARQGHWQIVRLLL .:. ..:.: ::: :. .. :: ::: :.... .: :. :: .:: .::. :: KIAA12 CADAD-SRTVLRAAAWGGHEDIVLNLLQHGAEVNKADNEGRTALIAAAYMGHREIVEHLL 300 310 320 330 340 350 920 930 940 950 960 970 KIAA17 ERGCDVNLSDKQGRTPLMVAA-C----EGHLSTVEFLLSKGAALSSLDKEGLSALSWACL ..: .:: : .::: : ::: : .:: :.: .:...:: .. ::.:.. : : KIAA12 DHGAEVNHEDVDGRTALSVAALCVPASKGHASVVSLLIDRGAEVDHCDKDGMTPLLVAAY 360 370 380 390 400 410 980 990 1000 1010 1020 1030 KIAA17 KGHRAVVQYLVEEGAAIDQTDKNGRTPLDLAAFYGDAETVLYLVEKGAVIEHVDHSGMRP .:: ::. :.: :: .:.::.:::::: :: .: : .: :. ::... .: : KIAA12 EGHVDVVDLLLEGGADVDHTDNNGRTPLLAAASMGHASVVNTLLFWGAAVDSIDSEGRTV 420 430 440 450 460 470 1040 1050 1060 1070 1080 KIAA17 LDRAIGCRNTSVVVALLRKG---AKLGNAAWA---MATSKPDILIILLQKLMEEG---NV :. : . :. :: .:: .: . .:.:. ::. . :: . :.:.: : KIAA12 LSIASAQGNVEVVRTLLDRGLDENHRDDAGWTPLHMAAFEGHRLIC--EALIEQGARTNE 480 490 500 510 520 530 1090 1100 1110 1120 1130 KIAA17 MYKKGKMKE--AAQRYQYALRKFPREGFGE-DMRPFNELRVSLYLNLSRCRRKTND--FG . . :.. :.:. .: .. :. .. :.: .. : .: . . .: . :. KIAA12 IDNDGRIPFILASQEGHYDCVQILLENKSNIDQRGYDG-RNALRVAALEGHRDIVELLFS 540 550 560 570 580 590 1140 1150 1160 1170 1180 1190 KIAA17 MAEEFASKALELKPKSYEAFYARARAKRNSRQFVAALADLQEAVKLCPTNQEVKRLLARV . . : . .: : : .: :.. : :...... .. : . : KIAA12 HGADVNCKDADGRPTLY------ILALEN--QLTMAEYFLENGANVEASDAEGRTAL--- 600 610 620 630 640 1200 1210 1220 1230 1240 1250 KIAA17 EEECKQLQRSQQQKQQGPLPAPLNDSENEEDTPTPGLSDHFHSEETEEEETSPQEESVSP . : : . . : . : .: ..::. . . . . : . .. .. .: KIAA12 HVSCWQGHMEMVQVLIA-YHADVNAADNEKRSALQSAAWQGHVKVVQ---LLIEHGAVVD 650 660 670 680 690 1260 1270 1280 1290 1300 1310 KIAA17 TPRSQPSSSVPSSYIRNLQEGLQSKGRPVSPQSRAGIGKSLREPVAQPGLLLQPSKQAQI .: .... . ::: . . . : : :.:. : .. :. KIAA12 HTCNQGATALCIAA----QEG------------HIDVVQVLLEHGADPNHADQFGRTAMR 700 710 720 730 740 1320 1330 1340 1350 1360 1370 KIAA17 VKTSQHLGSGQSAVRNGSMKVQISSQNP-PPSPMPGRIAAAPAGSRTQHLEGTGTFTTRA : .. .:.: . . : :: : :::. . : : ...... .. . KIAA12 VAAK----NGHSQIIKLLEKYGASSLNGCSPSPVH-TMEQKPLQSLSSKVQSLTIKSNSS 750 760 770 780 790 1380 1390 1400 1410 1420 1430 KIAA17 GCGHFGDRLGPSQNVRLQCGENGPAHPLPSKTKTTERLLSHSSVAVDAAPPNQGGLATCS : :: . :: :. :::.: . : ... . .:: KIAA12 GSTGGGD-MQPS----LRGLPNGPTHAFSSPSESPDS-------TVD------------- 800 810 820 830 1440 1450 1460 1470 1480 1490 KIAA17 DVRHPASLTSSGSSGSPSSSIKMSSSTSSLTSSSSFSDGFKVQGPDTRIKDKVVTHVQSG :. .::.... ..: .::.. .:::. :... :.:. . .:... . . .: KIAA12 --RQKSSLSNNSLKSSKNSSLRTTSSTA--TAQTVPIDSFHNLSFTEQIQQHSLPRSRSR 840 850 860 870 880 1500 1510 1520 1530 1540 1550 KIAA17 TAEHRPRNTPFMGIMDKTARFQQQSNPPSRS--WHCPAPEGLLTNTSSAAGLQSANTEKP . : .: : . :. : :: : : : .:... : .: :. : KIAA12 QSIVSPSST--------TQSLGQSHNSPSSEFEWSQVKPS--LKSTKASKGGKSENSAKS 890 900 910 920 930 1560 1570 1580 1590 1600 KIAA17 SLMQVGGYNNQAKTCSVSTLS------------ASVHNGAQVKELE-ESKCQIPVHSQEN . ..: .:... . ..: :. ..: :.. ::.:.: . : .. KIAA12 G--SAGKKAKQSNSSQPKVLEYEMTQFDRRGPIAKSGTAAPPKQMPAESQCKIMIPSAQQ 940 950 960 970 980 990 1610 1620 1630 1640 KIAA17 RITKTVSHLYQESISKQQPHISNEAHRSHLTAAKPKRSFIESNV .: .. ... .. : .: KIAA12 EIGRSQQQFLIHQQSGEQKKRNGIMTNPNYHLQSNQVFLGRVSVPRTMQDRGHQEVLEGY 1000 1010 1020 1030 1040 1050 >>KIAA1250 ( 1777 res) pf01137 (1777 aa) initn: 581 init1: 370 opt: 402 Z-score: 242.2 bits: 57.9 E(): 2.2e-08 Smith-Waterman score: 508; 30.025% identity (59.057% similar) in 403 aa overlap (695-1090:23-411) 670 680 690 700 710 720 KIAA17 SSSHLQALWIGYSTEGLSAALASLRNLYTPNVKVSRLLILGGANVNYRTEVLNNAPILCV :. . . :. .:. :.: ...:.. . KIAA12 LQLSVKMSVLISQSVINYVEEENIPALKALLEKCKDVDERNEC-GQTPLM-I 10 20 30 40 50 730 740 750 760 770 780 KIAA17 QSHLGHEEVVTLLLEFGACLDGTSENGMTALCYAAAAGHMKLVCLLTKKGVRVDHLDKKG .. :. :.: :.. :: . . .. ::: :. ::...: : : :: ..: : : KIAA12 AAEQGNLEIVKELIKNGANCNLEDLDNWTALISASKEGHVHIVEELLKCGVNLEHRDMGG 60 70 80 90 100 110 790 800 810 820 830 840 KIAA17 QCALVHSALRGHGDILQYLLTCEWSPGPPQPGTLRKSHALQQALTAAASMGHSSVVQCLL ::. . .:. :... ::. .: .. ... . ::. ::...:. :: KIAA12 WTALMWACYKGRTDVVELLLSHGANP------SVTGLYSVYPIIWAAGR-GHADIVHLLL 120 130 140 150 160 850 860 870 880 890 900 KIAA17 GMEKEHEVEVNGTDTLWGETALTAAAGRGKLEVCELLLGHGAAVSRTNRRGVPPLFCAAR .. ..:: .: .: : :. :: .:.:: . ::. :: :.. . .. :. :.. KIAA12 ----QNGAKVNCSDK-YGTTPLVWAARKGHLECVKHLLAMGADVDQEGANSMTALIVAVK 170 180 190 200 210 910 920 930 940 950 960 KIAA17 QGHWQIVRLLLERGCDVNLSDKQGRTPLMVAACEGHLSTVEFLLSKGAALSSLDKEGLSA :. : :. .:.:. .:::.::.: : ::.:. ::: :. ::. :. .. :. : .. KIAA12 GGYTQSVKEILKRNPNVNLTDKDGNTALMIASKEGHTEIVQDLLDAGTYVNIPDRSGDTV 220 230 240 250 260 270 970 980 990 1000 1010 1020 KIAA17 LSWACLKGHRAVVQYLVEEGAAIDQTDKNGRTPLDLAAFYGDAETVLYLVEKGAVIEHVD : : :: .:. :... : :: ....: : :. :.: : ... . : KIAA12 LIGAVRGGHVEIVRALLQKYADIDIRGQDNKTALYWAVEKGNATMVRDILQCNPDTEICT 280 290 300 310 320 330 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA17 HSGMRPLDRAIGCRNTSVVVALLRKGAKL------GNAAWAMAT-SKPDILIILLQKLME ..: :: .: :: :: :: ::::. :.. .: .. : :: . . KIAA12 KDGETPLIKATKMRNIEVVELLLDKGAKVSAVDKKGDTPLHIAIRGRSRKLAELLLRNPK 340 350 360 370 380 390 1080 1090 1100 1110 1120 1130 KIAA17 EGNVMYKKGKMKEAAQRYQYALRKFPREGFGEDMRPFNELRVSLYLNLSRCRRKTNDFGM .: ..:. .: : KIAA12 DGRLLYRPNKAGETPYNIDCSHQKSILTQIFGARHLSPTETDGDMLGYDLYSSALADILS 400 410 420 430 440 450 >>KIAA0379 ( 1059 res) hh00505s1 (1059 aa) initn: 573 init1: 305 opt: 346 Z-score: 212.8 bits: 51.7 E(): 9.8e-07 Smith-Waterman score: 453; 33.046% identity (56.609% similar) in 348 aa overlap (692-1034:56-385) 670 680 690 700 710 KIAA17 TGISSSHLQALWIGYSTEGLSAALASLRNLYTPNVKVSRLLILGGANVNYRTEV----LN : .... .::::.:: :: . :. KIAA03 DPDEVRALIFKKEDVNFQDNEKRTPLHAAAYLGDAEIIELLILSGARVNAKDSKWLTPLH 30 40 50 60 70 80 720 730 740 750 760 770 KIAA17 NAPILCVQSHLGHEEVVTLLLEFGACLDGTSENGMTALCYAAAAGHMKLVCLLTKKGVRV : : ::.: .::. .: ... ..: .: : ::: .: . :. : KIAA03 RAVASC------SEEAVQVLLKHSADVNARDKNWQTPLHIAAANKAVKCAEALVPLLSNV 90 100 110 120 130 780 790 800 810 820 830 KIAA17 DHLDKKGQCALVHSALRGHGDILQYLLTCEWSPGPPQPGTLRKSHALQQALTAAASMGHS . :. :. :: :.:. :::.... :: : : . .:. ..:. :: ::: KIAA03 NVSDRAGRTALHHAAFSGHGEMVKLLL----SRGANINAFDKKD---RRAIHWAAYMGHI 140 150 160 170 180 190 840 850 860 870 880 890 KIAA17 SVVQCLLGMEKEHEVEVNGTDTLWGETALTAAAGRGKLEVCELLLGHGAAVSRTNRRGVP ::. :.. : .::. : . : : :::. : . : . :: :. ... : : KIAA03 EVVKLLVS----HGAEVTCKDKK-SYTPLHAAASSGMISVVKYLLDLGVDMNEPNAYGNT 200 210 220 230 240 900 910 920 930 940 950 KIAA17 PLFCAARQGHWQIVRLLLERGCDVNLSDKQGRTPLMVAACEGHLST-VEFLLSKGAALSS :: : .:. .: :.. : :: ....: ::: :: : . .:.:...:: .. KIAA03 PLHVACYNGQDVVVNELIDCGAIVNQKNEKGFTPLHFAAASTHGALCLELLVGNGADVNM 250 260 270 280 290 300 960 970 980 990 1000 1010 KIAA17 LDKEGLSALSWACLKGHRAVVQYLVEEGAAIDQTDKNGRTPLDLAAFYGDAETVLYLVEK .:.: . : . :.:. . : ... ::.:: :::: ::: .:: :: . :. . KIAA03 KSKDGKTPLHMTALHGRFSRSQTIIQSGAVIDCEDKNGNTPLHIAARYGHELLINTLITS 310 320 330 340 350 360 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA17 GAVIEHVDHSGMRPLDRAIGCRNTSVVVALLRKGAKLGNAAWAMATSKPDILIILLQKLM :: . :: :: : KIAA03 GADTAKRGIHGMFPLHLAALSGFSDCCRKLLSSGFDIDTPDDFGRTCLHAAAAGGNLECL 370 380 390 400 410 420 >>KIAA1334 ( 989 res) fh15842 (989 aa) initn: 684 init1: 309 opt: 322 Z-score: 199.3 bits: 49.1 E(): 5.5e-06 Smith-Waterman score: 322; 29.730% identity (59.910% similar) in 222 aa overlap (828-1049:32-249) 800 810 820 830 840 850 KIAA17 DILQYLLTCEWSPGPPQPGTLRKSHALQQALTAAASMGHSSVVQCLLGMEKEHEVEVNGT : :. : . : ::: . .. .. KIAA13 FGRLNALNMKSLKAKFRKSDTNEWNKNDDRLLQAVENGDAEKVASLLGKKGASATKHDSE 10 20 30 40 50 60 860 870 880 890 900 910 KIAA17 DTLWGETALTAAAGRGKLEVCELLLGHGAAVSRTNRRGVPPLFCAARQGHWQIVRLLLER :.::. ::..:..: .... ::. :. . : : ::...: . .: ::. KIAA13 ----GKTAFHLAAAKGHVECLRVMITHGVDVTAQDTTGHSALHLAAKNSHHECIRKLLQS 70 80 90 100 110 920 930 940 950 960 970 KIAA17 GCDVNLSDKQGRTPLMVAACEGHLSTVEFLLSKGAALSSLDKEGLSALSWACLKGHRAVV : .. :..:.: : :: .: :..:..: . . .. : .: : : .:: . KIAA13 KCPAESVDSSGKTALHYAAAQGCLQAVQILCEHKSPINLKDLDGNIPLLLAVQNGHSEIC 120 130 140 150 160 170 980 990 1000 1010 1020 1030 KIAA17 QYLVEEGAAIDQTDKNGRTPLDLAAFYGDAETVLYLVEKGAVIEHVDHSGMRPLDRAIGC ..:...:: ... .:.::: : :: :....: :..::: .. :: :. : . KIAA13 HFLLDHGADVNSRNKSGRTALMLACEIGSSNAVEALIKKGADLNLVDSLGYNALHYSKLS 180 190 200 210 220 230 1040 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA17 RNTSVVVALLRKGAKLGNAAWAMATSKPDILIILLQKLMEEGNVMYKKGKMKEAAQRYQY .:... :: : KIAA13 ENAGIQSLLLSKISQDADLKTPTKPKQHDQVSKISSERSGTPKKRKAPPPPISPTQLSDV 240 250 260 270 280 290 >>KIAA0396 ( 627 res) hg00180s1 (627 aa) initn: 391 init1: 256 opt: 306 Z-score: 192.5 bits: 47.2 E(): 1.3e-05 Smith-Waterman score: 314; 30.337% identity (58.052% similar) in 267 aa overlap (828-1085:50-294) 800 810 820 830 840 850 KIAA17 DILQYLLTCEWSPGPPQPGTLRKSHALQQALTAAASMGHSSVVQCLLGMEKEHEVEVNGT : :: ::..::. :: ....:... : KIAA03 LAALLLNRSESDIRYLLGYVSQQGGQRSTPLIIAARNGHAKVVRLLL---EHYRVQTQQT 20 30 40 50 60 70 860 870 880 890 900 910 KIAA17 DTLW-------GETALTAAAGRGKLEVCELLLGHGAAVSRTNRRGVPPLFCAARQGHWQI :. : ::: ::: :..:: .::..::: :..:. . :: : .:. .: KIAA03 GTVRFDGYVIDGATALWCAAGAGHFEVVKLLVSHGANVNHTTVTNSTPLRAACFDGRLDI 80 90 100 110 120 130 920 930 940 950 960 970 KIAA17 VRLLLERGCDVNLSDKQGRTPLMVAACEGHLSTVEFLLSKGAALSSLDKEGLSALSWACL :. :.: . ......: : ::.:: .:: ..:..:: . : .. . : .:: .: KIAA03 VKYLVENNANISIANKYDNTCLMIAAYKGHTDVVRYLLEQRADPNAKAHCGATALHFAAE 140 150 160 170 180 190 980 990 1000 1010 1020 1030 KIAA17 KGHRAVVQYLVEEGAAIDQTDKNGRTPLDLAAFYGDAETVLYLVEKGAVIEHVDHSGMRP :: .:. :.. ::: .. .: ::: .:: :..: : . :.: KIAA03 AGHIDIVKELIKWRAAI-VVNGHGMTPLKVAAESCKADVVELL------LSHAD------ 200 210 220 230 240 1040 1050 1060 1070 1080 KIAA17 LDRAIGCRNTSVVVALLRKGAKLGN--AAWAMATSKPDILIILLQKLMEEGNVMYKKGKM : : . :: ::...: . . . . . .:..... :.. :. KIAA03 ------CDRRSRIEALELLGASFANDRENYDIIKTYHYLYLAMLERFQDGDNILEKEVLP 250 260 270 280 290 1090 1100 1110 1120 1130 1140 KIAA17 KEAAQRYQYALRKFPREGFGEDMRPFNELRVSLYLNLSRCRRKTNDFGMAEEFASKALEL KIAA03 PIHAYGNRTECRNPQELESIRQDRDALHMEGLIVRERILGADNIDVSHPIIYRGAVYADN 300 310 320 330 340 350 >>KIAA1561 ( 1416 res) fh20178s1 (1416 aa) initn: 460 init1: 255 opt: 308 Z-score: 189.5 bits: 47.8 E(): 1.9e-05 Smith-Waterman score: 308; 26.133% identity (55.200% similar) in 375 aa overlap (810-1169:14-375) 780 790 800 810 820 830 KIAA17 LDKKGQCALVHSALRGHGDILQYLLTCEWSPGPPQPGTLRKS-HA-----LQQALTAAAS ::: . :. : :: .. : :: KIAA15 MKSLKSRLRRQDVPGPASSGAAAASAHAADWNKYDDRLMKAAE 10 20 30 40 840 850 860 870 880 890 KIAA17 MGHSSVVQCLLGMEKEHEVEVN-GTDTLWGETALTAAAGRGKLEVCELLLGHGAAVSRTN : : .:. . :: : . :.... .....:.:: . .: ::. .. .. KIAA15 RGDVEKVTSILAKKG-----VNPGKLDVEGRSVFHVVTSKGNLECLNAILIHGVDITTSD 50 60 70 80 90 900 910 920 930 940 950 KIAA17 RRGVPPLFCAARQGHWQIVRLLLERGCDVNLSDKQGRTPLMVAACEGHLSTVEFLLSKGA : : ::. :: .. ::. .: .. .: :::: : :: :....: ..:: KIAA15 TAGRNALHLAAKYGHALCLQKLLQYNCPTEHADLQGRTALHDAAMADCPSSIQLLCDHGA 100 110 120 130 140 150 960 970 980 990 1000 1010 KIAA17 ALSSLDKEGLSALSWACLKGHRAVVQYLVEEGAAIDQTDKNGRTPLDLAAFYGDAETVLY .... : .: . : : .. .. : :...:: ... ::..:: : :. :: ..: KIAA15 SVNAKDVDGRTPLVLATQMSRPTICQLLIDRGADVNSRDKQNRTALMLGCEYGCRDAVEV 160 170 180 190 200 210 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA17 LVEKGAVIEHVDHSGMRPLDRA-IGCRNTSVVVALLRKGAKLGNAAWAMATSKPDILIIL :...:: : .: : : :: .. ...::. ... : . . . :.. KIAA15 LIKNGADISLLDALGHDSSYYARIG--DNLDILTLLKTASENTNKGRELWKKGPSLQQRN 220 230 240 250 260 270 1080 1090 1100 1110 1120 KIAA17 LQKLMEEGNVMYKKGKMKEAAQRYQYALRKFPREGFGEDMRPFN-ELRV------SLYLN : ....: :: :....: : : .. : . : .: .. : :. .: :. KIAA15 LTHMQDEVNV---KSHQREH-QNIQDL--EIENEDLKERLRKIQQEQRILLDKVNGLQLQ 280 290 300 310 320 330 1130 1140 1150 1160 1170 1180 KIAA17 LSRCRRKTNDFGMAEEFASKALELKPKSYEAFYARARAKRNSRQFVAALADLQEAVKLCP :.. ..:. .: .. : : :..: .: .: .. KIAA15 LNEEVMVADDLESEREKLKSLLAAKEKQHEESLRTIEALKNRFKYFESDHLGSGSHFSNR 340 350 360 370 380 390 1190 1200 1210 1220 1230 1240 KIAA17 TNQEVKRLLARVEEECKQLQRSQQQKQQGPLPAPLNDSENEEDTPTPGLSDHFHSEETEE KIAA15 KEDMLLKQGQMYMADSQCTSPGIPAHMQSRSMLRPLELSLPSQTSYSENEILKKELEAMR 400 410 420 430 440 450 >>KIAA0229 ( 1180 res) ha02570 (1180 aa) initn: 513 init1: 181 opt: 302 Z-score: 187.0 bits: 47.1 E(): 2.7e-05 Smith-Waterman score: 305; 32.589% identity (59.821% similar) in 224 aa overlap (743-965:121-330) 720 730 740 750 760 770 KIAA17 TEVLNNAPILCVQSHLGHEEVVTLLLEFGACLDGTSENGMTALCYAAAAGHMKLVCLLTK :.:.: :.: : .:: :: .: .: . KIAA02 GGSGGGGGGLGSSSHPLSSLLSMWRGPNVNCVDST---GYTPLHHAALNGHKDVVEVLLR 100 110 120 130 140 780 790 800 810 820 830 KIAA17 KGVRVDHLDKKGQCALVH-SALRGHGDILQYLLTCEWSPGPPQPGTLRKSHALQQALTAA . . .. :.:: : .: .: .: ..:.. :. :: . . .... . :: : KIAA02 NDALTNVADSKG-CYPLHLAAWKGDAQIVRLLI----HQGPSHTRVNEQNNDNETALHCA 150 160 170 180 190 200 840 850 860 870 880 890 KIAA17 ASMGHSSVVQCLLGMEKEHEVEVNGTDTLWGETALTAAAGRGKLEVCELLLGHGAAVSRT :..::. ::. :: . .. : :: : :: :.::: ..::. . KIAA02 AQYGHTEVVKVLLEELTDPTMRNNKF-----ETPLDLAALYGRLEVVKMLLNAHPNLLSC 210 220 230 240 250 900 910 920 930 940 950 KIAA17 NRRGVPPLFCAARQGHWQIVRLLLERGCDVNLSDKQGRTPLMVAACEGHLSTVEFLLSKG : . :: :::.:: .:..::. : : : . ..: . : :: :. ..:..::. : KIAA02 NTKKHTPLHLAARNGHKAVVQVLLDAGMDSNYQTEMG-SALHEAALFGKTDVVQILLAAG 260 270 280 290 300 310 960 970 980 990 1000 1010 KIAA17 AALSSLDKEGLSALSWACLKGHRAVVQYLVEEGAAIDQTDKNGRTPLDLAAFYGDAETVL . .. :..::.:: KIAA02 TDVNIKDNHGLTALDTVRELPSQKSQQIAALIEDHMTGKRSTKEVDKTPPPQPPLISSMD 320 330 340 350 360 370 >>KIAA1785 ( 617 res) fh12727 (617 aa) initn: 609 init1: 244 opt: 293 Z-score: 185.1 bits: 45.8 E(): 3.4e-05 Smith-Waterman score: 333; 31.878% identity (60.262% similar) in 229 aa overlap (824-1043:3-230) 800 810 820 830 840 850 KIAA17 RGHGDILQYLLTCEWSPGPPQPGTLRKSHALQQALTAAASMGHSSVVQCLLGMEKEHEVE :. :. :: :. .. ::. ....:: KIAA17 MDLKTAVFNAARDGKLRLLTKLLASKSKEEVS 10 20 30 860 870 880 890 900 KIAA17 VNGTDTLWGETALTAAAGRGKLEVCELLLGH-------GAAVSRTNR--RGVPPLFCAAR .. : : : :: :.:.. :.:: . :..:. .. .:.:::. :. KIAA17 SLISEKTNGATPLLMAARYGHLDMVEFLLEQCSASIEVGGSVNFDGETIEGAPPLWAASA 40 50 60 70 80 90 910 920 930 940 950 960 KIAA17 QGHWQIVRLLLERGCDVNLSDKQGRTPLMVAACEGHLSTVEFLLSKGAALSSLDKEGLSA :: ..:. ::..: .:: . . ::: .: .::: :..:. . : : ...: . KIAA17 AGHLKVVQSLLNHGASVNNTTLTNSTPLRAACFDGHLEIVKYLVEHKADLEVSNRHGHTC 100 110 120 130 140 150 970 980 990 1000 1010 1020 KIAA17 LSWACLKGHRAVVQYLVEEGAAIDQTDKNGRTPLDLAAFYGDAETVLYLVEKGAVIEHVD : .: :::. ..:::.:.:: ... . .: : : : :. . . .:. : .:. : KIAA17 LMISCYKGHKEIAQYLLEKGADVNRKSVKGNTALHDCAESGSLDIMKMLLMYCAKMEK-D 160 170 180 190 200 210 1030 1040 1050 1060 1070 1080 KIAA17 HSGMRPLDRAIGCRNTSVVVALLRKGAKLGNAAWAMATSKPDILIILLQKLMEEGNVMYK :: :: : .:..: KIAA17 GYGMTPLLSASVTGHTNIVDFLTHHAQTSKTERINALELLGATFVDKKRDLLGALKYWKK 220 230 240 250 260 270 >>KIAA1977 ( 606 res) fh18284(revised) (606 aa) initn: 362 init1: 217 opt: 281 Z-score: 178.3 bits: 44.5 E(): 8.1e-05 Smith-Waterman score: 281; 36.810% identity (59.509% similar) in 163 aa overlap (888-1047:12-171) 860 870 880 890 900 910 KIAA17 DTLWGETALTAAAGRGKLEVCELLLGHGAAVSRTNRRGVPPLFCAARQGHWQIVRLLLER ... : : ::. :. :: ::.:::: KIAA19 HILRLFRRELDLNKKNGGGWTPLMYASYIGHDTIVHLLLEA 10 20 30 40 920 930 940 950 960 970 KIAA17 GCDVNLSDKQGRTPLMVAACEGHLSTVEFLLSKGAALSSLDKEGLSALSWACLKGHRAVV : .::. .:.::::.:. :. : . :::..:: : : .: .:: ::. .: KIAA19 GVSVNVPTPEGQTPLMLASSCGNESIAYFLLQQGAELEMKDIQGWTALFHCTSAGHQHMV 50 60 70 80 90 100 980 990 1000 1010 1020 1030 KIAA17 QYLVEEGAAIDQTDK-NGRTPLDLAAFYGDAETVLYLVEKGAVIEHVDHSGM--RPLDRA ..:.. :: . . : ::: :: : : :....:. .. :::: : : . KIAA19 RFLLDSGANANVREPICGFTPLMEAAAAGHEIIVQYFLNHGVKVDARDHSGATARMLAKQ 110 120 130 140 150 160 1040 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA17 IGCRNTSVVVALLRKGAKLGNAAWAMATSKPDILIILLQKLMEEGNVMYKKGKMKEAAQR : . .:::. KIAA19 YGHMK---IVALMDTYSPSLPKSLYRSPEKYEDLSSSDESCPAPQRQRPCRKKGVSIHEG 170 180 190 200 210 1644 residues in 1 query sequences 1985861 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:14:34 2008 done: Thu Dec 18 15:14:35 2008 Total Scan time: 0.900 Total Display time: 0.580 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]