# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/pf00881.fasta.huge -Q ../query/KIAA1723.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1723, 1554 aa vs ./tmplib.25089 library 1985951 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7057+/-0.00681; mu= 4.4480+/- 0.462 mean_var=172.8471+/-41.026, 0's: 0 Z-trim: 20 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.097554 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0189 ( 1132 res) ha02928 (1132) 2585 377.1 1.1e-104 KIAA1314 ( 681 res) fh12718 ( 681) 294 54.5 8.3e-08 KIAA0131 ( 942 res) ha01235 ( 942) 293 54.5 1.2e-07 KIAA0672 ( 824 res) hk02382 ( 824) 289 53.9 1.6e-07 KIAA1722 ( 1499 res) pf00674s1 (1499) 287 53.8 3e-07 KIAA0013 ( 1086 res) ha00450s1 (1086) 279 52.6 5.1e-07 KIAA1204 ( 1445 res) fg03451 (1445) 281 53.0 5.2e-07 KIAA1424 ( 1944 res) ha06448 (1944) 258 49.8 6.1e-06 KIAA0411 ( 1061 res) hg02120 (1061) 252 48.8 7e-06 KIAA0456 ( 1095 res) hg00633 (1095) 250 48.5 8.7e-06 KIAA0621 ( 753 res) hg04539 ( 753) 244 47.5 1.2e-05 KIAA1501 ( 735 res) hh12863 ( 735) 241 47.1 1.6e-05 KIAA0712 ( 1770 res) hg04169 (1770) 244 47.8 2.2e-05 KIAA1304 ( 1051 res) fh04032 (1051) 225 45.0 9.7e-05 KIAA0782 ( 1281 res) hk05405s1 (1281) 219 44.2 0.0002 KIAA0053 ( 666 res) ha01417 ( 666) 211 42.8 0.00027 KIAA1391 ( 1194 res) hh12985 (1194) 214 43.5 0.00031 KIAA1478 ( 570 res) fj05212 ( 570) 206 42.1 0.00039 >>KIAA0189 ( 1132 res) ha02928 (1132 aa) initn: 2434 init1: 1061 opt: 2585 Z-score: 1971.6 bits: 377.1 E(): 1.1e-104 Smith-Waterman score: 2669; 42.460% identity (63.774% similar) in 1187 aa overlap (476-1552:56-1131) 450 460 470 480 490 500 KIAA17 TDLPSSTPVANSGTKPKTTAIQGISEKEKAEIEAKEACDWLRATGFPQYAQLYEDFLFPI : :::.::.::.:::::::.::.:. ::. 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KIAA01 DKAKKRHRNRSFLKHLESLRRKEKSGSQQAEPKH------SPATSEKVSKA--------- 230 240 250 260 270 750 760 770 780 790 KIAA17 ISALNGNR--INVPMVRKRSVSNSTQTSSSSSQSETSSAVSTPSPVTRTRSLSACNKRVG :.. . : ... . : . : . ::...: ..: .: . ::. : KIAA01 -SSFRSCRGFLSAGFYRAK---NWAATSAGGSGANTRKAWEAW-PVASFRH--------- 280 290 300 310 800 810 820 830 840 850 KIAA17 MYLEGFDPFNQSTFNNVMEQNFKNRESYPEDTVFYIPEDHKPGTFPKALTNGSFSPSGNN : : : . : . ..: ::::::::..:. :. : .. KIAA01 -------P--QWTHRG--------------DCLVHVPGDHKPGTFPRSLSIESLCPEDGH 320 330 340 350 860 870 880 890 900 910 KIAA17 GSVNWRTGSFHGPGHISLRRENSSDSPKELKRRNSSSSMSSRLSIYDNVP------GSIL ..:. :: :: . ::.: .: .:. : :::.: .. 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KIAA01 RDLPEPIFTSKLTTTFLQIYQLLPKDQWLAAAQAATLLLPDENREVLQTLLYFLSDI-AS 760 770 780 790 800 810 1250 1260 1270 1280 1290 1300 KIAA17 VKENQMTPTNLAVCLAPSLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPDQKDLNENLAATQGLA ..::::: :::::::::.::::. :... :::. .... .:.: .::..:.::::::. KIAA01 AEENQMTAGNLAVCLAPSIFHLNVSKKDSPSPRIKSKRSLIGRPGPRDLSDNMAATQGLS 820 830 840 850 860 870 1310 1320 1330 1340 1350 KIAA17 HMIAECKKLFQVPEEM--SRCRNSYTEQELKPLTLEALGHLGNDDSA--DYQHFLQDCVD :::..::::::::..: . : .::. ::.: ::..: . ..: . . .... .. KIAA01 HMISDCKKLFQVPQDMVLQLC-SSYSAAELSP-PGPALAELRQAQAAGVSLSLYMEENIQ 880 890 900 910 920 930 1360 1370 1380 1390 1400 1410 KIAA17 GLFKEVKEKFKGWVSYSTSEQAELSYKKVSEGPPLRLWRSVIEVPAVPEEILKRLLKEQH :.... :.::::.: ...::. .:. .: :::::.. :: : : .:.:.:.:. KIAA01 DLLRDAAERFKGWMSVPGPQHTELACRKAPDGHPLRLWKASTEVAAPPAVVLHRVLRERA 940 950 960 970 980 990 1420 1430 1440 1450 1460 1470 KIAA17 LWDVDLLDSKVIEILDSQTEIYQYVQNSMAPHPARDYVVLRTWRTNLPKGACALLLTSVD ::: ::: ..:.: : .:.:.:: .:::::: ::.:::: ::..::.:.: :. :.: KIAA01 LWDEDLLRAQVLEALMPGVELYHYVTDSMAPHPCRDFVVLRMWRSDLPRGGCLLVSQSLD 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1480 1490 1500 1510 1520 1530 KIAA17 HDR-APVVGVRVNVLLSRYLIEPCGPGKSKLTYMCRVDLRGHMPEWYTKSFGHLCAAEVV .. .: :::. .: :.::.:::: :.:.::..::.::::. :.::.: :::::: ::. KIAA01 PEQPVPESGVRALMLTSQYLMEPCGLGRSRLTHICRADLRGRSPDWYNKVFGHLCAMEVA 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1540 1550 KIAA17 KIRDSFSNQNTETKDTKSR :::::: . .. .:: KIAA01 KIRDSFPTLQAAGPETKL 1120 1130 >>KIAA1314 ( 681 res) fh12718 (681 aa) initn: 254 init1: 137 opt: 294 Z-score: 232.0 bits: 54.5 E(): 8.3e-08 Smith-Waterman score: 306; 25.490% identity (60.131% similar) in 306 aa overlap (967-1260:217-503) 940 950 960 970 980 990 KIAA17 YHVKGMQRIVNQWSEKFSDEGDSDSALDSVSPCPSSPKQIHLDVDN--DRTTPSDLDSTG :: :..: : .. :. ... : . . . KIAA13 QDKEGSFAVPRSDSVAILETIPVLPVHSNGSPEPGQPVQNAISDDDFLEKNIPPEAEELS 190 200 210 220 230 240 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA17 NSLNEPEEPSEIPERRDSGVGASLTRSNRHRLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQINCQSVAQM .. : .: .: . . : ... . : . :.. : .:. . . :. .: KIAA13 FEVSYSEMVTEALKR--NKLKKSEIKKEDYVLTKFNVQKT-RFGLT----EAGDLSAEDM 250 260 270 280 290 1060 1070 1080 1090 1100 1110 KIAA17 NLLQKYSLLKLTALLEKYTPSNKHGFSWAVPKFMKRIKVPDYK--DRSVFGVPLTV--NV . ... ::..:::... . :.. .:: :. : : ..::::::: . KIAA13 KKIRHLSLIELTAFFDAF------GIQ------LKRNKTEKVKGRDNGIFGVPLTVLLDG 300 310 320 330 340 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA17 QRTGQP---LPQSIQQAMRYLRNHCLDQVGLFRKSGVKSRIQALRQMNEGAI--DCVNYE .: .: .: .:. .. ... :.. :.:: :: .... :. .. . : ... KIAA13 DRKKDPGVKVPLVLQKFFEKVEESGLESEGIFRLSGCTAKVKQYREELDAKFNADKFKWD 350 360 370 380 390 400 1170 1180 1190 1200 1210 1220 KIAA17 GQSAYDVADMLKQYFRDLPEPLMTNKLSETFLQIYQYVPKDQ-RLQAIKAAIMLLPDENR . ..: ::: .::.:: :. . .:..... :. . ..::.. .: ::: :: KIAA13 KMCHREAAVMLKAFFRELPTSLFPVEYIPAFISLMERGPHVKVQFQALHLMVMALPDANR 410 420 430 440 450 460 1230 1240 1250 1260 1270 1280 KIAA17 EVLQTLLYFLSDVTAAVKENQMTPTNLAVCLAPSLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKP .. :.:. :.. : : ..:.:. :... .::.:: KIAA13 DAAQALMTFFNKVIANESKNRMSLWNISTVMAPNLFFSRSKHSDYEELLLANTAAHIIRL 470 480 490 500 510 520 1290 1300 1310 1320 1330 1340 KIAA17 DQKDLNENLAATQGLAHMIAECKKLFQVPEEMSRCRNSYTEQELKPLTLEALGHLGNDDS KIAA13 MLKYQKILWKVPSFLITQVRRMNEATMLLKKQLPSVRKLLRRKTLERETASPKTSKVLQK 530 540 550 560 570 580 >>KIAA0131 ( 942 res) ha01235 (942 aa) initn: 296 init1: 161 opt: 293 Z-score: 229.3 bits: 54.5 E(): 1.2e-07 Smith-Waterman score: 297; 30.400% identity (56.000% similar) in 250 aa overlap (1053-1286:441-689) 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA17 RHRLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQINCQSVAQMNLLQKYSLLKLTALLEKYTPSNKHG--- : : . : :: : :: . ..: KIAA01 KSTSSDPGSRQAGRRRGQQQETETFYLTKLQEYLSGRSILAKLQAKHEKLQEALQRGDKE 420 430 440 450 460 470 1080 1090 1100 1110 1120 1130 KIAA17 ---FSWAVP---KFMK-RIKVPDYK-DRSVFGVPLTVNVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRNH ::. ::.: : :. . .. .:: . .: .:::.: ... .:.. . KIAA01 EQEVSWTQYTQRKFQKSRQPRPSSQYNQRLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRFINLN 480 490 500 510 520 530 1140 1150 1160 1170 1180 KIAA17 CLDQVGLFRKSGVKSRIQALRQMNEGAIDCVNYEGQSAYD---VADMLKQYFRDLPEPLM :.. :.:: ::.. :.. .:. : . : . :: .:.: :: .:: :::.: ::. KIAA01 GLQHEGIFRVSGAQLRVSEIRDAFERGEDPL-VEGCTAHDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLF 540 550 560 570 580 1190 1200 1210 1220 1230 1240 KIAA17 TNKLSETFLQIYQYVPKDQRLQAIKAAIMLLPDENREVLQTLLYFLSDVTAAVKENQMTP : .: . .:.. .. . :: ::. :. ::. .. ::.: : KIAA01 PPDLFGELLASSELEATAERVEHVSRLLWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDP 590 600 610 620 630 640 1250 1260 1270 1280 1290 1300 KIAA17 TNLAVCLAPSLFHLNTLKRENS-SPRVMQRKQSLG-KPDQKDLNENLAATQGLAHMIAEC :::::..:.:. . . . . . :: : :.: .::. KIAA01 YNLAVCFGPTLLPVPAGQDPVALQGRVNQLVQTLIVQPDRVFPPLTSLPGPVYEKCMAPP 650 660 670 680 690 700 1310 1320 1330 1340 1350 1360 KIAA17 KKLFQVPEEMSRCRNSYTEQELKPLTLEALGHLGNDDSADYQHFLQDCVDGLFKEVKEKF KIAA01 SASCLGDAQLESLGADNEPELEAEMPAQEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSFRRGDVL 710 720 730 740 750 760 >>KIAA0672 ( 824 res) hk02382 (824 aa) initn: 280 init1: 280 opt: 289 Z-score: 227.1 bits: 53.9 E(): 1.6e-07 Smith-Waterman score: 289; 32.335% identity (62.874% similar) in 167 aa overlap (1098-1260:255-417) 1070 1080 1090 1100 1110 1120 KIAA17 LLEKYTPSNKHGFSWAVPKFMKRIKVPDYKDRSVFGVPLTVNVQRTGQPLPQSIQQAMRY .. :: :: .. .:. . :. . . KIAA06 IEVQAEYHRKSLTLLQAVLPQIKAQQEAWVEKPSFGKPLEEHLTISGREIAFPIEACVTM 230 240 250 260 270 280 1130 1140 1150 1160 1170 1180 KIAA17 LRNHCLDQVGLFRKSGVKSRIQALRQMNEGAIDC--VNYEGQSA--YDVADMLKQYFRDL : . ... :::: . :... :. .:.:: :. . :: . .: ::.:.:.: KIAA06 LLECGMQEEGLFRVAPSASKLKKLK----AALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALKSYLREL 290 300 310 320 330 340 1190 1200 1210 1220 1230 1240 KIAA17 PEPLMTNKLSETFLQIYQYVPKDQRLQAIKAAIMLLPDENREVLQTLLYFLSDVTAAVKE :::::: .: . ..: . .:..:::. : :: :.. .. :. ::: .. KIAA06 PEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKLQALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKLSEYQDV 350 360 370 380 390 400 1250 1260 1270 1280 1290 1300 KIAA17 NQMTPTNLAVCLAPSLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPDQKDLNENLAATQGLAHMI :.:::.:.:. :.:.:. KIAA06 NKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNITEMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGEIEFNIT 410 420 430 440 450 460 >>KIAA1722 ( 1499 res) pf00674s1 (1499 aa) initn: 259 init1: 194 opt: 287 Z-score: 222.1 bits: 53.8 E(): 3e-07 Smith-Waterman score: 287; 30.061% identity (65.644% similar) in 163 aa overlap (1098-1259:1243-1404) 1070 1080 1090 1100 1110 1120 KIAA17 LLEKYTPSNKHGFSWAVPKFMKRIKVPDYKDRSVFGVPLTVNVQRTGQPLPQSIQQAMRY . . ::::::. : .:.: :.. ..: KIAA17 PRRRNILRSLRRNTKKPKPKPRPSITKATWESNYFGVPLTT-VVTPEKPIPIFIERCIEY 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1130 1140 1150 1160 1170 1180 KIAA17 LRNHCLDQVGLFRKSGVKSRIQAL-RQMNEGAIDCVNYEGQSAYDVADMLKQYFRDLPEP .. :. :..: :: ::....: ::... . . .. :: .:..: .::.: KIAA17 IEATGLSTEGIYRVSGNKSEMESLQRQFDQDHNLDLAEKDFTVNTVAGAMKSFFSELPDP 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1190 1200 1210 1220 1230 1240 KIAA17 LMTNKLSETFLQIYQYVPKDQRLQAIKAAIMLLPDENREVLQTLLYFLSDVTAAVKENQM :. ... ... .. ..:.:.:.: .. .: ::.::.. .. :. :. : : : KIAA17 LVPYNMQIDLVEAHKINDREQKLHALKEVLKKFPKENHEVFKYVISHLNKVSHNNKVNLM 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1250 1260 1270 1280 1290 1300 KIAA17 TPTNLAVCLAPSLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPDQKDLNENLAATQGLAHMIAEC : ::..:. :.: KIAA17 TSENLSICFWPTLMRPDFSTMDALTATRTYQTIIELFIQQCPFFFYNRPITEPPGARPSS 1400 1410 1420 1430 1440 1450 >>KIAA0013 ( 1086 res) ha00450s1 (1086 aa) initn: 238 init1: 108 opt: 279 Z-score: 217.9 bits: 52.6 E(): 5.1e-07 Smith-Waterman score: 279; 32.571% identity (64.000% similar) in 175 aa overlap (1101-1271:109-278) 1080 1090 1100 1110 1120 KIAA17 KYTPSNKHGFSWAVPKFMKRIKVPDYKDRSVFGVPLTV----NVQRTGQPLPQSIQQAMR .::::... : . :. .:. . .: KIAA00 RAFYGIKVKGVRGQCDRRRHETAATEIGGKIFGVPFNALPHSAVPEYGH-IPSFLVDACT 80 90 100 110 120 130 1130 1140 1150 1160 1170 1180 KIAA17 YLRNHCLDQVGLFRKSGVKSRIQALRQMNEGAIDCVNYEGQSAYDVADMLKQYFRDLPEP :..: . ::::::: :..::.. . . :.. . :.: .:::.::.:::: KIAA00 SLEDH-IHTEGLFRKSGSVIRLKALKNKVDHGEGCLS--SAPPCDIAGLLKQFFRELPEP 140 150 160 170 180 190 1190 1200 1210 1220 1230 1240 KIAA17 LMTNKLSETFLQIYQYVPKDQRLQAIKAAIMLLPDENREVLQTLLYFLSDVTAAVKENQM .. : :..:. : . ... .: :: :.. .::. .. :: .:. .::.: KIAA00 ILPADLHEALLKA-QQLGTEEKNKATLLLSCLLADHTVHVLRYFFNFLRNVSLRSSENKM 200 210 220 230 240 250 1250 1260 1270 1280 1290 1300 KIAA17 TPTNLAVCLAPSLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPDQKDLNENLAATQGLAHMIAEC .:::: .::.:.. . ... :: KIAA00 DSSNLAVIFAPNLLQTSEGHEKMSSNTEKKLRLQAAVVQTLIDYASDIGRVPDFILEKIP 260 270 280 290 300 310 >>KIAA1204 ( 1445 res) fg03451 (1445 aa) initn: 223 init1: 169 opt: 281 Z-score: 217.7 bits: 53.0 E(): 5.2e-07 Smith-Waterman score: 281; 31.515% identity (64.848% similar) in 165 aa overlap (1100-1260:18-180) 1070 1080 1090 1100 1110 1120 KIAA17 EKYTPSNKHGFSWAVPKFMKRIKVPDYKDRSVFGVPLTVNVQRTGQPLPQSIQQAMRYLR :.:: :: .. .:: .: ... .... KIAA12 LMKNKGAKQKLKRKGAASAFGCDLTEYLESSGQDVPYVLKSCAEFIE 10 20 30 40 1130 1140 1150 1160 1170 1180 KIAA17 NHCLDQVGLFRKSGVKSRIQALRQMNEGAIDCVNYEG----QSAYDVADMLKQYFRDLPE .: . . :..: ::: : :: ::: . :. .: . :. . :... : :::.::. KIAA12 THGIVD-GIYRLSGVTSNIQRLRQ-EFGSDQCPDLTREVYLQDIHCVGSLCKLYFRELPN 50 60 70 80 90 100 1190 1200 1210 1220 1230 1240 KIAA17 PLMTNKLSETFLQIYQYVPKDQRLQAIKAAIMLLPDENREVLQTLLYFLSDVTAAVKENQ ::.: .: : : . .. :.. .: :. .:. :: . ..:. :. :. ... .... KIAA12 PLLTYELYEKFTEAVSHCPEEGQLARIQNVIQELPPSHYRTLEYLIRHLAHIASFSSKTN 110 120 130 140 150 160 1250 1260 1270 1280 1290 1300 KIAA17 MTPTNLAVCLAPSLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPDQKDLNENLAATQGLAHMIAE : :::. ::.:. KIAA12 MHARNLALVWAPNLLRSKEIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEFILNHVDQIFNNGAPGSL 170 180 190 200 210 220 >>KIAA1424 ( 1944 res) ha06448 (1944 aa) initn: 263 init1: 190 opt: 258 Z-score: 198.5 bits: 49.8 E(): 6.1e-06 Smith-Waterman score: 263; 20.226% identity (49.795% similar) in 974 aa overlap (389-1293:431-1317) 360 370 380 390 400 410 KIAA17 NQVRLRKRKEIREDRDRARLDSMVLLIMKLDQLDQDIENALSTSSSPSGTPTNLRRHVPD :.. :... . :. . : .. : KIAA14 LRAASQSTTDYNQVVPNRTTLQGRRRSTSHDRVPQSVQIRQRSVSQERLEDSVLMKYCPR 410 420 430 440 450 460 420 430 440 450 460 470 KIAA17 LESGSESGADTISVNQTRVNLSSDTESTD-----LPSSTPVANS-GTKPKTTAIQGISEK : . . ..: .. :. . :. : . :.::. .: : : .: .:..:. KIAA14 SASQGALTSPSVSFSNHRTRSWDYIEGQDETLENVNSGTPIPDSNGEKKQTYKWSGFTEQ 470 480 490 500 510 520 480 490 500 510 520 530 KIAA17 EKAEIEAKEACDWLRATGFPQYAQLYEDFLFPIDISLVKREHDF-LDRDAIEALCRRLNT . . . :. : :. .....: : .: . ..... ::.. KIAA14 D----DRRGICE--R----PRQQEIHKSF----------RGSNFTVAPSVVNSDNRRMSG 530 540 550 560 540 550 560 570 580 KIAA17 LNKCAVMKLEISPHRKRSDDSDED--EPCAISGKWTFQRDSKRWSRLEEFDVFSPKQDLV . .: ... : .. .:... :..: ...: . ... .. .:. .. KIAA14 RGVGSVSQFKKIPPDLKTLQSNRNFQTTCGMSLPRGISQDRSPLVKVRSNSLKAPSTHVT 570 580 590 600 610 620 590 600 610 620 630 KIAA17 -PG-------SPDDSLPKDGPSPGGTL-------MDLSERQEVSSVRSLSSTGSLPSHAP :. : :. : . .. : : . :.: . .: : .:. . :: KIAA14 KPSFSQKSFVSIKDQRPVNHLHQNSLLNQQTWVRTDSAPDQQVETGKSPSLSGASAKPAP 630 640 650 660 670 680 640 650 660 670 KIAA17 PS-EDAAT-----P--RTNSVISV----CSSSNLAGNDDSF---GSLPS----PKELSSF : :.:.: : . :. .:. .:. : .. . :: :. : KIAA14 QSSENAGTSDLELPVSQRNQDLSLQEAETEQSDTLDNKEAVILREKPPSGRQTPQPLRHQ 690 700 710 720 730 740 680 690 700 710 720 730 KIAA17 SFSMKGHEKTAKSKTRSLLK---RMESLKLKSSHHSKHKAPSKLG-LIISGPILQEGMDE :. . ... . : : : : : ...: .. : .. : : . : :...: . KIAA14 SYILAVNDQETGSDTTCWLPNDARRE-VHIKRMEERKASSTSPPGDSLASIPFIDEPTSP 750 760 770 780 790 740 750 760 770 780 790 KIAA17 EKLKQLNCVEISA-LNGNRINVPMVRKRSVSNSTQTSSSSSQSETSSAVSTPSPVTRTRS ... . :: .... .:: . .: ::. . . : . .: . . KIAA14 SIDHDIAHIPASAVISASTSQVPSIA--TVPPCLTTSAPLIRRQLSHDHESVGPPSLDAQ 800 810 820 830 840 850 800 810 820 830 840 KIAA17 LSACNKRVGMYLEGFDPFNQS---TFNNVME-QNFKNRESYPEDTVFYIPEDHKPGTFPK .. ..: : ::.: . .. .:..: ...: .: . .: . .: KIAA14 PNSKTERSKSYDEGLDDYREDAKLSFKHVSSLKGIKIADSQKSSEDSGSRKDSSSEVFSD 860 870 880 890 900 910 850 860 870 880 890 KIAA17 ALTNG--SFSP----SGN--NGSVN-WRTGSFHGPGH-ISLRRENSSDS-PKELKRRNSS : .: : : .:. .::. :. :: . : ... .. :.: .. : KIAA14 AAKEGWLHFRPLVTDKGKRVGGSIRPWKQMYVVLRGHSLYLYKDKREQTTPSEEEQPISV 920 930 940 950 960 970 900 910 920 930 940 950 KIAA17 SSMSSRLSIYDNVPGSILYSSSGDLADL-ENEDIFPELDDILYHVKGMQRIVNQWSEKFS .. .: .. ... ...: : . :: ::.: .: .:. : ... KIAA14 NACLIDISYSETKRKNVFRLTTSDCECLFQAED----RDDMLAWIKTIQE-----SSNLN 980 990 1000 1010 1020 960 970 980 990 1000 1010 KIAA17 DEGDSDSALDSVSPCPSSPKQIHLDVDNDRTTPSDLDSTGNSLNEPEEPSEIPERRDSGV .: . . : .: ..:. . .: : : ...: :. : . :.. . KIAA14 EEDTGVTNRDLIS------RRIK-EYNN-------LMSKAEQL--PKTPRQSLSIRQTLL 1030 1040 1050 1060 1070 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA17 GASLTRSNRHRLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQINCQSVAQMNLLQKYSLLKLTALLEKYTP :: .:. . :: : :. .: . .::.: . : KIAA14 GA---KSE------PKTQSPHSPKEES-----------ERKLLSKD---------DTSPP 1080 1090 1100 1080 1090 1100 1110 1120 1130 KIAA17 SNKHGFSWAVPKFMKRIKVPDYKDRSVFGVPLT-VNVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRNHCL ..: . ..:..:.. ..::: : .:.. .: .. . .... : KIAA14 KDKGTWRKGIPSIMRKTFEKKPTATGTFGVRLDDCPPAHTNRYIPLIVDICCKLVEERGL 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1140 1150 1160 1170 1180 KIAA17 DQVGLFRKSGVKSRIQALRQ-MNEGAIDCVNYEGQSAYD---VADMLKQYFRDLPEPLMT . .:..: : .. :..... .:.: : .. . .. : ....::..:: :::::.: KIAA14 EYTGIYRVPGNNAAISSMQEELNKGMAD-IDIQDDKWRDLNVISSLLKSFFRKLPEPLFT 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1190 1200 1210 1220 1230 1240 KIAA17 NKLSETFLQIYQYVPKDQRLQAIKAAIMLLPDENREVLQTLLYFLSDVTAAVKENQMTPT : :.. . .::...: : ::... :.:. : :. :. ..:.: : KIAA14 NDKYADFIEANRKEDPLDRLKTLKRLIHDLPEHHYETLKFLSAHLKTVAENSEKNKMEPR 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1250 1260 1270 1280 1290 1300 KIAA17 NLAVCLAPSLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPDQKDLNENLAATQGLAHMIAECKKL :::. ..:.: . . ..: . : . ::: . :.: KIAA14 NLAIVFGPTLVRTS---EDNMTHMVTHM------PDQYKIVETLIQHHDWFFTEEGAEEP 1290 1300 1310 1320 1330 1310 1320 1330 1340 1350 1360 KIAA17 FQVPEEMSRCRNSYTEQELKPLTLEALGHLGNDDSADYQHFLQDCVDGLFKEVKEKFKGW KIAA14 LTTVQEESTVDSQPVPNIDHLLTNIGRTGVSPGDVSDSATSDSTKSKGSWGSGKDQYSRE 1340 1350 1360 1370 1380 1390 >>KIAA0411 ( 1061 res) hg02120 (1061 aa) initn: 205 init1: 178 opt: 252 Z-score: 197.5 bits: 48.8 E(): 7e-06 Smith-Waterman score: 252; 29.032% identity (61.290% similar) in 155 aa overlap (1111-1262:475-628) 1090 1100 1110 1120 1130 1140 KIAA17 SWAVPKFMKRIKVPDYKDRSVFGVPLTVNVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRNHCLDQVGLFR : .:: .: ... .::. . :.: :.:: KIAA04 KHDLLKQTLGEGERAECGTTRGRRNARTRNQDSGQAIPLVVESCIRYINLYGLQQQGIFR 450 460 470 480 490 500 1150 1160 1170 1180 1190 KIAA17 KSGVKSRIQALRQMNEGAIDCVNYEGQSAYD---VADMLKQYFRDLPEPLMTNKLSETFL : . ... ... : . : . . :. : :: .:: ::: : .::. .. . .. KIAA04 VPGSQVEVNDIKNSFERGEDPL-VDDQNERDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFQDLI 510 520 530 540 550 560 1200 1210 1220 1230 1240 1250 KIAA17 QIYQYVPKDQRLQAIKAAIMLLPDENREVLQTLLYFLSDVTAAVKENQMTPTNLAVCLAP . . .:.. :. .. :: :.. :. ::. .. ::.: : :::.:..: KIAA04 STIKLENPAERVHQIQQILVTLPRVVIVVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGP 570 580 590 600 610 620 1260 1270 1280 1290 1300 1310 KIAA17 SLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPDQKDLNENLAATQGLAHMIAECKKLFQVPEEMS .:.:. KIAA04 TLMHIPDGQDPVSCQAHINEVIKTIIIHHEAIFPSPRELEGPVYEKCMAGGEEYCDSPHS 630 640 650 660 670 680 >>KIAA0456 ( 1095 res) hg00633 (1095 aa) initn: 205 init1: 170 opt: 250 Z-score: 195.8 bits: 48.5 E(): 8.7e-06 Smith-Waterman score: 251; 25.322% identity (57.082% similar) in 233 aa overlap (1030-1259:453-672) 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA17 PEEPSEIPERRDSGVGASLTRSNRHRLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQINCQSVAQMNLLQK .:.: .::. .. . : : . :. . . KIAA04 QDIVTVEDFDVSDCFQYSNSMESVKSTVSETFMS--KPSI--AKRRANQQETEQFYFTKM 430 440 450 460 470 1060 1070 1080 1090 1100 1110 KIAA17 YSLLKLTALLEKYTPSNKHGFSWAVPKFMKRIKVPDYKDRSVFGVPLTVNVQRTGQPLPQ :. :. : . :: . ..: . . : :. :: : ..: .: KIAA04 KEYLEGRNLITKL--QAKHDL------LQKTLGESQRTDCSLARRSSTVRKQDSSQAIPL 480 490 500 510 520 530 1120 1130 1140 1150 1160 1170 KIAA17 SIQQAMRYLRNHCLDQVGLFRKSGVKSRIQALRQMNEGAIDCVNYEGQSAYD---VADML ... .:.. : :.. :.:: :: . ... ... : . : . . :. .: .: .: KIAA04 VVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVNDIKNAFERGEDPLAGD-QNDHDMDSIAGVL 540 550 560 570 580 1180 1190 1200 1210 1220 1230 KIAA17 KQYFRDLPEPLMTNKLSETFLQIYQYVPKDQRLQAIKAAIMLLPDENREVLQTLLYFLSD : ::: : .::. . . . .. . ..: :. ....:: . ... :. ::. KIAA04 KLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQERALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNH 590 600 610 620 630 640 1240 1250 1260 1270 1280 1290 KIAA17 VTAAVKENQMTPTNLAVCLAPSLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPDQKDLNENLAAT .. .::.: : :::.:..::: KIAA04 LSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQVSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPREL 650 660 670 680 690 700 1554 residues in 1 query sequences 1985951 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:14:22 2008 done: Thu Dec 18 15:14:23 2008 Total Scan time: 0.880 Total Display time: 0.470 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]